Genes within 1Mb (chr12:105933525:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.03e-01 0.0881 0.131 0.122 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.71e-01 0.0755 0.104 0.122 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 9.96e-01 0.000333 0.068 0.122 B L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.13e-01 -0.124 0.0996 0.122 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.75e-02 0.14 0.063 0.122 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 6.45e-01 0.0469 0.101 0.122 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0366 0.123 0.122 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0345 0.0816 0.122 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 3.13e-01 0.0883 0.0873 0.122 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0369 0.0962 0.122 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.16e-01 0.0345 0.0947 0.122 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 2.60e-02 -0.182 0.0812 0.122 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0255 0.0947 0.122 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0465 0.0933 0.122 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 8.12e-01 0.0307 0.129 0.122 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.51e-01 0.00519 0.0836 0.122 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0968 0.0719 0.122 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0268 0.113 0.122 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 1.46e-01 -0.165 0.113 0.122 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0913 0.0743 0.122 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 1.62e-02 0.255 0.105 0.122 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 4.19e-01 0.0963 0.119 0.122 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 1.77e-01 0.146 0.107 0.122 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 5.81e-01 0.0366 0.0661 0.122 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.05e-01 0.0117 0.0474 0.122 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.09e-01 -0.137 0.134 0.124 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.48e-01 -0.161 0.139 0.124 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 8.89e-01 0.013 0.0928 0.124 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.48e-01 0.16 0.138 0.124 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.66e-02 0.246 0.11 0.124 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 1.78e-01 -0.127 0.0943 0.124 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0044 0.0847 0.124 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 2.38e-02 0.313 0.138 0.124 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.73e-01 -0.00906 0.0568 0.124 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0698 0.113 0.122 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.71e-01 0.0787 0.109 0.122 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00482 0.0814 0.122 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 4.06e-01 -0.107 0.129 0.122 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.49e-01 0.0913 0.063 0.122 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.76e-01 0.0793 0.111 0.122 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 3.28e-01 0.0925 0.0943 0.122 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 2.16e-01 -0.153 0.123 0.122 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 1.90e-01 0.163 0.124 0.122 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 1.29e-01 0.185 0.122 0.122 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.64e-01 -0.129 0.115 0.122 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0591 0.111 0.122 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 1.17e-01 -0.172 0.109 0.122 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.00e-01 0.147 0.114 0.122 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.32e-01 -0.136 0.14 0.122 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.41e-01 0.078 0.101 0.122 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 5.28e-01 0.0523 0.0828 0.122 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.78e-01 0.00381 0.14 0.122 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 1.77e-01 -0.133 0.0981 0.122 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 3.74e-01 0.0784 0.0879 0.122 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.60e-01 0.0351 0.115 0.122 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.89e-01 0.0604 0.151 0.122 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.93e-01 0.0907 0.106 0.122 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.20e-01 0.0871 0.108 0.122 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0104 0.0882 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 2.28e-02 0.327 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 5.74e-01 0.0827 0.147 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 7.09e-01 0.0514 0.137 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.89e-01 -0.165 0.155 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.68e-01 0.0633 0.147 0.125 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0848 0.11 0.125 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.08e-01 0.127 0.153 0.125 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.93e-01 0.00128 0.153 0.125 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 1.90e-01 0.194 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0546 0.148 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.83e-01 0.092 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0753 0.109 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.10e-01 0.0484 0.13 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.62e-01 0.157 0.112 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 1.74e-01 0.168 0.123 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00589 0.143 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.08e-01 0.0147 0.127 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 3.83e-01 -0.116 0.133 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.30e-01 0.0129 0.147 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.68e-01 0.0409 0.139 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 3.56e-01 -0.115 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 6.27e-01 0.0653 0.134 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 5.28e-01 0.07 0.111 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 1.44e-01 0.19 0.129 0.123 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.09e-01 0.0172 0.15 0.123 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 7.11e-01 -0.046 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 9.05e-01 0.0136 0.114 0.123 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.23e-01 0.0484 0.137 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.50e-01 -0.153 0.133 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0445 0.103 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 3.09e-01 -0.117 0.115 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 8.18e-02 0.18 0.103 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 6.11e-01 0.061 0.12 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.14e-02 -0.289 0.148 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0351 0.101 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 4.05e-01 0.111 0.132 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 2.27e-01 0.179 0.148 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.89e-01 0.0352 0.132 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 1.22e-02 0.32 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.50e-01 -0.142 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 7.87e-02 0.195 0.11 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 2.61e-01 -0.131 0.116 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0883 0.158 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.109 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 4.60e-02 0.271 0.135 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.07e-01 -0.145 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 9.16e-01 0.0158 0.15 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 3.39e-01 0.112 0.117 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00497 0.146 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 8.21e-01 0.0317 0.14 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 1.60e-01 0.198 0.14 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 6.64e-01 0.0644 0.148 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0319 0.0849 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.95e-01 0.0573 0.108 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 6.74e-02 0.186 0.101 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 1.69e-01 -0.127 0.0921 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0246 0.0986 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0928 0.097 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.21e-01 0.141 0.142 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 5.65e-01 0.0533 0.0925 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 4.81e-02 -0.249 0.125 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.46e-01 0.00811 0.12 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0877 0.126 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 6.18e-02 -0.165 0.0876 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0234 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 7.46e-01 0.0384 0.118 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0105 0.146 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0352 0.0972 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0159 0.0963 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.31e-02 -0.251 0.149 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0451 0.137 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.81e-01 0.0829 0.117 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.60e-01 0.0394 0.129 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 7.63e-01 -0.044 0.145 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.77e-01 -0.125 0.141 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.47e-01 0.0896 0.117 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00932 0.0944 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 6.41e-01 0.0637 0.136 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 3.08e-01 -0.131 0.128 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 8.31e-01 -0.026 0.121 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.03e-03 0.307 0.113 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 8.28e-01 0.0277 0.127 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.89e-01 0.0811 0.15 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0478 0.13 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.39e-01 0.0196 0.0962 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0935 0.126 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.24e-01 -0.108 0.135 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 3.71e-01 -0.101 0.113 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.30e-02 0.207 0.115 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.68e-01 0.139 0.125 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 8.19e-02 0.234 0.134 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.1 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 6.31e-01 0.0518 0.108 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0507 0.148 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.03e-01 -0.181 0.142 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 2.77e-02 -0.283 0.127 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 4.61e-01 0.107 0.145 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.73e-01 0.199 0.145 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 7.33e-02 -0.278 0.154 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 2.22e-02 -0.283 0.123 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0298 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.65e-01 -0.133 0.146 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0701 0.14 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.25e-01 -0.108 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 5.23e-01 0.0949 0.148 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.86e-01 0.203 0.153 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.63e-01 -0.11 0.149 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.02e-01 0.0173 0.14 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0239 0.114 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 1.58e-01 0.196 0.138 0.123 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.81e-02 -0.242 0.122 0.123 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.10e-01 0.103 0.124 0.123 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 5.84e-01 0.0729 0.133 0.123 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0429 0.157 0.123 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.35e-01 0.136 0.14 0.123 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 1.17e-01 0.198 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 5.79e-01 0.0586 0.105 0.123 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.79e-01 0.126 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 3.36e-01 0.12 0.125 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 1.14e-01 -0.245 0.154 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 1.95e-01 -0.152 0.117 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 1.26e-01 -0.213 0.139 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.16e-01 0.226 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0264 0.156 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.65e-02 0.248 0.148 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.20e-01 0.0308 0.135 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 6.40e-01 0.0597 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 2.37e-01 0.147 0.124 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 1.32e-01 -0.192 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0755 0.128 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 6.14e-02 -0.214 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 9.20e-01 0.0127 0.126 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0833 0.151 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.50e-01 0.0848 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 3.66e-01 0.0821 0.0907 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.54e-02 -0.249 0.148 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 3.65e-01 -0.132 0.146 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 8.16e-01 0.0356 0.153 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.46e-01 -0.103 0.134 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.66e-01 -0.165 0.148 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.05e-01 0.0795 0.153 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.47e-01 0.118 0.154 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0523 0.152 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0225 0.111 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0913 0.142 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 3.61e-02 0.274 0.13 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0278 0.135 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 5.57e-01 0.0765 0.13 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.23e-01 0.168 0.137 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 3.03e-01 0.137 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 1.14e-01 -0.232 0.146 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.56e-01 0.0869 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 4.63e-01 0.0718 0.0976 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 2.78e-01 0.196 0.18 0.122 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 5.50e-01 0.0966 0.161 0.122 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0143 0.101 0.122 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.88e-01 0.0495 0.183 0.122 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0952 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 3.79e-01 0.146 0.166 0.122 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.05e-01 0.137 0.164 0.122 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 1.51e-01 -0.243 0.168 0.122 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0448 0.115 0.122 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 2.76e-01 -0.158 0.145 0.12 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 3.85e-01 0.119 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0333 0.0758 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0502 0.138 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 4.64e-01 0.112 0.153 0.12 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.69e-02 0.222 0.116 0.12 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 8.31e-01 0.025 0.117 0.12 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 3.68e-01 -0.088 0.0975 0.12 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 4.22e-01 0.116 0.144 0.122 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.73e-01 -0.151 0.138 0.122 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0889 0.107 0.122 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.33e-01 -0.152 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.26e-02 0.263 0.14 0.122 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 2.38e-01 -0.168 0.142 0.122 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 9.58e-01 0.00601 0.115 0.122 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0805 0.092 0.122 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.34e-01 0.0469 0.138 0.124 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0436 0.146 0.124 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0119 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 9.18e-01 0.0149 0.146 0.124 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.57e-01 0.147 0.129 0.124 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0456 0.113 0.124 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0524 0.101 0.124 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 1.32e-01 0.23 0.152 0.124 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 1.17e-01 -0.171 0.108 0.124 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.96e-01 -0.116 0.137 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 7.46e-01 0.0403 0.124 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0496 0.0939 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 1.53e-01 -0.202 0.141 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.90e-01 0.0955 0.0726 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.14e-01 -0.119 0.118 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 2.57e-01 0.127 0.112 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.18e-02 -0.229 0.131 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00816 0.14 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 5.37e-01 0.0798 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 4.23e-01 0.0817 0.102 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.21e-01 0.185 0.151 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 4.85e-01 0.0735 0.105 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 2.19e-01 0.155 0.125 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 5.08e-01 0.0792 0.119 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0699 0.129 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 1.06e-01 -0.272 0.168 0.124 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 6.85e-01 0.0698 0.172 0.124 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 8.69e-01 0.0265 0.161 0.124 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 4.16e-01 -0.13 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 3.25e-01 0.185 0.188 0.124 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0671 0.187 0.124 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0757 0.175 0.124 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0265 0.148 0.124 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.99e-01 0.0729 0.138 0.12 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0907 0.135 0.12 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 2.01e-01 -0.18 0.14 0.12 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 9.39e-02 -0.247 0.147 0.12 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0951 0.125 0.12 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 6.43e-01 0.0701 0.151 0.12 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 3.72e-01 0.141 0.158 0.12 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 2.20e-01 -0.16 0.13 0.12 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0859 0.126 0.124 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.22e-01 0.149 0.122 0.124 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 7.67e-01 0.0388 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 3.12e-01 0.135 0.133 0.124 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.79e-01 0.0974 0.0898 0.124 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00679 0.144 0.124 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 5.29e-01 0.0809 0.128 0.124 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 8.06e-01 0.0344 0.14 0.124 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 7.10e-02 -0.294 0.162 0.13 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.54e-01 -0.18 0.157 0.13 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0887 0.105 0.13 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 4.60e-01 0.119 0.161 0.13 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00284 0.153 0.13 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 9.44e-02 -0.199 0.118 0.13 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 3.62e-01 0.0946 0.104 0.13 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 1.60e-01 0.221 0.156 0.13 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 7.19e-01 -0.036 0.0999 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 8.42e-01 0.0291 0.146 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 2.62e-01 0.14 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 1.65e-01 -0.137 0.0981 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 9.83e-01 0.00268 0.124 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 1.01e-01 0.146 0.0883 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 1.63e-01 0.18 0.128 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00888 0.135 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 8.86e-01 0.0171 0.119 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0787 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.19e-01 0.0897 0.139 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 1.12e-01 -0.216 0.135 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 5.83e-01 0.0569 0.103 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 1.01e-01 -0.174 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 2.58e-02 0.201 0.0894 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 974781 sc-eQTL 9.01e-01 0.0138 0.111 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 2.21e-01 -0.184 0.15 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 3.30e-01 -0.088 0.0902 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 7.41e-02 0.227 0.126 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0854 0.129 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 4.40e-01 0.0924 0.119 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0106 0.0898 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0506 0.139 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 6.16e-02 0.127 0.0674 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 7.70e-01 0.0324 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 2.02e-01 0.122 0.0951 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 2.56e-01 -0.143 0.126 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.64e-01 -0.112 0.123 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 3.23e-01 0.116 0.117 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0397 0.121 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.78e-01 -0.148 0.136 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 4.91e-01 0.0557 0.0807 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 5.27e-01 0.0929 0.147 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 3.42e-01 0.119 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 9.08e-01 0.0166 0.143 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -424223 sc-eQTL 3.83e-01 0.112 0.128 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 sc-eQTL 1.03e-01 0.201 0.123 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -841096 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0564 0.118 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -370754 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0214 0.117 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 697322 sc-eQTL 2.09e-01 -0.138 0.109 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 826201 sc-eQTL 5.61e-01 0.07 0.12 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 947209 sc-eQTL 4.27e-01 -0.115 0.145 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -368404 sc-eQTL 4.28e-01 0.0796 0.1 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 698235 sc-eQTL 4.87e-01 0.0584 0.0839 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -206508 eQTL 0.015 0.12 0.0491 0.0 0.0 0.106
ENSG00000235162 C12orf75 698235 eQTL 0.00663 0.0801 0.0294 0.0 0.0 0.106


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -424223 1.25e-06 9.33e-07 1.85e-07 1.11e-06 1.81e-07 5.32e-07 1.58e-06 2.74e-07 1.12e-06 3.13e-07 1.24e-06 5.51e-07 2.13e-06 2.73e-07 4.91e-07 5.29e-07 8.4e-07 5.67e-07 4.65e-07 4.95e-07 2.83e-07 8.66e-07 8.76e-07 5.79e-07 2.25e-06 2.34e-07 6.16e-07 5.33e-07 1.33e-06 1.08e-06 4.65e-07 4.53e-08 5.82e-08 4.54e-07 4.4e-07 3e-07 2.94e-07 1.21e-07 3.79e-07 3.08e-07 1.17e-07 1.61e-06 1.08e-07 1.21e-08 2.03e-07 7.57e-08 1.45e-07 4.41e-08 8.09e-08
ENSG00000235162 C12orf75 698235 5.74e-07 3.47e-07 6.57e-08 3.66e-07 1.02e-07 1.71e-07 5.2e-07 6.72e-08 2.38e-07 1.37e-07 2.47e-07 1.57e-07 6.47e-07 1.01e-07 1.45e-07 1.14e-07 8.53e-08 2.75e-07 1.36e-07 7.29e-08 1.39e-07 2.3e-07 3.02e-07 9.01e-08 6.02e-07 1.71e-07 1.57e-07 1.7e-07 3.56e-07 2.59e-07 1.59e-07 4.51e-08 4.23e-08 1.18e-07 2.15e-07 5.14e-08 6.95e-08 6.78e-08 4e-08 2.53e-08 5.1e-08 6.27e-07 2.16e-08 1.99e-08 3.71e-08 9.31e-09 8.93e-08 0.0 5.05e-08