logo

Genes within 1Mb (chr12:105654364:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 1.72e-01 0.124 0.0908 0.267 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.09e-01 0.048 0.047 0.267 B L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 2.03e-01 0.0883 0.0691 0.267 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.58e-01 0.0499 0.0441 0.267 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 9.00e-01 0.00887 0.0704 0.267 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.34e-01 0.101 0.0848 0.267 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.07e-01 0.0292 0.0566 0.267 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 7.73e-01 0.0175 0.0606 0.267 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0734 0.0656 0.267 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0847 0.0559 0.267 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 2.46e-01 0.0751 0.0646 0.267 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0118 0.0639 0.267 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.06e-01 -0.143 0.0878 0.267 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0499 0.0571 0.267 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.38e-01 0.0383 0.0494 0.267 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 1.41e-02 -0.19 0.077 0.267 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0702 0.0514 0.267 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 5.32e-02 0.142 0.0732 0.267 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.71e-02 0.196 0.0814 0.267 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 3.41e-01 0.0711 0.0745 0.267 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.39e-01 0.0152 0.0458 0.267 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0296 0.0327 0.267 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.99e-01 0.0963 0.0925 0.264 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0543 0.0637 0.264 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0405 0.0953 0.264 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 5.08e-01 0.051 0.0768 0.264 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 9.30e-01 0.00576 0.0652 0.264 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00847 0.0583 0.264 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 4.56e-01 0.0715 0.0958 0.264 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000139 0.0391 0.264 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0898 0.0775 0.267 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.69e-01 0.0238 0.0557 0.267 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 5.23e-01 0.0564 0.0881 0.267 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 8.71e-01 0.00704 0.0434 0.267 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 5.85e-01 0.0416 0.0761 0.267 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.29e-01 0.0313 0.0647 0.267 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 2.15e-01 -0.105 0.0842 0.267 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0463 0.0858 0.266 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 5.31e-01 0.053 0.0844 0.266 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 5.41e-01 -0.047 0.0767 0.266 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0108 0.0757 0.266 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0565 0.0789 0.266 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 6.69e-01 0.0415 0.0971 0.266 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 5.86e-02 0.132 0.0693 0.266 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.53e-01 0.043 0.0572 0.266 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.43e-01 0.0588 0.0965 0.267 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.70e-01 0.0543 0.0605 0.267 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 2.89e-01 0.0837 0.0787 0.267 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.11e-02 -0.262 0.102 0.267 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0832 0.0727 0.267 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 2.68e-01 0.0823 0.0741 0.267 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 2.12e-01 0.0756 0.0604 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 1.96e-01 -0.131 0.101 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0132 0.0962 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 1.77e-01 0.146 0.108 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0921 0.103 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0422 0.077 0.265 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0582 0.107 0.265 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0108 0.107 0.265 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 2.92e-01 0.109 0.104 0.265 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.52e-03 0.27 0.1 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.15e-01 0.0379 0.0753 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0058 0.0896 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 8.99e-02 0.131 0.0769 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 1.49e-01 0.123 0.0847 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 9.99e-01 9.71e-05 0.0985 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.93e-01 0.0346 0.0875 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 5.90e-01 0.0494 0.0915 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 8.02e-01 0.0257 0.103 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 2.68e-01 -0.096 0.0864 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.80e-01 0.0821 0.0933 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.51e-02 -0.172 0.0763 0.267 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00159 0.0907 0.267 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.70e-02 0.248 0.103 0.267 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 2.89e-01 0.0915 0.0861 0.267 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 1.82e-01 -0.106 0.079 0.267 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 4.92e-01 0.0646 0.0938 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.97e-01 0.0276 0.0707 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.61e-01 0.00383 0.0792 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.96e-01 0.092 0.0709 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 1.89e-01 -0.108 0.082 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0619 0.102 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0115 0.0694 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0137 0.0911 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.38e-01 0.0336 0.1 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.40e-01 0.0829 0.0867 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 8.52e-01 0.0155 0.0832 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.34e-01 0.0895 0.0749 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 8.39e-01 -0.016 0.0789 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.93e-01 0.139 0.106 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0214 0.0741 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.30e-01 0.0728 0.092 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.33e-01 -0.115 0.0959 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0114 0.0794 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.41e-01 0.0942 0.0986 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 6.43e-01 0.044 0.0947 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 4.81e-01 0.0673 0.0953 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 2.40e-01 0.118 0.1 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 7.94e-02 -0.101 0.0571 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0536 0.0736 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0736 0.0631 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.50e-01 0.063 0.0673 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00279 0.0665 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0552 0.097 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.14e-01 -0.032 0.0633 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 5.03e-01 0.058 0.0864 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.95e-01 0.000497 0.0825 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0545 0.0605 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.09e-02 0.169 0.078 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0791 0.081 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.26e-02 -0.228 0.0991 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.71e-01 0.0194 0.0667 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 1.28e-01 0.1 0.0657 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0661 0.103 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 5.62e-02 -0.154 0.0804 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.05e-01 0.0911 0.0885 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.01e-01 0.128 0.0999 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.78e-01 -0.106 0.097 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.61e-01 0.0356 0.0811 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 5.55e-02 0.124 0.0645 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 1.06e-01 -0.152 0.0937 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.30e-01 -0.029 0.0839 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0331 0.0793 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.85e-02 0.206 0.0867 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.65e-01 0.144 0.103 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 3.11e-01 0.0912 0.0899 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 9.75e-01 0.00207 0.0665 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 3.47e-01 -0.084 0.089 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0584 0.0794 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 1.45e-02 0.199 0.0806 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.07e-01 0.142 0.0881 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 8.47e-01 0.0185 0.0952 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 8.45e-01 0.0139 0.071 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 1.33e-01 0.114 0.0756 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.64e-01 0.00472 0.104 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.72e-01 0.0807 0.0902 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 8.58e-02 0.174 0.101 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00908 0.109 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00608 0.0871 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.81e-01 0.0679 0.0962 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.07e-01 -0.038 0.101 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.12e-02 -0.199 0.0918 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00312 0.102 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 9.37e-01 0.00833 0.106 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.99e-01 -0.107 0.103 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 8.00e-01 0.0246 0.0967 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0396 0.0788 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 3.68e-01 0.0854 0.0948 0.268 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.36e-01 0.0403 0.0852 0.268 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.81e-01 0.00217 0.0911 0.268 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0954 0.107 0.268 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.00e-01 -0.123 0.0959 0.268 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 5.58e-01 0.0509 0.0867 0.268 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 7.69e-02 0.127 0.0716 0.268 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00172 0.0941 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 4.17e-01 0.0668 0.082 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 1.32e-01 0.116 0.0766 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 4.38e-02 -0.184 0.0909 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0409 0.0947 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0115 0.103 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 4.26e-02 0.198 0.0973 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 5.89e-01 0.048 0.0887 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0385 0.0872 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0084 0.0852 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.96e-01 0.0342 0.0875 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 6.63e-01 0.0343 0.0786 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0541 0.0859 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 8.88e-01 0.0145 0.103 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 1.71e-01 0.105 0.0764 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 3.19e-01 0.062 0.062 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0894 0.0983 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 2.20e-01 -0.118 0.0957 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.17e-01 0.0322 0.0887 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0191 0.0978 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 4.14e-01 0.0826 0.101 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 4.73e-01 -0.073 0.102 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 2.25e-02 0.227 0.0986 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 8.97e-01 0.00946 0.0732 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00549 0.097 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 1.49e-01 0.129 0.0892 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 9.31e-02 -0.149 0.0881 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.63e-01 0.00439 0.0939 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0645 0.0907 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 7.43e-01 0.033 0.1 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 2.50e-01 0.0913 0.0791 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.67e-01 0.0485 0.0666 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.99e-01 0.134 0.129 0.252 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.40e-01 0.0241 0.0726 0.252 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 8.22e-01 0.0296 0.131 0.252 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 9.71e-01 0.00404 0.112 0.252 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 2.56e-02 0.263 0.116 0.252 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00764 0.117 0.252 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 1.41e-01 0.178 0.12 0.252 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 2.42e-01 0.0961 0.0817 0.252 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.48e-01 0.115 0.0995 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0855 0.0518 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.72e-02 0.157 0.0941 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.35e-02 -0.258 0.104 0.267 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 9.86e-01 0.00144 0.0805 0.267 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.80e-01 0.0225 0.0804 0.267 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0104 0.0672 0.267 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0424 0.0982 0.267 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0645 0.0724 0.267 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 1.41e-01 -0.127 0.0861 0.267 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.52e-01 0.138 0.0957 0.267 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 2.24e-01 -0.118 0.0965 0.267 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0263 0.0782 0.267 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 6.89e-01 0.0251 0.0626 0.267 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.36e-01 0.111 0.0931 0.268 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0569 0.0693 0.268 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0722 0.0985 0.268 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0405 0.088 0.268 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0176 0.0767 0.268 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.84e-01 0.0905 0.0679 0.268 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 9.89e-01 0.00138 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 6.35e-02 0.137 0.0732 0.268 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0528 0.0928 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 9.04e-01 0.00765 0.0636 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0773 0.0956 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 9.89e-01 0.000656 0.0494 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 6.51e-01 0.0364 0.0804 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0489 0.0758 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 6.62e-01 0.039 0.0891 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.69e-01 0.028 0.0951 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 8.79e-01 0.0106 0.0695 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 2.45e-01 0.12 0.103 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 3.42e-01 0.0681 0.0716 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.96e-01 0.111 0.0854 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.50e-02 0.15 0.0809 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0735 0.0879 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.12e-01 0.0123 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.45e-01 0.0345 0.106 0.279 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.37e-01 0.00826 0.105 0.279 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 8.52e-01 0.0232 0.124 0.279 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 3.54e-01 -0.114 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 5.56e-01 -0.068 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 9.79e-01 0.00252 0.0976 0.279 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0503 0.0922 0.262 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0359 0.094 0.262 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 7.27e-01 0.0345 0.0985 0.262 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.45e-01 0.0967 0.0829 0.262 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 7.37e-01 0.034 0.101 0.262 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 5.25e-02 -0.204 0.104 0.262 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0206 0.0871 0.262 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0323 0.0883 0.269 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0257 0.0914 0.269 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 2.98e-01 0.0971 0.0931 0.269 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0181 0.063 0.269 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 8.12e-01 0.024 0.101 0.269 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 3.47e-01 0.0846 0.0896 0.269 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 9.84e-01 0.00192 0.0978 0.269 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 5.62e-01 0.0629 0.108 0.274 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 1.11e-01 -0.11 0.0689 0.274 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 1.05e-01 -0.173 0.106 0.274 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 2.45e-02 0.226 0.0996 0.274 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0949 0.0785 0.274 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 7.82e-01 0.019 0.0687 0.274 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.09e-01 0.0535 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 3.51e-01 0.0617 0.066 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 1.08e-01 0.162 0.1 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 3.53e-01 0.0632 0.0679 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 7.52e-01 0.0271 0.0858 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0328 0.0613 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 4.71e-01 0.0643 0.089 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 1.20e-01 0.145 0.0926 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.50e-01 0.0374 0.0824 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0394 0.0843 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 2.13e-01 0.119 0.095 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 7.19e-01 0.0256 0.071 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 5.68e-01 0.0415 0.0727 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 1.93e-01 0.0807 0.0618 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 695620 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0801 0.0757 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 6.22e-01 0.051 0.103 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0172 0.062 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 5.11e-01 0.0575 0.0872 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00915 0.0874 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 8.26e-01 0.0134 0.0608 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 9.91e-01 0.00108 0.0941 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000269 0.046 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 6.04e-01 0.039 0.0751 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.05e-01 0.0334 0.0646 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0676 0.0852 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0272 0.0838 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0418 0.0827 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 3.66e-01 0.0844 0.093 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 6.90e-01 0.022 0.0551 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 5.59e-01 0.0586 0.1 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0408 0.0857 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 8.42e-01 0.0196 0.0979 0.265 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703384 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0642 0.0884 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -485669 sc-eQTL 6.05e-01 0.0441 0.0851 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0501 0.0809 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 418161 sc-eQTL 6.55e-01 0.0339 0.0757 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 547040 sc-eQTL 3.16e-01 -0.083 0.0827 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 668048 sc-eQTL 8.63e-01 0.0173 0.0999 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647565 sc-eQTL 4.16e-02 0.141 0.0686 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 419074 sc-eQTL 4.85e-01 0.0405 0.0579 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -649915 pQTL 0.0201 -0.0338 0.0145 0.0 0.0 0.289
ENSG00000136044 APPL2 418161 eQTL 0.0105 0.0544 0.0212 0.0012 0.0 0.294

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 418161 9.83e-07 6.26e-07 1.59e-07 4.04e-07 9.93e-08 2.64e-07 6.02e-07 2.04e-07 6.53e-07 2.98e-07 9.07e-07 4.75e-07 9.57e-07 1.6e-07 3.15e-07 3.57e-07 5.06e-07 4.39e-07 2.79e-07 1.87e-07 2.61e-07 5.2e-07 4.01e-07 2.65e-07 9.26e-07 2.64e-07 4.27e-07 3.24e-07 5.03e-07 6.98e-07 3.67e-07 5.82e-08 5.37e-08 1.93e-07 3.52e-07 1.55e-07 1.05e-07 1.06e-07 7.72e-08 1.58e-08 1.14e-07 6.27e-07 4.71e-08 1.99e-08 1.94e-07 1.5e-08 1.19e-07 2.41e-08 6.03e-08