logo

Genes within 1Mb (chr12:105739823:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.77e-01 0.0143 0.0925 0.261 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 8.35e-01 0.00994 0.0478 0.261 B L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000475 0.0703 0.261 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.48e-01 0.0269 0.0448 0.261 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0355 0.0713 0.261 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 9.77e-02 0.143 0.0857 0.261 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 7.39e-01 0.0192 0.0574 0.261 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 7.67e-01 0.0182 0.0615 0.261 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0574 0.0681 0.261 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 9.62e-01 0.00281 0.0583 0.261 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 1.56e-01 -0.095 0.0668 0.261 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.03e-01 0.108 0.0658 0.261 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00256 0.0916 0.261 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0334 0.0593 0.261 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0355 0.0512 0.261 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.84e-01 0.0118 0.0808 0.261 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0869 0.0531 0.261 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0766 0.0763 0.261 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 9.76e-01 0.00259 0.0854 0.261 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.07e-02 0.178 0.0763 0.261 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.79e-01 0.0196 0.0474 0.261 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 2.38e-01 -0.04 0.0339 0.261 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 1.21e-01 0.144 0.0928 0.266 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 4.60e-01 0.0474 0.0641 0.266 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0907 0.0957 0.266 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 2.89e-01 0.0821 0.0771 0.266 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0136 0.0656 0.266 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.41e-02 0.132 0.0579 0.266 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 2.69e-01 0.107 0.0962 0.266 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0616 0.0391 0.266 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 4.29e-01 -0.063 0.0795 0.261 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 9.39e-02 -0.0954 0.0567 0.261 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 6.90e-02 -0.164 0.0895 0.261 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0179 0.0444 0.261 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0277 0.0779 0.261 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.33e-01 0.0316 0.0662 0.261 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 5.32e-01 -0.054 0.0864 0.261 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.72e-03 0.234 0.0871 0.262 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 1.02e-01 0.142 0.0866 0.262 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0904 0.079 0.262 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 1.10e-01 -0.125 0.0777 0.262 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0627 0.0814 0.262 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 4.93e-01 0.0687 0.1 0.262 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.99e-01 0.0279 0.0721 0.262 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.19e-01 0.00601 0.0591 0.262 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 1.73e-01 0.137 0.1 0.261 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 9.32e-01 0.00539 0.0631 0.261 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.48e-01 0.0625 0.0821 0.261 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.43e-01 0.0214 0.108 0.261 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 3.00e-01 0.0788 0.0758 0.261 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 1.26e-01 0.118 0.077 0.261 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0367 0.0632 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 9.73e-01 0.00343 0.101 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.32e-01 -0.145 0.0958 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.46e-01 0.0352 0.109 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 6.84e-01 0.042 0.103 0.258 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 7.72e-01 0.0224 0.0772 0.258 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 3.43e-01 0.102 0.107 0.258 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 1.09e-01 0.172 0.107 0.258 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.38e-01 0.0212 0.104 0.258 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0377 0.105 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0855 0.0775 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.26e-01 0.0907 0.0922 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.75e-01 0.108 0.0795 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 6.77e-01 0.0366 0.0877 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.02e-01 0.13 0.101 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.16e-01 0.0735 0.0901 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0209 0.0944 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0217 0.106 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 9.74e-02 0.148 0.0891 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 5.50e-02 -0.185 0.096 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00108 0.08 0.263 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 4.67e-01 0.0683 0.0938 0.263 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0509 0.108 0.263 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 5.09e-02 0.174 0.0885 0.263 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.11e-01 0.00923 0.0822 0.263 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.66e-01 0.0285 0.0958 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.35e-01 0.108 0.0719 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0611 0.0807 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 9.70e-01 0.00276 0.0727 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0578 0.084 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0267 0.104 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0661 0.0707 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.86e-01 0.0807 0.0929 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.09e-01 0.0248 0.102 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 3.56e-01 0.0819 0.0885 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 5.56e-01 0.0501 0.0848 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00551 0.0767 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0107 0.0805 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.14e-02 0.203 0.108 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0513 0.0756 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0321 0.094 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 6.14e-01 0.05 0.0991 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 5.24e-01 0.0522 0.0818 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0261 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.30e-01 0.0613 0.0976 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.79e-02 -0.173 0.0976 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 9.40e-01 0.00785 0.103 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.48e-02 -0.125 0.0586 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0488 0.0762 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0436 0.0654 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.94e-02 -0.143 0.0691 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 3.61e-01 0.0629 0.0687 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.97e-01 0.0392 0.1 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0788 0.0653 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00453 0.0895 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 9.90e-01 0.00111 0.086 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 5.49e-01 0.0379 0.0631 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 8.50e-01 0.0156 0.0822 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 2.16e-01 0.105 0.0844 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 4.78e-01 0.0742 0.104 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.19e-01 0.0562 0.0694 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0144 0.0688 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0297 0.108 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0255 0.085 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0681 0.093 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0187 0.105 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0304 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.08e-01 0.0705 0.085 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 1.35e-01 -0.102 0.0679 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0622 0.098 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.09e-02 -0.221 0.086 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 1.08e-01 -0.132 0.0821 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0614 0.0914 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 5.45e-01 0.0655 0.108 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 9.71e-01 0.00346 0.0938 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0648 0.0691 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 5.75e-01 0.0505 0.09 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.18e-01 -0.125 0.0799 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 1.37e-01 -0.123 0.0822 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.97e-01 0.0116 0.0895 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.96e-02 0.174 0.0955 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0143 0.0718 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.97e-01 0.000288 0.0768 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.26e-01 0.0229 0.104 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 4.48e-01 0.0692 0.091 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.07e-01 0.0386 0.102 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 2.81e-01 0.111 0.103 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.22e-01 0.134 0.11 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.18e-01 0.0203 0.0879 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.90e-02 -0.16 0.0965 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 6.01e-01 0.0578 0.11 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0612 0.101 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0293 0.112 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0632 0.116 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 3.14e-01 -0.114 0.113 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.67e-01 0.0455 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 5.91e-02 -0.162 0.0854 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0991 0.262 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 7.76e-01 0.0255 0.0893 0.262 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0219 0.0955 0.262 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 7.34e-01 0.0382 0.112 0.262 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 1.64e-01 0.14 0.1 0.262 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0347 0.091 0.262 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 1.45e-01 -0.11 0.0753 0.262 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 1.93e-01 0.129 0.0987 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 1.14e-01 0.137 0.086 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0963 0.0809 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0294 0.0967 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.88e-01 0.0541 0.0998 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.108 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 3.90e-01 0.089 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.80e-01 0.0141 0.0935 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 2.66e-01 0.0999 0.0895 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 2.46e-01 0.102 0.0874 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0747 0.0899 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 2.77e-01 -0.088 0.0807 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.18e-01 0.0204 0.0884 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.106 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.69e-01 0.0131 0.079 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.49e-01 0.0599 0.0639 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 6.88e-01 0.0405 0.101 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00685 0.0984 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 9.10e-01 0.0102 0.0908 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00726 0.1 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0676 0.103 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 9.56e-01 0.00578 0.104 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 9.11e-01 0.0115 0.102 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 7.58e-01 0.0231 0.0749 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 2.72e-02 0.222 0.0998 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 6.06e-02 0.174 0.0925 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.24e-01 -0.142 0.0918 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 2.54e-02 -0.217 0.0965 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.24e-01 -0.145 0.094 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 8.48e-01 0.0201 0.104 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 2.40e-01 0.097 0.0823 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0444 0.0693 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0132 0.133 0.222 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 7.12e-01 0.0275 0.0744 0.222 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 5.59e-01 0.0787 0.134 0.222 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0649 0.114 0.222 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 8.47e-01 0.0236 0.122 0.222 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.70e-01 -0.133 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0187 0.124 0.222 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 1.69e-02 0.199 0.0822 0.222 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0887 0.103 0.259 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0821 0.0534 0.259 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.60e-02 0.203 0.0964 0.259 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.26e-01 -0.165 0.108 0.259 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.57e-02 -0.152 0.0821 0.259 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 2.48e-01 0.0955 0.0825 0.259 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.46e-01 0.00472 0.0692 0.259 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0156 0.102 0.261 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.48e-01 0.0868 0.075 0.261 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0623 0.0897 0.261 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 4.33e-01 0.0783 0.0997 0.261 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0378 0.1 0.261 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0392 0.0811 0.261 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.48e-01 0.0042 0.0649 0.261 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 1.71e-01 0.132 0.0963 0.263 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.33e-01 0.108 0.0715 0.263 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0635 0.102 0.263 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 4.02e-01 0.0765 0.091 0.263 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 1.53e-01 0.113 0.0791 0.263 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.88e-01 0.0751 0.0704 0.263 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.88e-01 0.0151 0.107 0.263 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.78e-01 0.0117 0.0765 0.263 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0195 0.0955 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0735 0.0653 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0983 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0165 0.0508 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0612 0.0826 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 7.55e-01 0.0244 0.0781 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 1.75e-01 -0.124 0.0913 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0759 0.0977 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.06e-01 -0.116 0.0711 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 3.83e-02 -0.219 0.105 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0238 0.0738 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 4.21e-01 0.071 0.0881 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0151 0.0838 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0537 0.0905 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00444 0.114 0.279 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 3.87e-01 0.094 0.108 0.279 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.88e-01 0.0747 0.107 0.279 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.87e-01 0.167 0.126 0.279 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 8.23e-01 0.0283 0.126 0.279 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 3.99e-01 0.0996 0.118 0.279 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0998 0.0997 0.279 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 6.84e-01 0.0387 0.0949 0.264 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 3.33e-02 -0.205 0.0957 0.264 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0827 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 1.98e-01 0.11 0.0853 0.264 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.23e-01 -0.126 0.103 0.264 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.264 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 6.95e-01 0.0351 0.0896 0.264 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.70e-01 0.0259 0.0885 0.267 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0208 0.0917 0.267 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0712 0.0935 0.267 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.42e-01 0.0126 0.0631 0.267 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 8.73e-01 0.0162 0.101 0.267 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 5.63e-01 0.0521 0.09 0.267 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0242 0.098 0.267 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 9.54e-01 0.00632 0.111 0.277 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.77e-01 -0.077 0.0706 0.277 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.14e-01 -0.089 0.109 0.277 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 8.19e-01 0.0237 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0778 0.0803 0.277 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 8.42e-02 0.121 0.0695 0.277 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.89e-01 0.0737 0.106 0.277 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 6.50e-01 0.0307 0.0675 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0567 0.104 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 6.23e-01 0.0347 0.0703 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 4.17e-01 -0.072 0.0886 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 2.72e-01 0.0696 0.0632 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 1.66e-01 0.128 0.0917 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 1.57e-01 0.136 0.0958 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 3.06e-02 0.183 0.0842 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.37e-01 0.0837 0.087 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 5.52e-01 0.0577 0.0969 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.87e-01 0.0951 0.0719 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.66e-01 -0.022 0.074 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0173 0.0631 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 781079 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0433 0.0772 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 2.14e-01 0.131 0.105 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0451 0.063 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 6.15e-01 0.0447 0.0888 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0705 0.0899 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.64e-01 -0.087 0.0623 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 7.85e-02 -0.17 0.0963 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0177 0.0474 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0341 0.0774 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.20e-01 0.033 0.0666 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0898 0.0877 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 7.83e-01 0.0235 0.0852 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 2.84e-02 -0.183 0.0831 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0616 0.0946 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 5.15e-01 0.0365 0.056 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0265 0.102 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 6.45e-01 0.0401 0.087 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0995 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -617925 sc-eQTL 3.01e-02 0.196 0.09 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 sc-eQTL 1.46e-01 0.127 0.0871 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -564456 sc-eQTL 1.73e-01 -0.113 0.0829 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 503620 sc-eQTL 1.14e-01 -0.123 0.0774 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 632499 sc-eQTL 4.05e-01 -0.071 0.085 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 753507 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0247 0.103 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -562106 sc-eQTL 5.64e-01 0.0411 0.0711 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 504533 sc-eQTL 9.01e-01 0.00738 0.0596 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 eQTL 0.00505 0.0913 0.0325 0.0 0.0 0.267
ENSG00000136044 APPL2 503620 eQTL 0.855 0.00381 0.0209 0.00139 0.0 0.267

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 NUAK1 -400210 1.29e-06 8.23e-07 2.84e-07 4.1e-07 1.4e-07 3.22e-07 7.1e-07 2.64e-07 8.36e-07 2.85e-07 1.09e-06 5.55e-07 1.23e-06 2.1e-07 4.05e-07 4.47e-07 6.67e-07 5.16e-07 3.64e-07 3.57e-07 2.53e-07 6.2e-07 5.21e-07 3.56e-07 1.47e-06 2.4e-07 5.24e-07 4.59e-07 6.76e-07 8.5e-07 4.39e-07 4.57e-08 1.31e-07 2.77e-07 3.29e-07 2.54e-07 2.04e-07 1.41e-07 1.24e-07 9.61e-09 1.85e-07 8.45e-07 6.68e-08 1.23e-08 1.89e-07 4.53e-08 1.78e-07 8.57e-08 4.96e-08