Genes within 1Mb (chr12:105874474:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.68e-01 0.0846 0.116 0.135 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 9.21e-01 0.00923 0.0926 0.135 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0573 0.0601 0.135 B L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 4.93e-01 0.0607 0.0884 0.135 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 6.77e-01 0.0235 0.0564 0.135 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 1.08e-01 -0.144 0.0893 0.135 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.97e-02 -0.235 0.107 0.135 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.37e-02 -0.145 0.0716 0.135 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0296 0.0774 0.135 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 3.12e-02 0.181 0.0835 0.135 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 6.57e-01 0.0369 0.0831 0.135 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 2.12e-02 0.165 0.0712 0.135 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 2.83e-01 0.0892 0.0829 0.135 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.55e-01 0.0758 0.0818 0.135 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 3.39e-01 -0.108 0.113 0.135 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0266 0.0734 0.135 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0769 0.0632 0.135 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 1.13e-01 0.161 0.101 0.135 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 6.03e-01 0.0531 0.102 0.135 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 7.67e-01 0.0199 0.0671 0.135 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.29e-01 0.0464 0.096 0.135 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.24e-01 -0.106 0.107 0.135 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.48e-01 -0.112 0.0968 0.135 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 5.05e-01 0.0397 0.0594 0.135 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.60e-01 -0.048 0.0425 0.135 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0563 0.123 0.133 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 2.49e-01 -0.147 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0158 0.0847 0.133 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00891 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0162 0.102 0.133 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 6.81e-01 0.0356 0.0865 0.133 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0221 0.0774 0.133 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 3.35e-01 -0.123 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.60e-03 -0.155 0.0507 0.133 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.135 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 6.98e-02 -0.175 0.0959 0.135 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 2.96e-01 0.0754 0.072 0.135 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0498 0.114 0.135 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.63e-02 -0.111 0.0556 0.135 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 6.11e-01 0.0502 0.0985 0.135 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0437 0.0837 0.135 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 1.19e-02 0.273 0.108 0.135 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.135 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 8.24e-03 -0.284 0.107 0.135 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 4.35e-01 -0.08 0.102 0.135 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.44e-01 0.0931 0.0982 0.135 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.0971 0.135 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0272 0.101 0.135 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 6.06e-01 0.0642 0.124 0.135 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 8.24e-01 -0.02 0.0897 0.135 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0828 0.0732 0.135 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0952 0.124 0.135 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 3.30e-01 -0.085 0.087 0.135 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.25e-01 0.0621 0.0778 0.135 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0406 0.102 0.135 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0852 0.133 0.135 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 1.97e-01 -0.121 0.0935 0.135 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 2.47e-01 -0.111 0.0953 0.135 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 1.80e-01 -0.105 0.0777 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.123 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 9.12e-01 0.0138 0.125 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.15e-01 0.0953 0.117 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.85e-02 0.239 0.131 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 5.77e-01 -0.07 0.125 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0613 0.0935 0.138 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.22e-01 0.0463 0.13 0.138 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 1.08e-01 -0.209 0.129 0.138 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 8.06e-01 -0.031 0.126 0.138 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0996 0.135 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.14e-01 -0.044 0.12 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 9.87e-01 0.00157 0.0999 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 5.56e-01 -0.07 0.119 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 2.61e-01 -0.115 0.102 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 1.68e-01 -0.155 0.112 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 3.46e-01 -0.123 0.13 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.73e-01 0.049 0.116 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0369 0.121 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 8.94e-01 0.0182 0.137 0.129 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 4.39e-01 0.0997 0.129 0.129 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.116 0.129 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 8.99e-01 0.0159 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.14e-01 0.104 0.103 0.129 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0183 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0264 0.14 0.129 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 9.37e-01 0.00912 0.115 0.129 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0981 0.106 0.129 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0397 0.121 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0429 0.118 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0203 0.0913 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.34e-01 0.153 0.102 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 1.91e-01 0.12 0.0915 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 2.86e-01 -0.113 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 3.62e-02 -0.275 0.131 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0993 0.0893 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.98e-01 0.0994 0.117 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 1.56e-01 0.183 0.129 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.51e-01 0.0217 0.115 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 1.06e-01 0.181 0.112 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0435 0.107 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0998 0.0969 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0773 0.102 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 1.36e-01 -0.205 0.137 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 5.93e-02 -0.18 0.095 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 5.23e-01 0.0761 0.119 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.47e-01 0.0956 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0307 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0501 0.104 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.83e-01 -0.172 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.50e-01 0.0234 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 1.09e-01 0.199 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 9.94e-01 0.000971 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 9.53e-01 0.00442 0.0752 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 2.92e-01 0.1 0.0948 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 4.66e-01 0.0655 0.0898 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.54e-02 0.171 0.0807 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 5.85e-02 0.164 0.0863 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.70e-01 0.062 0.0857 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0959 0.125 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0673 0.0816 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 4.97e-01 0.0759 0.111 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000547 0.107 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 1.73e-01 0.152 0.111 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 1.80e-01 0.105 0.0781 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0568 0.102 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 1.06e-01 0.17 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.92e-01 -0.137 0.129 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0799 0.0861 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 8.51e-01 -0.016 0.0854 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 2.90e-01 0.14 0.132 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 2.32e-02 -0.274 0.12 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.07e-01 0.106 0.104 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.17e-01 0.057 0.114 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.38e-01 0.0999 0.128 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.51e-01 0.0235 0.125 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 9.05e-01 0.0124 0.104 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0117 0.0834 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.12e-03 0.352 0.121 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0716 0.116 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 1.38e-01 0.163 0.11 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 4.00e-01 0.0876 0.104 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0129 0.115 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.11e-01 0.0326 0.136 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 7.47e-01 0.0382 0.118 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0322 0.0872 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0495 0.112 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 2.89e-01 -0.126 0.119 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.36e-01 0.0472 0.0995 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0757 0.102 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0983 0.111 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 1.99e-01 -0.153 0.119 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 7.84e-01 0.0244 0.0889 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0669 0.0951 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 1.89e-01 -0.172 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 1.68e-02 0.3 0.124 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.73e-01 0.0485 0.115 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 7.24e-01 0.0456 0.129 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 9.17e-02 -0.218 0.129 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0531 0.138 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 2.77e-01 0.12 0.11 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.67e-01 0.11 0.122 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0679 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.62e-01 0.0391 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 2.94e-01 0.13 0.124 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.37e-02 0.335 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 1.54e-01 0.201 0.141 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 5.58e-01 0.0809 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.06e-01 0.0667 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 7.08e-02 -0.19 0.104 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0208 0.123 0.134 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0362 0.109 0.134 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.62e-01 0.0484 0.11 0.134 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0638 0.118 0.134 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 2.90e-01 -0.147 0.139 0.134 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 4.28e-01 -0.099 0.125 0.134 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0258 0.113 0.134 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0565 0.0935 0.134 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 1.27e-01 0.191 0.125 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 4.66e-01 -0.08 0.11 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.136 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.58e-02 0.215 0.102 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 3.85e-01 0.106 0.122 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 7.10e-01 0.047 0.126 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.09e-02 0.247 0.136 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.70e-02 -0.26 0.13 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.69e-02 -0.246 0.117 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.24e-01 0.0395 0.112 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 5.66e-03 -0.3 0.107 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.65e-01 -0.019 0.112 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.112 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00673 0.101 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0495 0.11 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.29e-01 0.159 0.132 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 3.85e-01 0.0855 0.0982 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0909 0.0795 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 9.24e-01 0.0122 0.128 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 1.11e-01 -0.199 0.124 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 2.67e-01 -0.146 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.57e-01 0.0859 0.115 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0409 0.127 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 2.13e-01 -0.164 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0363 0.132 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 1.12e-01 -0.206 0.129 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0496 0.0951 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 8.17e-01 0.0293 0.126 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 1.47e-01 -0.169 0.116 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 9.73e-01 0.00401 0.12 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.20e-01 0.0573 0.115 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 8.87e-01 0.0174 0.122 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.39e-01 -0.024 0.118 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0536 0.131 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0487 0.103 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 1.90e-01 -0.114 0.0864 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 3.04e-01 0.161 0.156 0.144 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 3.05e-01 0.143 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0699 0.0876 0.144 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 2.80e-01 -0.171 0.158 0.144 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0953 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0597 0.144 0.144 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0887 0.142 0.144 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.144 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0669 0.0993 0.144 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0561 0.127 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0382 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.53e-01 0.0619 0.0665 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 5.39e-01 0.0744 0.121 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0144 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0325 0.103 0.133 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 8.64e-01 0.0176 0.103 0.133 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0194 0.0859 0.133 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 5.44e-02 0.247 0.128 0.135 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.43e-02 -0.211 0.122 0.135 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 8.97e-02 0.161 0.0944 0.135 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.53e-01 0.162 0.113 0.135 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 9.10e-01 0.0143 0.126 0.135 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 3.02e-01 -0.131 0.127 0.135 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.74e-01 0.0734 0.102 0.135 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0428 0.0819 0.135 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0435 0.131 0.132 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 5.50e-01 -0.083 0.139 0.132 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.85e-01 0.0682 0.0974 0.132 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.67e-01 -0.191 0.138 0.132 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0716 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0319 0.108 0.132 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 5.14e-01 0.0625 0.0957 0.132 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.41e-01 0.0679 0.145 0.132 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0939 0.104 0.132 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.43e-01 0.0395 0.12 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.38e-02 -0.188 0.108 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.98e-01 0.0558 0.0822 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0031 0.124 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 3.49e-03 -0.185 0.0626 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0516 0.104 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0714 0.0981 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.82e-02 0.238 0.114 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0121 0.122 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00904 0.113 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 1.74e-01 0.121 0.0891 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 7.99e-01 0.0337 0.132 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0988 0.0921 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.45e-01 0.128 0.11 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0559 0.105 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 1.20e-01 0.176 0.113 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.82e-01 0.0656 0.16 0.124 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0505 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 3.67e-01 -0.138 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 4.59e-01 0.112 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.79e-01 0.0272 0.178 0.124 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0329 0.177 0.124 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0464 0.166 0.124 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0949 0.14 0.124 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0894 0.12 0.138 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0978 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.54e-01 0.0551 0.123 0.138 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.45e-01 -0.187 0.128 0.138 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.68e-02 0.215 0.108 0.138 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0309 0.132 0.138 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0567 0.138 0.138 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 9.81e-02 0.188 0.113 0.138 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000513 0.112 0.133 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 9.52e-01 0.00658 0.109 0.133 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 9.73e-02 0.193 0.116 0.133 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 6.25e-02 -0.221 0.118 0.133 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0203 0.0802 0.133 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 4.78e-01 0.0914 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0199 0.114 0.133 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 6.61e-01 0.0547 0.124 0.133 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0484 0.144 0.124 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0222 0.139 0.124 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00277 0.0926 0.124 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 9.67e-01 0.00583 0.142 0.124 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 1.68e-01 -0.186 0.134 0.124 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 6.97e-01 -0.041 0.105 0.124 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.30e-01 0.0197 0.0916 0.124 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0523 0.139 0.124 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0986 0.0879 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0476 0.131 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0324 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.23e-01 0.0435 0.0885 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 8.96e-01 0.0146 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 9.58e-01 0.00423 0.0798 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0906 0.116 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 2.83e-01 -0.13 0.121 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 3.81e-01 -0.094 0.107 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.02e-01 -0.113 0.109 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 6.40e-01 0.0579 0.124 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.76e-01 0.0345 0.121 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 4.80e-01 0.0651 0.092 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 4.36e-01 0.0736 0.0942 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 4.21e-01 0.0648 0.0804 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 915730 sc-eQTL 2.71e-01 -0.108 0.0983 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 3.74e-03 -0.386 0.131 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 1.84e-01 -0.107 0.0801 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.18e-01 0.113 0.113 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 8.11e-01 0.0271 0.114 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 1.20e-01 -0.163 0.105 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 2.93e-01 0.0832 0.0788 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 7.85e-01 0.0334 0.122 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 6.45e-03 -0.162 0.0588 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 8.02e-01 0.0245 0.0977 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0586 0.084 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 7.76e-02 0.195 0.11 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 7.62e-01 0.0323 0.106 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.101 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 6.71e-01 0.0447 0.105 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 1.20e-01 -0.184 0.118 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 8.73e-01 0.0112 0.07 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.90e-01 0.034 0.127 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0699 0.109 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 5.51e-02 0.238 0.123 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -483274 sc-eQTL 5.70e-01 0.0645 0.113 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 sc-eQTL 6.05e-03 -0.297 0.107 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -900147 sc-eQTL 7.31e-01 -0.036 0.104 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -429805 sc-eQTL 7.91e-01 0.0275 0.104 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 638271 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0163 0.0969 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 767150 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0303 0.106 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 888158 sc-eQTL 7.03e-01 0.0487 0.128 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -427455 sc-eQTL 8.88e-01 0.0125 0.0886 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 639184 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0753 0.074 0.136 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 eQTL 0.0113 -0.115 0.0453 0.0 0.0 0.12


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 -265559 1.27e-06 1.19e-06 2.51e-07 1.26e-06 4.2e-07 6.25e-07 1.49e-06 3.83e-07 1.69e-06 6.98e-07 2.07e-06 9.31e-07 2.51e-06 2.82e-07 4.58e-07 9.77e-07 9.57e-07 1.14e-06 5.86e-07 4.71e-07 6.58e-07 1.93e-06 1.14e-06 6.43e-07 2.38e-06 9.28e-07 1.03e-06 8.46e-07 1.63e-06 1.16e-06 8.17e-07 2.31e-07 3.35e-07 6.13e-07 5.15e-07 6.33e-07 6.93e-07 3.65e-07 5.19e-07 2.03e-07 3.57e-07 1.62e-06 2.33e-07 8.98e-08 3.45e-07 2.03e-07 2.8e-07 1.7e-07 2.86e-07