logo

Genes within 1Mb (chr12:105658568:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0867 0.126 0.092 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.31e-02 -0.161 0.0643 0.092 B L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 2.27e-01 -0.116 0.0956 0.092 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0832 0.0609 0.092 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0207 0.0974 0.092 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00537 0.118 0.092 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.92e-01 0.0107 0.0783 0.092 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.41e-01 0.123 0.0835 0.092 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.20e-01 -0.021 0.0921 0.092 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 3.95e-01 -0.067 0.0785 0.092 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 2.19e-02 -0.207 0.0895 0.092 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00913 0.0893 0.092 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 8.03e-01 0.0309 0.124 0.092 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 7.64e-01 0.0241 0.08 0.092 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 8.46e-01 0.0135 0.0692 0.092 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 3.71e-02 0.228 0.109 0.092 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0217 0.0727 0.092 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.65e-01 -0.144 0.104 0.092 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0343 0.116 0.092 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 6.34e-03 -0.285 0.103 0.092 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0104 0.0645 0.092 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 8.50e-01 0.00873 0.0462 0.092 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.74e-01 0.0201 0.126 0.095 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.60e-01 -0.122 0.0866 0.095 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0898 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.62e-01 -0.077 0.105 0.095 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 1.17e-01 0.139 0.0883 0.095 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 8.51e-01 0.015 0.0795 0.095 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 7.86e-01 0.0355 0.131 0.095 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.74e-01 -0.03 0.0532 0.095 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.78e-01 0.0169 0.109 0.092 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.68e-02 -0.155 0.0777 0.092 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 2.67e-01 -0.138 0.124 0.092 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0513 0.0609 0.092 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0315 0.107 0.092 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0911 0.092 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0527 0.119 0.092 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.05e-02 0.247 0.12 0.092 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 1.43e-01 -0.175 0.119 0.092 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 8.07e-01 0.0266 0.108 0.092 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.56e-02 -0.257 0.105 0.092 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.51e-02 0.223 0.111 0.092 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.68e-02 -0.285 0.136 0.092 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.35e-01 0.0206 0.0988 0.092 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.39e-01 0.038 0.0809 0.092 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.76e-01 0.0383 0.135 0.092 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00414 0.0844 0.092 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 6.03e-01 0.0573 0.11 0.092 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00343 0.144 0.092 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 1.97e-01 -0.131 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.104 0.092 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0146 0.0846 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 3.27e-01 0.148 0.151 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.11e-01 -0.229 0.143 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0721 0.162 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 2.66e-02 -0.34 0.152 0.077 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 3.76e-01 -0.102 0.115 0.077 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 5.05e-01 -0.107 0.16 0.077 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.65e-01 0.0272 0.16 0.077 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.27e-01 0.0982 0.155 0.077 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0892 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 7.07e-03 -0.284 0.104 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.05e-01 -0.204 0.125 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 9.74e-02 -0.18 0.108 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 1.15e-01 0.188 0.119 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.66e-02 0.289 0.137 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.99e-01 0.000214 0.123 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 8.10e-01 0.0311 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0561 0.14 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0796 0.118 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0328 0.127 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 2.70e-01 -0.116 0.105 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 7.91e-01 0.0327 0.124 0.093 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 8.41e-01 0.0288 0.143 0.093 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0126 0.118 0.093 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0423 0.108 0.093 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.36e-01 -0.044 0.131 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 8.07e-01 0.024 0.0984 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 4.19e-01 0.0892 0.11 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0882 0.0989 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0244 0.115 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 4.00e-01 -0.12 0.142 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0215 0.0966 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.30e-01 0.191 0.126 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.34e-01 -0.11 0.14 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 5.80e-01 0.0675 0.122 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.48e-01 -0.11 0.117 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.86e-01 0.0736 0.105 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 1.37e-01 -0.164 0.11 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.83e-02 -0.309 0.148 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.104 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.16e-02 0.324 0.127 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0717 0.132 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 6.31e-01 0.0524 0.109 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.10e-01 -0.138 0.135 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 5.64e-01 -0.075 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.87e-01 0.113 0.131 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.11e-01 0.0154 0.137 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.32e-03 0.21 0.0774 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0683 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0724 0.0883 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 7.80e-02 -0.166 0.0936 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0104 0.093 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0123 0.136 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.65e-01 0.00385 0.0886 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.98e-01 -0.155 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.38e-01 0.0389 0.116 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0338 0.0855 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 8.70e-03 -0.29 0.109 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 3.03e-01 0.118 0.114 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.32e-01 0.137 0.141 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 6.44e-01 0.0436 0.0941 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.26e-01 0.0591 0.0931 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.54e-01 0.0845 0.143 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0686 0.112 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.42e-01 -0.18 0.122 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00319 0.139 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 2.32e-01 0.16 0.134 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.65e-01 0.00493 0.112 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00163 0.0899 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0348 0.134 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0149 0.12 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.67e-03 -0.352 0.111 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 7.50e-01 -0.04 0.125 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 1.73e-02 -0.35 0.146 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0818 0.128 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0439 0.0948 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 6.43e-02 0.222 0.119 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 8.89e-01 0.015 0.107 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 6.75e-01 0.0464 0.11 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 3.66e-01 0.108 0.119 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 2.06e-01 -0.163 0.128 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 5.86e-01 0.0523 0.0958 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0576 0.103 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.97e-01 0.0368 0.143 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0479 0.124 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0259 0.14 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 5.05e-01 -0.094 0.141 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 7.00e-02 -0.271 0.149 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 5.92e-01 0.0644 0.12 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 2.00e-01 -0.17 0.132 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 3.26e-02 0.294 0.137 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00694 0.127 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.85e-01 -0.122 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.87e-02 -0.285 0.143 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 6.20e-02 -0.263 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0365 0.132 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 4.14e-01 0.0882 0.108 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0114 0.138 0.091 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.95e-01 0.00083 0.124 0.091 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 8.13e-01 0.0315 0.132 0.091 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 7.32e-01 0.0534 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 2.31e-01 -0.168 0.14 0.091 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 5.10e-01 0.0833 0.126 0.091 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.091 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.53e-01 -0.1 0.133 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 7.02e-01 0.0446 0.116 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 3.75e-01 0.0967 0.109 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.81e-01 -0.174 0.129 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 1.73e-01 0.183 0.133 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0509 0.145 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 4.08e-01 0.115 0.139 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0443 0.125 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 1.63e-01 0.171 0.122 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 2.30e-01 -0.144 0.119 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0429 0.123 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.71e-02 -0.229 0.109 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 4.89e-02 0.237 0.12 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 1.97e-01 -0.187 0.144 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 3.78e-01 0.0951 0.108 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.75e-01 0.118 0.0869 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0418 0.137 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 1.81e-02 -0.314 0.132 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 8.90e-01 0.017 0.123 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0955 0.136 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 6.37e-01 0.0664 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0864 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 2.62e-01 -0.156 0.138 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0263 0.102 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.57e-01 0.0803 0.137 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 4.38e-01 -0.098 0.126 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 6.51e-01 0.0565 0.125 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.47e-01 -0.124 0.132 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 1.95e-01 0.166 0.127 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 5.82e-01 -0.078 0.141 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0901 0.112 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.80e-01 -0.052 0.0938 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00959 0.189 0.085 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0783 0.106 0.085 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 9.34e-01 0.0159 0.192 0.085 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.13e-01 0.0386 0.163 0.085 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 1.95e-01 -0.225 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0107 0.171 0.085 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 1.90e-01 -0.232 0.176 0.085 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.66e-01 0.166 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 1.81e-01 0.185 0.138 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00722 0.0722 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 2.45e-01 0.152 0.131 0.091 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 7.17e-01 0.0529 0.146 0.091 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 7.53e-01 0.0351 0.111 0.091 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 3.47e-01 0.105 0.111 0.091 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0448 0.0931 0.091 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.96e-02 0.246 0.14 0.092 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.104 0.092 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.94e-01 -0.161 0.124 0.092 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0665 0.138 0.092 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.28e-02 -0.295 0.137 0.092 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 6.04e-01 0.0583 0.112 0.092 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 9.64e-01 0.00402 0.0898 0.092 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 7.38e-01 0.0431 0.128 0.1 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00942 0.0954 0.1 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.08e-01 -0.217 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0285 0.121 0.1 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 8.56e-02 0.181 0.105 0.1 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0417 0.0937 0.1 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0222 0.142 0.1 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.84e-01 0.0279 0.101 0.1 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.28e-01 0.0284 0.13 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.42e-02 -0.179 0.0885 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.73e-01 -0.183 0.134 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 6.35e-01 -0.033 0.0693 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0843 0.113 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 7.47e-01 0.0344 0.107 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.40e-01 0.0768 0.125 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.17e-01 -0.108 0.133 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 6.37e-02 -0.18 0.0965 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 7.90e-01 0.0385 0.144 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0586 0.1 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 8.03e-01 0.03 0.12 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 2.31e-01 -0.137 0.114 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0418 0.123 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 6.53e-01 0.0689 0.153 0.088 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.02e-01 -0.238 0.144 0.088 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0505 0.144 0.088 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.10e-01 0.041 0.17 0.088 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 1.29e-01 -0.257 0.168 0.088 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 4.42e-01 -0.122 0.158 0.088 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 2.41e-02 0.301 0.132 0.088 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 9.79e-01 0.00334 0.126 0.096 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.09e-02 -0.261 0.127 0.096 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0893 0.134 0.096 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.91e-02 -0.192 0.113 0.096 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0566 0.137 0.096 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 1.39e-01 0.212 0.143 0.096 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 3.94e-01 -0.101 0.119 0.096 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0674 0.119 0.095 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 3.54e-01 -0.115 0.123 0.095 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 4.93e-01 0.0867 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 5.94e-01 0.0454 0.0852 0.095 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 9.53e-01 0.008 0.137 0.095 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 1.03e-01 0.198 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 8.03e-01 0.033 0.132 0.095 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.05e-02 -0.292 0.148 0.099 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.86e-01 -0.127 0.0958 0.099 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.54e-01 0.137 0.148 0.099 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 7.19e-02 -0.252 0.139 0.099 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 7.36e-01 0.0369 0.109 0.099 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 3.91e-01 0.0818 0.0951 0.099 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 1.00e-01 -0.237 0.143 0.099 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0528 0.0917 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 3.21e-01 -0.14 0.141 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 1.10e-02 -0.241 0.0938 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 1.62e-01 -0.168 0.12 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 3.71e-02 -0.178 0.085 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 1.50e-01 0.179 0.124 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 8.39e-02 0.225 0.129 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 8.90e-01 0.016 0.115 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 9.09e-01 0.0136 0.118 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0803 0.133 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.0991 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0169 0.102 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0178 0.0866 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699824 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0905 0.106 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 1.58e-01 -0.203 0.144 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 7.59e-01 0.0266 0.0865 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 1.67e-02 0.29 0.12 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0259 0.124 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 4.00e-02 -0.176 0.0851 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 3.73e-01 -0.119 0.133 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0141 0.065 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0341 0.106 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0503 0.0913 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.62e-01 0.0529 0.121 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0959 0.115 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 9.98e-02 -0.186 0.113 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0854 0.128 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0393 0.0756 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0112 0.137 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 1.23e-01 0.181 0.117 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0659 0.134 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699180 sc-eQTL 8.10e-02 0.217 0.124 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -481465 sc-eQTL 1.57e-01 -0.17 0.119 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645711 sc-eQTL 8.18e-01 0.0263 0.114 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422365 sc-eQTL 2.82e-02 -0.233 0.105 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 551244 sc-eQTL 6.86e-02 0.212 0.116 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672252 sc-eQTL 6.64e-02 -0.258 0.14 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643361 sc-eQTL 9.10e-01 0.011 0.0976 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423278 sc-eQTL 5.67e-01 0.0468 0.0816 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 422365 eQTL 4.72e-07 -0.154 0.0303 0.0 0.0 0.102
ENSG00000151131 C12orf45 672252 eQTL 0.042 0.054 0.0265 0.0 0.0 0.102

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina