Genes within 1Mb (chr12:105694983:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0168 0.124 0.124 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0957 0.0639 0.124 B L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0739 0.0943 0.124 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 2.65e-01 -0.067 0.06 0.124 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0525 0.0958 0.124 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.87e-01 0.0468 0.116 0.124 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.75e-01 0.0841 0.0769 0.124 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 2.96e-01 0.0864 0.0824 0.124 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0713 0.0898 0.124 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0169 0.0768 0.124 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.80e-02 -0.208 0.0873 0.124 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0194 0.0872 0.124 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 3.03e-01 0.124 0.12 0.124 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.01e-01 0.0527 0.078 0.124 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.62e-01 0.0204 0.0675 0.124 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.19e-01 0.0246 0.108 0.124 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.57e-01 -0.101 0.0708 0.124 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0845 0.102 0.124 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.46e-02 0.196 0.113 0.124 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0073 0.103 0.124 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0142 0.0631 0.124 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0194 0.0452 0.124 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 1.75e-01 -0.168 0.123 0.126 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.84e-01 -0.113 0.0849 0.126 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0152 0.127 0.126 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 3.63e-02 -0.214 0.102 0.126 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 7.85e-01 0.0238 0.0871 0.126 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.29e-01 0.0376 0.0779 0.126 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 9.12e-01 0.0142 0.128 0.126 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 8.76e-01 -0.00817 0.0522 0.126 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0744 0.107 0.124 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.05e-03 -0.202 0.0756 0.124 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.124 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0216 0.0598 0.124 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 3.25e-01 0.103 0.105 0.124 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.72e-01 0.0505 0.0891 0.124 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.12e-01 -0.185 0.116 0.124 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.62e-02 0.202 0.117 0.124 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0785 0.116 0.124 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.105 0.124 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 2.69e-01 -0.115 0.104 0.124 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0339 0.108 0.124 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0567 0.133 0.124 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.87e-01 0.0667 0.0959 0.124 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0384 0.0786 0.124 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 3.79e-01 0.114 0.13 0.124 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.93e-01 -0.011 0.0815 0.124 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 7.88e-01 0.0287 0.106 0.124 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.16e-01 0.0324 0.14 0.124 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 8.55e-01 0.018 0.0982 0.124 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 3.68e-01 -0.09 0.0998 0.124 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 8.69e-01 0.0134 0.0817 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 2.08e-01 0.183 0.145 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0111 0.138 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0234 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0827 0.148 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0724 0.11 0.117 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0399 0.154 0.117 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.29e-01 -0.122 0.153 0.117 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 3.84e-01 -0.13 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 6.10e-01 0.0711 0.139 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.06e-01 -0.166 0.103 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.68e-01 0.0204 0.123 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 1.68e-01 -0.146 0.106 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 3.42e-01 0.111 0.116 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 1.57e-01 0.191 0.134 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.60e-01 0.0699 0.12 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.60e-01 0.0383 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0849 0.135 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.114 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 7.11e-02 -0.222 0.123 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.31e-01 0.064 0.102 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00667 0.12 0.125 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0437 0.138 0.125 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.50e-01 0.0861 0.114 0.125 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0961 0.105 0.125 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.55e-01 0.0948 0.127 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.45e-01 0.0901 0.0953 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 5.34e-01 0.0665 0.107 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 1.12e-01 -0.153 0.0955 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 3.22e-01 0.11 0.111 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0901 0.138 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.66e-01 0.0538 0.0936 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 5.83e-01 0.0677 0.123 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 3.00e-01 -0.14 0.134 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0528 0.117 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 3.32e-01 -0.109 0.112 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.26e-01 0.0222 0.101 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 1.87e-01 -0.14 0.106 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 2.93e-01 -0.151 0.143 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.61e-02 0.19 0.0988 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.06e-01 0.2 0.123 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 7.73e-02 -0.226 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.61e-01 0.0968 0.106 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.16e-01 0.0307 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 2.54e-01 0.144 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 2.54e-01 -0.145 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 6.29e-01 0.0647 0.134 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 2.39e-02 0.172 0.0757 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.33e-01 0.0212 0.1 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.81e-01 0.0129 0.0862 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.91e-02 -0.214 0.0907 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00559 0.0906 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.68e-01 0.0568 0.132 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 3.28e-01 0.0843 0.0861 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 4.35e-01 -0.092 0.118 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.112 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0262 0.0826 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.17e-01 -0.168 0.107 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.12e-01 -0.041 0.111 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 2.74e-01 0.15 0.136 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.19e-01 0.0734 0.0908 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0707 0.0899 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 2.36e-01 -0.164 0.138 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0529 0.109 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.27e-01 -0.182 0.119 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0576 0.135 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 7.92e-01 0.0346 0.131 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 6.56e-01 0.0486 0.109 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 3.95e-01 0.0744 0.0873 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 1.75e-01 -0.175 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 7.99e-02 -0.201 0.114 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.19e-02 -0.271 0.107 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.78e-01 0.067 0.12 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 3.08e-01 -0.145 0.142 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 1.48e-01 -0.178 0.123 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.73e-01 -0.124 0.0906 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 7.27e-02 0.209 0.116 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.104 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.16e-01 -0.025 0.107 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.69e-02 0.199 0.115 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0649 0.125 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 1.50e-01 0.134 0.0928 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 5.48e-01 -0.06 0.0997 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 7.76e-01 0.039 0.137 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0676 0.119 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 9.04e-01 0.0162 0.134 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 2.98e-01 0.141 0.135 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 4.83e-01 -0.101 0.144 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0324 0.115 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0309 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 1.37e-01 0.204 0.137 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 4.86e-01 0.0881 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0178 0.139 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.28e-03 -0.377 0.141 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 2.07e-01 -0.177 0.14 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.64e-01 -0.147 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.107 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.45e-01 0.101 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.81e-01 0.0178 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0262 0.126 0.123 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 1.97e-01 0.192 0.148 0.123 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.133 0.123 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 3.87e-01 -0.104 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.0994 0.123 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 9.29e-01 0.0114 0.128 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000262 0.112 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0933 0.105 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 3.35e-01 -0.12 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.53e-01 0.0765 0.129 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0555 0.14 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 7.60e-02 0.237 0.133 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.45e-01 -0.176 0.12 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.23e-01 0.0962 0.12 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0434 0.117 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0123 0.12 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 9.57e-02 -0.18 0.107 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0146 0.118 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0808 0.142 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.10e-01 0.087 0.105 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 9.12e-01 0.00942 0.0855 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 9.43e-01 0.00953 0.134 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 2.24e-02 -0.296 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 7.63e-01 0.0363 0.12 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.14e-01 0.209 0.132 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 8.01e-01 0.0346 0.137 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 4.39e-01 0.107 0.138 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0616 0.135 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0346 0.0992 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 6.30e-01 0.0635 0.132 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 7.91e-01 0.0323 0.122 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0705 0.121 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 1.53e-01 -0.182 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0151 0.123 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 8.77e-01 0.0211 0.136 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 7.08e-01 0.0405 0.108 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0701 0.0905 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 9.50e-01 0.0103 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 9.63e-02 -0.153 0.0909 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0324 0.166 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.11e-01 0.0526 0.142 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 9.49e-02 -0.251 0.149 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 7.03e-01 0.0569 0.149 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 1.85e-01 -0.203 0.152 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 2.33e-01 0.124 0.104 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.11e-01 0.032 0.134 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0106 0.0698 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 3.82e-01 0.111 0.126 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0858 0.141 0.124 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 9.89e-01 0.00143 0.108 0.124 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0351 0.108 0.124 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0621 0.0898 0.124 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 6.05e-01 0.0695 0.134 0.124 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.29e-01 0.0967 0.0989 0.124 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 2.18e-01 -0.145 0.118 0.124 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.124 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.53e-01 0.0785 0.132 0.124 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0547 0.107 0.124 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 3.13e-01 0.0862 0.0853 0.124 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.20e-01 -0.029 0.127 0.129 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 2.03e-01 -0.12 0.0941 0.129 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0948 0.134 0.129 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0833 0.12 0.129 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 4.74e-01 0.0749 0.104 0.129 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 1.58e-01 -0.131 0.0924 0.129 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.09e-01 -0.177 0.14 0.129 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.52e-01 -0.144 0.1 0.129 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0813 0.128 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.03e-02 -0.223 0.0862 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.95e-01 -0.09 0.132 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0253 0.0679 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 4.96e-01 0.0754 0.111 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 6.56e-01 0.0466 0.104 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 9.72e-01 0.00427 0.123 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.87e-01 -0.091 0.131 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.03e-02 -0.244 0.0942 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0935 0.142 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0447 0.0987 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.06e-01 0.0786 0.118 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0913 0.112 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 3.58e-01 -0.111 0.121 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 3.73e-01 0.135 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.34e-01 -0.216 0.143 0.121 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0978 0.143 0.121 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.90e-01 -0.045 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 7.57e-01 0.0521 0.168 0.121 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 7.01e-01 0.0603 0.157 0.121 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.18e-01 0.0481 0.133 0.121 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.29e-02 -0.313 0.125 0.127 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0355 0.133 0.127 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 3.08e-01 -0.114 0.112 0.127 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.61e-01 0.0789 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.142 0.127 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 2.99e-01 -0.122 0.117 0.127 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0203 0.118 0.129 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 1.43e-01 -0.178 0.121 0.129 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 6.79e-01 0.0515 0.124 0.129 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 5.91e-01 0.0451 0.0839 0.129 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 3.21e-01 0.133 0.134 0.129 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 9.99e-02 0.197 0.119 0.129 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 1.68e-01 -0.179 0.13 0.129 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 2.63e-03 -0.436 0.142 0.133 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 2.07e-01 -0.119 0.0936 0.133 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 5.86e-01 0.0789 0.144 0.133 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.09e-02 -0.247 0.136 0.133 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0373 0.107 0.133 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.14e-01 0.0608 0.093 0.133 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0351 0.141 0.133 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0327 0.0896 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0465 0.137 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0962 0.0926 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0816 0.117 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0433 0.0837 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 6.80e-01 0.0502 0.122 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 4.28e-01 0.101 0.127 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 4.61e-01 0.083 0.112 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0554 0.115 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00636 0.129 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 6.99e-01 0.0371 0.096 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 9.79e-01 0.00256 0.0984 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 2.16e-01 -0.104 0.0837 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 736239 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0116 0.103 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0872 0.14 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.84e-01 0.0899 0.0836 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 2.35e-01 0.14 0.118 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 3.24e-01 -0.119 0.121 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 7.25e-03 -0.224 0.0827 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 2.39e-01 -0.153 0.13 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 9.46e-01 0.00429 0.0636 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 5.19e-01 0.067 0.104 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 9.14e-01 0.00971 0.0894 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0321 0.118 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 2.63e-02 -0.247 0.11 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0339 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 9.41e-01 0.00555 0.0744 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 1.64e-01 0.188 0.135 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 2.22e-02 0.263 0.114 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 7.76e-02 -0.233 0.131 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -662765 sc-eQTL 1.74e-01 0.165 0.121 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -445050 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0524 0.117 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -609296 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00502 0.111 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 458780 sc-eQTL 2.20e-01 -0.127 0.103 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 587659 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 708667 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0191 0.137 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -606946 sc-eQTL 5.70e-01 0.0538 0.0947 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 459693 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0201 0.0793 0.125 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 458780 eQTL 0.000165 -0.103 0.0271 0.0 0.0 0.135


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina