logo

Genes within 1Mb (chr12:105681297:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0626 0.111 0.171 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.98e-02 0.125 0.057 0.171 B L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.91e-01 0.0895 0.0846 0.171 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.60e-01 0.0238 0.054 0.171 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0542 0.086 0.171 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0454 0.104 0.171 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0175 0.0692 0.171 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00848 0.0742 0.171 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0341 0.0801 0.171 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 3.10e-02 0.147 0.0677 0.171 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 1.86e-01 -0.104 0.0786 0.171 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0347 0.0777 0.171 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0961 0.107 0.171 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0765 0.0695 0.171 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 1.89e-01 -0.079 0.06 0.171 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 3.76e-01 0.084 0.0947 0.171 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.92e-01 0.0661 0.0625 0.171 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0984 0.0895 0.171 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 1.78e-03 -0.31 0.0979 0.171 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.07e-01 0.0106 0.0907 0.171 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0441 0.0555 0.171 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 8.24e-01 -0.00887 0.0399 0.171 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.32e-02 0.208 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.31e-02 0.191 0.0763 0.167 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.42e-01 0.0707 0.116 0.167 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 7.34e-02 0.167 0.0925 0.167 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0454 0.079 0.167 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.42e-02 -0.118 0.0703 0.167 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0761 0.116 0.167 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0542 0.0473 0.167 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 7.95e-01 0.0253 0.0969 0.171 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 6.37e-02 0.128 0.0689 0.171 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0874 0.11 0.171 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 8.04e-01 0.0134 0.054 0.171 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.17e-01 0.022 0.0948 0.171 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 5.15e-02 -0.156 0.0799 0.171 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.85e-01 0.0288 0.105 0.171 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0416 0.104 0.172 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 9.60e-01 0.0051 0.102 0.172 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.18e-01 0.115 0.0926 0.172 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0622 0.0916 0.172 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 3.80e-02 0.198 0.0947 0.172 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0234 0.118 0.172 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.65e-01 -0.117 0.0843 0.172 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0546 0.0692 0.172 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.86e-01 0.0826 0.118 0.171 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 5.55e-01 0.0438 0.0742 0.171 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0697 0.0967 0.171 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 4.16e-02 0.258 0.126 0.171 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 5.08e-01 0.0592 0.0894 0.171 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0762 0.0909 0.171 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0359 0.0743 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 7.69e-01 0.0354 0.121 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.32e-01 0.173 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0282 0.129 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0629 0.123 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 3.19e-01 0.0916 0.0917 0.166 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.37e-02 0.22 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.50e-01 0.184 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 3.07e-01 0.127 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 3.67e-02 -0.262 0.125 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 8.26e-02 0.161 0.0926 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 2.58e-01 0.108 0.0956 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 2.92e-01 -0.111 0.105 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 2.80e-01 -0.131 0.121 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0333 0.108 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0722 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.77e-01 0.0531 0.128 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.63e-03 0.336 0.105 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 7.42e-01 0.0384 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00121 0.0962 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0549 0.113 0.168 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0426 0.13 0.168 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 7.24e-01 0.038 0.107 0.168 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.13e-01 0.0646 0.0987 0.168 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0723 0.114 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 3.73e-01 0.0767 0.0859 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.64e-01 0.0556 0.0963 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 1.50e-01 0.125 0.0862 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 9.04e-01 -0.012 0.1 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0557 0.124 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0577 0.0844 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 4.15e-01 0.0904 0.111 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.41e-01 0.0937 0.121 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 9.28e-01 0.00956 0.106 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 1.91e-03 0.31 0.0987 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0225 0.0912 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 5.80e-01 0.0531 0.0957 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0701 0.13 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.54e-01 0.0835 0.0898 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 1.07e-01 0.188 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 8.28e-01 0.021 0.0963 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0432 0.12 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0603 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.09e-01 -0.028 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.76e-02 -0.252 0.12 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00871 0.0697 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 2.42e-01 -0.105 0.0895 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 6.86e-02 0.14 0.0765 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.85e-01 -0.045 0.0822 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0177 0.081 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0868 0.118 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0393 0.0772 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.105 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 5.78e-01 0.0566 0.102 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.28e-01 0.09 0.0744 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 6.11e-02 -0.181 0.0963 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 7.03e-01 0.0382 0.1 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0224 0.124 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0919 0.0819 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 1.73e-03 -0.252 0.0795 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 5.98e-01 0.0656 0.124 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 4.81e-02 0.192 0.0968 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0936 0.107 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.46e-02 -0.223 0.12 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.53e-01 0.00696 0.117 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.66e-01 -0.135 0.0973 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.30e-01 -0.094 0.0782 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 1.31e-01 0.175 0.115 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 8.28e-01 0.0225 0.103 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0973 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0741 0.108 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.82e-01 0.00295 0.128 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.58e-01 -0.102 0.111 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 8.71e-01 0.0133 0.0819 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0794 0.106 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.094 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.85e-02 -0.16 0.0963 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 3.68e-03 -0.302 0.103 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 5.64e-01 0.0652 0.113 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0166 0.0842 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 8.30e-01 0.0193 0.0901 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 2.44e-01 -0.144 0.123 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 7.35e-01 0.0365 0.108 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.54e-01 0.00703 0.121 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.09e-03 -0.338 0.119 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.46e-01 0.00874 0.13 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.104 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.42e-01 -0.07 0.115 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0944 0.127 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.26e-01 0.179 0.116 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 1.59e-01 0.181 0.128 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 1.46e-01 -0.193 0.132 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.76e-01 -0.133 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0263 0.0992 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 9.60e-01 0.00584 0.117 0.169 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 9.88e-01 0.00152 0.105 0.169 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 3.60e-02 -0.235 0.111 0.169 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.85e-01 0.0537 0.132 0.169 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.47e-01 0.00795 0.119 0.169 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.38e-01 -0.126 0.107 0.169 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.66e-01 -0.099 0.0888 0.169 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 8.13e-01 0.0283 0.12 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 3.21e-01 0.104 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.72e-01 0.108 0.0977 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.14e-01 0.0126 0.117 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 8.19e-01 0.0276 0.12 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 2.26e-01 0.158 0.13 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 6.22e-02 -0.232 0.124 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.113 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0532 0.105 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0682 0.103 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 8.10e-01 0.0255 0.106 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00396 0.0951 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.59e-01 0.0608 0.104 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 4.45e-01 0.0955 0.125 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0632 0.0927 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 1.12e-01 -0.119 0.0748 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0568 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 5.14e-01 0.0759 0.116 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.78e-02 0.235 0.106 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.24e-01 -0.144 0.118 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00938 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.17e-01 0.0128 0.123 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.54e-02 -0.269 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 9.31e-01 0.00769 0.0885 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.95e-01 0.0464 0.118 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 5.66e-01 0.0627 0.109 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.66e-01 0.149 0.108 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00879 0.114 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 1.30e-01 0.167 0.11 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 2.79e-01 -0.132 0.122 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0497 0.0966 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0604 0.0811 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 8.35e-01 0.0315 0.151 0.159 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 4.50e-01 0.0641 0.0845 0.159 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 8.84e-01 0.0223 0.153 0.159 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00391 0.13 0.159 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 2.23e-01 -0.169 0.138 0.159 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00996 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.31e-01 0.213 0.14 0.159 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0538 0.0958 0.159 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.21e-01 0.0969 0.12 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.57e-01 0.0888 0.0626 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 3.18e-01 0.114 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 1.38e-01 0.188 0.126 0.17 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0393 0.097 0.17 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 5.74e-01 0.0546 0.0969 0.17 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.17e-01 0.0526 0.081 0.17 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 1.93e-01 -0.155 0.119 0.171 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 5.47e-01 0.0532 0.0881 0.171 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 3.65e-01 0.0953 0.105 0.171 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.74e-02 -0.221 0.116 0.171 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 1.93e-01 -0.153 0.117 0.171 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.13e-01 -0.151 0.0945 0.171 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.03e-01 -0.029 0.076 0.171 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.08e-01 0.0962 0.116 0.166 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.97e-03 0.264 0.0841 0.166 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0848 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 2.49e-02 0.244 0.108 0.166 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0707 0.0953 0.166 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0823 0.0846 0.166 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.95e-01 0.167 0.128 0.166 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.63e-01 -0.103 0.0916 0.166 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0243 0.115 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 4.43e-02 0.158 0.0781 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 9.81e-01 0.00285 0.119 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 7.38e-01 0.0205 0.0612 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00624 0.0996 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0696 0.0939 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.65e-02 -0.195 0.11 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0348 0.119 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.15e-02 0.199 0.0859 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 1.65e-01 -0.179 0.128 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0465 0.0898 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000593 0.107 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.30e-02 -0.217 0.101 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.21e-01 0.0708 0.11 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 3.36e-01 0.137 0.142 0.185 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 8.45e-01 0.0266 0.136 0.185 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.58e-01 0.152 0.134 0.185 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 7.67e-01 0.0469 0.158 0.185 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 5.34e-02 0.303 0.156 0.185 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 8.85e-01 0.0215 0.147 0.185 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0893 0.125 0.185 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0153 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.16e-02 0.289 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.18e-01 0.0782 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.71e-01 0.0579 0.102 0.173 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 4.05e-01 0.103 0.123 0.173 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.19e-01 -0.201 0.129 0.173 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 2.24e-01 0.13 0.106 0.173 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.17 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 2.35e-02 0.249 0.109 0.17 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 1.39e-01 -0.167 0.112 0.17 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.56e-01 0.0448 0.076 0.17 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.06e-01 -0.063 0.122 0.17 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0459 0.108 0.17 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 1.39e-01 -0.175 0.117 0.17 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 2.94e-01 0.142 0.135 0.164 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 4.77e-01 0.0619 0.0867 0.164 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.74e-02 0.253 0.132 0.164 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0922 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 4.61e-01 0.0728 0.0985 0.164 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0667 0.0858 0.164 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.80e-01 -0.175 0.13 0.164 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.19e-02 0.148 0.0819 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 1.36e-01 -0.184 0.123 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 1.07e-02 0.211 0.082 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0657 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 7.23e-01 0.0266 0.075 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 9.45e-01 0.00753 0.109 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0496 0.114 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0217 0.101 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 9.23e-01 0.00993 0.103 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0257 0.116 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 3.39e-01 0.0828 0.0864 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 7.86e-02 0.156 0.0881 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 3.24e-01 0.0747 0.0755 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 722553 sc-eQTL 8.36e-01 0.0192 0.0927 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0881 0.126 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 5.63e-01 0.0437 0.0755 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0406 0.107 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0393 0.109 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 6.38e-02 0.14 0.0753 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 2.14e-01 -0.146 0.117 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 9.06e-01 0.00677 0.0575 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0939 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 1.52e-01 -0.116 0.0804 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 5.81e-01 -0.059 0.107 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 4.76e-01 0.0732 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 3.64e-02 0.211 0.1 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0399 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 6.16e-01 0.0339 0.0675 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0186 0.123 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 2.62e-01 -0.118 0.105 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 7.76e-01 0.0342 0.12 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -676451 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0538 0.107 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -458736 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00759 0.103 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -622982 sc-eQTL 4.32e-01 0.0768 0.0974 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 445094 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0619 0.0911 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 573973 sc-eQTL 5.21e-02 0.193 0.0989 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 694981 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0498 0.12 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -620632 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0726 0.0833 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 446007 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0572 0.0697 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 445094 eQTL 0.0125 0.0673 0.0269 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina