logo

Genes within 1Mb (chr12:105654119:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0221 0.104 0.171 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0855 0.0534 0.171 B L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.36e-01 -0.076 0.0788 0.171 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.91e-02 -0.117 0.0497 0.171 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0202 0.0802 0.171 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0838 0.0968 0.171 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.99e-01 0.0544 0.0644 0.171 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 1.27e-01 0.105 0.0687 0.171 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.72e-01 0.055 0.0763 0.171 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.50e-01 0.039 0.0652 0.171 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0682 0.0751 0.171 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 5.25e-01 0.0472 0.0741 0.171 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.54e-01 0.0189 0.103 0.171 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 6.31e-01 0.0319 0.0664 0.171 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 3.40e-01 0.0548 0.0573 0.171 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 9.79e-02 0.149 0.0895 0.171 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 3.28e-01 0.0582 0.0594 0.171 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.16e-02 -0.182 0.0843 0.171 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 8.35e-01 0.0199 0.0951 0.171 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 7.76e-03 -0.228 0.0847 0.171 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.70e-01 0.0154 0.0528 0.171 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 1.83e-01 0.0504 0.0377 0.171 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 6.73e-01 0.0442 0.105 0.173 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.05e-01 0.00856 0.072 0.173 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0944 0.107 0.173 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.04e-01 -0.141 0.0861 0.173 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0731 0.173 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0188 0.0658 0.173 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 6.99e-01 0.0419 0.108 0.173 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 4.41e-01 -0.034 0.044 0.173 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.71e-01 0.0649 0.0898 0.171 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0332 0.0644 0.171 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0635 0.102 0.171 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0782 0.0498 0.171 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0172 0.088 0.171 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.52e-01 0.0139 0.0748 0.171 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0532 0.0976 0.171 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.15e-02 0.2 0.0975 0.172 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 5.57e-01 0.0569 0.0969 0.172 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.83e-01 0.0243 0.0881 0.172 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 1.23e-01 -0.134 0.0864 0.172 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.88e-01 0.0963 0.0904 0.172 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0456 0.111 0.172 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.96e-01 0.0682 0.0801 0.172 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 9.77e-01 0.00192 0.0657 0.172 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 9.96e-01 0.000535 0.111 0.171 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.24e-01 0.0246 0.0695 0.171 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 7.97e-02 -0.158 0.0899 0.171 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 3.95e-01 0.101 0.119 0.171 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0579 0.0836 0.171 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.68e-01 0.0252 0.0852 0.171 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 8.89e-01 0.00972 0.0696 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0204 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0849 0.115 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 8.64e-01 0.0222 0.129 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 4.38e-02 -0.247 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 3.73e-01 -0.082 0.0917 0.163 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0957 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 2.41e-01 -0.15 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.31e-01 0.0777 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0799 0.118 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 1.39e-02 -0.213 0.086 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 2.30e-01 -0.125 0.103 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 7.13e-02 -0.161 0.0891 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 3.79e-02 0.204 0.0976 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 1.87e-01 0.15 0.114 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.68e-01 0.0914 0.101 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 3.40e-01 0.101 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00808 0.117 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0626 0.0985 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 7.96e-01 0.0276 0.106 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0733 0.0878 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 6.52e-01 0.0465 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 6.15e-01 0.06 0.119 0.172 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.02e-01 0.0247 0.0982 0.172 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.50e-01 -0.041 0.0903 0.172 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0214 0.108 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.76e-01 0.0231 0.0813 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 7.07e-01 0.0342 0.0909 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0503 0.0817 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0132 0.0946 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 2.14e-01 -0.146 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 5.81e-01 0.0441 0.0797 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 8.21e-03 0.275 0.103 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 3.66e-01 -0.104 0.115 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 2.98e-01 0.104 0.0994 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00305 0.0954 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.21e-01 -0.105 0.0859 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 1.80e-02 -0.213 0.0893 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.10e-01 -0.124 0.122 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.04e-01 0.138 0.0845 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 9.21e-02 0.178 0.105 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.45e-01 0.13 0.112 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 6.69e-01 0.0396 0.0926 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.12e-02 -0.234 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 8.16e-01 0.0257 0.11 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0862 0.111 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.30e-01 -0.177 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 1.36e-01 0.0999 0.0667 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0646 0.0857 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 8.75e-01 0.0116 0.0737 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0141 0.0786 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 7.96e-01 0.0201 0.0775 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0282 0.113 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.95e-01 0.0192 0.0738 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 8.05e-01 0.025 0.101 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 3.52e-01 0.0892 0.0957 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00797 0.0705 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 1.39e-02 -0.224 0.0904 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0942 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.68e-01 0.0194 0.117 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 5.58e-01 0.0455 0.0775 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.19e-01 0.0496 0.0767 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.93e-02 0.232 0.117 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.84e-01 0.0509 0.0927 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 2.30e-01 -0.122 0.101 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0378 0.115 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.111 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 9.05e-01 0.0111 0.0929 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 4.74e-01 0.0534 0.0744 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.98e-01 0.113 0.109 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0358 0.097 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 5.18e-02 -0.178 0.0908 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 7.16e-01 -0.037 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 5.04e-02 -0.234 0.119 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.70e-01 0.017 0.104 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0255 0.0768 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0135 0.1 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 4.98e-01 0.0607 0.0893 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0281 0.0919 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 6.95e-01 0.0391 0.0996 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 2.61e-02 -0.237 0.106 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.0799 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 8.61e-01 0.015 0.0855 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0384 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.36e-01 0.0628 0.101 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0826 0.114 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 6.51e-01 -0.052 0.115 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0742 0.122 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.87e-01 0.129 0.0975 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0277 0.108 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.17e-01 0.147 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0974 0.109 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 5.13e-01 0.0815 0.124 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.07e-02 -0.248 0.12 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0625 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.40e-02 0.171 0.092 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00377 0.112 0.171 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0898 0.101 0.171 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.01e-02 -0.233 0.107 0.171 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0383 0.127 0.171 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.81e-01 -0.017 0.114 0.171 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0205 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.76e-01 0.0357 0.0854 0.171 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0439 0.11 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 1.78e-02 0.227 0.0951 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.99e-01 0.000106 0.0904 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0556 0.108 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 9.38e-01 0.00865 0.111 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.87e-01 0.0171 0.12 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0432 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 1.63e-01 -0.145 0.104 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 1.44e-01 0.146 0.0999 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 2.44e-01 0.114 0.0977 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.50e-01 0.0322 0.101 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0815 0.0902 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.93e-01 0.128 0.0985 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0884 0.119 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.54e-01 0.126 0.0879 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 2.08e-01 0.0901 0.0713 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0401 0.115 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0474 0.113 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0588 0.104 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 6.17e-02 0.221 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.06e-01 0.122 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 2.55e-01 -0.133 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.47e-02 0.164 0.0849 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.39e-01 0.132 0.112 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00887 0.104 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0312 0.103 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 4.62e-01 0.0774 0.105 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 7.87e-01 0.0315 0.116 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.84e-01 0.08 0.0917 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0401 0.0771 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 6.58e-01 0.0671 0.151 0.163 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000807 0.0849 0.163 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.80e-01 0.108 0.153 0.163 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 6.48e-01 0.0597 0.13 0.163 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0163 0.139 0.163 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 1.56e-02 -0.328 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.35e-01 -0.048 0.142 0.163 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 4.39e-01 0.0744 0.0959 0.163 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.85e-01 0.0795 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.78e-01 0.0331 0.0594 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 6.38e-01 0.0508 0.108 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.26e-01 0.183 0.119 0.172 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 9.60e-01 0.00455 0.0917 0.172 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0609 0.0916 0.172 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00513 0.0766 0.172 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.34e-01 0.137 0.114 0.171 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 3.59e-01 0.0778 0.0846 0.171 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00533 0.101 0.171 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 4.42e-01 0.0865 0.112 0.171 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.67e-01 -0.102 0.113 0.171 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000375 0.0914 0.171 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 2.05e-01 0.0927 0.0728 0.171 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 8.34e-01 0.0221 0.106 0.178 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 6.61e-02 0.144 0.0777 0.178 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 1.28e-02 -0.275 0.11 0.178 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.74e-01 -0.109 0.0991 0.178 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 1.08e-01 0.139 0.0861 0.178 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0891 0.0768 0.178 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0133 0.117 0.178 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 9.38e-01 0.00653 0.0834 0.178 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 5.10e-01 0.0711 0.108 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00592 0.0738 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 2.76e-01 -0.121 0.111 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0612 0.0571 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0671 0.0932 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0187 0.088 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0283 0.103 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.93e-01 0.0761 0.111 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0952 0.0808 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.31e-01 0.0946 0.12 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.54e-01 -0.119 0.0832 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.91e-01 0.0858 0.0997 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 2.08e-01 -0.119 0.0946 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.92e-01 0.055 0.103 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.43e-01 0.15 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 1.19e-01 -0.191 0.122 0.167 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0909 0.121 0.167 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 3.35e-01 0.138 0.143 0.167 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.79e-02 -0.295 0.141 0.167 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 7.45e-01 0.0435 0.134 0.167 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 1.88e-01 0.149 0.112 0.167 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0885 0.107 0.173 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000115 0.11 0.173 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 1.60e-01 -0.161 0.114 0.173 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 5.71e-03 -0.266 0.0952 0.173 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0864 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.28e-02 0.304 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0619 0.101 0.173 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 3.10e-01 -0.103 0.101 0.172 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 6.57e-01 0.0466 0.105 0.172 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.84e-01 0.0749 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 9.61e-01 0.00355 0.0721 0.172 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.98e-01 0.0148 0.116 0.172 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.39e-02 0.251 0.101 0.172 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0697 0.112 0.172 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0866 0.122 0.178 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0457 0.078 0.178 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 5.46e-02 0.23 0.119 0.178 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.88e-01 -0.149 0.113 0.178 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 3.09e-01 0.0902 0.0883 0.178 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 5.02e-01 0.0519 0.0772 0.178 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.34e-01 -0.175 0.116 0.178 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 4.20e-01 0.06 0.0742 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 3.47e-01 -0.11 0.116 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 2.78e-02 -0.172 0.0778 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0735 0.0992 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.48e-02 -0.159 0.0701 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 4.55e-02 0.205 0.102 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.09e-01 0.11 0.108 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 4.13e-01 0.0782 0.0952 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 4.15e-01 0.0796 0.0975 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0745 0.109 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 7.75e-01 0.0233 0.0814 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00095 0.0834 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0731 0.071 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 695375 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0981 0.0868 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 2.29e-01 -0.143 0.118 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 2.48e-01 0.0821 0.0708 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.97e-03 0.268 0.0984 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.01e-01 0.13 0.101 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0477 0.0708 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0147 0.11 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0847 0.0533 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 8.58e-01 0.0157 0.0876 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0658 0.0752 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0162 0.0995 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 9.33e-02 -0.163 0.0966 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.81e-01 0.0023 0.096 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0531 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0961 0.0636 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 3.39e-01 -0.111 0.116 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 3.11e-03 0.291 0.0974 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 2.46e-01 -0.132 0.113 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -703629 sc-eQTL 2.93e-02 0.22 0.1 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -485914 sc-eQTL 6.15e-01 0.0491 0.0974 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -650160 sc-eQTL 9.87e-01 0.00153 0.0927 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 417916 sc-eQTL 1.24e-01 -0.133 0.0861 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 546795 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0945 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 667803 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0301 0.114 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -647810 sc-eQTL 1.67e-01 0.109 0.0789 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 418829 sc-eQTL 6.28e-01 0.0322 0.0663 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 417916 eQTL 9.96e-05 -0.101 0.0258 0.0 0.0 0.169

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina