logo

Genes within 1Mb (chr12:105830659:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 9.69e-01 0.00487 0.127 0.126 B L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.29e-01 0.0488 0.101 0.126 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 4.95e-01 0.0448 0.0655 0.126 B L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 2.24e-01 0.117 0.096 0.126 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0413 0.0613 0.126 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 3.93e-01 0.0837 0.0977 0.126 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.62e-01 0.087 0.118 0.126 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.36e-01 -0.117 0.0783 0.126 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0847 0.0841 0.126 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.94e-01 0.097 0.0922 0.126 CD4T L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00329 0.091 0.126 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0214 0.0789 0.126 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 2.33e-01 -0.108 0.0907 0.126 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.31e-01 0.0706 0.0895 0.126 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 3.12e-01 0.125 0.124 0.126 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0382 0.0803 0.126 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.00e-01 0.0468 0.0693 0.126 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 7.87e-01 0.0296 0.11 0.126 CD8T L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 5.62e-01 0.064 0.11 0.126 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0402 0.0723 0.126 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 1.41e-01 -0.152 0.103 0.126 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 6.62e-01 0.0506 0.116 0.126 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.08e-01 0.0867 0.105 0.126 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0985 0.0639 0.126 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 3.92e-01 0.0394 0.0459 0.126 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.29e-01 -0.102 0.128 0.131 DC L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0647 0.133 0.131 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.91e-01 0.00103 0.0885 0.131 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 8.29e-01 0.0286 0.132 0.131 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0454 0.107 0.131 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 8.00e-02 -0.158 0.0897 0.131 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 2.84e-02 0.176 0.0799 0.131 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.60e-01 -0.187 0.132 0.131 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 8.54e-01 -0.01 0.0542 0.131 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 6.99e-01 0.0427 0.11 0.126 Mono L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 7.36e-01 0.0358 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 6.62e-01 0.0346 0.0791 0.126 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.48e-01 0.0571 0.125 0.126 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.74e-02 -0.122 0.061 0.126 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 3.32e-01 -0.105 0.108 0.126 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.97e-01 0.0485 0.0918 0.126 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.12 0.126 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 3.70e-01 0.107 0.119 0.127 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 3.01e-02 -0.253 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0683 0.111 0.127 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0559 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 4.47e-01 0.0799 0.105 0.127 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.67e-01 -0.151 0.109 0.127 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.00e-01 0.0342 0.134 0.127 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 9.62e-02 -0.161 0.0962 0.127 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0561 0.0793 0.127 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0547 0.136 0.126 Other_T L1
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00285 0.0951 0.126 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0495 0.0849 0.126 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.12e-01 0.0563 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 9.99e-02 -0.239 0.145 0.126 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.44e-01 0.0335 0.102 0.126 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.63e-02 -0.198 0.103 0.126 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0546 0.085 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0737 0.142 0.12 B_Activated L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.81e-01 0.0216 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 2.48e-01 0.156 0.134 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 1.93e-01 -0.198 0.151 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0489 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 9.03e-01 0.0131 0.108 0.12 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0166 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.44e-01 0.0693 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.75e-02 0.275 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.36e-01 -0.112 0.144 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 1.74e-01 0.174 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 4.91e-01 0.0737 0.107 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 5.07e-01 0.0844 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0443 0.11 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0526 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 6.78e-02 0.254 0.139 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.71e-01 -0.17 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 1.06e-01 -0.21 0.129 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.43e-01 -0.165 0.141 0.127 B_Memory L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.68e-01 0.057 0.133 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0879 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.32e-01 0.0616 0.129 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 7.14e-01 0.039 0.106 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 9.52e-01 0.00757 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0227 0.144 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.77e-01 0.0496 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.77e-01 0.0455 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 3.70e-01 0.118 0.132 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.96e-01 0.135 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 7.63e-02 0.176 0.0988 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 1.74e-02 0.263 0.11 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.54e-01 -0.143 0.0997 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 3.21e-01 0.115 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0246 0.144 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 3.16e-01 -0.098 0.0974 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 7.01e-01 0.0492 0.128 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 1.58e-01 -0.199 0.14 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 3.01e-01 -0.13 0.125 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 2.85e-01 0.131 0.122 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0109 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.02e-01 0.0711 0.106 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 7.40e-01 0.0369 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00817 0.15 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.104 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.63e-01 0.0953 0.13 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 5.42e-01 0.0821 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 4.83e-02 0.279 0.14 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.26e-01 0.0104 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 8.21e-01 0.0314 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 9.81e-01 0.00315 0.133 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 1.32e-02 0.329 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.23e-01 0.216 0.14 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 1.22e-02 0.2 0.0792 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.94e-01 0.0704 0.103 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.56e-01 0.111 0.0971 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 4.69e-01 -0.064 0.0883 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 2.42e-01 -0.11 0.0939 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 7.86e-01 0.0253 0.0929 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 6.52e-01 0.0612 0.136 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0376 0.0885 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00426 0.121 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 8.87e-01 0.0166 0.117 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.86e-01 0.0493 0.122 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 3.57e-01 0.0788 0.0854 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 5.35e-01 0.0691 0.111 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.83e-01 0.153 0.114 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.76e-01 0.0403 0.142 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 2.46e-01 -0.109 0.0939 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 1.33e-01 0.14 0.0928 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.46e-01 0.169 0.145 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0701 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.13e-01 0.0271 0.114 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0792 0.125 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.25e-01 -0.09 0.141 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0458 0.137 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0149 0.114 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0416 0.0918 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 9.36e-01 0.0106 0.131 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.09e-01 -0.155 0.123 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.64e-01 0.00535 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0804 0.11 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 2.16e-01 0.151 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.75e-01 -0.103 0.144 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 8.17e-01 0.029 0.125 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.43e-01 0.071 0.0925 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 1.22e-01 0.19 0.122 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.21e-01 0.0647 0.131 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 3.43e-01 -0.104 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 1.07e-01 -0.181 0.112 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 2.15e-01 0.151 0.122 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.56e-01 0.0979 0.131 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.11e-01 -0.156 0.0972 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0562 0.105 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 8.76e-01 0.0219 0.14 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0418 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 2.45e-01 0.142 0.121 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 5.56e-01 0.0808 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.27e-02 -0.266 0.137 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.93e-01 0.0386 0.147 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00862 0.117 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.19e-02 0.242 0.129 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 3.39e-01 -0.142 0.149 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 3.64e-02 0.297 0.141 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.35e-01 0.0285 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 1.08e-01 0.242 0.15 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.24e-02 -0.387 0.154 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0728 0.152 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0883 0.143 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0353 0.116 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0933 0.135 0.126 MAIT L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.60e-01 0.0212 0.12 0.126 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 3.38e-01 -0.116 0.121 0.126 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.60e-01 0.0397 0.13 0.126 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 2.93e-01 -0.16 0.152 0.126 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 6.63e-01 0.0597 0.137 0.126 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.48e-02 -0.299 0.122 0.126 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 1.39e-01 -0.152 0.102 0.126 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 9.85e-02 -0.227 0.137 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 3.72e-01 -0.107 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.96e-01 0.0584 0.149 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 7.90e-01 0.03 0.113 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.19e-01 0.0668 0.134 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 2.51e-01 0.159 0.138 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0147 0.15 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0161 0.144 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 7.51e-01 0.0412 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.88e-02 0.264 0.12 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 4.15e-02 -0.241 0.117 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00131 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 2.64e-01 -0.136 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 2.32e-01 0.131 0.109 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.77e-02 -0.236 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.47e-01 0.0277 0.144 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 9.04e-02 -0.18 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0831 0.0863 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0476 0.144 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 1.69e-01 -0.194 0.14 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.83e-01 0.0218 0.148 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0317 0.13 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 2.98e-01 -0.149 0.143 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.07e-01 0.123 0.148 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 3.27e-01 -0.146 0.149 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 3.24e-01 -0.144 0.146 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.47e-02 -0.215 0.106 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 5.37e-01 0.0832 0.135 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 9.43e-02 -0.208 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0575 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 6.40e-01 0.0578 0.123 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 4.39e-01 -0.101 0.13 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.65e-01 -0.175 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.28e-01 0.0486 0.139 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 1.97e-01 -0.142 0.11 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.53e-01 -0.055 0.0925 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.65e-01 -0.189 0.169 0.122 PB L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.55e-01 -0.068 0.152 0.122 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 5.22e-01 0.0613 0.0953 0.122 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0996 0.172 0.122 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 8.45e-02 -0.252 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 7.88e-01 0.0421 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.76e-01 0.11 0.154 0.122 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 3.81e-01 -0.14 0.159 0.122 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0474 0.108 0.122 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.67e-01 0.154 0.138 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0565 0.13 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.83e-01 0.00152 0.0725 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 8.90e-01 0.0181 0.131 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 9.02e-01 -0.018 0.146 0.124 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0917 0.112 0.124 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 4.16e-01 0.091 0.112 0.124 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 5.91e-01 0.0503 0.0933 0.124 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.53e-01 -0.103 0.138 0.126 Treg L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.78e-01 -0.142 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.57e-01 0.0183 0.102 0.126 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 4.17e-02 -0.246 0.12 0.126 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.76e-01 0.0961 0.135 0.126 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 1.52e-01 0.194 0.135 0.126 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0307 0.11 0.126 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0132 0.0877 0.126 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0223 0.13 0.137 cDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0312 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0963 0.137 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 8.17e-01 0.0318 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0133 0.122 0.137 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 3.13e-01 -0.107 0.106 0.137 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.55e-01 0.0707 0.0945 0.137 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0874 0.143 0.137 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 3.69e-02 -0.213 0.101 0.137 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.53e-01 0.151 0.131 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 3.15e-01 -0.12 0.119 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 1.59e-01 0.127 0.0899 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 3.71e-01 0.122 0.136 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 8.21e-02 -0.122 0.0696 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0768 0.114 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 7.97e-01 0.0278 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0112 0.127 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00492 0.135 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.23e-01 0.153 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.88e-01 0.00148 0.099 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.45e-01 0.0477 0.147 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.55e-01 -0.145 0.102 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 1.24e-01 -0.187 0.121 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 3.76e-01 0.103 0.116 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0553 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.65e-01 -0.118 0.161 0.142 gdT L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 4.59e-01 -0.122 0.164 0.142 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 3.73e-01 -0.137 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0478 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 1.75e-01 -0.244 0.179 0.142 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 2.25e-01 0.217 0.178 0.142 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 2.67e-01 -0.186 0.167 0.142 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.56e-01 0.106 0.142 0.142 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 1.45e-01 -0.189 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 1.70e-01 0.174 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0154 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0399 0.139 0.129 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 6.57e-01 -0.052 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 4.53e-01 0.107 0.142 0.129 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 4.66e-01 0.108 0.148 0.129 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 3.17e-01 0.123 0.122 0.129 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0509 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 9.75e-01 0.00399 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 2.26e-01 0.162 0.133 0.124 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.06e-01 0.0705 0.136 0.124 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0496 0.0919 0.124 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 2.89e-01 0.156 0.147 0.124 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.31e-01 0.063 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 2.99e-01 -0.148 0.142 0.124 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 1.21e-01 -0.231 0.148 0.144 pDC L2
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 4.07e-01 0.12 0.144 0.144 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 9.69e-01 0.00378 0.0959 0.144 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 8.95e-01 0.0194 0.147 0.144 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0852 0.14 0.144 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 1.75e-01 -0.147 0.108 0.144 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 1.37e-01 0.141 0.0943 0.144 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 8.67e-01 0.0242 0.144 0.144 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0132 0.0914 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 9.69e-02 -0.236 0.141 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 2.39e-01 0.144 0.122 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 7.40e-01 0.032 0.0961 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.40e-01 0.0403 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0321 0.0866 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 1.90e-01 -0.165 0.125 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 3.81e-01 0.115 0.131 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0628 0.116 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 2.95e-01 -0.125 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 7.70e-01 0.0391 0.134 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 5.14e-01 0.0853 0.131 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 5.54e-02 0.19 0.0986 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 9.72e-02 0.169 0.101 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0463 0.0869 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 871915 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0225 0.145 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 2.41e-01 -0.102 0.0866 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 6.37e-01 0.0578 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 4.30e-01 0.0983 0.124 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.77e-01 0.0179 0.115 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 3.77e-01 0.0767 0.0866 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 3.53e-01 0.125 0.134 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 6.73e-02 -0.12 0.0651 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 1.67e-01 -0.148 0.107 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 4.92e-01 0.0635 0.0921 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 8.37e-01 -0.025 0.122 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 2.24e-01 -0.145 0.119 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 4.52e-01 0.0852 0.113 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 8.43e-01 0.0232 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 7.31e-01 0.0455 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 8.40e-01 0.0158 0.0783 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 7.43e-01 0.0468 0.142 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 5.75e-01 0.0683 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 9.29e-01 0.0124 0.139 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -527089 sc-eQTL 1.07e-01 0.197 0.122 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -309374 sc-eQTL 4.66e-02 -0.233 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111785 RIC8B -943962 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0268 0.113 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0652 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 594456 sc-eQTL 6.44e-01 0.0484 0.105 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 723335 sc-eQTL 4.16e-02 -0.233 0.113 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 844343 sc-eQTL 8.48e-01 0.0266 0.138 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -471270 sc-eQTL 6.04e-02 -0.179 0.0949 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 595369 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0546 0.08 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -473620 eQTL 0.0233 -0.0333 0.0147 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina