Genes within 1Mb (chr12:105946199:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0397 0.0953 0.235 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00361 0.0758 0.235 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.89e-01 0.0424 0.0492 0.235 B L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0938 0.0722 0.235 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 2.89e-01 0.049 0.0461 0.235 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 5.96e-01 -0.039 0.0735 0.235 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0194 0.0889 0.235 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 3.51e-02 0.124 0.0586 0.235 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.49e-02 -0.133 0.0627 0.235 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0277 0.0698 0.235 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 2.99e-01 0.0715 0.0686 0.235 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0211 0.0596 0.235 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0484 0.0686 0.235 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0548 0.0676 0.235 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 3.76e-01 0.0831 0.0935 0.235 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 2.80e-01 0.0656 0.0605 0.235 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0122 0.0524 0.235 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0241 0.0833 0.235 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 2.96e-01 0.0875 0.0836 0.235 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 9.67e-02 -0.0913 0.0547 0.235 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0947 0.0786 0.235 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.92e-01 0.0754 0.0879 0.235 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0318 0.0796 0.235 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0163 0.0488 0.235 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 4.17e-02 0.071 0.0347 0.235 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.39e-01 0.0077 0.0997 0.234 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.234 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.03e-01 0.0707 0.0684 0.234 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 7.41e-02 -0.182 0.102 0.234 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 1.58e-01 0.117 0.0822 0.234 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 1.56e-01 0.0992 0.0697 0.234 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0228 0.0627 0.234 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 8.01e-01 0.026 0.103 0.234 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 1.06e-01 0.0677 0.0417 0.234 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 7.88e-01 0.0223 0.083 0.235 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.03e-01 0.0415 0.0797 0.235 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 8.64e-01 0.0102 0.0595 0.235 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00149 0.0941 0.235 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 8.65e-01 0.00789 0.0463 0.235 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 4.22e-01 0.0654 0.0812 0.235 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.33e-01 0.00582 0.0691 0.235 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.32e-01 -0.108 0.0899 0.235 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.20e-01 -0.045 0.0905 0.236 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0302 0.0892 0.236 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0412 0.0843 0.236 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 5.37e-01 0.0501 0.081 0.236 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0072 0.0799 0.236 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 7.41e-01 0.0275 0.0834 0.236 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 9.28e-01 0.00921 0.102 0.236 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 5.60e-01 0.0431 0.0738 0.236 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 7.23e-01 0.0214 0.0604 0.236 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 5.95e-01 0.0557 0.105 0.235 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.48e-01 0.0335 0.0733 0.235 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.76e-01 0.058 0.0655 0.235 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0477 0.0854 0.235 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 5.41e-01 0.0686 0.112 0.235 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.56e-01 0.0352 0.079 0.235 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 5.35e-02 0.155 0.0797 0.235 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 4.77e-01 0.0467 0.0656 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00579 0.108 0.235 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.40e-01 0.105 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0356 0.103 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0519 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 7.26e-01 0.0386 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0647 0.0821 0.235 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 1.87e-01 0.151 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 5.08e-01 0.0758 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0887 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 3.08e-01 0.111 0.109 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0782 0.0966 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 6.55e-01 0.0361 0.0807 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.83e-01 0.0392 0.096 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0619 0.0829 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.76e-01 0.065 0.0911 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.32e-01 0.066 0.105 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0738 0.0936 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0506 0.098 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.04e-01 0.0571 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0591 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0939 0.0926 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.21e-01 -0.123 0.0999 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0591 0.0828 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0584 0.0971 0.235 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.112 0.235 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0303 0.0925 0.235 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 4.25e-02 -0.172 0.0842 0.235 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0533 0.1 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 7.72e-01 0.0283 0.0977 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.80e-01 0.0211 0.0754 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 8.96e-02 -0.143 0.0838 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 2.92e-01 0.0799 0.0757 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0608 0.0877 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 4.48e-01 0.0828 0.109 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 1.67e-02 0.176 0.073 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0924 0.0969 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.77e-01 -0.147 0.108 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 8.57e-01 0.0175 0.0966 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0897 0.0941 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0547 0.0902 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 7.52e-01 0.0259 0.0816 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0032 0.0856 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.48e-01 0.053 0.116 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.31e-01 0.0634 0.0803 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.26e-01 -0.121 0.0996 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.24e-01 0.05 0.102 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0749 0.107 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.15e-01 0.0845 0.0839 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0279 0.105 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 2.41e-01 -0.118 0.1 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 2.77e-01 -0.11 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 2.63e-01 0.119 0.106 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.37e-01 0.072 0.0607 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.86e-01 0.00138 0.0794 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 9.12e-02 0.127 0.0746 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0306 0.0681 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0341 0.0726 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0367 0.0716 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 2.44e-01 0.122 0.104 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.47e-01 0.0221 0.0682 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.37e-01 -0.044 0.0931 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.90e-01 -0.115 0.0876 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.68e-01 0.0394 0.0919 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0159 0.0646 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0825 0.0839 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 6.28e-01 -0.042 0.0866 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 2.66e-01 -0.119 0.107 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.96e-03 0.198 0.0698 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0947 0.0701 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.80e-01 0.045 0.109 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 4.56e-01 0.0742 0.0995 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00772 0.0855 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0364 0.0935 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0793 0.106 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 3.75e-01 -0.091 0.102 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.33e-01 0.0292 0.0855 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.21e-01 0.0838 0.0684 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0654 0.1 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.10e-01 0.0621 0.0941 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 5.69e-01 0.0509 0.0892 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 3.98e-02 -0.173 0.0835 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 5.24e-01 0.0596 0.0934 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0267 0.11 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.28e-01 0.00863 0.0958 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 1.52e-01 0.101 0.0704 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 4.81e-01 0.0652 0.0925 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0164 0.0987 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0764 0.0824 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 8.61e-01 0.0149 0.0849 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 9.15e-01 0.00982 0.092 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0404 0.0989 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0249 0.0737 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 9.89e-01 0.00111 0.0789 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.92e-01 0.144 0.11 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.20e-01 -0.106 0.106 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 5.96e-02 -0.181 0.0957 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.36e-01 0.129 0.108 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.05e-01 0.0603 0.117 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0698 0.093 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.32e-01 0.0493 0.103 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0427 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.94e-01 0.0546 0.102 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 1.91e-01 -0.129 0.0982 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0276 0.109 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 7.64e-01 0.0337 0.112 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0825 0.109 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0282 0.103 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.72e-01 0.0355 0.0837 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 2.15e-01 0.128 0.103 0.236 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.47e-01 0.042 0.0916 0.236 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 1.91e-01 0.121 0.0923 0.236 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.89e-01 -0.105 0.0988 0.236 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.91e-01 0.1 0.116 0.236 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0274 0.105 0.236 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.70e-02 0.156 0.0938 0.236 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 8.36e-02 0.135 0.0779 0.236 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.16e-01 -0.163 0.103 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 4.37e-02 -0.182 0.0896 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 2.54e-01 -0.128 0.112 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 4.68e-01 0.0616 0.0847 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00507 0.101 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 1.86e-01 0.138 0.104 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0467 0.113 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0598 0.108 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 7.13e-01 -0.036 0.0977 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.98e-01 0.0363 0.0933 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00546 0.0912 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.98e-01 0.0493 0.0933 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 5.13e-01 0.0613 0.0935 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0903 0.0839 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0846 0.0918 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 7.37e-01 0.0372 0.111 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.79e-01 0.00216 0.0821 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.12e-01 0.0338 0.0665 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 2.56e-01 0.119 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0779 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0544 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 2.05e-01 0.119 0.094 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0888 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 1.26e-01 0.164 0.107 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 1.51e-01 -0.155 0.108 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 5.25e-02 0.205 0.105 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 8.66e-01 0.0131 0.0778 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0949 0.105 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0714 0.0971 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0894 0.0996 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 5.51e-01 0.0574 0.0962 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 4.80e-01 0.072 0.102 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.16e-01 0.0987 0.0983 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.24e-01 0.0694 0.109 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0588 0.086 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00472 0.0723 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.34e-01 0.2 0.133 0.219 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 7.77e-01 0.0339 0.119 0.219 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 4.67e-02 0.149 0.0738 0.219 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0993 0.135 0.219 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 1.08e-01 0.185 0.114 0.219 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00198 0.123 0.219 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 3.83e-01 -0.106 0.121 0.219 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 6.67e-01 0.054 0.125 0.219 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.12e-01 -0.106 0.0845 0.219 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.77e-02 -0.175 0.105 0.237 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 8.04e-02 -0.173 0.0987 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.64e-01 0.0166 0.0552 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.61e-01 0.113 0.0999 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0994 0.111 0.237 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0834 0.085 0.237 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.96e-01 -0.058 0.0851 0.237 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.76e-01 0.0775 0.071 0.237 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 7.28e-01 0.0367 0.105 0.235 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.91e-01 0.0861 0.1 0.235 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0341 0.0778 0.235 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 4.20e-01 0.0748 0.0926 0.235 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0051 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.89e-02 0.195 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 8.38e-01 0.0172 0.0838 0.235 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 8.59e-01 -0.012 0.0671 0.235 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0509 0.1 0.239 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0143 0.106 0.239 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.25e-01 0.0263 0.0746 0.239 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.63e-01 -0.119 0.106 0.239 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 5.28e-01 0.0597 0.0944 0.239 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 5.13e-01 -0.054 0.0823 0.239 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0412 0.0732 0.239 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0558 0.111 0.239 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.25e-01 0.0962 0.079 0.239 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0405 0.0993 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0389 0.09 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.29e-01 0.0236 0.068 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 5.92e-01 0.055 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.42e-01 0.0502 0.0527 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 4.95e-01 0.0587 0.086 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.64e-01 0.0595 0.0811 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.46e-01 -0.111 0.0951 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 3.64e-01 0.0931 0.102 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 2.04e-01 0.121 0.0945 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0133 0.075 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0771 0.111 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 6.50e-01 0.0352 0.0773 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0218 0.0924 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0741 0.0878 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0758 0.0948 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 7.30e-01 0.0424 0.123 0.242 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0747 0.125 0.242 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0601 0.117 0.242 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0706 0.116 0.242 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 6.18e-01 0.0684 0.137 0.242 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 1.83e-01 0.181 0.135 0.242 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.60e-02 0.225 0.126 0.242 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.22e-01 0.107 0.108 0.242 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.10e-01 0.0113 0.0997 0.236 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 6.32e-01 0.0467 0.0974 0.236 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 4.27e-01 0.0808 0.101 0.236 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 8.91e-01 0.0146 0.106 0.236 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0954 0.0897 0.236 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.36e-01 0.0675 0.109 0.236 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.43e-01 0.00819 0.114 0.236 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.76e-01 -0.102 0.0938 0.236 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 3.24e-01 0.0933 0.0943 0.242 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 4.33e-01 0.0721 0.0917 0.242 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0251 0.0979 0.242 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.60e-01 0.0441 0.1 0.242 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0365 0.0674 0.242 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 1.85e-02 0.253 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 2.63e-01 0.108 0.0959 0.242 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.61e-01 0.118 0.104 0.242 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0542 0.115 0.251 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.83e-01 0.0608 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.33e-01 0.0252 0.0735 0.251 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 1.73e-01 -0.154 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 3.02e-01 0.111 0.107 0.251 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.59e-01 0.062 0.0834 0.251 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0153 0.0728 0.251 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 2.91e-01 -0.117 0.11 0.251 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.39e-01 0.0671 0.0699 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.68e-01 0.149 0.108 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0543 0.0929 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.10e-01 0.0272 0.0731 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0448 0.0922 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0471 0.0659 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0752 0.0956 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 7.51e-01 0.0318 0.1 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 7.46e-01 0.0287 0.0886 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0927 0.0904 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 1.32e-01 -0.154 0.102 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 8.03e-01 0.025 0.1 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0291 0.0764 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0953 0.078 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.47e-01 0.0508 0.0667 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 987455 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0665 0.0816 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 5.32e-01 0.0696 0.111 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 2.33e-01 0.0795 0.0665 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0886 0.0938 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 9.31e-01 0.0082 0.0943 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00656 0.0873 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 8.71e-01 0.0106 0.0656 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 8.90e-01 -0.014 0.102 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 7.59e-01 0.0153 0.0496 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 6.44e-01 0.0375 0.081 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000472 0.0697 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 2.35e-01 -0.109 0.0918 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 5.19e-01 0.0575 0.0889 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 3.18e-01 0.0847 0.0846 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 4.86e-01 0.0612 0.0877 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 3.78e-01 0.0873 0.0988 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0426 0.0585 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 4.28e-02 0.215 0.105 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 4.03e-01 0.0762 0.0909 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0995 0.104 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -411549 sc-eQTL 7.47e-01 0.0307 0.095 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0718 0.0913 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -828422 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0734 0.0874 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -358080 sc-eQTL 3.35e-01 0.0839 0.0867 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 709996 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0362 0.0812 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 838875 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0129 0.0889 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 959883 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00633 0.107 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -355730 sc-eQTL 8.59e-01 0.0132 0.0743 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 710909 sc-eQTL 6.42e-01 0.029 0.0622 0.235 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -193834 eQTL 0.0338 -0.0742 0.0349 0.0 0.0 0.235
ENSG00000151131 C12orf45 959883 eQTL 0.0447 0.0389 0.0194 0.0 0.0 0.235
ENSG00000277715 AC079174.2 -304560 eQTL 0.0356 -0.0397 0.0189 0.0 0.0 0.235


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina