logo

Genes within 1Mb (chr12:105720154:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.132 0.128 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0126 0.0683 0.128 B L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.05e-01 -0.127 0.1 0.128 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 6.62e-01 -0.028 0.064 0.128 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0359 0.102 0.128 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 1.09e-01 0.197 0.123 0.128 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0844 0.0818 0.128 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0768 0.0877 0.128 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0315 0.0965 0.128 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0706 0.0823 0.128 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.85e-01 0.102 0.0948 0.128 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0656 0.0936 0.128 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 7.64e-02 0.229 0.129 0.128 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 5.99e-01 0.0442 0.0839 0.128 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 9.32e-03 -0.187 0.0714 0.128 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 6.19e-02 0.217 0.116 0.128 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.28e-02 -0.129 0.0765 0.128 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.60e-02 0.244 0.109 0.128 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 3.80e-01 0.108 0.123 0.128 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 8.55e-01 0.0204 0.111 0.128 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 6.21e-01 0.0338 0.0683 0.128 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0283 0.0489 0.128 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 7.30e-01 -0.045 0.13 0.133 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0289 0.0897 0.133 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 8.45e-01 0.0262 0.134 0.133 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.46e-01 0.0653 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0652 0.0915 0.133 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 4.63e-01 0.0602 0.0818 0.133 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 1.38e-01 0.199 0.134 0.133 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 4.13e-01 0.045 0.0548 0.133 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 6.38e-01 0.0533 0.113 0.128 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0978 0.081 0.128 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.72e-01 0.0545 0.128 0.128 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 9.65e-01 0.00282 0.0632 0.128 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.39e-01 0.00851 0.111 0.128 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00552 0.0943 0.128 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0823 0.123 0.128 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 3.54e-01 -0.117 0.126 0.129 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 1.33e-01 -0.186 0.123 0.129 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0669 0.113 0.129 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 5.91e-01 0.0598 0.111 0.129 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0351 0.116 0.129 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.66e-01 -0.129 0.142 0.129 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 2.72e-01 -0.113 0.102 0.129 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.24e-01 0.0828 0.0838 0.129 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.98e-01 -0.077 0.146 0.128 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.36e-02 -0.153 0.0909 0.128 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 4.24e-01 0.0955 0.119 0.128 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 1.03e-01 0.255 0.156 0.128 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0884 0.11 0.128 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00601 0.112 0.128 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0102 0.0916 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 2.62e-03 0.436 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 3.36e-01 0.134 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 4.73e-01 -0.113 0.157 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.41e-01 0.0494 0.149 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 7.35e-02 -0.199 0.11 0.12 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.91e-01 0.133 0.154 0.12 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.93e-01 0.00133 0.155 0.12 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0558 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 2.18e-01 0.179 0.145 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.74e-01 0.0309 0.107 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 9.11e-01 0.0143 0.128 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 1.73e-01 -0.15 0.11 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 7.61e-01 0.037 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 1.54e-01 0.2 0.14 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 3.79e-01 -0.11 0.125 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 4.92e-01 0.0897 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00232 0.145 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 3.88e-01 0.106 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.93e-01 0.0522 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 9.40e-02 0.182 0.108 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.128 0.127 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 5.78e-01 0.0823 0.148 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 1.80e-02 -0.286 0.12 0.127 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 6.57e-01 0.0498 0.112 0.127 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.57e-01 -0.103 0.138 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0228 0.104 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0674 0.105 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 5.58e-01 0.0885 0.151 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0849 0.102 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.49e-01 -0.155 0.134 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.76e-01 -0.103 0.144 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 4.16e-01 -0.102 0.125 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 3.35e-01 -0.115 0.119 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0927 0.108 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 1.92e-01 -0.148 0.113 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.73e-01 0.00521 0.153 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 7.11e-01 0.0394 0.106 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 8.14e-01 0.0311 0.132 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.04e-02 -0.273 0.133 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.16e-01 0.0402 0.111 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 5.49e-01 0.0825 0.138 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 8.09e-02 -0.23 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 4.11e-01 0.109 0.133 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00182 0.14 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0357 0.0801 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.16e-01 0.0698 0.107 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0568 0.0922 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0239 0.0984 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.58e-01 0.0299 0.097 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.58e-02 0.235 0.141 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 5.57e-01 0.0543 0.0923 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.64e-02 -0.279 0.125 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.60e-01 -0.071 0.122 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0791 0.0894 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.82e-01 0.125 0.116 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0947 0.12 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 1.44e-01 0.216 0.147 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 4.77e-01 0.07 0.0984 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 1.75e-03 -0.302 0.0953 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.90e-01 -0.104 0.151 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0601 0.118 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.16e-01 0.16 0.129 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 1.65e-01 -0.203 0.146 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.24e-01 0.14 0.142 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 4.52e-01 0.0892 0.118 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.15e-02 -0.217 0.0938 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00523 0.136 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.38e-01 0.0249 0.122 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.28e-01 0.0558 0.115 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.55e-01 0.0397 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0112 0.15 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.27e-01 0.012 0.13 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.52e-01 -0.11 0.096 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 1.14e-01 0.199 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0397 0.112 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 7.95e-03 0.305 0.114 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 4.10e-01 0.103 0.125 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.21e-01 0.134 0.134 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 8.17e-01 0.0232 0.1 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0267 0.107 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 3.06e-01 0.154 0.15 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 6.33e-02 -0.243 0.13 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.37e-02 0.332 0.145 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 4.96e-02 0.29 0.147 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 2.72e-01 -0.174 0.158 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.11e-01 0.0142 0.126 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.59e-01 -0.128 0.139 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 6.82e-01 0.0606 0.148 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.76e-01 0.00411 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.97e-01 0.0583 0.15 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0266 0.155 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.42e-01 -0.143 0.151 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00319 0.142 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.19e-01 0.115 0.115 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.06e-01 0.0916 0.138 0.13 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0186 0.123 0.13 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.132 0.13 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 6.57e-02 0.285 0.154 0.13 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 4.31e-01 0.11 0.139 0.13 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00346 0.126 0.13 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 1.40e-01 0.154 0.104 0.13 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.99e-02 -0.263 0.133 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0839 0.117 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.54e-01 0.00639 0.11 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 1.71e-01 -0.18 0.131 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.74e-01 0.0763 0.135 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 4.40e-01 -0.113 0.147 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 7.71e-01 -0.041 0.141 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.79e-01 0.0705 0.127 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0791 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 2.41e-01 -0.143 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.70e-02 -0.222 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.06e-02 -0.211 0.112 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 8.17e-01 0.0286 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0674 0.148 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 1.60e-01 -0.155 0.11 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00535 0.0893 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 2.05e-01 -0.176 0.139 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 1.54e-01 -0.194 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 4.66e-01 0.0915 0.125 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 8.50e-01 0.0262 0.138 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0159 0.143 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 7.26e-01 0.0506 0.144 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0672 0.141 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0561 0.103 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00591 0.138 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 2.07e-01 -0.161 0.127 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0188 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 1.08e-02 0.338 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 2.80e-01 -0.139 0.129 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0641 0.142 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0589 0.113 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 1.85e-01 0.125 0.0942 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 2.81e-01 0.179 0.165 0.141 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.04e-01 0.0112 0.093 0.141 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 3.38e-01 -0.161 0.167 0.141 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0679 0.143 0.141 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 8.60e-01 0.027 0.152 0.141 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 1.76e-01 0.203 0.149 0.141 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0979 0.155 0.141 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0396 0.105 0.141 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0405 0.142 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0478 0.074 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0466 0.134 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.67e-01 0.0442 0.149 0.13 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 5.31e-01 0.0717 0.114 0.13 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 9.70e-02 0.189 0.113 0.13 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 1.35e-02 -0.234 0.0941 0.13 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 4.07e-01 0.118 0.143 0.128 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0474 0.105 0.128 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 7.92e-01 0.0333 0.126 0.128 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 6.92e-01 0.0554 0.14 0.128 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0352 0.141 0.128 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 8.02e-01 0.0285 0.114 0.128 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.99e-02 -0.197 0.0899 0.128 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.96e-01 0.000691 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0877 0.098 0.137 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 5.11e-01 0.0917 0.139 0.137 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 9.53e-01 0.00741 0.124 0.137 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 2.84e-01 -0.116 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.30e-01 0.0939 0.0962 0.137 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 5.47e-01 0.0882 0.146 0.137 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.73e-01 0.0589 0.104 0.137 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0715 0.135 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 1.72e-01 -0.126 0.0919 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0646 0.139 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 8.27e-01 0.0157 0.0717 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.55e-01 0.00664 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 8.05e-01 0.0272 0.11 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0469 0.129 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00903 0.137 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 6.72e-02 -0.183 0.0992 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 1.80e-01 0.198 0.148 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0886 0.103 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00301 0.123 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0683 0.117 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0123 0.127 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 5.83e-01 0.0935 0.17 0.115 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 1.13e-02 -0.407 0.159 0.115 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 3.63e-01 0.146 0.16 0.115 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.69e-01 0.108 0.189 0.115 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0862 0.189 0.115 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 6.68e-01 0.0757 0.176 0.115 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 1.22e-02 0.371 0.146 0.115 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0163 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0533 0.134 0.133 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0317 0.14 0.133 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 1.94e-01 -0.153 0.118 0.133 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0383 0.143 0.133 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 1.79e-01 0.201 0.149 0.133 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.29e-02 -0.263 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 8.07e-01 0.0303 0.124 0.131 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0682 0.128 0.131 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.13 0.131 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 3.91e-01 0.0755 0.0879 0.131 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 7.11e-02 0.254 0.14 0.131 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 6.88e-01 0.0505 0.126 0.131 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 6.89e-01 0.0548 0.137 0.131 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.83e-02 -0.257 0.154 0.136 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 8.44e-01 0.0197 0.0999 0.136 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00346 0.154 0.136 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.13e-01 0.0537 0.146 0.136 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 3.04e-01 -0.117 0.113 0.136 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 6.13e-01 0.0501 0.0989 0.136 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 3.96e-01 0.127 0.15 0.136 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0892 0.095 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 1.42e-01 0.212 0.144 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 2.98e-01 0.102 0.0976 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0379 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.59e-01 0.0271 0.0882 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0963 0.128 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 8.87e-02 0.228 0.133 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 2.05e-01 -0.15 0.118 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 5.25e-01 0.0771 0.121 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 3.00e-01 -0.145 0.139 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0393 0.104 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 5.17e-01 -0.069 0.106 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0542 0.0908 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 761410 sc-eQTL 6.14e-01 0.0562 0.111 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 3.88e-01 0.131 0.151 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0715 0.0906 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.90e-01 -0.11 0.128 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0265 0.127 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.89e-02 -0.146 0.0878 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 8.28e-01 0.0297 0.137 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 9.69e-01 0.00257 0.0669 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00534 0.109 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0236 0.094 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00547 0.124 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 9.30e-01 0.0106 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00126 0.118 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 9.09e-01 0.0151 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 7.02e-01 0.03 0.0784 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 2.62e-01 0.16 0.142 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 4.42e-01 0.0937 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 2.39e-01 -0.164 0.139 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -637594 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0652 0.128 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -419879 sc-eQTL 2.25e-01 -0.15 0.123 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -584125 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0658 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 483951 sc-eQTL 2.88e-01 0.117 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 612830 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0765 0.12 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 733838 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0786 0.145 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -581775 sc-eQTL 2.02e-01 -0.128 0.1 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 484864 sc-eQTL 3.00e-01 0.0873 0.0839 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000235162 C12orf75 484864 eQTL 0.0194 -0.0649 0.0277 0.0 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -637594 6.8e-07 2.89e-07 1.05e-07 2.61e-07 1.1e-07 1.54e-07 3.7e-07 8.17e-08 2.6e-07 1.65e-07 3.32e-07 2.98e-07 4.74e-07 9.15e-08 1.32e-07 1.63e-07 1.17e-07 2.96e-07 1.5e-07 8.25e-08 1.59e-07 2.51e-07 2.26e-07 1.03e-07 4.11e-07 2.01e-07 1.87e-07 1.85e-07 2.11e-07 2.59e-07 1.88e-07 7.69e-08 5.55e-08 1.18e-07 1.69e-07 6.33e-08 6.95e-08 6.46e-08 5.89e-08 5.72e-08 4.63e-08 2.65e-07 1.96e-08 1.13e-08 9.15e-08 9.31e-09 9.83e-08 3.04e-09 5.52e-08