logo

Genes within 1Mb (chr12:105718681:TA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0295 0.103 0.205 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.04e-01 0.0357 0.0534 0.205 B L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 7.65e-01 0.0236 0.0786 0.205 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 3.65e-01 0.0454 0.05 0.205 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0222 0.0799 0.205 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 4.77e-01 0.0687 0.0964 0.205 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0198 0.0642 0.205 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 4.23e-01 0.0551 0.0687 0.205 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0589 0.0749 0.205 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.23e-01 0.0634 0.064 0.205 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.81e-01 -0.011 0.0739 0.205 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 1.79e-01 0.0978 0.0725 0.205 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 1.91e-01 -0.132 0.1 0.205 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.01e-01 -0.107 0.0648 0.205 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 7.06e-01 0.0213 0.0563 0.205 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0162 0.0885 0.205 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0376 0.0585 0.205 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0835 0.205 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.0932 0.205 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.46e-01 0.039 0.0846 0.205 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.90e-01 -0.028 0.0519 0.205 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00412 0.0372 0.205 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 1.61e-01 0.143 0.102 0.209 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.32e-01 0.106 0.0699 0.209 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0246 0.105 0.209 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 1.50e-02 0.205 0.0834 0.209 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 2.56e-01 0.0816 0.0716 0.209 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0185 0.0642 0.209 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.10e-01 0.169 0.105 0.209 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0317 0.043 0.209 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 1.01e-01 -0.145 0.0878 0.205 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0804 0.0631 0.205 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 6.21e-01 0.0496 0.1 0.205 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0555 0.0491 0.205 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0377 0.0865 0.205 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0226 0.0735 0.205 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 5.08e-01 0.0636 0.0959 0.205 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 1.70e-01 0.133 0.0969 0.206 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 1.08e-01 0.154 0.0953 0.206 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 8.82e-01 0.0129 0.0871 0.206 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0202 0.0859 0.206 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.52e-01 0.0534 0.0895 0.206 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0132 0.11 0.206 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 8.10e-01 0.0191 0.0793 0.206 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 2.22e-02 0.148 0.0642 0.206 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 1.95e-01 0.142 0.11 0.205 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 4.21e-01 0.0555 0.0688 0.205 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 6.79e-01 0.0372 0.0898 0.205 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 8.42e-01 0.0236 0.118 0.205 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.03e-01 0.0316 0.083 0.205 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 3.95e-01 0.0719 0.0844 0.205 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 5.43e-01 0.042 0.069 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 9.18e-01 0.0119 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 2.82e-01 -0.119 0.11 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 1.49e-01 0.179 0.124 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 8.71e-01 0.0192 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 1.33e-01 0.133 0.0878 0.196 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 3.51e-01 0.114 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.94e-01 0.159 0.122 0.196 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0493 0.119 0.196 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0251 0.116 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0184 0.0858 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 4.07e-02 0.208 0.101 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 1.99e-01 0.113 0.0878 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00274 0.0969 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 8.41e-01 0.0226 0.112 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.04e-01 0.0667 0.0995 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0691 0.104 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0914 0.116 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.19e-02 0.246 0.0971 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0779 0.106 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00121 0.0879 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 7.46e-01 0.0335 0.103 0.207 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 3.51e-01 -0.111 0.119 0.207 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 3.96e-02 0.201 0.0972 0.207 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 9.05e-01 0.0107 0.0903 0.207 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0148 0.106 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.42e-01 0.0762 0.08 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 1.35e-01 -0.134 0.0893 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.35e-01 0.0958 0.0804 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0931 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 3.92e-01 0.0993 0.116 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.02e-01 -0.129 0.0782 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.41e-01 0.152 0.103 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 5.96e-01 0.0601 0.113 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 2.71e-01 0.108 0.0981 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 2.93e-01 0.099 0.0939 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0025 0.085 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 2.17e-01 0.11 0.089 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 2.19e-01 0.148 0.12 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 6.42e-01 -0.039 0.0838 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 7.14e-01 0.0383 0.104 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0911 0.0895 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 7.61e-01 0.0341 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.51e-01 0.123 0.107 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 2.10e-01 -0.135 0.107 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0944 0.113 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.09e-01 -0.104 0.0646 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 9.28e-01 0.00755 0.0836 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.98e-01 0.0607 0.0717 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000744 0.0766 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.42e-01 0.0882 0.0752 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0649 0.11 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.78e-02 -0.126 0.0714 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 5.62e-01 0.057 0.0981 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 2.62e-01 -0.106 0.094 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0321 0.0692 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0132 0.0901 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.66e-01 0.0677 0.0927 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 3.71e-01 -0.103 0.114 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0376 0.0762 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00364 0.0755 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0599 0.117 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.31e-01 0.0578 0.092 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.81e-02 -0.166 0.1 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 9.23e-01 -0.011 0.114 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 2.53e-01 -0.126 0.11 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.08e-01 -0.148 0.0916 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0832 0.0737 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0498 0.107 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.11e-01 -0.152 0.0949 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0967 0.09 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 6.22e-02 -0.186 0.0992 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0276 0.118 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 7.90e-01 0.0202 0.0757 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0238 0.0987 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.86e-01 -0.048 0.088 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 2.04e-01 -0.115 0.0901 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0624 0.098 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.33e-01 0.0504 0.105 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0806 0.0784 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.72e-01 0.115 0.0837 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0339 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.73e-01 0.0883 0.0988 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0275 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0749 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 3.86e-01 0.104 0.119 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 9.99e-01 -9.23e-05 0.0955 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 9.40e-03 -0.272 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 9.84e-01 0.00224 0.115 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0309 0.106 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.18e-01 -0.012 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00773 0.121 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0249 0.118 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.10e-01 0.0411 0.11 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 7.16e-01 0.0327 0.0899 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.30e-01 0.0529 0.11 0.206 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 4.52e-01 -0.074 0.0982 0.206 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 7.94e-01 0.0276 0.105 0.206 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 8.91e-01 0.017 0.124 0.206 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 4.16e-01 0.0903 0.111 0.206 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0595 0.1 0.206 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.15e-01 -0.131 0.0828 0.206 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.48e-03 0.29 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 2.76e-01 0.102 0.0935 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 9.81e-01 0.00213 0.0879 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.65e-01 0.0179 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.12e-01 0.0709 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0339 0.117 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 4.92e-01 0.0771 0.112 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 6.13e-01 0.0514 0.101 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0336 0.0989 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 1.03e-01 0.157 0.0961 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.37e-01 0.0954 0.099 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00121 0.0891 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.91e-01 0.0672 0.0974 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 8.84e-01 0.0171 0.117 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.50e-01 0.0278 0.087 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.58e-03 0.204 0.0691 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 5.10e-01 0.0743 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 3.08e-01 0.112 0.11 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 4.09e-01 0.0838 0.101 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0257 0.112 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0641 0.115 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.21e-01 0.0416 0.116 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0331 0.114 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.81e-01 0.0732 0.0835 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.72e-02 0.189 0.11 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 8.22e-01 0.023 0.102 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.32e-01 -0.152 0.101 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00999 0.107 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.39e-01 0.0638 0.104 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0135 0.115 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.61e-01 0.0277 0.0907 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.65e-01 0.106 0.0759 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 2.06e-01 0.196 0.154 0.17 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.97e-01 0.0462 0.0872 0.17 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 2.01e-01 0.201 0.156 0.17 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.99e-01 -0.091 0.134 0.17 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 5.45e-01 0.0866 0.143 0.17 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.34e-03 -0.373 0.137 0.17 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 2.88e-01 0.155 0.145 0.17 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.22e-02 0.21 0.0968 0.17 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0343 0.112 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00342 0.0585 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 3.95e-02 0.218 0.105 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 1.55e-01 -0.168 0.117 0.207 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 2.28e-02 -0.204 0.089 0.207 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0515 0.0901 0.207 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 9.85e-01 0.00141 0.0753 0.207 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0424 0.112 0.205 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0254 0.0829 0.205 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 5.54e-01 0.0585 0.0988 0.205 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0934 0.11 0.205 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0346 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0125 0.0894 0.205 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0132 0.0715 0.205 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.36e-02 0.19 0.0764 0.21 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 3.16e-01 -0.111 0.11 0.21 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 7.44e-02 0.175 0.0976 0.21 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 1.58e-01 0.121 0.0854 0.21 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0282 0.0763 0.21 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 2.96e-01 0.121 0.115 0.21 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0339 0.0826 0.21 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 3.20e-01 -0.105 0.105 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0392 0.0722 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 5.79e-01 0.0604 0.109 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0601 0.0559 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00192 0.0913 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 1.86e-01 -0.114 0.0858 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0952 0.101 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 3.25e-01 -0.107 0.109 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0939 0.0793 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.99e-01 0.000211 0.118 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 7.57e-01 0.0255 0.0821 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0584 0.098 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 9.69e-01 0.00365 0.0932 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 4.95e-01 0.0688 0.101 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0728 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 6.15e-02 0.218 0.116 0.224 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 4.24e-01 0.0929 0.116 0.224 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.08e-01 0.172 0.136 0.224 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.48e-01 0.0622 0.136 0.224 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 8.39e-01 0.0259 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0896 0.108 0.224 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 4.17e-01 0.0846 0.104 0.211 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 2.66e-01 -0.118 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0368 0.111 0.211 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 6.96e-02 0.17 0.0932 0.211 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0782 0.114 0.211 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.211 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 6.35e-01 0.0468 0.0983 0.211 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 9.85e-01 0.00185 0.0986 0.213 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 8.89e-01 0.0143 0.102 0.213 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 1.53e-01 -0.149 0.104 0.213 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0388 0.0703 0.213 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 9.99e-01 0.000122 0.113 0.213 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0313 0.1 0.213 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.06e-01 0.112 0.109 0.213 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 4.58e-02 0.236 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 9.83e-01 0.00166 0.0761 0.22 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 3.06e-01 0.12 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.11 0.22 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 3.07e-01 0.0883 0.0861 0.22 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.34e-01 0.0359 0.0753 0.22 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 3.54e-01 -0.106 0.114 0.22 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 3.47e-01 0.0683 0.0723 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0793 0.116 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.89e-01 0.103 0.078 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 4.36e-01 0.0769 0.0986 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.37e-01 0.0549 0.0705 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 6.90e-01 0.041 0.102 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.88e-01 0.0431 0.107 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.30e-02 0.183 0.094 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 7.47e-01 0.0314 0.097 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.20e-01 0.0536 0.108 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.00e-01 0.0833 0.0801 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0773 0.0821 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 3.91e-01 0.0603 0.0701 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 759937 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00728 0.0859 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.74e-02 0.206 0.116 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0575 0.07 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 2.01e-01 0.126 0.0984 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 1.18e-01 -0.156 0.0993 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0605 0.0694 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 5.06e-01 0.0715 0.107 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.58e-01 -0.039 0.0525 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0562 0.0858 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0431 0.0738 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0408 0.0975 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 6.89e-01 0.0377 0.094 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 1.34e-01 -0.139 0.0923 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0959 0.104 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00699 0.0619 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0342 0.112 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0138 0.0962 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 2.25e-01 0.133 0.109 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -639067 sc-eQTL 7.55e-01 0.0313 0.1 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -421352 sc-eQTL 1.99e-01 0.124 0.0961 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -585598 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00225 0.0917 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 482478 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00341 0.0857 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 611357 sc-eQTL 4.36e-01 0.0732 0.0937 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 732365 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0454 0.113 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 sc-eQTL 7.94e-01 0.0204 0.0784 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 483391 sc-eQTL 1.53e-02 0.158 0.0647 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 -583248 eQTL 0.035 -0.0379 0.0179 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina