logo

Genes within 1Mb (chr12:105668736:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000792 0.131 0.1 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 2.81e-02 -0.148 0.0672 0.1 B L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0432 0.0998 0.1 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0285 0.0636 0.1 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00169 0.101 0.1 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 5.40e-01 0.0752 0.123 0.1 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.79e-01 0.0718 0.0814 0.1 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.91e-01 0.0922 0.0872 0.1 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0905 0.0957 0.1 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0632 0.0818 0.1 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.73e-02 -0.223 0.0931 0.1 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.71e-01 0.00335 0.093 0.1 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 3.93e-01 0.11 0.128 0.1 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.29e-01 0.0525 0.0833 0.1 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 8.57e-01 -0.013 0.072 0.1 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 8.43e-01 0.0229 0.115 0.1 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 6.86e-02 -0.138 0.0755 0.1 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 2.52e-01 -0.125 0.109 0.1 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.69e-02 0.208 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0647 0.11 0.1 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00713 0.0675 0.1 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0197 0.0484 0.1 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 2.11e-01 -0.165 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0723 0.0909 0.101 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0345 0.136 0.101 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 3.27e-01 -0.107 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 5.13e-01 0.0609 0.0928 0.101 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 6.33e-01 0.0398 0.0831 0.101 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 4.71e-01 0.0986 0.137 0.101 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 9.02e-01 0.00689 0.0557 0.101 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0932 0.113 0.1 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 9.09e-02 -0.137 0.0806 0.1 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.11e-01 -0.13 0.128 0.1 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0272 0.0631 0.1 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.09e-01 0.0267 0.111 0.1 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.43e-01 0.0187 0.0941 0.1 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 8.72e-02 -0.21 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 1.06e-01 0.202 0.124 0.101 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0819 0.123 0.101 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0321 0.112 0.101 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.20e-01 -0.171 0.11 0.101 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.36e-01 0.0545 0.115 0.101 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.96e-01 -0.183 0.141 0.101 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.06e-01 0.0678 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0336 0.0834 0.101 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.51e-01 0.063 0.139 0.1 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0353 0.0873 0.1 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 8.53e-01 0.0211 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.19e-01 0.0151 0.149 0.1 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.93e-01 0.0142 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0503 0.107 0.1 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 8.32e-01 0.0186 0.0874 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.18e-01 0.156 0.155 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.58e-01 0.11 0.148 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0833 0.167 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 4.18e-01 -0.128 0.158 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00876 0.119 0.092 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.08e-01 0.04 0.165 0.092 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 7.57e-01 0.0511 0.165 0.092 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 6.25e-01 0.0781 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.13e-01 0.075 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 3.59e-02 -0.229 0.108 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0636 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 2.76e-01 -0.123 0.112 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 2.28e-01 0.149 0.123 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.52e-02 0.345 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.25e-01 0.081 0.127 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.31e-01 0.0457 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0954 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000485 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.46e-01 -0.191 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.71e-01 0.0176 0.108 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 6.83e-01 0.0521 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0875 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 4.86e-01 0.0844 0.121 0.101 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.45e-01 -0.105 0.111 0.101 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.54e-01 0.125 0.134 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0144 0.101 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.50e-01 0.106 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0249 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 4.70e-01 0.0852 0.118 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0359 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.58e-01 0.0178 0.0994 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.17e-01 0.0473 0.13 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.88e-01 -0.124 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 3.85e-01 -0.109 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0785 0.119 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.32e-01 -0.023 0.108 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 3.73e-01 -0.101 0.113 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 7.08e-02 -0.277 0.152 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.92e-02 0.181 0.106 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.60e-02 0.277 0.131 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 4.37e-01 -0.106 0.137 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 6.47e-01 0.0517 0.113 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 4.00e-01 -0.118 0.14 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 2.55e-01 0.153 0.134 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0591 0.136 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 4.23e-01 0.114 0.142 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 8.93e-02 0.139 0.0812 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0136 0.107 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0133 0.0921 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.63e-02 -0.205 0.0972 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.12e-01 0.0107 0.0968 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 6.49e-01 0.0643 0.141 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.08e-01 0.094 0.092 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 1.85e-01 -0.167 0.125 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0863 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0694 0.088 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 9.96e-02 -0.188 0.114 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0154 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.146 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.63e-01 0.0562 0.0969 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0957 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 4.64e-01 -0.109 0.148 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 9.77e-01 0.00339 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.92e-01 -0.166 0.127 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.70e-01 0.0235 0.144 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.49e-01 0.0266 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00797 0.116 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 6.54e-01 0.0419 0.0934 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0681 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 8.03e-02 -0.216 0.123 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.45e-03 -0.338 0.114 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.74e-01 0.0544 0.129 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.18e-01 -0.238 0.152 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.10e-01 -0.135 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.06e-01 -0.124 0.0975 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.47e-01 0.118 0.125 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 2.45e-01 -0.13 0.111 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 9.19e-01 0.0117 0.115 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 2.13e-01 0.155 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0905 0.134 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0996 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0124 0.107 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 7.14e-01 0.0537 0.146 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.71e-02 -0.252 0.126 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0371 0.143 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 3.56e-01 0.133 0.144 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 4.47e-01 -0.117 0.154 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0528 0.123 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.63e-01 -0.152 0.136 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.69e-01 0.133 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0124 0.136 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 8.75e-01 0.0237 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 1.96e-02 -0.36 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.24e-01 -0.232 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0851 0.142 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 4.97e-01 0.0786 0.115 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 7.85e-01 0.0387 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0608 0.127 0.1 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0612 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 2.85e-01 0.171 0.159 0.1 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0145 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 6.94e-01 -0.051 0.129 0.1 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.96e-01 0.0913 0.107 0.1 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 9.66e-01 0.00591 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 9.47e-01 0.00809 0.121 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.08e-01 -0.216 0.134 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 1.28e-02 0.344 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0835 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.27e-01 0.0914 0.144 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.77e-02 -0.229 0.129 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 4.77e-01 0.0905 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0884 0.124 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000466 0.128 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.90e-02 -0.235 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0135 0.125 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.16e-01 -0.237 0.15 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.86e-01 0.097 0.112 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.42e-01 0.0298 0.0906 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.144 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 4.92e-02 -0.275 0.139 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 3.98e-01 0.11 0.129 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.04e-01 0.147 0.142 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 4.82e-01 0.104 0.147 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 7.80e-01 0.0416 0.149 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 7.70e-01 0.0426 0.146 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0363 0.107 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.72e-01 0.0599 0.141 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 6.57e-01 0.0581 0.131 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0308 0.129 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.19e-01 -0.136 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.47e-01 0.0607 0.132 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 7.38e-01 0.0489 0.146 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 7.08e-01 0.0434 0.116 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0362 0.0971 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 7.50e-01 0.0579 0.182 0.1 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 1.96e-01 -0.132 0.101 0.1 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00302 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0166 0.157 0.1 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 1.74e-01 -0.227 0.166 0.1 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.40e-01 0.0334 0.165 0.1 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 1.43e-01 -0.249 0.169 0.1 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.1 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.03e-01 0.0743 0.143 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 6.74e-01 0.0314 0.0745 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.25e-01 0.207 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.98e-01 0.0192 0.15 0.1 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.04e-01 0.0286 0.115 0.1 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00339 0.115 0.1 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0838 0.0959 0.1 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 5.39e-01 0.0884 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 3.76e-01 0.0942 0.106 0.1 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 8.90e-02 -0.215 0.126 0.1 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 1.93e-01 0.183 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 5.59e-01 -0.083 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.82e-01 -0.017 0.115 0.1 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.24e-01 0.0325 0.0917 0.1 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0834 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0523 0.0988 0.107 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.48e-01 -0.203 0.14 0.107 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0347 0.125 0.107 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 4.19e-01 0.0884 0.109 0.107 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 6.53e-02 -0.179 0.0963 0.107 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0805 0.147 0.107 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.105 0.107 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0816 0.135 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 5.96e-02 -0.174 0.092 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0651 0.14 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 7.29e-01 -0.025 0.072 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0245 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 6.70e-01 0.0473 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0142 0.13 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 3.60e-01 -0.127 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 5.63e-02 -0.192 0.1 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0277 0.15 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0448 0.104 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.67e-01 0.0208 0.125 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 1.76e-01 -0.16 0.118 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 1.66e-01 -0.177 0.127 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.41e-01 0.0745 0.159 0.103 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 1.90e-01 -0.199 0.151 0.103 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 2.22e-01 -0.184 0.15 0.103 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 5.05e-01 -0.118 0.177 0.103 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.02e-01 0.0443 0.177 0.103 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.21e-01 0.0374 0.165 0.103 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.21e-01 0.139 0.14 0.103 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 5.93e-01 0.0704 0.131 0.102 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 1.66e-01 -0.185 0.133 0.102 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 7.38e-01 -0.047 0.14 0.102 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0947 0.118 0.102 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 3.95e-01 0.122 0.143 0.102 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 1.88e-01 0.198 0.15 0.102 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.37e-01 -0.119 0.124 0.102 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00374 0.125 0.104 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0843 0.129 0.104 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 2.64e-01 0.148 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.86e-01 0.00159 0.0891 0.104 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 7.89e-01 0.0384 0.143 0.104 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.74e-02 0.217 0.126 0.104 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 3.94e-01 -0.118 0.138 0.104 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 1.22e-02 -0.395 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.105 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.39e-01 0.231 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0966 0.148 0.105 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 8.82e-01 0.0172 0.116 0.105 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 2.06e-01 0.127 0.1 0.105 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0777 0.153 0.105 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 8.59e-01 0.0173 0.0971 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0722 0.145 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 7.62e-02 -0.174 0.0974 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 2.77e-01 -0.135 0.123 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0596 0.0884 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 2.66e-01 0.143 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 1.90e-01 0.176 0.134 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 4.11e-01 0.0978 0.119 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0343 0.122 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 8.53e-01 0.0254 0.137 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0708 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 6.59e-01 0.0462 0.104 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0333 0.0891 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 709992 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000145 0.109 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 4.63e-01 -0.109 0.148 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 3.99e-01 0.0751 0.0888 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 2.15e-01 0.155 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 2.85e-01 -0.137 0.127 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 5.71e-02 -0.169 0.0881 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 3.92e-01 -0.118 0.137 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000107 0.0672 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0262 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0229 0.0945 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0551 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0206 0.12 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 2.98e-01 -0.123 0.118 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00544 0.133 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 8.69e-01 -0.013 0.0788 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 2.67e-01 0.159 0.143 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 2.03e-02 0.283 0.121 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 1.57e-01 -0.198 0.139 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -689012 sc-eQTL 2.58e-01 0.145 0.128 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -471297 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0511 0.124 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -635543 sc-eQTL 8.94e-01 0.0156 0.118 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 432533 sc-eQTL 1.36e-01 -0.164 0.109 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 561412 sc-eQTL 9.62e-01 0.00567 0.12 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 682420 sc-eQTL 3.19e-01 -0.144 0.145 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -633193 sc-eQTL 4.15e-01 0.0819 0.1 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 433446 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00541 0.0841 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 432533 eQTL 4.49e-06 -0.137 0.0297 0.0 0.0 0.113

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 432533 8.43e-07 4.93e-07 1e-07 3.48e-07 9.33e-08 1.74e-07 5.13e-07 1.37e-07 4.18e-07 2.34e-07 5.73e-07 3.61e-07 6.77e-07 1.1e-07 1.9e-07 2.1e-07 2.53e-07 3.82e-07 1.89e-07 1.51e-07 1.92e-07 3.76e-07 3.19e-07 1.44e-07 6.59e-07 2.49e-07 2.58e-07 2.65e-07 3.58e-07 4.72e-07 2.54e-07 6.2e-08 5.19e-08 1.38e-07 3.05e-07 1.02e-07 1.05e-07 7.93e-08 3.82e-08 3.05e-08 9.77e-08 4.35e-07 2.75e-08 1.77e-08 1.41e-07 1.29e-08 1.03e-07 1.18e-08 4.71e-08