logo

Genes within 1Mb (chr12:106117347:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 3.12e-01 -0.134 0.133 0.051 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.32e-01 -0.289 0.192 0.051 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 4.54e-01 0.115 0.153 0.051 B L1
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 8.50e-01 -0.04 0.212 0.051 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 6.41e-01 0.0465 0.0995 0.051 B L1
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 1.98e-01 0.188 0.146 0.051 B L1
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 7.15e-02 -0.268 0.148 0.051 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.92e-01 0.00122 0.12 0.051 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0618 0.128 0.051 B L1
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 4.16e-01 0.07 0.0859 0.051 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.32e-01 -0.108 0.137 0.051 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0758 0.135 0.051 CD4T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 4.08e-01 0.137 0.166 0.051 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 4.73e-01 -0.084 0.117 0.051 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0736 0.135 0.051 CD4T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 3.73e-01 0.117 0.131 0.051 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0194 0.119 0.051 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 5.89e-01 0.0557 0.103 0.051 CD4T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 5.03e-01 0.127 0.189 0.051 CD4T L1
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 7.80e-01 0.0306 0.11 0.051 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 2.24e-01 -0.198 0.162 0.051 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 4.05e-01 -0.136 0.163 0.051 CD8T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 2.42e-01 0.198 0.169 0.051 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0229 0.107 0.051 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0501 0.154 0.051 CD8T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 4.26e-01 -0.112 0.14 0.051 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0977 0.0951 0.051 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0135 0.0684 0.051 CD8T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 2.26e-01 -0.248 0.204 0.051 CD8T L1
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 4.95e-01 0.0931 0.136 0.051 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.87e-01 -0.114 0.164 0.051 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 3.77e-02 -0.325 0.156 0.051 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 9.42e-01 0.00857 0.117 0.051 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 1.95e-01 -0.24 0.185 0.051 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.02e-01 -0.174 0.136 0.051 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 4.98e-01 -0.121 0.178 0.051 Mono L1
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 5.51e-01 0.0635 0.106 0.051 Other_T L1
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 3.56e-01 0.184 0.199 0.051 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 2.49e-01 -0.161 0.139 0.051 Other_T L1
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 8.33e-01 0.0351 0.167 0.051 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.19e-01 0.0285 0.125 0.051 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 2.37e-01 0.192 0.162 0.051 Other_T L1
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0201 0.174 0.051 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.42e-01 -0.179 0.153 0.051 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 3.27e-01 -0.123 0.125 0.051 Other_T L1
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 2.31e-01 -0.226 0.188 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 5.36e-01 0.13 0.209 0.051 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.57e-01 -0.153 0.206 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 8.07e-01 0.0511 0.209 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 5.94e-01 0.0867 0.162 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 3.53e-01 0.182 0.195 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0369 0.221 0.051 B_Activated L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.69e-01 0.241 0.218 0.051 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00278 0.218 0.051 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 4.07e-01 0.175 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 2.23e-01 0.236 0.193 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 3.41e-01 -0.204 0.214 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 3.15e-01 0.191 0.19 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 6.56e-01 -0.091 0.204 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0589 0.158 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 7.07e-01 0.0709 0.188 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.98e-01 -0.211 0.202 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 1.93e-01 -0.24 0.183 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.57e-02 -0.341 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 3.51e-01 -0.168 0.18 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.87e-01 -0.141 0.202 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 2.11e-01 0.247 0.197 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 5.64e-01 0.125 0.216 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 4.75e-01 0.109 0.152 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 9.57e-01 0.00925 0.171 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.56e-01 -0.244 0.214 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 7.73e-01 0.0432 0.149 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.73e-02 -0.346 0.195 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 1.99e-01 -0.212 0.164 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 3.89e-02 -0.412 0.198 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0612 0.211 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0515 0.201 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 3.84e-01 0.144 0.165 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 1.98e-01 -0.264 0.205 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00907 0.214 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.40e-01 0.245 0.208 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 5.06e-01 0.0797 0.12 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0215 0.179 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 2.77e-01 0.109 0.1 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.45e-01 -0.223 0.152 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0228 0.145 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0615 0.192 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 3.00e-01 -0.136 0.131 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 6.64e-01 0.061 0.14 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 5.33e-01 0.088 0.141 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.14e-01 0.0143 0.132 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0295 0.18 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0806 0.199 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 8.12e-01 0.0299 0.126 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 3.17e-01 0.173 0.173 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 3.60e-01 -0.166 0.181 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 5.86e-01 0.113 0.208 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.127 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 3.26e-01 -0.163 0.165 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0837 0.173 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0608 0.14 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 1.91e-01 0.181 0.138 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 1.46e-01 0.304 0.209 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 5.80e-01 0.0949 0.171 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.77e-01 0.29 0.214 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 2.37e-01 0.232 0.196 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 4.74e-01 0.15 0.21 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0229 0.169 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 5.37e-01 -0.114 0.184 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 9.43e-01 0.0139 0.193 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.98e-01 0.000343 0.169 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 5.06e-01 0.09 0.135 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 3.56e-01 -0.187 0.203 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 7.41e-01 0.0429 0.129 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00992 0.195 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 2.52e-01 -0.21 0.182 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.26e-01 -0.071 0.202 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0896 0.173 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 2.21e-01 -0.201 0.163 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 3.92e-02 -0.343 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.76e-01 0.0057 0.186 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 3.40e-01 -0.131 0.137 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 1.06e-01 -0.333 0.205 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 6.07e-01 0.0774 0.15 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0667 0.182 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 6.90e-01 0.0775 0.194 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 4.77e-01 0.142 0.199 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0918 0.163 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0887 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 3.10e-01 -0.176 0.173 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.76e-01 -0.158 0.145 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0177 0.155 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0743 0.205 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 3.13e-01 -0.192 0.19 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0701 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 8.71e-01 0.0336 0.206 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.04e-01 0.0824 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 4.44e-01 -0.152 0.198 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 9.29e-01 0.0194 0.219 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0468 0.217 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0248 0.207 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 2.46e-01 -0.196 0.168 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 2.86e-01 -0.204 0.191 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 1.92e-01 0.208 0.159 0.052 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 7.81e-01 0.056 0.201 0.052 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 4.84e-01 -0.125 0.178 0.052 MAIT L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 2.77e-01 -0.212 0.195 0.052 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0405 0.18 0.052 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 1.03e-01 0.314 0.192 0.052 MAIT L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0635 0.211 0.052 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0605 0.184 0.052 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 4.03e-01 -0.128 0.153 0.052 MAIT L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0287 0.198 0.052 MAIT L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 7.60e-01 0.0528 0.173 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.04e-01 0.339 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -22686 sc-eQTL 8.99e-01 0.026 0.204 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 6.97e-01 0.0835 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 1.61e-01 -0.303 0.216 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0356 0.188 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 1.40e-01 -0.306 0.206 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.48e-01 0.249 0.215 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 1.96e-01 0.274 0.211 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 2.02e-01 0.198 0.155 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 9.25e-02 0.333 0.197 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 6.20e-01 0.119 0.24 0.052 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 5.12e-01 -0.169 0.258 0.052 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 3.67e-01 0.208 0.23 0.052 PB L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0599 0.217 0.052 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 7.25e-01 -0.051 0.145 0.052 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 3.72e-01 0.234 0.261 0.052 PB L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 9.88e-02 0.305 0.183 0.052 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 1.82e-01 0.322 0.24 0.052 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0876 0.164 0.052 PB L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0326 0.14 0.052 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.08e-01 0.323 0.2 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0778 0.19 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 4.12e-01 0.156 0.19 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 9.94e-01 0.000842 0.105 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 2.49e-01 -0.22 0.191 0.052 Pro_T L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 4.52e-01 0.132 0.176 0.052 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 3.65e-01 -0.147 0.162 0.052 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0721 0.136 0.052 Pro_T L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 1.89e-01 -0.221 0.167 0.052 Pro_T L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 2.70e-01 -0.194 0.176 0.051 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 8.52e-01 0.0389 0.209 0.051 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 8.46e-01 0.0388 0.199 0.051 Treg L2
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 7.74e-01 0.0621 0.216 0.051 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 3.93e-01 0.132 0.154 0.051 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 2.82e-01 -0.198 0.184 0.051 Treg L2
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.23e-01 0.244 0.199 0.051 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 5.20e-01 -0.107 0.166 0.051 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 4.73e-01 0.0957 0.133 0.051 Treg L2
ENSG00000260329 AC007541.1 -838150 sc-eQTL 8.61e-01 0.0343 0.196 0.051 Treg L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0155 0.173 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00405 0.195 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 2.87e-01 -0.188 0.177 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0692 0.134 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0026 0.202 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0495 0.16 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.06e-01 0.0708 0.187 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 6.00e-01 0.105 0.201 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 7.42e-01 -0.066 0.2 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 4.11e-01 -0.152 0.185 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 6.72e-01 0.0621 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 5.70e-02 -0.412 0.215 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 5.76e-02 -0.325 0.17 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0152 0.185 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0287 0.202 0.051 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.33e-03 -0.554 0.192 0.051 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 7.33e-02 -0.342 0.19 0.051 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 2.90e-01 0.211 0.199 0.051 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 3.64e-01 -0.19 0.209 0.051 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 9.95e-01 -0.0013 0.224 0.051 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.63e-01 0.0558 0.185 0.051 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 8.00e-01 0.0461 0.181 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 1.93e-01 -0.272 0.208 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 1.39e-01 0.265 0.179 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00577 0.203 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.98e-01 0.018 0.141 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 8.32e-01 0.0379 0.178 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.18e-01 -0.244 0.198 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.27e-01 -0.206 0.17 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0554 0.175 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 1.48e-01 -0.236 0.163 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 4.37e-01 -0.159 0.204 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0426 0.2 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 sc-eQTL 9.90e-01 0.00272 0.219 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.65e-01 0.026 0.152 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 4.01e-01 0.131 0.156 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 sc-eQTL 2.62e-01 -0.232 0.206 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 8.35e-01 0.0278 0.133 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 9.81e-02 -0.309 0.186 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000008405 CRY1 -976202 sc-eQTL 6.54e-01 0.0748 0.166 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -240401 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0232 0.184 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -657274 sc-eQTL 1.60e-01 -0.239 0.17 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -186932 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0222 0.128 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 881144 sc-eQTL 2.04e-01 -0.252 0.198 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -184582 sc-eQTL 2.80e-01 -0.147 0.136 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 882057 sc-eQTL 7.38e-01 0.0603 0.18 0.051 CD14_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -22686 eQTL 0.000704 -0.202 0.0595 0.0 0.0 0.0623
ENSG00000120832 MTERF2 -869813 eQTL 0.00373 0.138 0.0473 0.00322 0.0 0.0623
ENSG00000151135 TMEM263 -838372 eQTL 0.0327 0.0512 0.0239 0.0 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 -22686 2.39e-05 2.54e-05 4.66e-06 1.39e-05 4.07e-06 1.12e-05 3.18e-05 3.76e-06 2.4e-05 1.19e-05 3.05e-05 1.33e-05 3.88e-05 1.06e-05 5.6e-06 1.34e-05 1.31e-05 2.1e-05 6.45e-06 5.62e-06 1.12e-05 2.43e-05 2.43e-05 7.51e-06 3.59e-05 6.17e-06 9.85e-06 9.19e-06 2.43e-05 2.14e-05 1.53e-05 1.63e-06 2.25e-06 6.16e-06 9.85e-06 4.58e-06 2.78e-06 2.97e-06 4.1e-06 2.93e-06 1.72e-06 3.15e-05 2.71e-06 3.62e-07 2e-06 3e-06 3.77e-06 1.5e-06 1.38e-06