Genes within 1Mb (chr12:105951817:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 7.35e-01 0.0438 0.129 0.098 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.13e-01 0.128 0.103 0.098 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0611 0.0668 0.098 B L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0981 0.098 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0142 0.0627 0.098 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 1.55e-01 -0.142 0.0995 0.098 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.62e-01 -0.169 0.12 0.098 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.05e-01 -0.13 0.0799 0.098 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0618 0.086 0.098 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.47e-02 0.181 0.0937 0.098 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 6.14e-01 -0.047 0.093 0.098 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 1.68e-03 0.251 0.0788 0.098 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 5.67e-01 0.0533 0.0929 0.098 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 1.07e-02 0.232 0.0902 0.098 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.06e-01 -0.205 0.126 0.098 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.59e-01 -0.116 0.0817 0.098 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0278 0.0709 0.098 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.95e-02 0.208 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.72e-02 0.245 0.11 0.098 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.17e-01 0.0474 0.0731 0.098 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0336 0.105 0.098 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.81e-02 -0.23 0.116 0.098 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 2.30e-01 -0.127 0.105 0.098 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0219 0.0649 0.098 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0632 0.0463 0.098 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 8.18e-01 0.033 0.143 0.092 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.06e-01 -0.187 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.76e-01 0.0701 0.0983 0.092 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 7.19e-01 0.0529 0.147 0.092 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0311 0.118 0.092 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 4.04e-02 0.205 0.0994 0.092 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0761 0.0897 0.092 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.86e-02 -0.346 0.146 0.092 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0399 0.0602 0.092 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.96e-01 0.0773 0.113 0.098 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.32e-01 -0.164 0.108 0.098 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.77e-01 0.0453 0.0812 0.098 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 1.80e-02 0.302 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.60e-01 0.0468 0.0631 0.098 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0851 0.0942 0.098 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.08e-02 0.312 0.121 0.098 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.93e-01 0.129 0.122 0.099 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 5.31e-10 -0.718 0.11 0.099 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 3.64e-01 -0.104 0.114 0.099 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.22e-01 0.134 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0565 0.108 0.099 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00284 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 3.35e-01 -0.134 0.139 0.099 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 9.12e-01 0.0111 0.1 0.099 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0462 0.0818 0.099 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 8.75e-01 0.0215 0.136 0.098 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 9.24e-01 0.00912 0.0957 0.098 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.86e-01 0.0466 0.0855 0.098 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 5.01e-01 0.0751 0.111 0.098 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 6.94e-01 0.0576 0.146 0.098 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 2.46e-01 -0.119 0.103 0.098 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.93e-01 -0.136 0.104 0.098 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0451 0.0856 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 1.81e-01 0.201 0.15 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 8.99e-01 0.0193 0.153 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.41e-01 0.168 0.143 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 4.50e-01 0.122 0.161 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0499 0.153 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.115 0.092 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0142 0.159 0.092 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0805 0.159 0.092 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.154 0.092 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.97e-01 0.161 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.76e-01 0.0979 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.96e-02 0.215 0.113 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 5.62e-01 0.0789 0.136 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0658 0.118 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 3.56e-01 -0.119 0.129 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0588 0.149 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 4.72e-01 0.0956 0.133 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 8.29e-01 -0.03 0.139 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.59e-01 0.114 0.154 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 6.44e-01 0.067 0.145 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.36e-01 0.101 0.13 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.77e-01 0.0587 0.14 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.42e-01 0.0232 0.116 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 6.47e-01 0.0624 0.136 0.095 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000578 0.157 0.095 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.095 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 6.26e-01 0.0582 0.119 0.095 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.77e-01 -0.142 0.131 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.38e-01 0.0995 0.128 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.16e-01 0.0804 0.0987 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 5.24e-02 0.214 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.01e-01 0.0251 0.0995 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0629 0.115 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.11e-01 -0.228 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0967 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0197 0.127 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.69e-01 -0.082 0.144 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 3.89e-01 0.11 0.128 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.07e-01 0.158 0.124 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 7.72e-01 0.0347 0.119 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 9.51e-01 0.00668 0.108 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 8.04e-01 0.0281 0.113 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.75e-01 -0.208 0.153 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.76e-01 -0.116 0.106 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 7.48e-01 0.0425 0.132 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.61e-01 -0.1 0.136 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 8.09e-01 0.0347 0.143 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 6.66e-01 0.0486 0.112 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.03e-01 0.0348 0.14 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 2.72e-01 -0.147 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.50e-01 0.194 0.134 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 8.39e-01 0.0288 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 9.97e-01 0.000261 0.0813 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.04e-01 0.136 0.107 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 9.90e-01 0.00124 0.101 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 1.05e-02 0.234 0.0904 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 3.90e-01 0.0842 0.0978 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 1.90e-02 0.225 0.0953 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 1.83e-02 -0.331 0.139 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.09e-01 -0.147 0.0914 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 4.83e-01 0.0881 0.125 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00878 0.118 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0813 0.124 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 6.87e-02 0.158 0.0863 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 9.27e-01 0.0105 0.113 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 3.83e-02 0.241 0.115 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 7.64e-01 0.0433 0.144 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.42e-02 -0.171 0.095 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0199 0.0948 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.90e-01 0.155 0.146 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.58e-02 -0.322 0.132 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 8.52e-02 0.198 0.114 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.45e-01 0.0247 0.126 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 2.50e-02 0.318 0.141 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.33e-01 0.0117 0.138 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.75e-02 -0.203 0.114 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 9.50e-01 0.00578 0.0924 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 6.08e-01 0.0689 0.134 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 5.90e-02 0.238 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0255 0.12 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00311 0.113 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.86e-01 -0.018 0.125 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0293 0.148 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0644 0.128 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.51e-01 -0.136 0.0943 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 1.16e-01 0.194 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0504 0.132 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 3.64e-01 0.1 0.11 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.01e-01 0.0287 0.114 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0935 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 3.04e-01 -0.136 0.132 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 4.93e-01 0.0677 0.0986 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0165 0.106 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 7.41e-01 0.0489 0.148 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.36e-01 0.168 0.141 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0814 0.129 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0922 0.145 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 2.36e-02 -0.328 0.144 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 8.78e-01 0.024 0.155 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.81e-01 0.134 0.124 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0472 0.137 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00411 0.141 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.28e-01 0.204 0.134 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.00e-02 0.299 0.128 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.34e-01 0.0679 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 3.71e-01 -0.132 0.147 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.20e-01 0.0144 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.86e-01 -0.144 0.134 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 3.44e-01 -0.104 0.11 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 3.85e-01 -0.119 0.137 0.097 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.22e-01 0.0977 0.121 0.097 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 8.24e-01 0.0274 0.123 0.097 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.57e-01 0.0584 0.131 0.097 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.59e-01 0.114 0.154 0.097 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0779 0.139 0.097 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.097 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0474 0.104 0.097 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.15e-01 0.0895 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0935 0.12 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0794 0.149 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.47e-03 0.337 0.11 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.04e-02 0.234 0.133 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0644 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0601 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0472 0.144 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.66e-01 -0.179 0.129 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.43e-01 0.0758 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 1.97e-08 -0.66 0.113 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.70e-01 -0.171 0.124 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 7.12e-01 0.0462 0.125 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.07e-01 0.0274 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00211 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 7.17e-01 0.0535 0.148 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 8.54e-01 0.0201 0.11 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 2.01e-01 -0.114 0.0885 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 6.91e-01 0.0549 0.138 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 2.95e-03 -0.397 0.132 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 9.33e-01 0.0119 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 3.19e-01 0.124 0.124 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 1.06e-01 0.221 0.136 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 3.80e-01 -0.125 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 6.15e-02 -0.266 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.92e-01 -0.183 0.14 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 9.51e-01 0.00631 0.103 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 7.87e-01 0.0372 0.138 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 1.17e-05 -0.545 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 9.36e-01 0.0105 0.13 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.90e-01 0.0869 0.126 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 1.19e-02 -0.333 0.131 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0499 0.129 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.14e-02 -0.24 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.36e-01 0.0379 0.113 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0398 0.0945 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0554 0.177 0.104 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0829 0.157 0.104 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0224 0.0991 0.104 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 4.69e-01 -0.13 0.179 0.104 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00665 0.153 0.104 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0899 0.162 0.104 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 2.71e-01 0.176 0.159 0.104 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0599 0.165 0.104 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 5.37e-01 0.0694 0.112 0.104 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 9.38e-01 -0.011 0.14 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 9.73e-01 0.00441 0.132 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000946 0.0731 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.66e-01 0.0573 0.133 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.75e-01 -0.106 0.147 0.1 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0475 0.113 0.1 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.19e-01 0.139 0.112 0.1 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0352 0.0942 0.1 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0158 0.143 0.098 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 3.39e-01 -0.13 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000224 0.105 0.098 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.97e-02 0.227 0.125 0.098 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 1.98e-01 -0.18 0.139 0.098 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 5.89e-01 -0.076 0.141 0.098 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 8.30e-01 0.0244 0.114 0.098 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0318 0.0909 0.098 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.61e-01 -0.163 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.82e-01 -0.164 0.152 0.093 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00723 0.107 0.093 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0666 0.153 0.093 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0301 0.136 0.093 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 9.07e-01 0.014 0.119 0.093 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.27e-01 0.00971 0.106 0.093 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.67e-01 -0.221 0.159 0.093 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0112 0.114 0.093 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.29e-01 0.161 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.46e-01 -0.177 0.121 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.87e-01 0.098 0.0917 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 1.05e-02 0.352 0.136 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0673 0.0712 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 5.19e-01 -0.075 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0879 0.11 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 5.96e-02 0.242 0.128 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0649 0.138 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0267 0.128 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.28e-01 0.0799 0.101 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 9.31e-01 -0.013 0.149 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 3.65e-02 0.217 0.103 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0241 0.124 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 2.84e-01 -0.127 0.118 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.85e-01 0.169 0.127 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 2.05e-02 0.396 0.169 0.097 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.53e-01 0.131 0.174 0.097 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.74e-01 0.0925 0.164 0.097 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 8.27e-02 0.281 0.161 0.097 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.00e-01 0.0487 0.192 0.097 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 9.51e-01 0.0118 0.191 0.097 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.58e-01 -0.252 0.177 0.097 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 4.46e-01 -0.115 0.151 0.097 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.45e-01 0.102 0.133 0.1 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.40e-01 -0.192 0.129 0.1 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 9.20e-01 0.0136 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 4.88e-01 0.0986 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 1.22e-01 0.185 0.119 0.1 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 4.77e-01 -0.104 0.145 0.1 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0753 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 7.99e-04 0.416 0.122 0.1 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.33e-01 0.102 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 6.87e-01 0.0512 0.127 0.093 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 4.27e-01 0.107 0.135 0.093 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 4.85e-01 0.0964 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 6.90e-01 0.0372 0.093 0.093 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 4.09e-01 0.123 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 9.00e-01 0.0167 0.133 0.093 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 2.43e-01 0.168 0.144 0.093 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 3.81e-01 0.14 0.159 0.093 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 2.45e-01 -0.179 0.153 0.093 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 1.68e-01 0.141 0.102 0.093 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 2.70e-01 0.174 0.157 0.093 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0864 0.149 0.093 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 3.40e-02 0.245 0.115 0.093 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0708 0.101 0.093 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 1.79e-01 -0.206 0.153 0.093 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.89e-01 -0.128 0.097 0.093 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 4.04e-01 0.123 0.147 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 5.12e-01 0.083 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 5.18e-02 0.193 0.0987 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 6.30e-01 0.0606 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0478 0.0897 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 3.16e-01 -0.131 0.13 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 5.67e-01 -0.078 0.136 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 8.65e-01 0.0206 0.121 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 4.03e-01 -0.103 0.123 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 3.58e-01 -0.125 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.95e-02 0.261 0.132 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 1.21e-01 0.157 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 1.36e-01 0.155 0.103 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 4.96e-01 0.0605 0.0886 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 993073 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0168 0.109 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 3.96e-02 -0.303 0.146 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0603 0.0885 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0315 0.125 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 7.82e-01 0.0355 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.55e-01 -0.168 0.118 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 2.72e-01 0.0977 0.0888 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 3.97e-02 0.282 0.136 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.20e-01 0.0154 0.0674 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0908 0.0945 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 1.23e-01 0.193 0.124 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 1.05e-01 0.192 0.118 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 1.68e-01 -0.155 0.112 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0466 0.117 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 2.38e-01 0.155 0.131 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 1.68e-01 0.107 0.0775 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0918 0.141 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0627 0.121 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 3.05e-03 0.406 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -405931 sc-eQTL 5.45e-01 0.0762 0.126 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 sc-eQTL 2.42e-10 -0.732 0.11 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -822804 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0935 0.116 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -352462 sc-eQTL 6.54e-01 0.0516 0.115 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 715614 sc-eQTL 2.91e-01 -0.114 0.107 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 844493 sc-eQTL 8.64e-01 0.0202 0.118 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 965501 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0981 0.142 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -350112 sc-eQTL 8.52e-01 0.0184 0.0984 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 716527 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0584 0.0823 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 eQTL 6.52e-16 -0.417 0.0507 0.0237 0.0272 0.0815


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 -188216 1.93e-06 2.12e-06 2.85e-07 1.28e-06 4.75e-07 6.47e-07 1.31e-06 4.42e-07 1.75e-06 6.94e-07 1.89e-06 1.29e-06 2.84e-06 5.79e-07 3.68e-07 1.1e-06 1.12e-06 1.34e-06 5.51e-07 7.26e-07 6.02e-07 1.96e-06 1.65e-06 9.28e-07 2.63e-06 1.05e-06 1.04e-06 1.04e-06 1.62e-06 1.63e-06 7.39e-07 3.03e-07 3.78e-07 8.95e-07 8.57e-07 6.2e-07 6.79e-07 3.26e-07 6.01e-07 1.98e-07 3.04e-07 2.51e-06 3.55e-07 1.66e-07 3.48e-07 3.21e-07 4.02e-07 1.97e-07 2.87e-07