logo

Genes within 1Mb (chr12:105711871:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0105 0.134 0.124 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0364 0.069 0.124 B L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.00e-01 -0.13 0.101 0.124 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0302 0.0647 0.124 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0386 0.103 0.124 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.60e-02 0.207 0.124 0.124 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0639 0.0828 0.124 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0874 0.0886 0.124 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0384 0.0974 0.124 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0846 0.083 0.124 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.71e-01 0.105 0.0956 0.124 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0945 0.0943 0.124 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.06e-02 0.221 0.13 0.124 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.61e-01 0.0624 0.0846 0.124 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 2.42e-02 -0.164 0.0723 0.124 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.98e-02 0.213 0.117 0.124 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 1.41e-01 -0.114 0.0775 0.124 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 4.73e-02 0.221 0.111 0.124 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 4.19e-01 0.101 0.124 0.124 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0389 0.113 0.124 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 5.10e-01 0.0456 0.0691 0.124 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0254 0.0495 0.124 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0132 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0401 0.0906 0.128 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.62e-01 0.00644 0.135 0.128 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.29e-01 0.0527 0.109 0.128 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0868 0.0924 0.128 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 5.10e-01 0.0545 0.0827 0.128 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 2.15e-01 0.169 0.136 0.128 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.34e-01 0.0536 0.0554 0.128 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.22e-01 0.0258 0.115 0.124 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 1.34e-01 -0.123 0.0817 0.124 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 7.07e-01 0.0488 0.13 0.124 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00397 0.0639 0.124 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.38e-01 0.00878 0.112 0.124 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00816 0.0954 0.124 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.96e-01 -0.106 0.124 0.124 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 4.16e-01 -0.104 0.127 0.124 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 1.86e-01 -0.166 0.125 0.124 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0436 0.114 0.124 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 4.74e-01 0.0804 0.112 0.124 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0421 0.117 0.124 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.18e-01 -0.144 0.144 0.124 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 2.64e-01 -0.116 0.103 0.124 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.86e-01 0.0736 0.0847 0.124 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0647 0.147 0.124 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 6.70e-02 -0.168 0.0913 0.124 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 3.24e-01 0.118 0.12 0.124 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 7.45e-02 0.28 0.156 0.124 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0994 0.111 0.124 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0235 0.113 0.124 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0168 0.0922 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.52e-03 0.463 0.144 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 3.34e-01 0.136 0.14 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0861 0.158 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0105 0.151 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 8.83e-02 -0.191 0.112 0.115 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 5.13e-01 0.102 0.156 0.115 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0188 0.157 0.115 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0808 0.152 0.115 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.17e-01 0.228 0.145 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 5.26e-01 0.0684 0.108 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0136 0.128 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 5.90e-01 0.0657 0.122 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 8.92e-02 0.239 0.14 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0654 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.23e-01 0.0838 0.131 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0834 0.145 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 5.08e-01 0.0814 0.123 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 7.07e-01 0.0498 0.133 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.62e-02 0.229 0.108 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0943 0.128 0.123 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 6.70e-01 0.0633 0.148 0.123 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 3.64e-02 -0.255 0.121 0.123 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 7.09e-01 0.0421 0.112 0.123 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 3.82e-01 -0.122 0.14 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0162 0.105 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 7.99e-01 0.03 0.118 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0599 0.106 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 1.86e-01 0.162 0.122 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 6.94e-01 0.06 0.152 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0669 0.103 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 1.78e-01 -0.183 0.135 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 3.76e-01 -0.128 0.145 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 3.92e-01 -0.108 0.125 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 3.44e-01 -0.114 0.12 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 2.45e-01 -0.126 0.108 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 1.95e-01 -0.148 0.114 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.53e-01 0.00917 0.154 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 5.49e-01 0.0643 0.107 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 8.15e-01 0.0312 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.93e-02 -0.313 0.132 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.28e-01 0.0386 0.111 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.23e-01 0.0134 0.138 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.62e-02 -0.22 0.131 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.80e-01 0.0942 0.133 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.69e-01 0.0231 0.14 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0323 0.0803 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 5.43e-01 0.0661 0.108 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0647 0.093 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0395 0.0993 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.42e-01 0.00714 0.0979 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 1.32e-01 0.215 0.142 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.44e-01 0.0713 0.0931 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 4.30e-02 -0.257 0.126 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0839 0.123 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 2.66e-01 -0.1 0.0901 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 1.83e-01 0.156 0.117 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.60e-01 -0.111 0.121 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 8.78e-02 0.255 0.149 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.37e-01 0.0774 0.0993 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 6.96e-03 -0.264 0.0968 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 4.63e-01 -0.112 0.152 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0633 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.95e-01 0.137 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 1.74e-01 -0.201 0.147 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.69e-01 0.129 0.143 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 3.19e-01 0.119 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.89e-02 -0.197 0.095 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.51e-01 0.026 0.138 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00961 0.123 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 7.94e-01 0.0303 0.116 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 5.05e-01 0.0857 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.05e-01 -0.126 0.151 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 6.16e-01 0.0661 0.132 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 1.23e-01 -0.15 0.0967 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.86e-01 0.168 0.127 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0209 0.114 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 1.48e-02 0.283 0.115 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 4.47e-01 0.0963 0.126 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.64e-01 0.0995 0.136 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.90e-01 0.014 0.101 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 9.39e-01 0.00825 0.109 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 2.79e-01 0.164 0.151 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 8.96e-02 -0.224 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.93e-02 0.322 0.147 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.55e-02 0.249 0.149 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 2.14e-01 -0.198 0.159 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 7.01e-01 0.0491 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.48e-01 -0.132 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 7.85e-01 0.0403 0.147 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.15e-01 0.0145 0.135 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 8.46e-01 0.029 0.149 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00703 0.154 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.09e-01 -0.153 0.15 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00317 0.141 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.115 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 3.98e-01 0.117 0.138 0.126 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0416 0.124 0.126 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0918 0.133 0.126 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 4.12e-02 0.318 0.155 0.126 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.80e-01 0.123 0.14 0.126 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0312 0.127 0.126 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 1.65e-01 0.146 0.105 0.126 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 7.46e-02 -0.24 0.134 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 5.64e-01 -0.068 0.118 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.99e-01 0.000162 0.11 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 1.75e-01 -0.178 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.32e-01 0.0651 0.136 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.64e-01 -0.134 0.147 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 7.07e-01 -0.053 0.141 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.25e-01 0.0809 0.127 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0665 0.127 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 2.64e-01 -0.139 0.124 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 1.46e-01 -0.185 0.127 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 1.05e-01 -0.185 0.114 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 5.90e-01 0.0675 0.125 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.75e-01 -0.108 0.15 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 1.50e-01 -0.161 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 9.84e-01 0.00178 0.0905 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 3.25e-01 -0.138 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 1.59e-01 -0.192 0.136 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 3.42e-01 0.12 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 8.78e-01 0.0214 0.139 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.39e-01 -0.011 0.144 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.81e-01 0.127 0.144 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0477 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0384 0.104 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0173 0.139 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 2.77e-01 -0.139 0.128 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0117 0.127 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 1.72e-02 0.318 0.132 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 2.63e-01 -0.145 0.129 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0733 0.143 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0563 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 2.75e-01 0.104 0.095 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 2.87e-01 0.179 0.167 0.137 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00686 0.0942 0.137 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 3.64e-01 -0.154 0.169 0.137 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0584 0.145 0.137 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 9.31e-01 0.0135 0.154 0.137 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 2.15e-01 0.189 0.151 0.137 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.76e-01 -0.112 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0714 0.106 0.137 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0271 0.142 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.83e-01 -0.052 0.074 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00866 0.134 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 8.42e-01 0.0297 0.149 0.126 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 7.11e-01 0.0423 0.114 0.126 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 1.23e-01 0.176 0.114 0.126 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 1.11e-02 -0.241 0.094 0.126 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 2.77e-01 0.156 0.143 0.124 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0428 0.106 0.124 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.72e-01 0.0536 0.126 0.124 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 7.48e-01 0.0452 0.141 0.124 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0655 0.141 0.124 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 7.50e-01 0.0364 0.114 0.124 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 2.33e-02 -0.206 0.0903 0.124 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.33e-01 0.0282 0.133 0.132 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0792 0.0987 0.132 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 7.26e-01 0.0494 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.75e-01 0.00388 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 2.37e-01 -0.129 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.61e-01 0.0716 0.097 0.132 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.32e-01 0.0314 0.147 0.132 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 4.51e-01 0.0794 0.105 0.132 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0828 0.136 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.69e-02 -0.154 0.0924 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0565 0.14 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 8.76e-01 0.0112 0.0722 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.32e-01 0.0101 0.118 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.13e-01 0.0262 0.111 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0645 0.13 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0692 0.138 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 3.57e-02 -0.211 0.0997 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.38e-01 0.176 0.149 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.20e-01 -0.103 0.104 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00917 0.124 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0594 0.118 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00361 0.128 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.21e-01 0.0386 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 1.39e-02 -0.396 0.159 0.112 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 4.55e-01 0.12 0.16 0.112 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.86e-01 0.164 0.189 0.112 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0395 0.189 0.112 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 6.90e-01 0.0705 0.176 0.112 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 7.80e-03 0.394 0.146 0.112 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0274 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.85e-01 -0.094 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0637 0.141 0.129 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.14e-01 -0.12 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0252 0.144 0.129 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 1.89e-01 0.198 0.15 0.129 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 2.63e-02 -0.276 0.123 0.129 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 8.14e-01 0.0294 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.24e-01 -0.103 0.129 0.127 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 4.17e-01 0.107 0.132 0.127 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 3.48e-01 0.0834 0.0887 0.127 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 1.25e-01 0.218 0.142 0.127 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 5.82e-01 0.0698 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.35e-01 0.0856 0.138 0.127 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.71e-01 -0.215 0.156 0.13 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00695 0.101 0.13 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0102 0.155 0.13 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.18e-01 0.0152 0.147 0.13 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 1.29e-01 -0.173 0.114 0.13 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.28e-01 0.0792 0.0997 0.13 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.62e-01 0.111 0.151 0.13 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0957 0.0958 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 1.55e-01 0.207 0.145 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 2.55e-01 0.112 0.0981 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.04e-01 0.046 0.0886 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0598 0.129 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 7.97e-02 0.235 0.134 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 3.08e-01 -0.122 0.119 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 5.82e-01 0.0673 0.122 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 2.24e-01 -0.171 0.141 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0347 0.105 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0541 0.108 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0719 0.0917 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 753127 sc-eQTL 7.26e-01 0.0394 0.112 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 4.38e-01 0.119 0.153 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0545 0.0916 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.56e-01 -0.119 0.129 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0537 0.128 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 4.85e-02 -0.175 0.0883 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 8.69e-01 0.0228 0.138 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00639 0.0674 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0117 0.11 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0227 0.0947 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0174 0.125 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 9.87e-01 0.00195 0.12 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0375 0.119 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00735 0.134 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 6.15e-01 0.0398 0.0791 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 3.28e-01 0.141 0.144 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 4.29e-01 0.0973 0.123 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 2.64e-01 -0.157 0.14 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -645877 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0648 0.13 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -428162 sc-eQTL 3.11e-01 -0.126 0.125 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -592408 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0382 0.119 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 475668 sc-eQTL 2.18e-01 0.137 0.111 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 604547 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0699 0.121 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 725555 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0851 0.146 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -590058 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 476581 sc-eQTL 3.77e-01 0.0751 0.0848 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136010 ALDH1L2 604228 eQTL 0.0489 0.0826 0.0419 0.0 0.0 0.105
ENSG00000235162 C12orf75 476581 eQTL 0.0158 -0.0671 0.0278 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -645877 3.92e-07 1.92e-07 6.41e-08 2.36e-07 1.07e-07 1.13e-07 3.11e-07 6.72e-08 2.04e-07 1.21e-07 2.18e-07 1.72e-07 3.18e-07 8.66e-08 7.79e-08 1.13e-07 6.81e-08 2.43e-07 7.76e-08 8e-08 1.39e-07 2.09e-07 1.89e-07 3.83e-08 2.86e-07 1.76e-07 1.37e-07 1.47e-07 1.44e-07 1.8e-07 1.35e-07 4.78e-08 3.8e-08 9.9e-08 6.87e-08 4.68e-08 5.26e-08 6.66e-08 5.8e-08 6.79e-08 4.89e-08 1.68e-07 3.53e-08 1.43e-08 4.99e-08 9.44e-09 9.23e-08 0.0 4.83e-08