logo

Genes within 1Mb (chr12:105679679:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0644 0.111 0.173 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.16e-02 0.117 0.0569 0.173 B L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 3.14e-01 0.0851 0.0844 0.173 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.43e-01 0.0177 0.0539 0.173 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0543 0.0858 0.173 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0312 0.104 0.173 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0293 0.069 0.173 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0215 0.074 0.173 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 7.18e-01 -0.029 0.0802 0.173 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.99e-02 0.159 0.0676 0.173 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0996 0.0786 0.173 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0313 0.0778 0.173 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0971 0.107 0.173 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0666 0.0695 0.173 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0893 0.0599 0.173 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.89e-01 0.0817 0.0947 0.173 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 3.71e-01 0.0561 0.0626 0.173 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0986 0.0895 0.173 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 1.78e-03 -0.31 0.098 0.173 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.69e-01 0.0149 0.0907 0.173 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0367 0.0556 0.173 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 8.09e-01 -0.00962 0.0399 0.173 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.58e-02 0.215 0.112 0.169 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 9.33e-03 0.2 0.0762 0.169 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.41e-01 0.0709 0.116 0.169 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 8.97e-02 0.158 0.0926 0.169 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0476 0.0791 0.169 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0967 0.0704 0.169 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0692 0.116 0.169 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0564 0.0473 0.169 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00308 0.0966 0.173 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 6.22e-02 0.129 0.0687 0.173 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0789 0.109 0.173 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00241 0.0539 0.173 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 7.78e-01 0.0267 0.0946 0.173 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 4.54e-02 -0.16 0.0796 0.173 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.42e-01 0.0076 0.105 0.173 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.38e-01 -0.049 0.104 0.174 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 9.68e-01 0.00413 0.103 0.174 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0928 0.174 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0574 0.0918 0.174 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 5.45e-02 0.184 0.095 0.174 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 7.86e-01 -0.032 0.118 0.174 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.79e-01 -0.114 0.0845 0.174 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0532 0.0694 0.174 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 4.75e-01 0.0849 0.119 0.173 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 6.88e-01 0.0299 0.0744 0.173 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0597 0.0969 0.173 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 3.98e-02 0.261 0.126 0.173 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.27e-01 0.0713 0.0895 0.173 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0773 0.0911 0.173 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0328 0.0745 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 7.44e-01 0.0395 0.121 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.28e-01 0.174 0.114 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0307 0.129 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0543 0.123 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 3.00e-01 0.0952 0.0916 0.168 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.64e-02 0.212 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.70e-01 0.175 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 3.29e-01 0.121 0.124 0.168 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 2.65e-02 -0.276 0.124 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 8.17e-02 0.161 0.092 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 3.03e-01 -0.113 0.11 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 2.81e-01 0.103 0.095 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 2.92e-01 -0.11 0.104 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0974 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0332 0.108 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 4.89e-01 -0.078 0.113 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.42e-01 0.0591 0.127 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.70e-04 0.37 0.104 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 7.72e-01 0.0337 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.91e-01 0.0254 0.0957 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 5.81e-01 -0.062 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0154 0.13 0.17 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.75e-01 0.0449 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 6.42e-01 0.0457 0.0982 0.17 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0682 0.114 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.28e-01 0.068 0.0857 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.06e-01 0.0639 0.096 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 1.53e-01 0.123 0.086 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00202 0.0999 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0678 0.124 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 4.34e-01 -0.066 0.0841 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 3.91e-01 0.0949 0.11 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 4.15e-01 0.0993 0.121 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 9.70e-01 0.004 0.106 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.01e-03 0.309 0.0988 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0339 0.0913 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 6.13e-01 0.0485 0.0958 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0709 0.13 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.91e-01 0.095 0.0898 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 1.44e-01 -0.163 0.111 0.174 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 1.16e-01 0.182 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 9.96e-01 0.000504 0.096 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0375 0.119 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0723 0.114 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0307 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.44e-02 -0.255 0.12 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.55e-01 0.00391 0.0695 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0856 0.0897 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.38e-02 0.155 0.0764 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0416 0.0822 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00914 0.0811 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0854 0.118 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0343 0.0772 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 8.96e-01 0.0138 0.105 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.94e-01 0.0401 0.102 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 2.16e-01 0.0924 0.0745 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 6.56e-02 -0.179 0.0965 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 8.16e-01 0.0233 0.1 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.124 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0824 0.0821 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 1.09e-03 -0.263 0.0794 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.90e-01 0.0673 0.125 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 5.16e-02 0.19 0.0969 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0827 0.107 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 5.84e-02 -0.228 0.12 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.97e-01 0.0151 0.117 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.06e-01 -0.124 0.0974 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0914 0.0782 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 1.09e-01 0.186 0.115 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 7.74e-01 0.0297 0.103 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.73e-01 0.107 0.0974 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0772 0.108 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.68e-01 0.0213 0.128 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0915 0.111 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.90e-01 0.00099 0.0819 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0687 0.106 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 3.06e-01 0.0965 0.0939 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0962 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 2.54e-03 -0.314 0.103 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.92e-01 0.0776 0.113 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00991 0.0841 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 7.47e-01 0.029 0.09 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 2.67e-01 -0.137 0.123 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 7.65e-01 0.0323 0.108 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 8.19e-01 0.0278 0.121 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.20e-03 -0.332 0.12 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000785 0.13 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.14e-01 0.105 0.104 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0631 0.115 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0906 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.27e-01 0.177 0.116 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 1.52e-01 0.184 0.128 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 1.32e-01 -0.2 0.132 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 1.64e-01 0.18 0.129 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.85e-01 -0.13 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0359 0.0989 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 9.71e-01 0.00424 0.117 0.171 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.171 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.54e-02 -0.224 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.32e-01 0.0634 0.132 0.171 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.31e-01 0.0253 0.119 0.171 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.04e-01 -0.136 0.107 0.171 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.11e-01 -0.111 0.0887 0.171 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 8.26e-01 0.0263 0.12 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 3.63e-01 0.095 0.104 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 2.74e-01 0.107 0.0977 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 9.01e-01 0.0146 0.117 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00251 0.121 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 3.37e-01 0.125 0.13 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.54e-02 -0.23 0.124 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.18e-01 -0.139 0.112 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0609 0.105 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0828 0.103 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 8.34e-01 0.0222 0.106 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0129 0.095 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.46e-01 0.0477 0.104 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.51e-01 0.0942 0.125 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0637 0.0927 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 1.07e-01 -0.121 0.0747 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0495 0.12 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 4.08e-01 0.097 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 3.51e-02 0.227 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0205 0.123 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.83e-01 0.0183 0.124 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 5.09e-02 -0.237 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0165 0.0892 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.65e-01 0.0515 0.119 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 6.35e-01 0.052 0.11 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.10e-01 0.173 0.108 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0131 0.115 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 1.50e-01 0.16 0.111 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 3.15e-01 -0.123 0.122 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0577 0.097 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0523 0.0814 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.92e-01 0.0595 0.15 0.163 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.27e-01 0.067 0.084 0.163 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 8.53e-01 0.0283 0.152 0.163 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00542 0.13 0.163 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 1.64e-01 -0.192 0.137 0.163 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0182 0.136 0.163 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.87e-01 0.185 0.14 0.163 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0535 0.0953 0.163 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.121 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.50e-01 0.0907 0.0628 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.99e-01 0.119 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 1.68e-01 0.175 0.127 0.172 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0542 0.0973 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.95e-01 0.0383 0.0973 0.172 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 4.46e-01 0.0621 0.0812 0.172 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 2.30e-01 -0.144 0.119 0.173 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 5.29e-01 0.0557 0.0883 0.173 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.10e-01 0.0869 0.105 0.173 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.01e-02 -0.212 0.116 0.173 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 2.09e-01 -0.148 0.118 0.173 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.44e-01 -0.139 0.0948 0.173 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 6.75e-01 -0.032 0.0762 0.173 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.48e-01 0.109 0.116 0.168 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.02e-03 0.279 0.0837 0.168 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0662 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 2.80e-02 0.239 0.108 0.168 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0705 0.0951 0.168 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0459 0.0846 0.168 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.47e-01 0.186 0.128 0.168 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.47e-01 -0.106 0.0914 0.168 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0525 0.115 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.57e-02 0.157 0.0779 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0105 0.118 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 9.53e-01 0.00359 0.061 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000703 0.0994 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0701 0.0937 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.07e-02 -0.215 0.109 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0596 0.119 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 2.04e-02 0.201 0.0859 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.28e-01 -0.155 0.128 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 4.90e-01 -0.062 0.0897 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0129 0.107 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.58e-02 -0.226 0.101 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.23e-01 0.0705 0.11 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 4.03e-01 0.119 0.142 0.188 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 8.89e-01 0.019 0.136 0.188 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.43e-01 0.157 0.134 0.188 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.03e-01 0.0604 0.158 0.188 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 6.52e-02 0.289 0.156 0.188 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 7.75e-01 0.0422 0.147 0.188 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0758 0.125 0.188 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 9.89e-01 0.0016 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 1.01e-02 0.294 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.19e-01 0.0974 0.12 0.176 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.29e-01 0.0493 0.102 0.176 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 3.07e-01 0.126 0.123 0.176 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.19e-01 -0.201 0.128 0.176 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 2.74e-01 0.117 0.106 0.176 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.33e-01 0.103 0.106 0.172 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.35e-02 0.222 0.109 0.172 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 1.37e-01 -0.167 0.112 0.172 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.62e-01 0.0332 0.076 0.172 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0543 0.122 0.172 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0443 0.108 0.172 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.73e-02 -0.195 0.117 0.172 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 3.29e-01 0.132 0.135 0.167 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 5.55e-01 0.0514 0.0868 0.167 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 6.89e-02 0.242 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 3.93e-01 -0.108 0.126 0.167 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 4.14e-01 0.0807 0.0985 0.167 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0686 0.0859 0.167 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.68e-01 -0.18 0.13 0.167 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 8.68e-02 0.141 0.0821 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 1.15e-01 -0.193 0.122 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 7.52e-03 0.22 0.0814 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0721 0.104 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 5.28e-01 0.0471 0.0745 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 9.64e-01 0.00495 0.108 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0147 0.113 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0196 0.1 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00649 0.103 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 7.63e-01 -0.035 0.116 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 3.54e-01 0.0801 0.0862 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 7.79e-02 0.156 0.0879 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 3.79e-01 0.0664 0.0754 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 720935 sc-eQTL 8.30e-01 0.0199 0.0924 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 4.46e-01 -0.096 0.126 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 5.62e-01 0.0438 0.0754 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0362 0.106 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0714 0.109 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 6.04e-02 0.142 0.0751 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 2.31e-01 -0.141 0.117 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 8.63e-01 -0.00992 0.0573 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.28e-01 0.00846 0.0936 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 1.26e-01 -0.123 0.0801 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0726 0.106 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.62e-01 0.0595 0.102 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.48e-02 0.202 0.1 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0319 0.114 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 7.27e-01 0.0235 0.0674 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00133 0.123 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 2.82e-01 -0.113 0.105 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 9.43e-01 0.00864 0.12 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -678069 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0661 0.107 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -460354 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00583 0.103 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -624600 sc-eQTL 4.05e-01 0.0816 0.0977 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 443476 sc-eQTL 5.26e-01 -0.058 0.0914 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 572355 sc-eQTL 6.51e-02 0.184 0.0993 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 693363 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0531 0.121 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -622250 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0737 0.0835 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 444389 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0553 0.0699 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 443476 eQTL 0.0127 0.0671 0.0269 0.0 0.0 0.138

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina