logo

Genes within 1Mb (chr12:105638374:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0338 0.106 0.16 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.59e-02 -0.0913 0.0546 0.16 B L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0941 0.0805 0.16 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 6.13e-02 -0.0961 0.0511 0.16 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0391 0.082 0.16 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0969 0.0989 0.16 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.42e-01 0.0968 0.0656 0.16 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 1.20e-01 0.11 0.0703 0.16 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.04e-01 0.0804 0.078 0.16 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.79e-01 0.0276 0.0668 0.16 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0137 0.077 0.16 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.57e-01 0.107 0.0755 0.16 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 8.67e-01 0.0176 0.105 0.16 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.42e-01 0.0136 0.068 0.16 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 2.54e-01 0.0669 0.0586 0.16 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 1.20e-01 0.143 0.0918 0.16 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 4.44e-01 0.0467 0.0609 0.16 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 6.56e-02 -0.16 0.0866 0.16 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 8.89e-01 0.0137 0.0975 0.16 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.30e-02 -0.2 0.0872 0.16 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 7.88e-01 0.0146 0.0541 0.16 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.14e-01 0.0317 0.0387 0.16 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.94e-01 0.0283 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.34e-01 0.00618 0.0743 0.162 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.08e-01 -0.113 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0941 0.0893 0.162 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 7.57e-02 0.135 0.0753 0.162 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0197 0.0679 0.162 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.02e-01 0.115 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0201 0.0455 0.162 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.75e-01 0.0819 0.0921 0.16 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0149 0.0662 0.16 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0378 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0729 0.0512 0.16 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0271 0.0903 0.16 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.31e-01 0.0164 0.0768 0.16 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0577 0.1 0.16 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.50e-02 0.224 0.0994 0.161 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 6.86e-01 0.0402 0.099 0.161 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.19e-01 0.0448 0.09 0.161 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 1.37e-01 -0.132 0.0883 0.161 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.11e-01 0.116 0.0923 0.161 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.26e-01 -0.04 0.114 0.161 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 7.41e-02 0.146 0.0814 0.161 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0129 0.0671 0.161 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0343 0.114 0.16 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.59e-01 0.0315 0.0713 0.16 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.08e-02 -0.157 0.0924 0.16 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 6.00e-01 0.0641 0.122 0.16 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0257 0.0859 0.16 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 6.60e-01 0.0385 0.0875 0.16 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 9.32e-01 0.00615 0.0715 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 1.65e-01 -0.169 0.121 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.56e-01 0.00722 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 5.36e-02 -0.239 0.123 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0922 0.153 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.26e-01 -0.127 0.129 0.153 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 2.16e-01 -0.16 0.128 0.153 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 3.94e-01 0.107 0.125 0.153 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.36e-01 -0.143 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.57e-03 -0.237 0.0878 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.14e-01 -0.107 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.13e-01 -0.145 0.0913 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 2.80e-02 0.221 0.0998 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.64e-01 0.13 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 9.92e-02 0.171 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.32e-01 0.0678 0.108 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0207 0.12 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0928 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0858 0.0901 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 6.35e-01 0.0504 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 4.06e-01 0.102 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 5.89e-01 0.0546 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0978 0.0925 0.162 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0282 0.111 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.35e-01 0.0283 0.0836 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 6.62e-01 0.0409 0.0935 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00274 0.0842 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0437 0.0973 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.53e-01 -0.138 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.83e-01 0.109 0.0817 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.55e-03 0.303 0.106 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0374 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 2.21e-01 0.126 0.103 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0503 0.0986 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0691 0.089 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 2.35e-02 -0.211 0.0924 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.50e-01 -0.146 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.76e-01 0.119 0.0875 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.16e-02 0.19 0.108 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.69e-01 0.129 0.116 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.33e-01 0.046 0.0963 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 6.05e-02 -0.224 0.119 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 7.79e-01 0.0323 0.115 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 6.60e-01 -0.051 0.116 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 2.36e-01 -0.144 0.121 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.67e-01 0.0508 0.0697 0.155 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 9.09e-01 0.0101 0.088 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.55e-01 0.0043 0.0756 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 8.18e-01 0.0185 0.0806 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 5.46e-01 0.048 0.0794 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0199 0.116 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.85e-01 -0.011 0.0757 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.33e-01 0.0644 0.103 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 6.58e-01 0.0434 0.0981 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0237 0.0721 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 2.15e-01 -0.116 0.0935 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.37e-01 0.144 0.0962 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.86e-01 0.0324 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 7.49e-01 0.0254 0.0794 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 2.37e-01 0.0928 0.0783 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 9.45e-02 0.202 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.43e-01 0.0313 0.0952 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0459 0.104 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 7.72e-01 0.0342 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 1.64e-01 0.159 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 4.43e-01 0.0731 0.0951 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 3.96e-01 0.0649 0.0763 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.14e-01 0.138 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0353 0.0992 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.83e-02 -0.155 0.0932 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0539 0.104 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.61e-02 -0.256 0.121 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.70e-01 0.0175 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0633 0.0785 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0978 0.103 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.32e-01 0.0314 0.0916 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0021 0.0942 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 7.47e-01 0.033 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 1.28e-01 -0.167 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.01e-01 0.0207 0.0818 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.94e-01 0.0599 0.0875 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 8.81e-01 -0.018 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.10e-01 0.0391 0.105 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0974 0.118 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0356 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0467 0.127 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.75e-01 0.0899 0.101 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.92e-01 -0.077 0.112 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.81e-01 0.132 0.122 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0756 0.113 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0882 0.124 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 3.47e-01 0.121 0.128 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 9.76e-02 -0.207 0.124 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0575 0.117 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 1.05e-01 0.155 0.095 0.158 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0402 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0745 0.104 0.16 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.42e-02 -0.234 0.11 0.16 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 3.66e-01 -0.118 0.131 0.16 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.42e-01 0.0387 0.117 0.16 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0087 0.106 0.16 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.43e-01 0.0174 0.0881 0.16 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 4.86e-01 0.0789 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 2.28e-02 0.224 0.0977 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 8.78e-01 0.0143 0.0927 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.81e-01 0.0026 0.111 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 8.93e-01 0.0153 0.114 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 6.01e-01 0.0646 0.123 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00974 0.118 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 1.97e-01 -0.138 0.106 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.12e-01 0.128 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 2.52e-01 0.115 0.1 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.32e-01 0.0353 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0837 0.0923 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.16e-01 0.159 0.101 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0592 0.122 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.27e-02 0.224 0.089 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 3.17e-01 0.0733 0.073 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0413 0.119 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0243 0.116 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0761 0.107 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 5.58e-01 -0.069 0.118 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 3.83e-02 0.251 0.121 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.12e-01 0.124 0.122 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0573 0.12 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 7.39e-02 0.157 0.0875 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 1.76e-01 0.156 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0615 0.106 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0108 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0854 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 4.50e-01 0.0815 0.108 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 9.79e-01 0.00311 0.119 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.80e-01 0.126 0.0938 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0504 0.079 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 5.55e-01 0.0912 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00333 0.0867 0.148 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.64e-01 0.142 0.156 0.148 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 6.20e-01 0.0663 0.133 0.148 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 7.51e-01 0.0453 0.142 0.148 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.29e-03 -0.42 0.134 0.148 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0429 0.145 0.148 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.0977 0.148 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.04e-01 0.0444 0.117 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 2.97e-01 0.0637 0.0609 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 7.40e-01 0.0369 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.42e-01 0.181 0.123 0.161 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0138 0.0942 0.161 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0795 0.094 0.161 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0243 0.0787 0.161 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.00e-01 0.121 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 3.26e-01 0.0848 0.0862 0.16 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00563 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 5.02e-01 0.077 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0608 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 7.50e-01 0.0297 0.0931 0.16 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 1.52e-01 0.107 0.0742 0.16 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0338 0.11 0.166 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 1.56e-01 0.116 0.0815 0.166 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 2.72e-02 -0.256 0.115 0.166 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.47e-01 -0.12 0.103 0.166 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 7.10e-02 0.163 0.0897 0.166 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0772 0.0803 0.166 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.37e-01 0.0252 0.122 0.166 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.43e-01 0.0531 0.0871 0.166 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.44e-01 0.00531 0.0759 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 1.51e-01 -0.164 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0566 0.0588 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0783 0.0958 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0196 0.0906 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0253 0.106 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 4.56e-01 0.0851 0.114 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0496 0.0833 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 1.73e-01 0.168 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.39e-01 -0.101 0.0858 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.103 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 2.52e-01 -0.112 0.0974 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 5.93e-01 0.0564 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.01e-01 0.139 0.134 0.152 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 5.96e-02 -0.24 0.126 0.152 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.38e-01 0.00985 0.127 0.152 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.96e-01 0.193 0.149 0.152 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.51e-02 -0.312 0.147 0.152 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 3.84e-01 0.103 0.118 0.152 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 3.61e-01 -0.102 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.59e-01 0.00576 0.113 0.162 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 2.54e-01 -0.135 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 8.32e-02 -0.173 0.0995 0.162 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 3.66e-01 -0.11 0.121 0.162 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.68e-02 0.264 0.126 0.162 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 9.62e-01 0.00503 0.105 0.162 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 2.04e-01 -0.132 0.104 0.161 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.45e-01 0.00748 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.36e-01 0.00884 0.11 0.161 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0168 0.0743 0.161 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0743 0.119 0.161 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 3.61e-03 0.306 0.104 0.161 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 3.71e-01 -0.103 0.115 0.161 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0323 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0159 0.08 0.164 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 3.38e-02 0.26 0.121 0.164 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.45e-01 -0.136 0.116 0.164 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 2.29e-01 0.109 0.0904 0.164 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 4.94e-01 0.0542 0.0791 0.164 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.68e-01 -0.165 0.119 0.164 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 2.67e-01 0.0846 0.0759 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 9.55e-02 -0.198 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 8.16e-03 -0.211 0.0791 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0695 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 2.86e-02 -0.158 0.0717 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 4.07e-02 0.215 0.104 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.91e-01 0.116 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 2.01e-01 0.125 0.097 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.12e-01 0.0238 0.0997 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0322 0.112 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.71e-01 0.0356 0.0837 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 7.53e-01 -0.027 0.0857 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0292 0.0731 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 679630 sc-eQTL 2.29e-01 -0.108 0.0892 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 2.33e-01 -0.145 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 8.99e-02 0.124 0.0726 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.83e-03 0.288 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 8.69e-02 0.179 0.104 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0286 0.0727 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 9.79e-01 0.00295 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0822 0.0547 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 8.27e-01 0.0197 0.0899 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0598 0.0772 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00844 0.102 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 9.37e-02 -0.168 0.0998 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0286 0.0992 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0848 0.112 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0959 0.0658 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 1.44e-01 -0.175 0.12 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 4.89e-03 0.287 0.101 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0951 0.117 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -719374 sc-eQTL 4.48e-02 0.207 0.103 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -501659 sc-eQTL 7.47e-01 0.0322 0.0996 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -665905 sc-eQTL 9.28e-01 0.00861 0.0947 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 402171 sc-eQTL 1.28e-01 -0.135 0.088 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 531050 sc-eQTL 1.35e-01 0.145 0.0964 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 652058 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0396 0.117 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -663555 sc-eQTL 1.79e-02 0.191 0.0799 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 403084 sc-eQTL 8.12e-01 0.0161 0.0678 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 402171 eQTL 6.3e-05 -0.105 0.0261 0.0 0.0 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 402171 8.43e-07 5.18e-07 1.04e-07 3.66e-07 9.29e-08 2.12e-07 5.54e-07 1.42e-07 4.26e-07 2.34e-07 5.93e-07 3.73e-07 7.53e-07 1.23e-07 2.26e-07 2.1e-07 3.24e-07 3.82e-07 1.97e-07 1.55e-07 1.92e-07 3.71e-07 3.45e-07 1.78e-07 7.01e-07 2.4e-07 2.56e-07 2.57e-07 3.58e-07 5.36e-07 2.83e-07 6.84e-08 4.42e-08 1.57e-07 3.01e-07 9.51e-08 1.09e-07 9.71e-08 6.81e-08 2.53e-08 9.77e-08 4.42e-07 2.92e-08 1.88e-08 1.14e-07 1.95e-08 1.18e-07 1.24e-08 5.13e-08