logo

Genes within 1Mb (chr12:105713472:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0221 0.105 0.205 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.11e-01 0.0356 0.0541 0.205 B L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0235 0.0796 0.205 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 2.93e-01 0.0534 0.0506 0.205 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0553 0.0808 0.205 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 6.04e-01 0.0508 0.0977 0.205 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.00e-01 -0.025 0.065 0.205 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.40e-01 0.0427 0.0696 0.205 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0326 0.0761 0.205 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.56e-01 0.0486 0.065 0.205 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0171 0.075 0.205 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.27e-01 0.113 0.0735 0.205 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0967 0.102 0.205 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 1.05e-01 -0.107 0.0658 0.205 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 7.58e-01 0.0176 0.0572 0.205 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0139 0.09 0.205 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0718 0.0592 0.205 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0953 0.0849 0.205 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0588 0.095 0.205 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 3.42e-01 0.0818 0.0858 0.205 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0294 0.0527 0.205 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 9.85e-01 0.000717 0.0378 0.205 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 1.74e-01 0.141 0.103 0.209 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 2.23e-01 0.0869 0.071 0.209 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0402 0.106 0.209 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.39e-02 0.21 0.0846 0.209 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 2.56e-01 0.0827 0.0726 0.209 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0136 0.0651 0.209 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 3.98e-02 0.219 0.106 0.209 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0265 0.0436 0.209 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 2.57e-01 -0.101 0.0889 0.205 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0577 0.0638 0.205 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.72e-01 0.00362 0.101 0.205 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0426 0.0496 0.205 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0248 0.0873 0.205 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0192 0.0742 0.205 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.74e-01 0.0545 0.0968 0.205 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 1.19e-01 0.153 0.098 0.206 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 5.58e-02 0.185 0.0963 0.206 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0456 0.0882 0.206 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.36e-01 -0.018 0.087 0.206 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 5.92e-01 0.0487 0.0907 0.206 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0178 0.112 0.206 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 8.55e-01 0.0147 0.0804 0.206 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.84e-02 0.154 0.065 0.206 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 9.53e-02 0.186 0.111 0.205 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.68e-01 0.0207 0.0702 0.205 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.31e-01 0.0315 0.0915 0.205 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.20e-01 -0.012 0.12 0.205 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.66e-01 0.0252 0.0846 0.205 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 2.68e-01 0.0953 0.0859 0.205 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 4.88e-01 0.0488 0.0703 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.48e-01 0.0227 0.118 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.21e-01 -0.174 0.112 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 3.27e-01 0.125 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.18e-01 0.0125 0.121 0.196 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 1.58e-01 0.127 0.0897 0.196 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 1.53e-01 0.179 0.125 0.196 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 6.13e-02 0.234 0.124 0.196 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0699 0.121 0.196 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0136 0.117 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0312 0.0868 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 1.72e-01 0.141 0.103 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.20e-01 0.138 0.0887 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0167 0.098 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.20e-01 0.0259 0.113 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.13e-01 0.0372 0.101 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0503 0.105 0.204 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0663 0.118 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.33e-02 0.245 0.0982 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0668 0.107 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0456 0.0888 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0135 0.104 0.207 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0687 0.12 0.207 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 6.74e-02 0.181 0.0985 0.207 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0176 0.0913 0.207 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0551 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.30e-01 0.0511 0.0812 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.45e-02 -0.152 0.0903 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.34e-01 0.122 0.0813 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 1.65e-01 -0.131 0.0942 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.29e-01 0.0254 0.117 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 6.75e-02 -0.145 0.0791 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.36e-01 0.156 0.104 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 4.06e-01 0.0952 0.114 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 3.74e-01 0.0884 0.0992 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 3.77e-01 0.0841 0.0949 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.07e-01 -0.01 0.086 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 3.85e-01 0.0784 0.0901 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 2.06e-01 0.154 0.122 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0337 0.0847 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 9.00e-01 0.0132 0.105 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 9.06e-02 0.187 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 3.71e-01 -0.082 0.0914 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 3.89e-01 0.0982 0.114 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.29e-01 0.107 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.97e-02 -0.186 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0941 0.116 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0967 0.066 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.74e-01 0.0135 0.085 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.58e-01 0.0543 0.0729 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.48e-01 -0.015 0.0779 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0764 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0493 0.112 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.49e-02 -0.13 0.0726 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 4.98e-01 0.0676 0.0997 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 2.67e-01 -0.106 0.0955 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0321 0.0703 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00142 0.0915 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.74e-01 0.0839 0.0941 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0824 0.116 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0444 0.0774 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0126 0.0766 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 9.36e-01 0.00952 0.119 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.90e-01 0.0505 0.0936 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.41e-02 -0.171 0.102 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0216 0.116 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0627 0.112 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 2.43e-01 -0.109 0.0934 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.36e-01 -0.112 0.0748 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0284 0.109 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.27e-02 -0.187 0.0958 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0747 0.0912 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.58e-01 -0.093 0.101 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.73e-01 0.0345 0.12 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 2.41e-01 -0.122 0.103 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 7.53e-01 0.0242 0.0766 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0506 0.0998 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0866 0.0889 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 1.90e-01 -0.12 0.0912 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0399 0.0992 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 4.70e-01 0.0772 0.107 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0727 0.0794 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.97e-01 0.11 0.0848 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0385 0.115 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.55e-01 0.075 0.1 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0222 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.22e-01 0.0111 0.114 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 2.29e-01 0.146 0.121 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 9.89e-01 0.00128 0.0968 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.95e-02 -0.248 0.105 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.17e-01 0.0425 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0133 0.108 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0192 0.119 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.96e-01 0.00069 0.123 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.70e-01 -0.035 0.12 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 5.53e-01 0.0667 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 9.55e-01 0.00521 0.0916 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 5.23e-01 0.0709 0.111 0.206 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0993 0.206 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.66e-01 0.0179 0.106 0.206 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 8.98e-01 -0.016 0.125 0.206 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 4.85e-01 0.0786 0.112 0.206 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0375 0.101 0.206 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 8.84e-02 -0.143 0.0837 0.206 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.84e-03 0.289 0.107 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 1.22e-01 0.148 0.0949 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0275 0.0895 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.58e-01 0.0329 0.107 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 5.82e-01 0.0607 0.11 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.26e-01 0.0263 0.119 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.33e-01 0.039 0.114 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.16e-01 0.067 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0256 0.1 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 3.61e-02 0.205 0.0971 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.74e-01 0.0289 0.101 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0152 0.0904 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 6.90e-01 0.0395 0.0989 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.57e-01 0.0214 0.119 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 5.04e-01 0.059 0.0882 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 4.74e-03 0.2 0.0702 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 5.63e-01 0.066 0.114 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 1.34e-01 0.167 0.111 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.91e-01 0.0553 0.103 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0248 0.113 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0716 0.117 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.16e-01 0.0429 0.118 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0997 0.115 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 4.65e-01 0.0619 0.0846 0.21 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 4.92e-02 0.22 0.111 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 7.74e-01 0.0299 0.104 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.14e-01 -0.162 0.102 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.46e-01 0.00733 0.109 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.86e-01 0.0913 0.105 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0375 0.116 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 8.11e-01 0.0221 0.092 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.58e-01 0.109 0.0769 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 1.99e-01 0.198 0.154 0.174 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.80e-01 0.0614 0.0866 0.174 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 2.25e-01 0.19 0.156 0.174 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0996 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 4.93e-01 0.0978 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 1.10e-02 -0.353 0.136 0.174 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 2.60e-01 0.163 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.61e-02 0.234 0.0958 0.174 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0335 0.114 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.88e-01 -0.016 0.0595 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.32e-02 0.193 0.107 0.207 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.207 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 5.49e-02 -0.176 0.0909 0.207 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 8.02e-01 -0.023 0.0917 0.207 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 6.05e-01 0.0397 0.0766 0.207 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0479 0.114 0.205 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0699 0.0838 0.205 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 6.96e-01 0.0392 0.1 0.205 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0802 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.83e-01 0.00238 0.112 0.205 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0021 0.0905 0.205 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 8.90e-01 0.01 0.0724 0.205 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.32e-01 0.0225 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.82e-02 0.185 0.0775 0.21 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 2.23e-01 -0.136 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0994 0.21 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 1.96e-01 0.113 0.0866 0.21 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.00e-01 0.00969 0.0773 0.21 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 1.23e-01 0.181 0.117 0.21 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0451 0.0837 0.21 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0885 0.106 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0102 0.073 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.29e-01 0.00975 0.11 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0522 0.0565 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000359 0.0922 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 1.99e-01 -0.112 0.0867 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.96e-01 -0.132 0.102 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0469 0.11 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0559 0.0801 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.94e-01 0.000894 0.119 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 6.32e-01 0.0397 0.0827 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.82e-01 0.0022 0.0988 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 9.80e-01 0.00237 0.094 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.26e-01 0.0645 0.101 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 8.96e-01 0.0163 0.124 0.221 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.04e-01 0.192 0.117 0.221 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.64e-01 0.0353 0.117 0.221 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 2.51e-01 0.159 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 8.57e-01 0.0248 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.63e-01 0.039 0.129 0.221 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0662 0.109 0.221 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 3.80e-01 0.0927 0.105 0.211 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0652 0.108 0.211 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00964 0.113 0.211 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.67e-02 0.158 0.0946 0.211 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0716 0.115 0.211 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 2.61e-01 -0.135 0.12 0.211 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 6.25e-01 0.0487 0.0996 0.211 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 5.90e-01 0.0537 0.0996 0.213 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 9.49e-01 0.00661 0.103 0.213 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 1.11e-01 -0.167 0.105 0.213 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0114 0.0711 0.213 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0135 0.114 0.213 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00342 0.101 0.213 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 3.69e-01 0.0992 0.11 0.213 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.77e-02 0.219 0.119 0.22 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0261 0.0773 0.22 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 3.18e-01 0.119 0.118 0.22 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 8.65e-02 0.193 0.112 0.22 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 3.02e-01 0.0905 0.0875 0.22 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00444 0.0765 0.22 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0412 0.116 0.22 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 3.13e-01 0.0743 0.0734 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0485 0.117 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 2.15e-01 0.0981 0.0789 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 8.75e-01 0.0157 0.0999 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 4.59e-01 0.0529 0.0713 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 9.19e-01 0.0106 0.104 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 3.83e-01 0.0946 0.108 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 7.78e-02 0.169 0.0952 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 8.07e-01 0.024 0.0981 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 7.73e-01 0.0316 0.109 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.58e-01 0.0477 0.0813 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0976 0.0831 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 2.90e-01 0.0753 0.0709 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 754728 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0442 0.087 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 1.82e-01 0.158 0.118 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0667 0.0709 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 2.45e-01 0.116 0.0998 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 2.44e-01 -0.117 0.1 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0269 0.07 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 7.73e-01 0.0313 0.108 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0261 0.053 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0291 0.0866 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0468 0.0745 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0582 0.0983 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 4.23e-01 0.0763 0.095 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 1.81e-01 -0.125 0.0935 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0934 0.106 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 9.31e-01 0.00544 0.0626 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0395 0.114 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 9.60e-01 0.00483 0.0972 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.111 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -644276 sc-eQTL 5.49e-01 0.0609 0.102 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -426561 sc-eQTL 1.27e-01 0.149 0.0972 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -590807 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0929 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 477269 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00743 0.0869 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 606148 sc-eQTL 4.54e-01 0.0712 0.095 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 727156 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0682 0.115 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 sc-eQTL 8.07e-01 0.0195 0.0795 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 478182 sc-eQTL 1.37e-02 0.163 0.0656 0.205 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 -588457 eQTL 0.0172 -0.0426 0.0178 0.0 0.0 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina