logo

Genes within 1Mb (chr12:105658317:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0361 0.117 0.118 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.80e-02 -0.132 0.0597 0.118 B L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0827 0.0886 0.118 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0842 0.0563 0.118 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 2.51e-01 -0.103 0.0899 0.118 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0335 0.109 0.118 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.97e-01 0.0187 0.0725 0.118 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 1.27e-01 0.118 0.0773 0.118 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.87e-01 0.00138 0.0855 0.118 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.22e-01 -0.036 0.073 0.118 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.63e-02 -0.175 0.0833 0.118 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00217 0.0829 0.118 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 5.18e-01 0.0742 0.115 0.118 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.11e-01 0.0378 0.0742 0.118 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.98e-01 0.0165 0.0642 0.118 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.40e-03 0.267 0.1 0.118 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0273 0.0674 0.118 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.51e-01 -0.139 0.0961 0.118 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 9.59e-01 0.00556 0.108 0.118 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.50e-02 -0.236 0.0962 0.118 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 8.67e-01 -0.01 0.0598 0.118 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0125 0.0429 0.118 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00095 0.116 0.122 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0861 0.0794 0.122 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0133 0.119 0.122 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0871 0.0957 0.122 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 1.50e-01 0.117 0.0809 0.122 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 7.66e-01 0.0217 0.0728 0.122 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.14e-01 -0.013 0.12 0.122 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0179 0.0488 0.122 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.23e-01 0.0495 0.101 0.118 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.75e-02 -0.159 0.0715 0.118 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.38e-01 -0.135 0.114 0.118 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0552 0.0561 0.118 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0202 0.0987 0.118 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0173 0.0839 0.118 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.55e-01 -0.125 0.109 0.118 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 7.18e-02 0.2 0.11 0.118 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 3.54e-01 -0.102 0.109 0.118 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0347 0.0995 0.118 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.27e-02 -0.176 0.0974 0.118 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.65e-01 0.142 0.102 0.118 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 2.63e-01 -0.141 0.125 0.118 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 8.98e-01 0.0117 0.0906 0.118 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0282 0.0742 0.118 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.99e-01 0.0159 0.125 0.118 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0137 0.0782 0.118 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 8.47e-01 0.0197 0.102 0.118 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0156 0.134 0.118 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0434 0.0941 0.118 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.30e-01 0.0331 0.0958 0.118 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.35e-01 0.0266 0.0783 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.46e-01 0.0639 0.139 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 4.00e-01 -0.112 0.132 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0395 0.149 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.90e-02 -0.291 0.14 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0342 0.106 0.105 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 4.94e-01 -0.101 0.147 0.105 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 3.33e-01 -0.143 0.147 0.105 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 4.83e-01 0.1 0.143 0.105 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0642 0.133 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 5.54e-03 -0.27 0.0964 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.27e-01 -0.141 0.116 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.26e-01 -0.154 0.1 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 1.87e-01 0.146 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 6.06e-02 0.24 0.127 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00421 0.114 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 8.81e-01 0.0179 0.119 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.03e-01 0.0156 0.129 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.52e-01 -0.049 0.109 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0763 0.117 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.00e-01 -0.1 0.0967 0.119 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 9.23e-01 -0.011 0.114 0.119 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 6.72e-01 0.0557 0.131 0.119 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.69e-01 0.00417 0.108 0.119 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0633 0.0995 0.119 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.121 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 7.83e-01 0.0251 0.0912 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.30e-01 0.0994 0.102 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0737 0.0917 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0538 0.106 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 4.20e-01 -0.106 0.132 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0895 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.62e-02 0.195 0.117 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 2.16e-01 -0.159 0.128 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0168 0.112 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0466 0.107 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.69e-01 0.0284 0.0967 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 7.86e-02 -0.178 0.101 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 2.20e-02 -0.313 0.136 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 3.43e-01 0.0905 0.0952 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 1.94e-02 0.276 0.117 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0562 0.122 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.50e-01 0.0191 0.101 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.02e-01 -0.205 0.125 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 8.65e-01 0.0205 0.12 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 6.52e-01 0.0547 0.121 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0821 0.127 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.16e-02 0.167 0.0721 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0397 0.0954 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0328 0.0819 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 9.10e-02 -0.147 0.0868 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0091 0.0862 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 8.73e-01 0.0201 0.126 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.34e-01 0.0391 0.082 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.73e-01 -0.123 0.112 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 4.60e-01 0.0794 0.107 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0572 0.0788 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.09e-02 -0.236 0.101 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 5.40e-01 0.0648 0.106 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 3.10e-01 0.132 0.13 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 5.59e-01 0.0508 0.0868 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 5.79e-01 0.0478 0.0859 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.36e-01 0.0273 0.132 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0249 0.103 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.78e-01 -0.123 0.113 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.50e-01 0.0408 0.128 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.94e-01 0.161 0.124 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0436 0.103 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.27e-01 -0.029 0.083 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0203 0.124 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0573 0.111 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.51e-03 -0.328 0.102 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0569 0.116 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 2.14e-02 -0.313 0.135 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 3.77e-01 -0.105 0.119 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.39e-01 -0.103 0.0875 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 4.08e-02 0.227 0.11 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0043 0.0994 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.13e-01 0.0376 0.102 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.11 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.46e-01 -0.173 0.118 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 3.47e-01 0.0835 0.0886 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0479 0.0949 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.60e-01 0.058 0.132 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0304 0.115 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0914 0.129 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0986 0.13 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 2.51e-01 -0.159 0.138 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.94e-01 0.0289 0.111 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.64e-01 -0.137 0.122 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 3.26e-02 0.274 0.127 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.79e-01 0.00311 0.118 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0793 0.13 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 2.82e-02 -0.295 0.133 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 4.52e-02 -0.263 0.13 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0453 0.123 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 4.63e-01 0.0739 0.1 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0619 0.128 0.117 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0655 0.115 0.117 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.79e-01 0.0346 0.123 0.117 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.77e-01 0.041 0.145 0.117 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0126 0.13 0.117 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.24e-01 0.0575 0.117 0.117 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 8.58e-01 0.0175 0.0975 0.117 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0996 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 3.85e-01 0.0929 0.107 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.10e-01 0.0114 0.1 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.08e-01 -0.191 0.119 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.78e-01 0.166 0.123 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0423 0.133 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.24e-01 0.0627 0.128 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0925 0.115 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 2.82e-01 0.121 0.112 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0914 0.11 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0135 0.113 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.15e-01 -0.126 0.101 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.41e-01 0.163 0.11 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0999 0.133 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 8.03e-01 0.0248 0.0991 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 5.84e-01 0.044 0.0803 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0706 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 9.91e-02 -0.205 0.123 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.06e-01 0.0283 0.115 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0515 0.126 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.08e-01 0.133 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.57e-01 0.00705 0.132 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 2.10e-01 -0.162 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0107 0.0947 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 5.55e-01 0.0749 0.127 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 9.54e-01 0.00673 0.117 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0737 0.116 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0969 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.118 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.36e-01 0.0106 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00426 0.104 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 2.27e-01 -0.105 0.0868 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0515 0.182 0.1 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.97e-01 -0.107 0.102 0.1 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0168 0.185 0.1 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0583 0.157 0.1 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 1.43e-01 -0.245 0.166 0.1 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0375 0.165 0.1 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 2.08e-01 -0.215 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 6.14e-02 0.216 0.114 0.1 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 3.36e-01 0.122 0.126 0.117 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00183 0.0661 0.117 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.12 0.117 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.91e-01 0.0353 0.133 0.117 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 8.99e-01 0.013 0.102 0.117 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 4.60e-01 0.0754 0.102 0.117 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0242 0.0852 0.117 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 1.44e-01 0.188 0.128 0.118 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 5.70e-01 0.0541 0.0952 0.118 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.118 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.71e-01 0.0369 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.04e-01 -0.206 0.126 0.118 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 5.36e-01 0.0636 0.103 0.118 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00888 0.0822 0.118 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 6.33e-01 0.0559 0.117 0.129 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.22e-01 0.0429 0.0868 0.129 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.80e-02 -0.217 0.122 0.129 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0332 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 9.26e-02 0.161 0.0953 0.129 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0966 0.0851 0.129 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0706 0.129 0.129 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.44e-01 0.00646 0.0925 0.129 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 7.11e-01 0.0447 0.12 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 3.42e-02 -0.174 0.0817 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.03e-01 -0.128 0.124 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0298 0.064 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0498 0.104 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 8.79e-01 -0.015 0.0985 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0124 0.116 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0697 0.123 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 3.33e-02 -0.19 0.0887 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 9.15e-01 0.0142 0.133 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0913 0.0924 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 7.09e-01 0.0413 0.111 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 1.17e-01 -0.165 0.105 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0475 0.114 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 5.36e-01 0.0859 0.139 0.118 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 3.25e-01 -0.13 0.132 0.118 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0873 0.131 0.118 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 9.66e-01 0.0065 0.154 0.118 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.61e-01 -0.215 0.153 0.118 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 4.71e-01 -0.104 0.143 0.118 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 1.07e-01 0.196 0.121 0.118 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0195 0.116 0.122 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 6.20e-02 -0.22 0.117 0.122 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0598 0.124 0.122 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 4.37e-02 -0.21 0.103 0.122 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.84e-01 -0.168 0.126 0.122 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 1.37e-01 0.197 0.132 0.122 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0458 0.109 0.122 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.59e-01 0.00576 0.111 0.122 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0696 0.114 0.122 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 5.98e-01 0.0617 0.117 0.122 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 3.94e-01 0.0673 0.0787 0.122 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.74e-01 0.00406 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.36e-02 0.201 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 8.72e-01 0.0198 0.122 0.122 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 1.53e-02 -0.325 0.133 0.13 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0936 0.0863 0.13 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.15e-02 0.285 0.131 0.13 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 1.26e-01 -0.193 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 6.87e-01 0.0397 0.0984 0.13 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 1.89e-01 0.113 0.0853 0.13 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.67e-02 -0.23 0.129 0.13 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0122 0.0826 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 4.42e-01 -0.1 0.13 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 1.23e-02 -0.219 0.0866 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.93e-01 -0.144 0.11 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 5.77e-02 -0.15 0.0785 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 3.78e-01 0.101 0.115 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.10e-02 0.203 0.119 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.46e-01 0.00723 0.106 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00605 0.109 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0112 0.123 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00566 0.0916 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 7.80e-01 0.0262 0.0938 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0213 0.0801 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699573 sc-eQTL 2.01e-01 -0.125 0.0976 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.92e-02 -0.22 0.133 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 6.22e-01 0.0394 0.0799 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 1.55e-02 0.271 0.111 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000887 0.114 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 2.29e-02 -0.179 0.0783 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 3.85e-01 -0.107 0.123 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0402 0.0599 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.098 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0929 0.0841 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0361 0.111 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0269 0.106 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 1.87e-01 -0.138 0.104 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 5.42e-01 -0.072 0.118 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0226 0.0697 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0942 0.127 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 7.54e-02 0.192 0.108 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0587 0.124 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699431 sc-eQTL 1.23e-01 0.176 0.114 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -481716 sc-eQTL 3.40e-01 -0.105 0.11 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -645962 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0188 0.105 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 422114 sc-eQTL 1.47e-01 -0.142 0.0974 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550993 sc-eQTL 2.20e-01 0.131 0.107 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 672001 sc-eQTL 3.76e-01 -0.114 0.129 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -643612 sc-eQTL 9.60e-01 0.00445 0.0895 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 423027 sc-eQTL 8.31e-01 -0.016 0.0749 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 422114 eQTL 2.19e-06 -0.127 0.0267 0.0 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 422114 5.59e-07 9.39e-07 7.87e-08 3.96e-07 1.07e-07 1.26e-07 5.54e-07 2.04e-07 1.14e-06 3.04e-07 1.82e-06 5.83e-07 1.65e-06 2.83e-07 4.32e-07 2.14e-07 3.52e-07 3.95e-07 1.77e-07 1.69e-07 1.34e-07 4.11e-07 2.11e-07 1.06e-07 1.25e-06 2e-07 2.52e-07 5.8e-07 2.66e-07 3.39e-07 7.32e-07 3.6e-08 4.93e-08 1.57e-07 2.84e-07 5.32e-08 1.06e-07 8.71e-08 4.23e-08 8.61e-08 4.83e-08 6.49e-07 3.59e-08 1.13e-08 3.36e-08 9.49e-09 1.18e-07 1.88e-09 5.01e-08