logo

Genes within 1Mb (chr12:105659467:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 1.05e-01 0.228 0.14 0.098 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0319 0.0729 0.098 B L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0386 0.107 0.098 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.65e-01 0.0499 0.0683 0.098 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 4.35e-01 -0.085 0.109 0.098 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.43e-01 0.0261 0.132 0.098 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.24e-02 0.152 0.0869 0.098 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0937 0.0936 0.098 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0253 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.44e-01 0.0405 0.0876 0.098 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 5.09e-01 0.0668 0.101 0.098 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 8.89e-01 0.0139 0.0995 0.098 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0769 0.138 0.098 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0325 0.0892 0.098 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 4.28e-01 0.0611 0.0769 0.098 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0324 0.123 0.098 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0925 0.0809 0.098 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 8.26e-01 0.0256 0.116 0.098 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 7.70e-01 0.038 0.13 0.098 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.58e-01 -0.021 0.117 0.098 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.90e-01 0.0287 0.072 0.098 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.63e-01 0.00892 0.0516 0.098 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 1.21e-01 0.22 0.141 0.099 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.45e-01 0.0451 0.0976 0.099 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0537 0.146 0.099 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 2.50e-01 0.135 0.117 0.099 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.0993 0.099 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 4.66e-01 0.065 0.0891 0.099 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.89e-01 0.0588 0.147 0.099 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0506 0.0597 0.099 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0975 0.123 0.098 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0484 0.0885 0.098 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 2.24e-01 0.17 0.14 0.098 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00489 0.0689 0.098 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0711 0.121 0.098 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.76e-01 0.043 0.103 0.098 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.00e-01 0.034 0.134 0.098 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.24e-02 0.236 0.135 0.099 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 4.33e-01 -0.105 0.134 0.099 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0647 0.122 0.099 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0596 0.12 0.099 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 1.67e-01 -0.173 0.125 0.099 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0341 0.154 0.099 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.07e-01 0.14 0.11 0.099 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.37e-03 0.238 0.0894 0.099 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 6.21e-01 0.0745 0.15 0.098 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0469 0.0942 0.098 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.02e-01 0.201 0.122 0.098 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 6.38e-01 0.0761 0.161 0.098 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0388 0.114 0.098 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.75e-01 0.126 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.77e-01 0.103 0.0941 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0237 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 4.40e-01 -0.11 0.142 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 3.26e-01 0.158 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0469 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 2.80e-02 0.249 0.112 0.102 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.15e-01 0.0579 0.158 0.102 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.39e-01 0.0323 0.159 0.102 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0272 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 7.90e-04 0.527 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 8.88e-01 0.0166 0.118 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 4.14e-01 0.114 0.14 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0616 0.121 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 3.66e-01 0.12 0.133 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 4.68e-01 -0.111 0.153 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.79e-01 0.0566 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.76e-01 0.0223 0.143 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.83e-01 0.00338 0.157 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 8.70e-01 0.0217 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 3.54e-01 0.133 0.143 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0867 0.118 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0555 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0857 0.16 0.099 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 9.74e-02 0.219 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0634 0.121 0.099 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 7.43e-01 0.0487 0.149 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.13e-01 0.0412 0.112 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.33e-01 -0.188 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 8.20e-01 0.0256 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0932 0.13 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 3.80e-01 0.142 0.162 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0106 0.11 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.17e-01 -0.178 0.144 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0368 0.161 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 4.67e-01 -0.102 0.14 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 2.93e-01 -0.141 0.134 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.09e-01 0.1 0.121 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0518 0.127 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.82e-01 0.0477 0.172 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 3.36e-01 0.115 0.119 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.148 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 5.25e-01 0.0957 0.15 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.94e-01 0.000917 0.124 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.45e-01 0.0502 0.155 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 7.23e-01 0.0526 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 1.97e-02 -0.346 0.147 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 3.40e-01 0.15 0.156 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0475 0.0899 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0192 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00992 0.0982 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 9.71e-01 0.00383 0.105 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00609 0.103 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.57e-01 0.00818 0.151 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 9.57e-02 -0.164 0.0977 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 5.00e-01 0.0907 0.134 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0817 0.13 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0112 0.0955 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.04e-02 0.224 0.123 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0727 0.128 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 1.43e-01 -0.231 0.157 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.89e-01 0.0421 0.105 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.98e-01 0.108 0.104 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 3.37e-01 0.154 0.16 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.66e-01 0.0374 0.126 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0739 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 1.31e-01 0.234 0.155 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.61e-01 0.0458 0.151 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 3.98e-02 -0.257 0.124 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.10e-01 0.0243 0.101 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 4.05e-01 -0.124 0.148 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0505 0.132 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.32e-01 -0.188 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0348 0.138 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.00e-01 0.0414 0.163 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0195 0.142 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 5.82e-01 0.0576 0.105 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.73e-01 0.00462 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 1.86e-01 -0.16 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.124 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 8.90e-01 0.0187 0.135 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.16e-01 0.0527 0.145 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.54e-01 0.0339 0.108 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 3.74e-01 0.103 0.115 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.54e-01 0.00915 0.159 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0293 0.138 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 8.33e-01 0.0328 0.155 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 6.47e-01 0.0718 0.156 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.77e-01 0.00476 0.167 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 3.31e-01 0.13 0.133 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00861 0.147 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 3.77e-01 -0.14 0.158 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.33e-01 0.0498 0.146 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0414 0.161 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 3.06e-01 0.17 0.166 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.07e-02 -0.303 0.161 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 5.94e-01 0.0811 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0511 0.124 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.89e-01 0.00204 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 2.46e-01 -0.154 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.08e-01 0.138 0.167 0.1 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0122 0.15 0.1 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 5.20e-01 -0.087 0.135 0.1 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 7.87e-01 0.0304 0.112 0.1 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 6.43e-01 0.0698 0.15 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 6.64e-01 0.0572 0.131 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 8.50e-01 0.0233 0.123 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.34e-01 -0.22 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 3.72e-01 -0.135 0.151 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 3.44e-01 -0.155 0.164 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.13e-01 0.058 0.157 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 1.27e-02 0.352 0.14 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0581 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 4.41e-01 -0.104 0.135 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.43e-01 0.0643 0.139 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00278 0.125 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 9.42e-01 0.0099 0.136 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.42e-01 0.0763 0.164 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.39e-01 0.143 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.68e-02 0.217 0.0974 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.19e-02 0.262 0.15 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0805 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.12e-01 0.0503 0.136 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 4.09e-01 0.124 0.149 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 3.23e-01 -0.153 0.154 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.54e-01 -0.07 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 9.95e-02 0.251 0.152 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 4.60e-01 0.0828 0.112 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 3.27e-02 0.325 0.151 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0909 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 1.60e-01 -0.196 0.139 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0539 0.148 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.10e-01 -0.118 0.143 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0514 0.158 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.33e-01 0.0427 0.125 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 9.52e-03 0.27 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.93e-02 0.364 0.219 0.07 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 6.56e-01 0.0555 0.124 0.07 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00398 0.225 0.07 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 2.34e-01 -0.228 0.19 0.07 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 1.97e-01 0.263 0.203 0.07 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 2.58e-01 -0.228 0.2 0.07 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.96e-02 -0.375 0.205 0.07 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 5.90e-01 0.076 0.141 0.07 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 1.85e-02 -0.365 0.154 0.098 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 1.80e-01 -0.109 0.0811 0.098 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.38e-01 0.219 0.147 0.098 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0471 0.164 0.098 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.60e-02 -0.23 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 4.47e-01 0.0957 0.125 0.098 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0346 0.105 0.098 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 4.25e-01 0.122 0.152 0.098 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 2.00e-02 -0.26 0.111 0.098 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.63e-01 0.0405 0.134 0.098 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.39e-01 0.115 0.149 0.098 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.72e-01 0.00531 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.31e-02 0.225 0.12 0.098 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0217 0.0969 0.098 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0834 0.145 0.098 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.098 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0889 0.153 0.098 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 9.76e-01 0.00414 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 2.27e-01 0.144 0.119 0.098 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.72e-02 0.194 0.105 0.098 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0583 0.161 0.098 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0313 0.115 0.098 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 3.26e-01 -0.145 0.148 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.80e-01 0.00261 0.101 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 6.01e-01 0.0801 0.153 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0451 0.0787 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0527 0.128 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.29e-01 -0.145 0.121 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0202 0.142 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0287 0.151 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0903 0.11 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.54e-01 0.233 0.163 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 2.52e-02 0.253 0.112 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 1.00e+00 -6.21e-05 0.136 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.75e-02 0.22 0.128 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 9.22e-01 0.0137 0.14 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 1.22e-01 0.253 0.162 0.109 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.29e-01 0.0139 0.156 0.109 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 5.23e-01 0.099 0.154 0.109 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 1.96e-01 0.235 0.181 0.109 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 4.25e-01 0.145 0.181 0.109 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 5.51e-01 0.101 0.17 0.109 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 7.44e-01 0.047 0.144 0.109 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 4.07e-01 0.124 0.149 0.098 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 1.98e-01 -0.196 0.152 0.098 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0445 0.16 0.098 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 5.27e-01 0.0854 0.135 0.098 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0255 0.163 0.098 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 3.32e-01 -0.166 0.17 0.098 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.88e-01 0.15 0.141 0.098 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 2.15e-01 0.168 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.27e-01 0.0491 0.141 0.1 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0596 0.144 0.1 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0414 0.0969 0.1 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 2.97e-01 0.162 0.155 0.1 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 7.29e-01 -0.048 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.05e-01 0.191 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 9.86e-02 0.263 0.159 0.105 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0569 0.102 0.105 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 4.21e-01 -0.127 0.157 0.105 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 6.08e-02 0.279 0.148 0.105 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 7.60e-01 0.0356 0.116 0.105 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.69e-01 0.00393 0.102 0.105 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0211 0.154 0.105 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0155 0.0977 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 2.26e-02 0.358 0.156 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00996 0.107 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 2.55e-01 0.153 0.134 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 2.69e-01 -0.106 0.0959 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 5.69e-01 0.0796 0.139 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0169 0.146 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.22e-01 0.158 0.129 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 9.05e-01 0.0158 0.132 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 4.97e-01 0.103 0.152 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.57e-01 -0.035 0.113 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 6.84e-02 -0.21 0.115 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 3.59e-01 0.0906 0.0986 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 700723 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0883 0.121 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 5.37e-01 0.102 0.164 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 6.91e-01 0.0393 0.0986 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 4.83e-02 -0.274 0.138 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 2.79e-01 -0.151 0.139 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0142 0.0972 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 1.75e-01 0.204 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 5.73e-01 0.0415 0.0735 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0709 0.12 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 8.63e-01 0.0179 0.103 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 4.33e-01 -0.107 0.136 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 1.96e-01 0.171 0.132 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 3.54e-01 -0.121 0.13 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0766 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00851 0.0868 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 8.08e-01 0.0385 0.158 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 4.29e-01 -0.107 0.135 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 1.42e-01 0.226 0.153 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -698281 sc-eQTL 2.30e-01 0.168 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -480566 sc-eQTL 3.58e-01 -0.124 0.134 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -644812 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0461 0.128 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 423264 sc-eQTL 8.98e-01 0.0153 0.12 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 552143 sc-eQTL 4.16e-01 -0.107 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 673151 sc-eQTL 7.90e-01 -0.042 0.158 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -642462 sc-eQTL 2.93e-01 0.115 0.109 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 424177 sc-eQTL 2.15e-02 0.21 0.0906 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -480566 1.26e-06 2.52e-06 3.12e-07 1.29e-06 2.98e-07 4.63e-07 1.44e-06 1.91e-07 1.66e-06 3.77e-07 1.75e-06 6.06e-07 2.46e-06 2.98e-07 5.4e-07 7.95e-07 1.12e-06 1.09e-06 8.13e-07 3.93e-07 4.77e-07 1.6e-06 1.44e-06 2.24e-07 2.17e-06 8.08e-07 6.85e-07 6.83e-07 1.63e-06 1.27e-06 7.64e-07 5.22e-08 5.77e-08 2.97e-07 5.25e-07 1.44e-07 4.54e-07 1.03e-07 1.5e-07 3.35e-07 4.07e-08 1.65e-06 2.75e-08 2.03e-07 1.45e-07 3.92e-08 1.9e-07 2.75e-09 4.98e-08