logo

Genes within 1Mb (chr12:105698793:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0335 0.121 0.126 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0958 0.0621 0.126 B L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0821 0.0916 0.126 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0756 0.0583 0.126 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0451 0.0932 0.126 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.48e-01 0.0514 0.113 0.126 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.16e-01 0.0928 0.0747 0.126 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 2.54e-01 0.0916 0.0801 0.126 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0808 0.0872 0.126 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0235 0.0746 0.126 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.33e-02 -0.212 0.0848 0.126 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0186 0.0848 0.126 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 2.82e-01 0.126 0.117 0.126 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.17e-01 0.076 0.0758 0.126 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.51e-01 0.0209 0.0656 0.126 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.61e-01 0.0319 0.105 0.126 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0747 0.0689 0.126 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0841 0.0988 0.126 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.82e-02 0.194 0.11 0.126 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0102 0.1 0.126 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 9.38e-01 0.00475 0.0613 0.126 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0117 0.044 0.126 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 1.49e-01 -0.174 0.12 0.128 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.95e-01 -0.107 0.0826 0.128 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00478 0.124 0.128 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 3.18e-02 -0.214 0.0987 0.128 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 6.62e-01 0.037 0.0847 0.128 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 7.49e-01 0.0242 0.0758 0.128 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 8.96e-01 0.0164 0.125 0.128 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0101 0.0508 0.128 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0661 0.104 0.126 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.39e-03 -0.199 0.0734 0.126 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 7.03e-02 -0.213 0.117 0.126 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0224 0.0581 0.126 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 3.13e-01 0.103 0.102 0.126 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 4.26e-01 0.0691 0.0865 0.126 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.12e-01 -0.18 0.112 0.126 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 8.20e-02 0.198 0.114 0.127 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.93e-01 0.000891 0.102 0.127 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 2.23e-01 -0.123 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.127 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0668 0.129 0.127 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.00e-01 0.0966 0.093 0.127 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0364 0.0763 0.127 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 4.00e-01 0.106 0.126 0.126 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00377 0.0793 0.126 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.46e-01 0.00707 0.103 0.126 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.12e-01 0.0502 0.136 0.126 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 8.51e-01 0.018 0.0955 0.126 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0599 0.0972 0.126 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 9.43e-01 0.00572 0.0794 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 2.89e-01 0.148 0.139 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 8.16e-01 -0.031 0.133 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0326 0.15 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0996 0.142 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0712 0.106 0.12 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 9.15e-01 0.0158 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0952 0.148 0.12 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.71e-01 -0.104 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.49e-01 0.0435 0.136 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.44e-02 -0.168 0.0997 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.64e-01 0.0054 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 1.11e-01 -0.164 0.103 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 2.64e-01 0.127 0.113 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 1.80e-01 0.176 0.131 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.90e-01 0.0629 0.117 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 8.12e-01 0.0291 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0747 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 3.03e-01 0.115 0.111 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 5.67e-02 -0.229 0.119 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 5.63e-01 0.0575 0.0994 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 9.59e-01 0.00595 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0431 0.135 0.127 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.90e-01 0.0955 0.111 0.127 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0944 0.102 0.127 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.44e-01 0.0748 0.123 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 3.01e-01 0.0961 0.0926 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 5.47e-01 0.0626 0.104 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.68e-02 -0.16 0.0928 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 3.74e-01 0.0961 0.108 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0962 0.134 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 4.78e-01 0.0648 0.091 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.53e-01 0.0899 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 3.78e-01 -0.116 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0339 0.114 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 2.94e-01 -0.114 0.109 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.53e-01 0.0183 0.0985 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 1.77e-01 -0.14 0.103 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 3.77e-01 -0.124 0.14 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.34e-02 0.187 0.0963 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.34e-02 0.216 0.12 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 9.91e-02 -0.206 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 3.14e-01 0.104 0.103 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.07e-01 0.015 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.123 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 2.28e-01 -0.149 0.123 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 7.09e-01 0.0486 0.13 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.57e-02 0.179 0.0736 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00432 0.0976 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.44e-01 0.00591 0.0838 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.68e-02 -0.213 0.0882 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0128 0.0881 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.74e-01 0.0541 0.129 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 1.92e-01 0.109 0.0836 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 3.41e-01 -0.109 0.114 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 3.52e-01 -0.102 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0259 0.0803 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.11e-01 -0.166 0.104 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0259 0.108 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 2.09e-01 0.167 0.133 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.58e-01 0.0813 0.0883 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0693 0.0874 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 3.60e-01 -0.124 0.135 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0721 0.106 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 6.84e-02 -0.211 0.115 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0327 0.131 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 7.28e-01 0.0443 0.127 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.19e-01 0.0683 0.106 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 2.86e-01 0.0907 0.0848 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 1.80e-01 -0.168 0.125 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.16e-01 -0.176 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.11e-02 -0.267 0.104 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 5.12e-01 0.0768 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 2.41e-01 -0.162 0.138 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.12 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0967 0.0883 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 6.77e-02 0.207 0.113 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0711 0.101 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0215 0.104 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.13e-02 0.191 0.112 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0655 0.121 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 1.10e-01 0.145 0.0901 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0643 0.0969 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.93e-01 0.0714 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0518 0.116 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.74e-01 0.00425 0.131 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 3.79e-01 0.116 0.132 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0726 0.14 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0304 0.112 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0336 0.124 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 1.48e-01 0.193 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 6.35e-01 0.0584 0.123 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0624 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 1.07e-02 -0.355 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 1.82e-01 -0.182 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.08e-01 -0.13 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.39e-01 0.0347 0.104 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 4.56e-01 0.0954 0.128 0.126 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 8.05e-01 0.0284 0.115 0.126 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0459 0.123 0.126 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 1.76e-01 0.195 0.144 0.126 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 8.47e-01 0.025 0.13 0.126 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0747 0.117 0.126 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.34e-01 0.145 0.0966 0.126 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 8.97e-01 0.0161 0.125 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00348 0.109 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 3.07e-01 -0.124 0.121 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 5.68e-01 0.0717 0.125 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 4.89e-01 -0.094 0.136 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 1.01e-01 0.213 0.129 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.50e-01 -0.169 0.117 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 4.75e-01 0.0833 0.116 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0586 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.14e-01 0.0127 0.117 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 7.36e-02 -0.187 0.104 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.25e-01 0.0108 0.115 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0984 0.138 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 8.37e-01 0.0171 0.083 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 8.48e-01 0.0249 0.13 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 2.26e-02 -0.287 0.125 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 6.19e-01 0.0581 0.117 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.31e-01 0.194 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.46e-01 0.0431 0.133 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.13e-01 0.0877 0.134 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0301 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0387 0.0963 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 6.83e-01 0.0524 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 8.78e-01 0.0181 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0715 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.55e-01 -0.176 0.123 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.37e-01 0.00952 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 7.89e-01 0.0355 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 6.07e-01 0.0539 0.105 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0681 0.0879 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 9.50e-01 0.0103 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.63e-02 -0.153 0.0909 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0324 0.166 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.11e-01 0.0526 0.142 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 9.49e-02 -0.251 0.149 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 7.03e-01 0.0569 0.149 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 1.85e-01 -0.203 0.152 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 2.33e-01 0.124 0.104 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 8.72e-01 0.021 0.13 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0173 0.068 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 4.56e-01 0.0921 0.123 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0564 0.137 0.126 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 8.92e-01 0.0143 0.105 0.126 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0148 0.105 0.126 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.87e-01 -0.061 0.0876 0.126 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.46e-01 0.079 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.81e-01 0.104 0.0962 0.126 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 2.21e-01 -0.141 0.115 0.126 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 3.66e-01 0.116 0.128 0.126 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.03e-01 0.0864 0.129 0.126 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0265 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 4.16e-01 0.0677 0.0831 0.126 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0359 0.123 0.132 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.16e-01 -0.113 0.0913 0.132 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0826 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0876 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 3.87e-01 0.0876 0.101 0.132 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 1.60e-01 -0.127 0.0896 0.132 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.43e-01 -0.159 0.136 0.132 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.93e-01 -0.127 0.0971 0.132 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0836 0.124 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 9.05e-03 -0.221 0.0837 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 3.66e-01 -0.116 0.128 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 6.17e-01 -0.033 0.066 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.23e-01 0.0688 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 4.75e-01 0.0726 0.101 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00104 0.119 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0619 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.20e-02 -0.232 0.0917 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 4.40e-01 -0.106 0.138 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0345 0.096 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 4.63e-01 0.0843 0.115 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0802 0.109 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.118 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 4.45e-01 0.112 0.146 0.124 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 8.24e-02 -0.241 0.138 0.124 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0965 0.138 0.124 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0588 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 9.99e-01 0.000283 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 6.84e-01 0.0616 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.13e-01 0.0471 0.128 0.124 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 4.44e-01 0.0924 0.121 0.129 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 7.39e-03 -0.327 0.121 0.129 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0366 0.129 0.129 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 3.44e-01 -0.103 0.109 0.129 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.36e-01 0.0625 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.06e-01 0.174 0.137 0.129 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 3.35e-01 -0.11 0.114 0.129 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0362 0.114 0.131 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.19e-01 -0.184 0.118 0.131 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 7.92e-01 0.0319 0.121 0.131 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 6.09e-01 0.0418 0.0815 0.131 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 3.17e-01 0.131 0.131 0.131 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 8.46e-02 0.2 0.115 0.131 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.68e-01 -0.174 0.126 0.131 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 2.45e-03 -0.422 0.137 0.136 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.25e-01 -0.11 0.09 0.136 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 4.34e-01 0.109 0.139 0.136 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 5.22e-02 -0.255 0.13 0.136 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0228 0.103 0.136 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 6.85e-01 0.0364 0.0895 0.136 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0379 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 5.87e-01 -0.047 0.0861 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0644 0.134 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0901 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0982 0.114 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0596 0.0813 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 5.47e-01 0.0712 0.118 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 3.76e-01 0.11 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 4.39e-01 0.0846 0.109 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 6.30e-01 -0.054 0.112 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0103 0.126 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 6.37e-01 0.0442 0.0935 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000105 0.0958 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0814 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 740049 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0246 0.1 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0792 0.136 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 2.44e-01 0.0951 0.0814 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 1.53e-01 0.164 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 3.86e-01 -0.102 0.117 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 6.88e-03 -0.219 0.0803 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.63e-01 -0.176 0.126 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.78e-01 0.0017 0.0618 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 5.00e-01 0.0681 0.101 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 7.53e-01 0.0274 0.0869 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0319 0.115 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0357 0.11 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 1.78e-02 -0.256 0.107 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0512 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.25e-01 0.00678 0.0723 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 1.77e-01 0.178 0.131 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 1.51e-02 0.272 0.111 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 8.38e-02 -0.222 0.128 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -658955 sc-eQTL 1.65e-01 0.163 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -441240 sc-eQTL 5.25e-01 -0.072 0.113 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -605486 sc-eQTL 8.45e-01 0.0211 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 462590 sc-eQTL 1.76e-01 -0.136 0.1 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 591469 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00832 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 712477 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0254 0.133 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -603136 sc-eQTL 3.58e-01 0.0845 0.0918 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 463503 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0204 0.077 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 462590 eQTL 0.000235 -0.0999 0.0271 0.0 0.0 0.133

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina