logo

Genes within 1Mb (chr12:105657857:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00342 0.102 0.186 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00355 0.0525 0.186 B L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 6.93e-02 -0.14 0.0766 0.186 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0125 0.0492 0.186 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 3.03e-01 0.0808 0.0782 0.186 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.42e-01 0.0189 0.0947 0.186 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 7.56e-01 0.0196 0.063 0.186 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 7.24e-01 0.0239 0.0675 0.186 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 8.65e-01 0.0124 0.0729 0.186 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0222 0.0623 0.186 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 7.43e-01 0.0236 0.0718 0.186 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0624 0.0706 0.186 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 3.93e-01 0.0836 0.0977 0.186 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00156 0.0634 0.186 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0294 0.0548 0.186 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.0871 0.186 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0078 0.0577 0.186 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.17e-02 0.207 0.0814 0.186 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.53e-01 0.132 0.0919 0.186 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.55e-01 0.0153 0.0835 0.186 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0128 0.0512 0.186 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 4.15e-02 0.0746 0.0364 0.186 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 3.50e-02 -0.22 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0714 0.0719 0.185 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.35e-01 0.161 0.107 0.185 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.27e-01 -0.069 0.0867 0.185 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0688 0.0735 0.185 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00507 0.0659 0.185 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 6.39e-01 0.0509 0.108 0.185 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 3.35e-01 0.0425 0.044 0.185 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.10e-01 0.01 0.0884 0.186 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.97e-01 0.000251 0.0634 0.186 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 2.54e-01 0.114 0.0999 0.186 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 3.69e-01 0.0443 0.0492 0.186 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.94e-02 0.147 0.086 0.186 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 4.13e-01 0.0603 0.0734 0.186 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.70e-03 0.263 0.0943 0.186 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 1.64e-01 -0.132 0.0942 0.187 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 5.01e-01 0.0628 0.0931 0.187 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.88e-01 0.0228 0.0846 0.187 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 5.08e-02 0.163 0.0827 0.187 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.41e-01 0.128 0.0867 0.187 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.92e-01 0.0282 0.107 0.187 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 2.91e-01 0.0814 0.0769 0.187 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 7.32e-01 0.0217 0.0631 0.187 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0179 0.11 0.186 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0195 0.0692 0.186 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0154 0.0902 0.186 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 5.18e-03 0.328 0.116 0.186 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0842 0.0831 0.186 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 1.43e-01 0.124 0.0844 0.186 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0135 0.0693 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.37e-03 0.333 0.108 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.20e-01 0.0679 0.105 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 8.32e-01 0.0253 0.119 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.33e-01 0.0886 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 9.93e-02 -0.139 0.0837 0.191 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0188 0.117 0.191 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0698 0.117 0.191 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.113 0.191 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0974 0.116 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0342 0.0862 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0516 0.0885 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 4.24e-01 0.0779 0.0972 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 5.33e-01 0.0702 0.113 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.61e-02 0.209 0.0991 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 9.50e-01 0.00662 0.105 0.187 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 3.11e-01 -0.119 0.117 0.185 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 1.43e-01 -0.145 0.0984 0.185 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 8.93e-01 0.0144 0.107 0.185 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.58e-01 0.0654 0.0881 0.185 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.185 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 1.41e-01 -0.176 0.119 0.185 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.49e-01 0.00632 0.0985 0.185 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 2.62e-01 0.102 0.0903 0.185 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00619 0.105 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.31e-01 0.0495 0.0789 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 3.15e-02 -0.189 0.0875 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 8.78e-01 0.0122 0.0795 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 4.84e-01 0.0644 0.0919 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.64e-01 0.0196 0.114 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 6.82e-01 0.0318 0.0775 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 8.38e-01 0.0208 0.102 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 3.53e-01 -0.105 0.113 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.29e-01 0.0617 0.0979 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0746 0.0936 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 9.92e-02 -0.139 0.0842 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 5.38e-01 0.0548 0.0889 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.63e-01 0.0364 0.12 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00612 0.0836 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.70e-01 0.143 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.59e-01 0.125 0.11 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.99e-01 0.0481 0.0914 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 8.58e-01 0.0204 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 6.46e-01 0.0502 0.109 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0865 0.11 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0779 0.115 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0815 0.066 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.13e-01 0.00895 0.0817 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0189 0.0701 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 9.21e-01 0.00746 0.0748 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0121 0.0737 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.22e-01 0.0383 0.108 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.46e-01 0.00477 0.0702 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.55e-01 0.0566 0.0958 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.31e-01 0.00806 0.0925 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0214 0.068 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 7.54e-01 0.0277 0.0884 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0265 0.0911 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 6.32e-01 0.054 0.112 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0419 0.0748 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.37e-01 -0.11 0.0737 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.87e-01 0.0814 0.117 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0507 0.0917 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 7.27e-01 0.0351 0.1 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 2.19e-01 -0.139 0.113 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 6.45e-01 0.0508 0.11 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 7.18e-01 0.0332 0.0918 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 3.97e-01 0.0624 0.0735 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0623 0.107 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0191 0.0954 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 5.87e-02 0.17 0.0894 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00992 0.0999 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0714 0.118 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0886 0.102 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.31e-01 0.114 0.0752 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 1.47e-01 -0.14 0.0962 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0059 0.0862 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.49e-02 0.215 0.0873 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.79e-01 -0.068 0.0959 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00507 0.077 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 2.98e-01 0.0858 0.0822 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 8.21e-01 0.0268 0.118 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 4.22e-01 0.093 0.115 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 9.66e-03 0.299 0.114 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.124 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0931 0.099 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0513 0.11 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0608 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.21e-01 0.0105 0.107 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.31e-01 -0.177 0.117 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.35e-02 0.244 0.12 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.26e-02 0.212 0.118 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 5.26e-01 0.0705 0.111 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 6.37e-01 0.0428 0.0905 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.69e-01 0.0776 0.107 0.188 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.77e-01 0.0536 0.0959 0.188 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 8.58e-01 0.0184 0.103 0.188 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.49e-02 0.292 0.119 0.188 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 5.21e-01 0.0697 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 8.86e-02 0.166 0.0971 0.188 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.71e-01 0.111 0.081 0.188 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0238 0.107 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 2.12e-01 0.117 0.0933 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.36e-01 0.00709 0.0878 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 6.48e-01 0.0477 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 5.17e-01 -0.07 0.108 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 2.56e-01 -0.133 0.117 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.83e-01 0.0978 0.112 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 2.20e-01 0.124 0.101 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0114 0.0961 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 7.66e-01 0.028 0.0938 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.75e-01 0.00305 0.0964 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 2.67e-01 0.096 0.0863 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 3.02e-01 0.0977 0.0944 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0442 0.114 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 1.38e-01 0.125 0.0841 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00706 0.0685 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0561 0.11 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 1.70e-01 0.148 0.107 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0111 0.0994 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.109 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 9.65e-02 0.188 0.113 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0276 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0506 0.112 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.16e-01 0.0533 0.0819 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 1.17e-01 -0.169 0.107 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 5.07e-01 0.0663 0.0998 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 6.45e-01 0.0456 0.0988 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.27e-01 0.16 0.104 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.24e-01 0.0808 0.101 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 1.29e-01 0.169 0.111 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0694 0.0883 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 4.27e-01 0.059 0.0741 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.06e-01 0.17 0.133 0.211 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0424 0.0753 0.211 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 9.87e-01 0.00222 0.136 0.211 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.06e-01 0.187 0.115 0.211 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0583 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 2.85e-01 0.13 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.12e-01 0.0139 0.126 0.211 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0151 0.0854 0.211 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.112 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 8.65e-01 0.01 0.0587 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 9.47e-01 0.00707 0.107 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 8.61e-02 0.203 0.118 0.187 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 6.01e-01 0.0475 0.0906 0.187 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0911 0.0904 0.187 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0981 0.0754 0.187 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.46e-01 -0.128 0.11 0.186 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 8.63e-01 0.0141 0.0816 0.186 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 2.18e-01 0.12 0.0969 0.186 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0467 0.108 0.186 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 1.36e-01 0.162 0.108 0.186 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 3.78e-01 0.0775 0.0878 0.186 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0542 0.0702 0.186 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 2.20e-02 -0.253 0.109 0.176 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 1.27e-01 -0.126 0.082 0.176 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.25e-01 0.179 0.116 0.176 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0562 0.104 0.176 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0464 0.0911 0.176 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.68e-01 -0.024 0.081 0.176 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 9.90e-01 0.00158 0.123 0.176 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.02e-01 0.059 0.0877 0.176 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0869 0.108 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0427 0.0741 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 2.78e-01 0.121 0.111 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.91e-01 0.0752 0.0573 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 8.84e-02 0.159 0.0931 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 2.88e-01 0.0939 0.0882 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 3.43e-02 0.219 0.103 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.21e-01 0.0896 0.111 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0281 0.0813 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 4.47e-01 0.0917 0.12 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0428 0.0838 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 3.72e-01 0.0896 0.1 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0781 0.0951 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 1.22e-02 0.256 0.101 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 6.52e-02 -0.247 0.133 0.17 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 5.27e-01 0.0813 0.128 0.17 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.95e-01 -0.164 0.126 0.17 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0969 0.15 0.17 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0412 0.149 0.17 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 1.38e-01 0.207 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 7.18e-01 0.0427 0.118 0.17 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 5.06e-02 0.208 0.106 0.18 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 2.35e-01 0.129 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.64e-01 -0.158 0.113 0.18 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 8.79e-01 0.0147 0.0961 0.18 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0314 0.116 0.18 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 7.88e-02 0.214 0.121 0.18 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 7.46e-01 0.0326 0.101 0.18 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 1.59e-01 -0.142 0.1 0.188 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0855 0.104 0.188 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 3.41e-01 0.101 0.106 0.188 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0826 0.0715 0.188 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0791 0.115 0.188 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 2.93e-01 0.108 0.102 0.188 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.79e-01 0.0618 0.111 0.188 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.17e-01 0.11 0.136 0.172 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 2.12e-01 0.109 0.0868 0.172 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 5.10e-01 0.0884 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.08e-01 0.105 0.127 0.172 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0914 0.0988 0.172 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 2.26e-01 -0.104 0.0859 0.172 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 2.10e-01 0.164 0.13 0.172 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0488 0.083 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 6.46e-01 0.0524 0.114 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0545 0.0768 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 6.64e-01 0.0421 0.0969 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 7.49e-01 0.0222 0.0693 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 6.34e-01 0.0479 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0322 0.105 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 4.05e-01 0.0775 0.0929 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 6.66e-01 0.0411 0.0952 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0774 0.106 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 6.95e-01 0.031 0.0791 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.16e-02 -0.203 0.0798 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0837 0.0689 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 699113 sc-eQTL 5.38e-01 0.0522 0.0845 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 7.76e-01 0.0328 0.115 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0122 0.069 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 4.72e-01 0.07 0.0972 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0192 0.101 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0211 0.07 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 1.37e-01 0.161 0.108 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 4.25e-01 0.0423 0.0529 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 9.52e-02 0.144 0.086 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 7.92e-01 0.0197 0.0744 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 3.51e-03 0.284 0.0963 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 9.08e-01 0.0112 0.0974 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 6.68e-01 0.0412 0.096 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 9.99e-01 0.000166 0.108 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0278 0.064 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00435 0.116 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 1.22e-02 0.248 0.0981 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -699891 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0943 0.0971 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -482176 sc-eQTL 4.70e-01 0.0676 0.0935 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -646422 sc-eQTL 8.73e-01 0.0142 0.089 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 421654 sc-eQTL 3.72e-02 0.173 0.0823 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 550533 sc-eQTL 1.10e-01 0.145 0.0905 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 671541 sc-eQTL 4.28e-01 0.0871 0.11 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -644072 sc-eQTL 5.05e-01 0.0507 0.076 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 422567 sc-eQTL 6.30e-01 0.0307 0.0637 0.188 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 671541 3.21e-07 1.56e-07 6.42e-08 2.2e-07 1.07e-07 8.89e-08 2.16e-07 5.89e-08 1.86e-07 1.03e-07 1.76e-07 1.46e-07 2.38e-07 8.07e-08 6.12e-08 9.6e-08 4.25e-08 1.91e-07 7.29e-08 6.03e-08 1.26e-07 1.7e-07 1.68e-07 3.68e-08 2.17e-07 1.51e-07 1.29e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.29e-07 1.21e-07 4.32e-08 3.65e-08 9.3e-08 4.04e-08 3.11e-08 4.28e-08 7.61e-08 6.49e-08 5.96e-08 5.1e-08 1.55e-07 3.99e-08 7.78e-09 3.4e-08 8.31e-09 7.83e-08 2.02e-09 4.94e-08