Genes within 1Mb (chr12:105892745:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.17e-02 0.258 0.112 0.15 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.96e-02 -0.176 0.089 0.15 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 8.22e-01 0.0131 0.0584 0.15 B L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0764 0.0857 0.15 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00201 0.0547 0.15 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0295 0.0871 0.15 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 4.15e-01 0.086 0.105 0.15 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.79e-01 0.0942 0.0698 0.15 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0234 0.0751 0.15 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.31e-01 0.0521 0.0829 0.15 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 6.52e-01 0.0369 0.0817 0.15 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.35e-01 0.0841 0.0707 0.15 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 7.33e-02 -0.146 0.0811 0.15 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0732 0.0803 0.15 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.111 0.15 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.37e-01 0.0242 0.0721 0.15 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 5.58e-01 0.0365 0.0623 0.15 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0696 0.0996 0.15 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0685 0.1 0.15 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0491 0.0658 0.15 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0981 0.0941 0.15 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 9.39e-01 0.00802 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0354 0.0953 0.15 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 9.23e-01 0.00566 0.0584 0.15 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.95e-01 0.0286 0.0418 0.15 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.56e-01 0.171 0.12 0.151 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.39e-02 0.264 0.124 0.151 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.53e-01 0.0374 0.0831 0.151 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 2.00e-01 -0.159 0.124 0.151 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 4.23e-01 0.0803 0.1 0.151 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00564 0.0849 0.151 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0523 0.0759 0.151 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.91e-01 -0.163 0.124 0.151 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 2.44e-03 0.153 0.0497 0.151 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0303 0.0987 0.15 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 9.92e-01 0.000893 0.0948 0.15 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 5.16e-01 -0.046 0.0707 0.15 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0522 0.112 0.15 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.74e-02 -0.121 0.0544 0.15 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 9.90e-02 0.159 0.096 0.15 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.13e-01 0.0195 0.0821 0.15 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 8.55e-01 0.0196 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0736 0.108 0.15 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 7.00e-01 0.041 0.106 0.15 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.65e-01 -0.14 0.1 0.15 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00975 0.0967 0.15 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.20e-01 0.0218 0.0954 0.15 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0971 0.0993 0.15 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.64e-01 0.0209 0.122 0.15 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0262 0.0881 0.15 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.33e-01 0.0345 0.0721 0.15 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 9.90e-01 0.00147 0.121 0.15 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0971 0.0848 0.15 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 7.56e-01 0.0237 0.076 0.15 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0244 0.099 0.15 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0476 0.13 0.15 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.12e-01 0.114 0.0912 0.15 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 4.17e-01 0.0756 0.093 0.15 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 2.09e-01 0.0956 0.0758 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.05e-01 -0.157 0.123 0.156 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 5.92e-01 0.0674 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.10e-01 0.147 0.117 0.156 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.38e-01 -0.103 0.132 0.156 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.28e-01 -0.152 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0669 0.094 0.156 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.74e-01 0.143 0.13 0.156 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 2.89e-01 -0.139 0.131 0.156 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0203 0.127 0.156 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.50e-03 0.387 0.127 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.93e-02 -0.236 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0464 0.0957 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.12e-02 -0.232 0.113 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.92e-01 0.104 0.0982 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 2.74e-01 0.118 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.96e-01 0.106 0.125 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 6.70e-01 0.0475 0.111 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 9.70e-01 0.00434 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.23e-01 0.194 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0143 0.119 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.81e-01 0.0439 0.106 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 7.31e-01 0.0395 0.115 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 6.21e-02 -0.177 0.0942 0.149 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 2.27e-01 -0.135 0.111 0.149 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.27e-02 0.274 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.106 0.149 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0707 0.0974 0.149 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.63e-01 0.165 0.118 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 6.22e-02 -0.215 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0592 0.0891 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.28e-01 0.00899 0.0999 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 8.62e-01 0.0157 0.0898 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 8.83e-01 0.0153 0.104 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.72e-01 0.142 0.129 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0204 0.0876 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.115 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.46e-01 0.0754 0.125 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0173 0.111 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.12e-02 -0.202 0.107 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00213 0.104 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 1.62e-01 -0.131 0.0932 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0273 0.0983 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 9.42e-01 0.00971 0.133 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.23e-01 0.142 0.0919 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 1.69e-01 -0.158 0.114 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.20e-01 -0.149 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.77e-01 -0.113 0.128 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.51e-01 0.115 0.1 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 7.70e-04 -0.415 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0626 0.12 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 9.14e-01 -0.013 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 4.16e-01 0.103 0.127 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.27e-01 0.0354 0.0727 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 8.79e-01 0.0141 0.093 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 7.04e-01 0.0335 0.088 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.32e-01 0.0383 0.0798 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0765 0.085 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0519 0.0839 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 7.14e-01 0.0449 0.122 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.81e-01 -0.012 0.08 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.33e-01 0.0522 0.109 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 4.89e-01 0.073 0.105 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.51e-01 -0.103 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 3.15e-01 0.0778 0.0772 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 2.06e-01 -0.127 0.1 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 1.32e-01 -0.156 0.103 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 6.89e-01 0.0514 0.128 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.43e-02 0.207 0.084 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0239 0.0843 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.04e-01 0.0879 0.131 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 2.02e-01 0.153 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 7.11e-01 0.0382 0.103 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.14e-01 0.0266 0.113 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 5.35e-01 0.0792 0.127 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.76e-01 0.135 0.123 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0362 0.103 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 1.45e-01 0.12 0.0823 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.74e-02 -0.261 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0299 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.10e-01 -0.054 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.36e-02 -0.167 0.0993 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 8.51e-01 0.0209 0.111 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0168 0.131 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 2.51e-01 0.13 0.113 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0172 0.0838 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.57e-01 0.16 0.113 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.59e-01 0.11 0.12 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0254 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0245 0.104 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0725 0.112 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 7.81e-01 0.0337 0.121 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000268 0.09 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0455 0.0963 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 7.86e-01 0.0356 0.131 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.78e-01 0.0893 0.125 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0361 0.114 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 1.91e-01 0.167 0.128 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.37e-01 0.153 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.35e-01 -0.133 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.33e-01 0.0232 0.11 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.66e-01 0.0888 0.122 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.19e-01 0.0817 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 5.74e-02 -0.229 0.12 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0106 0.117 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.35e-01 0.1 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.133 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00492 0.129 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0421 0.121 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0447 0.0988 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.88e-01 0.129 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 8.36e-01 0.0222 0.107 0.149 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.64e-01 0.121 0.108 0.149 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.34e-01 0.0243 0.116 0.149 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 4.18e-01 0.111 0.136 0.149 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.46e-01 0.116 0.122 0.149 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.35e-01 0.165 0.11 0.149 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 2.61e-01 0.103 0.0917 0.149 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.76e-01 0.162 0.119 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0082 0.105 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 7.67e-01 0.0385 0.13 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0319 0.0981 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0283 0.117 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 5.39e-03 -0.333 0.118 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.22e-01 0.0294 0.131 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0148 0.125 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0644 0.113 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.109 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 4.73e-01 0.0769 0.107 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0227 0.11 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0172 0.11 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 6.53e-01 0.0445 0.0988 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0425 0.108 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 6.90e-01 0.0519 0.13 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0138 0.0965 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 1.83e-01 0.104 0.0779 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 3.84e-01 0.105 0.121 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 6.39e-01 0.0555 0.118 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 9.86e-02 -0.204 0.123 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 1.48e-01 0.157 0.108 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00903 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 8.47e-01 -0.024 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0747 0.125 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 9.22e-01 0.012 0.123 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 9.18e-01 0.00924 0.0899 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0268 0.121 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 5.15e-01 0.073 0.112 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0489 0.115 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00241 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.39e-01 0.0239 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 7.87e-01 0.0307 0.113 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.43e-01 0.119 0.125 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.95e-01 -0.128 0.0987 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 9.26e-01 0.00778 0.0832 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.67e-01 0.0983 0.171 0.144 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.87e-01 -0.201 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.15e-01 -0.119 0.0955 0.144 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 1.51e-01 -0.249 0.172 0.144 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 7.23e-01 0.0526 0.148 0.144 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0845 0.157 0.144 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0298 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0332 0.161 0.144 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0532 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.19e-01 -0.196 0.125 0.15 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 2.42e-02 -0.265 0.117 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.73e-01 -0.072 0.0656 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 5.91e-01 0.0642 0.119 0.15 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 1.03e-01 -0.216 0.132 0.15 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0427 0.101 0.15 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0331 0.101 0.15 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.73e-03 0.237 0.0831 0.15 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.09e-01 0.0842 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.15e-01 0.099 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0298 0.094 0.15 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 1.08e-01 -0.18 0.111 0.15 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 1.86e-01 -0.165 0.124 0.15 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 6.63e-02 0.23 0.124 0.15 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0194 0.101 0.15 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 7.11e-02 0.146 0.0805 0.15 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 1.99e-01 0.156 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 7.62e-01 0.039 0.128 0.156 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 4.26e-01 0.072 0.0902 0.156 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0583 0.128 0.156 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 4.16e-01 0.0931 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0527 0.0998 0.156 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 4.90e-02 -0.174 0.0878 0.156 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.37e-01 -0.2 0.134 0.156 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.79e-01 0.0681 0.096 0.156 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 3.02e-01 -0.121 0.117 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0379 0.106 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0881 0.0802 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0764 0.121 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 7.01e-01 0.024 0.0624 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.04e-01 0.129 0.101 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 4.19e-01 0.0776 0.0958 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 7.27e-01 0.0393 0.113 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 5.11e-01 0.0791 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00978 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0864 0.0877 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.20e-01 -0.105 0.13 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 8.65e-02 -0.155 0.0901 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.87e-01 0.0154 0.108 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 2.85e-01 0.119 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 9.08e-01 0.0162 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.44e-02 -0.343 0.138 0.152 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 8.84e-01 0.0194 0.133 0.152 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0955 0.131 0.152 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00711 0.155 0.152 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 1.60e-01 0.217 0.153 0.152 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.46e-01 0.209 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.122 0.152 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0598 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 3.22e-01 0.113 0.114 0.147 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00126 0.125 0.147 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.03e-02 -0.244 0.104 0.147 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 1.62e-01 0.179 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 5.40e-02 -0.257 0.133 0.147 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0131 0.11 0.147 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 8.35e-01 0.0232 0.111 0.152 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 2.86e-01 -0.115 0.108 0.152 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 1.50e-01 0.166 0.115 0.152 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00303 0.118 0.152 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 3.41e-02 -0.168 0.0786 0.152 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 8.76e-01 0.0199 0.127 0.152 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0989 0.113 0.152 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 8.91e-01 0.0169 0.123 0.152 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 8.07e-01 0.0329 0.135 0.158 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.43e-01 0.19 0.129 0.158 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 9.81e-01 0.00202 0.0865 0.158 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 2.40e-01 -0.156 0.132 0.158 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 6.33e-01 0.0603 0.126 0.158 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 3.45e-01 0.0928 0.098 0.158 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 5.42e-01 0.0522 0.0855 0.158 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 2.03e-01 -0.165 0.129 0.158 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 5.82e-03 0.225 0.0804 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 4.28e-03 0.36 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0743 0.109 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0042 0.086 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 5.55e-01 -0.064 0.108 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0147 0.0775 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0693 0.112 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 5.75e-02 0.223 0.117 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 9.01e-01 0.013 0.104 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 3.27e-01 -0.104 0.106 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 2.10e-01 0.151 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.44e-01 -0.172 0.117 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 1.08e-01 -0.144 0.0889 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 8.46e-01 0.0178 0.0917 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0333 0.0782 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 934001 sc-eQTL 9.35e-01 0.00777 0.0957 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 6.58e-01 0.0578 0.13 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.80e-01 0.0219 0.0781 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 9.82e-01 0.00254 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0982 0.111 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0555 0.102 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 3.24e-01 -0.076 0.0769 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0814 0.119 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 2.10e-01 -0.073 0.0581 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 2.02e-01 0.121 0.0949 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 7.12e-01 0.0303 0.0819 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 5.70e-01 0.0615 0.108 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 8.52e-01 0.0198 0.106 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 4.53e-01 0.0758 0.101 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 6.54e-02 0.192 0.104 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 1.00e+00 -2.63e-05 0.118 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 1.01e-02 -0.178 0.0686 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 3.06e-01 0.13 0.127 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 1.06e-01 -0.175 0.108 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0762 0.124 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -465003 sc-eQTL 3.60e-01 -0.102 0.111 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -247288 sc-eQTL 6.47e-01 0.049 0.107 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -881876 sc-eQTL 1.95e-01 -0.133 0.102 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -411534 sc-eQTL 8.15e-01 0.0238 0.102 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 656542 sc-eQTL 7.14e-01 0.0349 0.095 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 785421 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0571 0.104 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 906429 sc-eQTL 7.87e-01 0.0339 0.125 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -409184 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0207 0.0869 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 657455 sc-eQTL 4.58e-01 0.054 0.0726 0.151 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111785 \N -881876 2.67e-07 1.35e-07 3.88e-08 2.07e-07 9.25e-08 9.91e-08 1.53e-07 5.2e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.52e-07 8.55e-08 1.53e-07 7.64e-08 6.12e-08 7.17e-08 3.93e-08 1.21e-07 5.75e-08 4.45e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.44e-07 4.05e-08 1.63e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.12e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.89e-08 2.91e-08 8.25e-08 6.67e-08 3.76e-08 5.03e-08 9.62e-08 6.56e-08 3.76e-08 4.27e-08 1.52e-07 5.24e-08 2.17e-08 5.43e-08 1.99e-08 1.26e-07 4.26e-09 5.04e-08