logo

Genes within 1Mb (chr12:105840533:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 4.65e-01 0.0733 0.1 0.209 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 9.28e-01 0.00716 0.0797 0.209 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0309 0.0518 0.209 B L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0658 0.0761 0.209 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.82e-01 0.0268 0.0485 0.209 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 8.13e-02 0.135 0.0768 0.209 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.05e-01 0.0111 0.0935 0.209 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 6.49e-01 0.0284 0.0622 0.209 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0281 0.0666 0.209 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.48e-01 -0.014 0.073 0.209 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0585 0.0718 0.209 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0608 0.0623 0.209 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 8.78e-01 -0.011 0.0719 0.209 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 9.05e-01 0.00847 0.0709 0.209 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.20e-01 0.12 0.0977 0.209 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 1.11e-01 -0.101 0.0631 0.209 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.71e-02 0.0967 0.0545 0.209 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 9.35e-01 0.00709 0.0864 0.209 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0391 0.0868 0.209 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0219 0.057 0.209 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.84e-01 0.108 0.0814 0.209 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.01e-01 -0.117 0.0909 0.209 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 1.55e-01 0.117 0.0822 0.209 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.61e-01 0.0374 0.0506 0.209 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 3.65e-01 0.0329 0.0362 0.209 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 9.30e-01 0.00889 0.101 0.212 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 1.93e-01 -0.136 0.104 0.212 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0187 0.0697 0.212 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 2.70e-01 0.115 0.104 0.212 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.45e-02 0.161 0.0832 0.212 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00888 0.0712 0.212 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0676 0.0635 0.212 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 1.50e-01 0.15 0.104 0.212 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0284 0.0426 0.212 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0164 0.0867 0.209 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0063 0.0832 0.209 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 1.38e-01 0.092 0.0618 0.209 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0446 0.0982 0.209 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.66e-01 0.0538 0.0482 0.209 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.89e-01 0.0732 0.0847 0.209 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0097 0.0721 0.209 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0512 0.0941 0.209 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0541 0.0944 0.208 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 1.53e-01 0.133 0.0926 0.208 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 1.34e-01 -0.132 0.0875 0.208 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 4.13e-01 0.0692 0.0844 0.208 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0867 0.0831 0.208 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 4.52e-01 0.0654 0.0869 0.208 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0338 0.107 0.208 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000567 0.077 0.208 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 4.04e-02 0.129 0.0624 0.208 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 6.25e-01 0.0519 0.106 0.209 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0822 0.0743 0.209 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.92e-01 0.00907 0.0666 0.209 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 9.66e-01 0.00367 0.0868 0.209 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 9.63e-01 0.00532 0.114 0.209 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 5.94e-01 0.0428 0.0801 0.209 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 8.56e-01 0.0148 0.0816 0.209 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 2.14e-01 0.0828 0.0664 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.07e-01 0.132 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 8.83e-01 0.0156 0.106 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.63e-02 -0.17 0.0984 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.79e-01 -0.15 0.111 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.92e-01 -0.057 0.106 0.219 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0266 0.0794 0.219 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 4.58e-01 -0.082 0.11 0.219 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0676 0.11 0.219 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0118 0.107 0.219 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0834 0.112 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.87e-01 0.107 0.0997 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 6.84e-01 -0.034 0.0834 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.29e-01 0.048 0.0991 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.77e-01 0.0932 0.0855 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.0939 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 1.29e-01 -0.165 0.108 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.95e-01 0.0515 0.0968 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0228 0.101 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.209 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.39e-01 -0.124 0.105 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 5.91e-01 -0.051 0.0948 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0287 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.84e-01 0.0345 0.0846 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 4.35e-01 0.0776 0.0991 0.209 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.33e-01 -0.111 0.114 0.209 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.87e-01 0.0255 0.0945 0.209 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0291 0.0869 0.209 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.39e-01 0.12 0.102 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0242 0.1 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 5.76e-01 0.0431 0.0771 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0439 0.0863 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 7.32e-01 0.0266 0.0776 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 2.77e-01 0.0977 0.0896 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0306 0.112 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 3.61e-01 0.0692 0.0756 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0606 0.0993 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 6.50e-02 0.204 0.11 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0332 0.0983 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0957 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.96e-01 -0.119 0.0915 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.65e-02 0.152 0.0823 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 4.89e-01 0.0603 0.087 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 7.63e-01 0.0356 0.118 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.76e-01 0.0233 0.0818 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.70e-01 0.00381 0.102 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 3.11e-01 -0.105 0.103 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 4.45e-01 0.0835 0.109 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.38e-01 0.0821 0.0855 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.96e-01 0.0417 0.107 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 8.45e-01 0.0202 0.103 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0579 0.108 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.97e-01 0.08 0.0618 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0792 0.0817 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 3.39e-01 0.0741 0.0773 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0167 0.0703 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.68e-01 0.0675 0.0748 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.24e-01 0.0362 0.0739 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.108 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.04e-01 -0.047 0.0703 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.32e-01 0.00816 0.0961 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.67e-01 0.102 0.0918 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 1.46e-01 -0.14 0.0958 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 1.14e-01 -0.107 0.0673 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0769 0.0879 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 7.65e-01 0.0271 0.0907 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 1.91e-01 0.146 0.112 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 1.49e-01 -0.107 0.0741 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.57e-02 0.177 0.0727 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.74e-01 -0.123 0.112 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 1.98e-01 -0.132 0.102 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0219 0.0882 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 9.25e-01 0.00905 0.0966 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 1.69e-01 -0.15 0.109 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.106 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 2.12e-01 -0.11 0.088 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0342 0.0708 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 1.25e-01 0.156 0.102 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 9.88e-01 0.00142 0.0961 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0907 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 5.68e-02 0.163 0.0853 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 4.18e-03 -0.271 0.0935 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.113 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.41e-01 0.0753 0.0976 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 8.78e-01 0.0111 0.0722 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0566 0.0953 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.69e-01 -0.112 0.101 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0801 0.0849 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0138 0.0874 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 1.88e-01 0.125 0.0944 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 6.25e-02 0.189 0.101 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0274 0.0759 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.06e-01 0.0307 0.0812 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 4.11e-01 0.0944 0.115 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0386 0.11 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0215 0.1 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 8.63e-01 0.0195 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0893 0.113 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.21e-01 -0.148 0.12 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 2.11e-01 -0.121 0.0962 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.59e-01 0.15 0.106 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.60e-01 0.0194 0.11 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 4.07e-01 0.0869 0.105 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.101 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0972 0.111 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.05e-01 -0.115 0.112 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 1.14e-01 0.166 0.104 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 8.00e-01 0.0217 0.0856 0.219 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.66e-01 0.0175 0.104 0.212 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0994 0.0919 0.212 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.12e-01 0.0345 0.0932 0.212 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00648 0.0996 0.212 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0944 0.117 0.212 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.94e-01 0.0898 0.105 0.212 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.88e-01 0.0659 0.0948 0.212 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 4.26e-01 0.0629 0.0788 0.212 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0879 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 2.65e-01 0.1 0.0898 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0147 0.112 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.32e-02 0.146 0.0838 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 5.51e-02 -0.192 0.0997 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.41e-01 0.122 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.01e-01 -0.144 0.112 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.24e-01 0.0862 0.108 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.12e-03 0.26 0.0956 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.42e-01 0.019 0.0956 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 9.75e-02 0.154 0.0928 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0952 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 5.46e-01 0.058 0.0958 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.94e-01 -0.112 0.0858 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00982 0.0942 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.04e-01 -0.116 0.113 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.10e-01 0.0555 0.084 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.89e-02 0.159 0.0672 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.22e-03 -0.325 0.105 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0817 0.105 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 3.32e-01 -0.107 0.11 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0859 0.0965 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.62e-01 -0.149 0.106 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 8.03e-01 0.0278 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0637 0.109 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 8.36e-01 0.0165 0.0798 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0291 0.106 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 2.40e-01 0.115 0.0973 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0393 0.1 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.46e-01 0.0912 0.0965 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.03e-01 0.167 0.102 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 7.11e-02 0.178 0.0982 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.87e-01 0.00173 0.109 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0704 0.0863 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 3.51e-01 0.0678 0.0725 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0376 0.137 0.226 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 4.54e-02 -0.243 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0215 0.0767 0.226 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 9.31e-01 0.012 0.139 0.226 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 7.15e-01 0.0432 0.118 0.226 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 5.91e-02 0.236 0.124 0.226 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 2.22e-01 0.151 0.123 0.226 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.35e-01 0.0795 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0913 0.0865 0.226 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 1.85e-01 0.144 0.108 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 3.87e-02 0.211 0.101 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0249 0.0568 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.98e-01 -0.133 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 9.17e-02 0.193 0.114 0.211 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.29e-01 0.0855 0.0874 0.211 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0444 0.0875 0.211 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.25e-01 0.0069 0.0732 0.211 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.64e-04 0.387 0.104 0.209 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.98e-02 -0.222 0.102 0.209 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0871 0.0794 0.209 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.34e-02 -0.201 0.0939 0.209 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 8.39e-01 0.0215 0.106 0.209 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.75e-01 0.00337 0.106 0.209 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 1.88e-01 -0.113 0.0854 0.209 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 4.80e-01 0.0485 0.0686 0.209 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 7.39e-01 0.0341 0.102 0.22 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0376 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0761 0.0758 0.22 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.91e-01 0.043 0.108 0.22 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.64e-01 0.0557 0.0963 0.22 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0841 0.22 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0144 0.0747 0.22 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.15e-01 0.0414 0.113 0.22 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0623 0.0808 0.22 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0862 0.103 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0319 0.0939 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 2.08e-01 0.0892 0.0707 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 4.55e-01 -0.08 0.107 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 7.93e-01 0.0145 0.0551 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 5.11e-01 0.059 0.0897 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000917 0.0847 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0526 0.0994 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.64e-01 0.118 0.105 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 5.05e-01 0.0653 0.0977 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.65e-03 0.202 0.0761 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 8.11e-02 0.199 0.114 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 3.42e-01 0.0758 0.0796 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 8.99e-01 0.0121 0.0953 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.37e-01 0.0559 0.0905 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.22e-01 0.00955 0.0979 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 6.83e-02 -0.231 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00902 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0489 0.121 0.197 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.37e-01 -0.179 0.119 0.197 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.32e-01 0.0681 0.142 0.197 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 5.25e-01 0.0899 0.141 0.197 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 6.86e-01 0.0535 0.132 0.197 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 9.55e-01 0.00628 0.112 0.197 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.21e-02 0.237 0.103 0.204 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0273 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0772 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.44e-01 -0.162 0.111 0.204 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.10e-01 -0.117 0.0935 0.204 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.47e-01 0.00758 0.114 0.204 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 9.21e-01 0.0118 0.119 0.204 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 2.48e-02 -0.219 0.097 0.204 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 1.27e-01 -0.15 0.0976 0.21 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 6.57e-01 0.0424 0.0953 0.21 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.83e-01 0.0281 0.102 0.21 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.20e-01 0.0515 0.104 0.21 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.94e-01 0.0276 0.07 0.21 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 9.75e-01 0.00353 0.112 0.21 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.76e-02 -0.176 0.0991 0.21 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.36e-01 0.0673 0.109 0.21 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0263 0.126 0.203 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 5.77e-01 -0.068 0.122 0.203 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0154 0.081 0.203 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.75e-01 0.111 0.124 0.203 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 5.98e-01 0.0623 0.118 0.203 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0279 0.0919 0.203 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 1.00e+00 3.56e-05 0.0802 0.203 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 3.48e-01 0.114 0.121 0.203 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.39e-01 -0.114 0.0766 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 3.67e-01 -0.101 0.112 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 5.90e-01 0.0519 0.096 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 3.34e-01 -0.073 0.0754 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0571 0.0953 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.28e-01 0.0821 0.0679 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 2.17e-01 0.122 0.0986 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.47e-02 -0.218 0.102 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0247 0.0915 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0287 0.0936 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 2.85e-02 0.228 0.103 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0919 0.102 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 4.31e-01 0.0612 0.0776 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0776 0.0795 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 2.67e-01 0.0753 0.0677 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 881789 sc-eQTL 2.63e-01 0.0931 0.0829 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 6.56e-01 0.0504 0.113 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 4.54e-01 0.0509 0.0678 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0302 0.0956 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 9.39e-01 0.00752 0.0977 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 9.03e-01 0.0111 0.0905 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 8.65e-02 0.116 0.0675 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 6.61e-01 0.0462 0.105 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 1.42e-01 0.0754 0.0512 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 3.39e-01 0.0804 0.0838 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00328 0.0723 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 6.45e-01 -0.044 0.0954 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0166 0.0941 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0346 0.0896 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 7.30e-01 0.0321 0.0928 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 1.78e-01 -0.141 0.104 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00573 0.0619 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 7.86e-01 0.0306 0.113 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 5.82e-01 -0.053 0.0961 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0684 0.11 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -517215 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0962 0.0968 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -299500 sc-eQTL 1.11e-01 0.148 0.0928 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -934088 sc-eQTL 2.30e-01 -0.107 0.0891 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -463746 sc-eQTL 5.24e-01 0.0566 0.0887 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 604330 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0443 0.0829 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 733209 sc-eQTL 6.02e-01 0.0474 0.0908 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 854217 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0346 0.109 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -461396 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00128 0.0759 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 605243 sc-eQTL 1.02e-01 0.104 0.0631 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000166046 \N -461396 4.24e-06 8.33e-07 1.96e-07 3.65e-07 1.03e-07 4.63e-07 6.19e-07 5.62e-08 8.7e-07 1.89e-07 1.09e-06 3.61e-07 1.62e-06 2.57e-07 4.39e-07 3.36e-07 3.75e-07 5.12e-07 1.62e-07 5.48e-08 1.59e-07 6.48e-07 4.77e-07 3.49e-08 1.22e-06 1.31e-07 1.57e-07 1.85e-07 2.66e-07 2.75e-07 4.34e-07 4.03e-08 3.38e-08 4.04e-07 3.68e-07 2.95e-08 5.31e-08 9.55e-08 4.23e-08 7.92e-08 5.42e-08 1.62e-06 5.03e-08 0.0 5.43e-08 1.44e-08 1.26e-07 4.04e-09 5.04e-08