logo

Genes within 1Mb (chr12:105711998:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0161 0.105 0.207 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 6.43e-01 0.0251 0.0541 0.207 B L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.99e-01 -8.7e-05 0.0796 0.207 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.36e-01 0.0488 0.0506 0.207 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0445 0.0808 0.207 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 6.67e-01 0.042 0.0977 0.207 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0276 0.065 0.207 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.31e-01 0.0549 0.0695 0.207 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0309 0.0762 0.207 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 6.06e-01 0.0336 0.0651 0.207 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0193 0.075 0.207 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.70e-01 0.101 0.0736 0.207 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 2.70e-01 -0.113 0.102 0.207 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 1.28e-01 -0.101 0.0659 0.207 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 7.74e-01 0.0165 0.0573 0.207 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.42e-01 -0.018 0.09 0.207 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0796 0.0592 0.207 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0954 0.0849 0.207 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0579 0.095 0.207 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 3.82e-01 0.0753 0.0859 0.207 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0321 0.0527 0.207 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 9.93e-01 0.000355 0.0378 0.207 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 1.40e-01 0.153 0.103 0.212 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.86e-01 0.0941 0.071 0.212 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0418 0.106 0.212 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.03e-02 0.219 0.0845 0.212 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 2.60e-01 0.0819 0.0726 0.212 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0108 0.0652 0.212 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 5.94e-02 0.201 0.106 0.212 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0312 0.0436 0.212 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0996 0.0889 0.207 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0577 0.0638 0.207 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.76e-01 0.00304 0.101 0.207 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.76e-01 -0.044 0.0496 0.207 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0334 0.0872 0.207 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0128 0.0742 0.207 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 5.09e-01 0.0639 0.0967 0.207 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 9.29e-02 0.165 0.0978 0.208 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 5.54e-02 0.185 0.0961 0.208 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0539 0.0881 0.208 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0302 0.0869 0.208 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 6.11e-01 0.0461 0.0906 0.208 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.23e-01 -0.025 0.111 0.208 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 8.93e-01 0.0108 0.0803 0.208 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.40e-02 0.161 0.0648 0.208 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 1.10e-01 0.178 0.111 0.207 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.05e-01 0.0173 0.0701 0.207 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.26e-01 0.032 0.0914 0.207 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0223 0.12 0.207 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.72e-01 0.0245 0.0845 0.207 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.65e-01 0.0959 0.0857 0.207 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.68e-01 0.051 0.0702 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.95e-01 0.0156 0.118 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.70e-01 -0.154 0.112 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 2.98e-01 0.132 0.126 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 9.12e-01 0.0134 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 1.70e-01 0.123 0.0894 0.199 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 1.90e-01 0.164 0.124 0.199 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.96e-02 0.226 0.124 0.199 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0297 0.121 0.199 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 7.59e-01 -0.036 0.117 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0525 0.0867 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 1.05e-01 0.167 0.103 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.40e-01 0.132 0.0888 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0346 0.098 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.03e-01 0.0284 0.113 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 7.15e-01 0.0368 0.101 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0435 0.105 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0721 0.118 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.83e-02 0.234 0.0983 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0522 0.107 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0378 0.0888 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 9.96e-01 0.0005 0.104 0.209 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.23e-01 -0.077 0.12 0.209 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 7.97e-02 0.173 0.0985 0.209 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 9.54e-01 0.00532 0.0912 0.209 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0163 0.108 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.61e-01 0.0473 0.0812 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 1.43e-01 -0.133 0.0905 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.61e-01 0.114 0.0814 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 1.61e-01 -0.132 0.0941 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.97e-01 0.0153 0.117 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.90e-02 -0.145 0.0791 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.21e-01 0.162 0.104 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 4.83e-01 0.0804 0.114 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 3.68e-01 0.0894 0.0992 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 3.14e-01 0.0957 0.0948 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0151 0.0859 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 2.57e-01 0.102 0.0899 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 2.29e-01 0.147 0.122 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0377 0.0847 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 8.90e-01 0.0146 0.105 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.97e-02 0.188 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0888 0.0914 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 3.91e-01 0.0979 0.114 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 2.49e-01 0.126 0.109 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 1.07e-01 -0.177 0.109 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0824 0.116 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.16e-01 -0.104 0.0659 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 7.07e-01 0.032 0.0851 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.82e-01 0.0403 0.0731 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0155 0.078 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 2.16e-01 0.095 0.0766 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0578 0.112 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 8.27e-02 -0.127 0.0727 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.60e-01 0.0739 0.0998 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 2.45e-01 -0.111 0.0955 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0449 0.0703 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00541 0.0916 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.96e-01 0.0801 0.0942 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 3.82e-01 -0.102 0.116 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0326 0.0775 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0177 0.0767 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0117 0.119 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 7.10e-01 0.0348 0.0936 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.49e-02 -0.176 0.102 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0355 0.116 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0837 0.112 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.29e-01 -0.113 0.0933 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.04e-01 -0.122 0.0747 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0515 0.109 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 6.52e-02 -0.178 0.096 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 4.00e-01 -0.077 0.0913 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 2.74e-01 -0.111 0.101 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.24e-01 0.0267 0.12 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.103 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 6.57e-01 0.0341 0.0766 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0393 0.0998 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 2.61e-01 -0.1 0.0888 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 1.71e-01 -0.125 0.0911 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 7.17e-01 -0.036 0.0992 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.05e-01 0.0711 0.107 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0761 0.0794 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 2.43e-01 0.0994 0.0848 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0488 0.115 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 4.33e-01 0.0787 0.1 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0208 0.113 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 9.34e-01 0.00946 0.114 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 2.66e-01 0.135 0.121 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 1.00e+00 2.14e-05 0.0967 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.98e-02 -0.248 0.105 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.70e-01 0.0192 0.117 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0222 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00591 0.119 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00705 0.123 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0516 0.12 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 4.62e-01 0.0827 0.112 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 9.21e-01 0.00915 0.0916 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.61e-01 0.0644 0.111 0.208 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 2.93e-01 -0.105 0.0991 0.208 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.77e-01 0.0164 0.106 0.208 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0277 0.125 0.208 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.11e-01 0.0738 0.112 0.208 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0352 0.101 0.208 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 9.74e-02 -0.139 0.0837 0.208 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 8.47e-03 0.285 0.107 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 1.30e-01 0.144 0.0948 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0204 0.0894 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.25e-01 0.0236 0.106 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 5.30e-01 0.0691 0.11 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.90e-01 0.0165 0.119 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 7.18e-01 0.0412 0.114 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.72e-01 0.0741 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00739 0.1 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 3.99e-02 0.201 0.097 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.96e-01 0.0131 0.101 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0299 0.0904 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 7.58e-01 0.0304 0.0988 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.29e-01 0.0105 0.119 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 5.19e-01 0.057 0.0882 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 3.68e-03 0.206 0.0701 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.50e-01 0.0681 0.114 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 1.92e-01 0.145 0.111 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.36e-01 0.0635 0.102 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0215 0.113 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0477 0.117 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.54e-01 0.0368 0.118 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 3.78e-01 -0.102 0.115 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.21e-01 0.068 0.0844 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 4.17e-02 0.228 0.111 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 7.19e-01 0.0374 0.104 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 7.33e-02 -0.183 0.102 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00324 0.109 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 4.94e-01 0.0719 0.105 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0348 0.116 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 8.24e-01 0.0204 0.0918 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.17e-01 0.121 0.0766 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 1.99e-01 0.198 0.154 0.174 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 4.80e-01 0.0614 0.0866 0.174 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 2.25e-01 0.19 0.156 0.174 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0996 0.133 0.174 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 4.93e-01 0.0978 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 1.10e-02 -0.353 0.136 0.174 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.60e-01 0.163 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.61e-02 0.234 0.0958 0.174 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0122 0.114 0.209 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00262 0.0594 0.209 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 5.46e-02 0.207 0.107 0.209 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.17e-01 -0.188 0.119 0.209 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.10e-02 -0.178 0.0908 0.209 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0262 0.0916 0.209 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 7.82e-01 0.0212 0.0765 0.209 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0603 0.114 0.207 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0695 0.0839 0.207 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.52e-01 0.0317 0.1 0.207 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0981 0.111 0.207 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 8.93e-01 -0.015 0.112 0.207 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 9.70e-01 0.0034 0.0906 0.207 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 8.67e-01 0.0121 0.0724 0.207 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 7.46e-01 0.0343 0.106 0.212 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.85e-02 0.184 0.0774 0.212 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 2.10e-01 -0.14 0.111 0.212 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.63e-01 0.139 0.0992 0.212 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 1.68e-01 0.12 0.0865 0.212 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.60e-01 0.00385 0.0773 0.212 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.04e-01 0.149 0.117 0.212 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0471 0.0836 0.212 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0872 0.106 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0116 0.0729 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.57e-01 0.00594 0.11 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0581 0.0564 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0084 0.0922 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.40e-01 -0.102 0.0867 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 2.19e-01 -0.125 0.102 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0614 0.11 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0539 0.0801 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0156 0.119 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 5.74e-01 0.0465 0.0827 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00666 0.0988 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 9.77e-01 0.00271 0.094 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 4.63e-01 0.0746 0.101 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000588 0.125 0.224 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.32e-01 0.178 0.118 0.224 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 7.61e-01 0.0358 0.118 0.224 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 2.05e-01 0.176 0.138 0.224 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.29e-01 0.0478 0.138 0.224 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.96e-01 0.0505 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0689 0.109 0.224 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 3.57e-01 0.0973 0.105 0.213 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0691 0.108 0.213 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.113 0.213 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.05e-01 0.154 0.0946 0.213 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0743 0.115 0.213 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 2.76e-01 -0.132 0.12 0.213 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 5.73e-01 0.0562 0.0996 0.213 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.64e-01 0.0575 0.0996 0.215 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.86e-01 0.0148 0.103 0.215 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 1.29e-01 -0.16 0.105 0.215 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0197 0.0711 0.215 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00352 0.114 0.215 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 9.68e-01 0.00412 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 3.59e-01 0.101 0.11 0.215 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.35e-02 0.232 0.119 0.223 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0152 0.0772 0.223 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 3.12e-01 0.12 0.118 0.223 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 1.04e-01 0.183 0.112 0.223 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 3.48e-01 0.0823 0.0874 0.223 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 9.95e-01 0.000501 0.0765 0.223 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 6.99e-01 -0.045 0.116 0.223 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 3.79e-01 0.0647 0.0734 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0699 0.117 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 3.24e-01 0.0782 0.0791 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 6.95e-01 0.0393 0.0999 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 4.72e-01 0.0514 0.0713 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 9.58e-01 0.00547 0.104 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 4.05e-01 0.0904 0.108 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 9.26e-02 0.161 0.0953 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 6.33e-01 0.0469 0.0982 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 5.90e-01 0.0589 0.109 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 5.76e-01 0.0455 0.0813 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0778 0.0832 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 3.55e-01 0.0658 0.071 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 753254 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0299 0.0871 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 2.11e-01 0.148 0.118 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0664 0.0709 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0998 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 2.30e-01 -0.121 0.1 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0266 0.07 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.27e-01 0.0237 0.108 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0269 0.053 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0394 0.0865 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0415 0.0744 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0508 0.0983 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 3.94e-01 0.0812 0.095 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 1.88e-01 -0.123 0.0935 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0753 0.106 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 9.86e-01 0.00113 0.0626 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0339 0.114 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 9.06e-01 0.0115 0.0973 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 2.60e-01 0.125 0.111 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645750 sc-eQTL 4.57e-01 0.0756 0.101 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -428035 sc-eQTL 1.31e-01 0.147 0.0971 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592281 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0683 0.0928 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475795 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0191 0.0868 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604674 sc-eQTL 5.02e-01 0.0639 0.0949 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725682 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0741 0.114 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 sc-eQTL 8.32e-01 0.0168 0.0794 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476708 sc-eQTL 1.03e-02 0.169 0.0654 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 -589931 eQTL 0.0187 -0.042 0.0178 0.0 0.0 0.197

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina