Genes within 1Mb (chr12:105901712:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 2.33e-02 0.24 0.105 0.167 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.24e-02 -0.142 0.084 0.167 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 7.95e-01 0.0143 0.055 0.167 B L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.76e-01 -0.088 0.0806 0.167 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.57e-01 -0.00928 0.0515 0.167 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000529 0.0821 0.167 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00653 0.0992 0.167 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 4.07e-02 0.135 0.0654 0.167 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0379 0.0707 0.167 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.73e-01 0.0692 0.0775 0.167 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.55e-01 0.0239 0.0765 0.167 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.12e-01 0.0544 0.0662 0.167 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.82e-02 -0.179 0.0754 0.167 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.67e-01 -0.104 0.075 0.167 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 4.27e-01 0.0829 0.104 0.167 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 3.94e-01 0.0576 0.0674 0.167 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 2.35e-01 0.0693 0.0581 0.167 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0981 0.0925 0.167 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 1.85e-01 -0.124 0.0929 0.167 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0467 0.0612 0.167 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 9.89e-02 -0.145 0.0872 0.167 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 5.17e-01 0.0636 0.0979 0.167 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0517 0.0886 0.167 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 9.76e-01 0.00161 0.0544 0.167 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.17e-01 0.039 0.0389 0.167 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 1.69e-01 0.157 0.114 0.167 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 1.99e-02 0.274 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 8.98e-01 0.0101 0.0786 0.167 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.05e-01 -0.149 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0217 0.0946 0.167 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0382 0.0802 0.167 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0416 0.0717 0.167 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0684 0.118 0.167 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.69e-03 0.125 0.0473 0.167 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0528 0.0926 0.167 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 5.96e-01 0.0472 0.0889 0.167 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0595 0.0663 0.167 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0555 0.105 0.167 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.33e-02 -0.127 0.0509 0.167 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 6.85e-02 0.165 0.09 0.167 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0121 0.0771 0.167 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 6.34e-01 -0.048 0.101 0.167 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0377 0.102 0.167 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 8.95e-01 0.0133 0.1 0.167 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 2.59e-01 -0.107 0.0946 0.167 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 6.47e-01 0.0418 0.0911 0.167 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0686 0.0898 0.167 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.25e-01 -0.144 0.0933 0.167 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 7.03e-01 0.0439 0.115 0.167 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.12e-01 0.0307 0.083 0.167 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.94e-01 0.000553 0.068 0.167 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0391 0.114 0.167 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0546 0.0797 0.167 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.90e-01 0.000924 0.0713 0.167 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.35e-01 -0.11 0.0926 0.167 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 3.95e-01 -0.104 0.122 0.167 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.99e-01 0.11 0.0856 0.167 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 2.68e-01 0.0969 0.0872 0.167 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.83e-01 0.0624 0.0713 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 7.96e-02 -0.207 0.117 0.176 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.49e-01 0.0385 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 1.60e-01 0.158 0.112 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 3.87e-01 -0.11 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 3.29e-01 -0.117 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0392 0.09 0.176 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 4.09e-01 0.103 0.125 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 2.21e-01 -0.153 0.125 0.176 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0125 0.121 0.176 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.83e-03 0.32 0.121 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 6.28e-02 -0.203 0.108 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0323 0.0911 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.85e-02 -0.19 0.108 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 6.71e-01 0.0398 0.0937 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 3.57e-01 0.0948 0.103 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00668 0.111 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 4.08e-02 0.243 0.118 0.166 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0421 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.74e-01 0.00323 0.101 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.93e-01 0.0285 0.109 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.21e-01 -0.139 0.0892 0.166 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 3.03e-01 -0.108 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 2.07e-02 0.28 0.12 0.166 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.00e-02 0.175 0.0994 0.166 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0826 0.092 0.166 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.90e-02 0.209 0.11 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.90e-02 -0.19 0.108 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0724 0.0837 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0357 0.0938 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 7.47e-01 0.0272 0.0844 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 6.67e-01 0.042 0.0976 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 3.94e-01 0.103 0.121 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.22e-01 0.0185 0.0823 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 2.73e-01 0.118 0.108 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 6.68e-01 0.0508 0.118 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.76e-01 0.00316 0.105 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 1.34e-02 -0.252 0.101 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 8.31e-01 -0.021 0.0981 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 9.84e-02 -0.146 0.0881 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 8.22e-01 -0.021 0.0931 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0565 0.126 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 3.33e-01 0.0847 0.0872 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0989 0.108 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0761 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0964 0.122 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 2.24e-01 0.116 0.0954 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 6.03e-04 -0.403 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0218 0.114 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 6.50e-01 0.0523 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 5.32e-01 0.0756 0.121 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 6.08e-01 0.0356 0.0693 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 2.21e-01 0.107 0.0869 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.09e-01 0.00945 0.0825 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 6.44e-01 0.0346 0.0749 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.16e-01 -0.125 0.0794 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0968 0.0784 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00279 0.115 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.15e-01 0.0176 0.075 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 1.71e-01 0.14 0.102 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.45e-01 0.0193 0.0988 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0705 0.103 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.93e-01 0.0498 0.0725 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.00e-01 -0.155 0.0939 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.88e-01 -0.128 0.0969 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 9.36e-01 0.0096 0.12 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 5.76e-03 0.219 0.0785 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 7.81e-01 0.022 0.0791 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.124 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 1.29e-01 0.172 0.113 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0972 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 8.39e-01 0.0217 0.106 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 5.34e-01 0.0748 0.12 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 2.92e-01 0.123 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.97e-01 0.025 0.0973 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.10e-02 0.136 0.0775 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.84e-02 -0.212 0.111 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0629 0.105 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0571 0.0998 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.91e-01 -0.123 0.094 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 3.29e-01 0.102 0.104 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.60e-01 -0.072 0.123 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 1.24e-01 0.165 0.107 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00533 0.0792 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.27e-01 0.0231 0.106 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00995 0.112 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0628 0.094 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.99e-01 -0.124 0.0964 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0982 0.105 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0157 0.113 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.25e-01 0.0186 0.0841 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.15e-01 0.0211 0.09 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 7.29e-01 0.0425 0.123 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 2.66e-01 0.131 0.117 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 7.81e-01 0.0297 0.107 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 4.94e-01 0.0823 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 3.97e-01 0.103 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 3.16e-01 -0.129 0.129 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0023 0.103 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 2.54e-01 0.13 0.114 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 4.30e-01 0.0972 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.28e-03 -0.304 0.116 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.96e-01 0.000512 0.113 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 3.27e-01 0.122 0.124 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0288 0.129 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 4.96e-01 0.0857 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.45e-01 -0.023 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.11e-01 0.0108 0.0961 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.78e-01 0.0633 0.114 0.167 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0214 0.101 0.167 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 5.42e-01 0.0623 0.102 0.167 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0208 0.109 0.167 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 4.43e-01 0.0985 0.128 0.167 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.00e-01 0.0779 0.115 0.167 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 1.14e-01 0.164 0.103 0.167 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.00e-01 0.0896 0.0863 0.167 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.20e-01 0.115 0.116 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0455 0.101 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.28e-01 0.0115 0.126 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 8.15e-01 0.0223 0.095 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.55e-01 -0.129 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.09e-02 -0.295 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 8.99e-01 -0.016 0.127 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0307 0.121 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 7.15e-01 -0.04 0.109 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 2.90e-01 -0.11 0.104 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 6.93e-01 0.04 0.101 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.84e-01 0.0152 0.104 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.87e-01 0.0725 0.104 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0238 0.0936 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.04e-01 -0.13 0.102 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 8.17e-01 0.0285 0.123 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 6.09e-01 0.0468 0.0913 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 2.72e-01 0.0813 0.0738 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 7.90e-01 0.0304 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 3.38e-02 -0.253 0.118 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.35e-02 0.176 0.104 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0517 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 5.30e-01 0.0752 0.12 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0804 0.12 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 9.35e-01 0.00962 0.118 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.22e-01 0.0195 0.0866 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0814 0.116 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 5.82e-01 0.0591 0.107 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0213 0.11 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 8.78e-01 0.0163 0.106 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.42e-01 -0.037 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 9.95e-01 0.000638 0.109 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.86e-01 0.159 0.12 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 2.37e-01 -0.112 0.0947 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.02e-01 -0.02 0.0798 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 5.83e-01 0.0836 0.152 0.17 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 3.00e-01 -0.141 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0849 0.0849 0.17 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.75e-01 -0.209 0.153 0.17 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0376 0.131 0.17 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0999 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 3.58e-01 -0.127 0.137 0.17 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0413 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0347 0.0965 0.17 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.40e-01 -0.024 0.119 0.167 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 1.94e-01 -0.145 0.111 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0908 0.0616 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.61e-01 0.0342 0.112 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 1.49e-01 -0.18 0.124 0.167 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0461 0.0955 0.167 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.84e-01 0.0263 0.0955 0.167 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 4.23e-02 0.161 0.079 0.167 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 9.86e-01 0.00207 0.119 0.167 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.02e-01 0.0286 0.114 0.167 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 8.65e-01 0.0151 0.0882 0.167 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.01e-01 -0.172 0.105 0.167 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.57e-01 -0.132 0.117 0.167 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.85e-01 0.156 0.117 0.167 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0253 0.0951 0.167 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.13e-02 0.132 0.0755 0.167 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.90e-01 0.0995 0.115 0.171 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 6.64e-01 0.0531 0.122 0.171 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 9.58e-01 0.0045 0.086 0.171 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 9.86e-01 0.00214 0.122 0.171 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 7.53e-01 0.0343 0.109 0.171 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0607 0.0949 0.171 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.20e-01 -0.131 0.0839 0.171 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 1.42e-01 -0.188 0.127 0.171 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0186 0.0915 0.171 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.11 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.42e-01 -0.02 0.1 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0855 0.0754 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0436 0.114 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0406 0.0586 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.85e-01 0.127 0.0952 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 6.23e-01 0.0444 0.0902 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00292 0.106 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 4.03e-01 0.0946 0.113 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 9.48e-01 0.00682 0.105 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 2.61e-01 -0.093 0.0824 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 1.95e-01 -0.159 0.122 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0919 0.0851 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 6.54e-01 0.0457 0.102 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0816 0.0968 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 6.22e-01 0.0517 0.105 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0329 0.134 0.173 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.86e-02 -0.239 0.135 0.173 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 7.50e-01 0.041 0.128 0.173 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.25e-01 -0.154 0.126 0.173 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.72e-01 0.0242 0.15 0.173 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 9.75e-03 0.381 0.146 0.173 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 9.38e-02 0.233 0.138 0.173 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 8.80e-01 0.0178 0.118 0.173 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0323 0.111 0.164 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 1.48e-02 0.263 0.107 0.164 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 2.50e-01 0.13 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 8.03e-01 0.0297 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 4.61e-02 -0.199 0.0993 0.164 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 2.78e-01 0.132 0.121 0.164 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 5.71e-02 -0.241 0.126 0.164 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.40e-01 0.00784 0.105 0.164 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000382 0.108 0.165 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0198 0.105 0.165 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 1.89e-01 0.146 0.111 0.165 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0299 0.114 0.165 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.20e-02 -0.175 0.0758 0.165 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 7.22e-01 0.044 0.123 0.165 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 7.64e-01 -0.033 0.11 0.165 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.29e-01 0.0106 0.119 0.165 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.98e-01 0.111 0.131 0.175 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 2.03e-01 0.161 0.126 0.175 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 7.97e-01 0.0217 0.084 0.175 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.129 0.175 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 7.48e-01 0.0395 0.122 0.175 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.095 0.175 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 7.03e-01 0.0318 0.0831 0.175 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0879 0.126 0.175 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 2.36e-02 0.18 0.0787 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 9.29e-03 0.31 0.118 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0787 0.103 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0179 0.0811 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0534 0.102 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0351 0.0731 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0804 0.106 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.111 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 3.81e-01 0.086 0.0981 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0899 0.1 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 8.12e-02 0.196 0.112 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 2.68e-01 -0.122 0.11 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.43e-02 -0.168 0.0832 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0129 0.0861 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0393 0.0734 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 942968 sc-eQTL 7.09e-01 0.0336 0.0898 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0285 0.122 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 6.75e-01 0.0308 0.0733 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 6.39e-01 0.0485 0.103 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 3.93e-01 -0.089 0.104 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0356 0.0964 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0807 0.0722 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0898 0.112 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 5.90e-02 -0.103 0.0544 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.79e-01 0.12 0.0892 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 9.88e-01 0.00118 0.0771 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0125 0.102 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 9.95e-01 0.000623 0.0994 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 3.35e-02 0.2 0.0936 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 1.63e-01 0.137 0.0976 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 9.02e-01 0.0137 0.11 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 8.71e-03 -0.17 0.0643 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 1.53e-01 0.17 0.118 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 2.96e-01 -0.106 0.101 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 3.15e-01 -0.117 0.116 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -456036 sc-eQTL 6.34e-01 -0.05 0.105 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -238321 sc-eQTL 8.98e-01 0.0129 0.101 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -872909 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0797 0.0965 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -402567 sc-eQTL 4.74e-01 0.0687 0.0958 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 665509 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0321 0.0896 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 794388 sc-eQTL 2.88e-01 -0.104 0.0979 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 915396 sc-eQTL 5.48e-01 0.0712 0.118 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -400217 sc-eQTL 6.21e-01 0.0406 0.0819 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 666422 sc-eQTL 7.54e-01 0.0215 0.0686 0.168 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -456036 9.39e-07 6.09e-07 1.45e-07 3.87e-07 1.09e-07 2.42e-07 6.06e-07 2.21e-07 6.71e-07 3.04e-07 9.07e-07 4.75e-07 9.23e-07 1.52e-07 2.86e-07 3.35e-07 4.73e-07 4.27e-07 2.79e-07 2.02e-07 2.61e-07 5.2e-07 4.13e-07 2.29e-07 8.99e-07 2.41e-07 4e-07 2.74e-07 4.88e-07 6.03e-07 3.38e-07 6.31e-08 5.71e-08 2.04e-07 3.34e-07 1.71e-07 1.31e-07 1.06e-07 7.63e-08 2.17e-08 1.17e-07 5.52e-07 4.18e-08 1.8e-08 1.45e-07 1.39e-08 1.13e-07 1.79e-08 6.17e-08