logo

Genes within 1Mb (chr12:105627378:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.102 0.179 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 4.91e-01 0.0364 0.0527 0.179 B L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.43e-01 0.114 0.0772 0.179 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.40e-01 0.01 0.0495 0.179 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 7.31e-01 0.0271 0.0788 0.179 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 7.04e-01 0.0362 0.0953 0.179 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0221 0.0634 0.179 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 1.93e-01 0.0883 0.0676 0.179 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 5.82e-01 -0.041 0.0744 0.179 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 6.64e-02 -0.116 0.0631 0.179 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 3.35e-02 0.155 0.0725 0.179 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0124 0.0722 0.179 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000713 0.0999 0.179 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.19e-01 0.101 0.0643 0.179 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 2.40e-01 0.0656 0.0557 0.179 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 8.66e-03 -0.229 0.0866 0.179 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0746 0.0579 0.179 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 5.22e-02 0.161 0.0825 0.179 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 2.87e-02 0.202 0.0919 0.179 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.20e-01 0.0418 0.0841 0.179 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 4.93e-01 0.0354 0.0515 0.179 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.87e-01 0.000604 0.037 0.179 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0931 0.108 0.171 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0922 0.0739 0.171 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.24e-01 0.0391 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0196 0.0893 0.171 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0732 0.0755 0.171 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0483 0.0676 0.171 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00692 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 1.75e-01 0.0616 0.0452 0.171 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0758 0.0876 0.179 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0354 0.0629 0.179 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0372 0.0994 0.179 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.13e-01 0.00537 0.0489 0.179 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 3.63e-01 0.0782 0.0858 0.179 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.76e-01 0.0408 0.073 0.179 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0419 0.0953 0.179 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.09e-01 -0.157 0.0977 0.176 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 8.60e-01 0.0171 0.0968 0.176 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 1.02e-01 0.144 0.0874 0.176 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 2.92e-01 0.0915 0.0866 0.176 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.06e-01 0.0222 0.0905 0.176 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 3.26e-01 0.109 0.111 0.176 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.65e-01 0.111 0.0798 0.176 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.67e-01 0.00268 0.0656 0.176 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 8.09e-01 0.0262 0.108 0.179 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.01e-01 0.0085 0.068 0.179 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.24e-01 0.0197 0.0886 0.179 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 2.90e-03 -0.343 0.114 0.179 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 1.62e-01 -0.114 0.0815 0.179 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 4.84e-01 0.0583 0.0832 0.179 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 4.76e-01 0.0486 0.068 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 2.45e-01 -0.129 0.111 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.07e-01 0.0124 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.43e-01 0.0391 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0368 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 2.32e-01 -0.101 0.0845 0.176 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0643 0.118 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.54e-01 -0.168 0.117 0.176 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.53e-01 0.0361 0.114 0.176 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 2.77e-01 0.123 0.113 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.29e-01 0.00747 0.084 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000349 0.0999 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.31e-01 0.0185 0.0863 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 5.35e-01 0.0588 0.0947 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0568 0.11 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0896 0.0973 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.73e-01 0.0431 0.102 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 5.93e-01 0.0607 0.113 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0737 0.0958 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 3.51e-01 0.0966 0.103 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0475 0.0855 0.179 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 5.37e-01 -0.062 0.1 0.179 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 8.79e-02 0.197 0.115 0.179 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 9.35e-01 0.00786 0.0956 0.179 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.56e-01 0.00485 0.0879 0.179 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 4.36e-02 0.216 0.106 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00829 0.0809 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0216 0.0905 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 3.31e-01 0.0792 0.0812 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0582 0.0941 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.60e-01 0.00592 0.117 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 6.13e-01 0.0402 0.0793 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.24e-01 0.0511 0.104 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 6.85e-01 -0.046 0.113 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.28e-01 0.00892 0.0983 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.38e-01 0.139 0.0936 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 1.73e-01 0.116 0.0846 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 3.64e-01 -0.081 0.0891 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00644 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 7.03e-01 -0.032 0.0838 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 1.43e-01 0.152 0.104 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0984 0.105 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0384 0.0867 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.92e-01 0.0146 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0094 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 2.60e-01 0.117 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 3.60e-02 0.229 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0322 0.0628 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 9.94e-01 0.000629 0.0831 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0918 0.0711 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.03e-02 0.194 0.0749 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 7.75e-01 0.0215 0.075 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.58e-01 0.0486 0.109 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.78e-02 0.135 0.0709 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 5.60e-01 0.0569 0.0975 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.72e-01 0.0273 0.0941 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0189 0.0691 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.06e-01 0.145 0.0894 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0635 0.0926 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 1.62e-01 -0.16 0.114 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 7.14e-02 0.137 0.0755 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 2.51e-02 0.168 0.0744 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0927 0.118 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 8.12e-03 -0.243 0.0911 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0029 0.101 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00258 0.115 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0735 0.111 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 9.20e-02 0.156 0.092 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 4.20e-02 0.151 0.0736 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.83e-01 -0.092 0.105 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.83e-01 0.00195 0.094 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 5.22e-01 0.0569 0.0888 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 2.41e-02 0.221 0.0972 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.63e-01 0.0853 0.116 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 6.70e-02 0.184 0.1 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0278 0.0745 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.15e-01 -0.155 0.0981 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0521 0.0879 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.64e-01 0.126 0.09 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 6.63e-02 0.179 0.0972 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 5.36e-01 0.0652 0.105 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 8.39e-01 0.0159 0.0785 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 2.65e-01 0.0937 0.0838 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0621 0.115 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.91e-02 0.165 0.0996 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 9.51e-02 0.188 0.112 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.99e-01 0.000143 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 3.10e-01 -0.123 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.70e-01 0.055 0.0966 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.78e-01 0.0445 0.107 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.34e-01 0.0384 0.113 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 2.40e-02 -0.233 0.103 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 4.52e-01 0.0862 0.114 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00955 0.118 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00231 0.115 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 2.48e-01 0.125 0.108 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000436 0.0882 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 4.19e-01 0.0871 0.107 0.18 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0142 0.0966 0.18 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0905 0.103 0.18 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 4.63e-02 -0.241 0.12 0.18 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 1.14e-01 -0.172 0.108 0.18 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 2.64e-01 0.11 0.0981 0.18 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 3.71e-01 0.0732 0.0817 0.18 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0305 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 6.08e-01 0.048 0.0936 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 1.86e-02 0.205 0.0866 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0199 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0424 0.108 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0522 0.117 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 2.92e-02 0.243 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.23e-01 0.00974 0.101 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0254 0.0996 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 8.85e-01 0.0141 0.0973 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.75e-02 0.165 0.0992 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.37e-01 0.0302 0.0897 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 7.39e-01 0.0327 0.0981 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 2.89e-01 0.125 0.118 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.83e-01 0.0481 0.0875 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.67e-01 0.0211 0.071 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 8.76e-02 -0.19 0.111 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 3.09e-02 -0.234 0.108 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 2.22e-01 0.123 0.1 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0616 0.111 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 1.52e-03 0.359 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 2.96e-01 -0.121 0.115 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.59e-01 0.159 0.113 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00126 0.0829 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.93e-01 -0.144 0.111 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 4.25e-01 0.082 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 4.79e-01 0.0719 0.101 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 2.26e-01 0.13 0.107 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0218 0.104 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 8.53e-01 0.0214 0.115 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 4.43e-01 0.0697 0.0907 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.19e-01 0.0275 0.0763 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0115 0.141 0.185 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 7.95e-01 0.0206 0.079 0.185 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 2.58e-01 0.161 0.142 0.185 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00403 0.122 0.185 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 7.59e-02 0.229 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.47e-01 0.00846 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.66e-01 0.182 0.131 0.185 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 5.84e-01 -0.049 0.0893 0.185 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.183 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00215 0.0579 0.183 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0117 0.105 0.183 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 3.52e-03 -0.338 0.114 0.183 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 7.13e-01 0.0329 0.0892 0.183 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0551 0.0892 0.183 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 5.37e-01 0.0461 0.0745 0.183 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0945 0.111 0.179 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0222 0.0821 0.179 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0821 0.0978 0.179 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0136 0.109 0.179 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 5.49e-01 0.0657 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 8.24e-01 0.0197 0.0885 0.179 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 3.08e-01 0.0722 0.0707 0.179 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0874 0.108 0.178 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 6.00e-02 -0.15 0.0794 0.178 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 3.00e-01 0.118 0.114 0.178 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00389 0.102 0.178 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0883 0.178 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.38e-01 0.0371 0.0787 0.178 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00625 0.12 0.178 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 3.47e-02 0.179 0.0843 0.178 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0325 0.105 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0584 0.0718 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0503 0.108 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.38e-01 0.00433 0.0558 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.50e-01 0.0688 0.0908 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 8.15e-01 0.0201 0.0858 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 3.39e-01 0.0965 0.101 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0298 0.108 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0602 0.0787 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0213 0.117 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0109 0.0814 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 3.27e-01 0.0953 0.097 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 4.17e-01 0.075 0.0923 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.12e-01 0.0369 0.0998 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 2.07e-01 -0.155 0.122 0.182 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0284 0.117 0.182 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 6.95e-01 0.0455 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 5.97e-01 0.0724 0.137 0.182 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0708 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 6.32e-01 -0.061 0.127 0.182 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 4.46e-01 0.0823 0.108 0.182 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.173 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0624 0.109 0.173 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 8.07e-01 0.028 0.114 0.173 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 3.32e-01 0.0937 0.0963 0.173 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.76e-01 0.0834 0.117 0.173 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 4.52e-02 -0.244 0.121 0.173 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 4.40e-01 -0.078 0.101 0.173 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 6.00e-01 0.0531 0.101 0.176 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0533 0.105 0.176 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00851 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00457 0.0721 0.176 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 8.58e-01 0.0207 0.116 0.176 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 5.65e-01 0.0593 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0651 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 9.16e-01 0.0131 0.124 0.178 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0686 0.0793 0.178 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 1.85e-01 -0.162 0.122 0.178 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 3.87e-01 0.1 0.116 0.178 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 2.05e-01 -0.114 0.0898 0.178 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00891 0.0787 0.178 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 9.22e-01 0.0117 0.119 0.178 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 2.73e-01 0.083 0.0755 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 3.89e-01 0.0969 0.112 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 5.33e-01 0.0474 0.0759 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.14e-01 0.0351 0.0958 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0462 0.0684 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0609 0.0993 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 5.21e-01 0.0667 0.104 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 1.58e-01 -0.13 0.0915 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0266 0.0941 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.53e-01 0.155 0.108 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0132 0.0809 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0826 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 3.33e-01 0.0685 0.0706 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 668634 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0618 0.0865 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 9.38e-01 0.00917 0.118 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0111 0.0707 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 1.24e-01 0.153 0.099 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0132 0.099 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0628 0.0687 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0583 0.107 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0277 0.0521 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.68e-01 0.0617 0.085 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 3.54e-01 0.0679 0.0731 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 6.58e-01 0.0429 0.0966 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 4.39e-01 0.0754 0.0971 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0354 0.0959 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 7.78e-01 0.0305 0.108 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 6.28e-01 0.031 0.0639 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 4.23e-01 0.0932 0.116 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 2.79e-01 -0.108 0.0991 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0779 0.113 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -730370 sc-eQTL 1.50e-01 -0.145 0.101 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 sc-eQTL 8.81e-01 0.0146 0.0974 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 sc-eQTL 1.57e-01 0.131 0.0922 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 391175 sc-eQTL 4.35e-01 0.0676 0.0865 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 520054 sc-eQTL 7.91e-01 0.0251 0.0948 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 641062 sc-eQTL 2.96e-01 0.119 0.114 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -674551 sc-eQTL 2.20e-01 0.0971 0.0789 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 392088 sc-eQTL 9.47e-01 0.00439 0.0663 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -512655 eQTL 0.0321 -0.0781 0.0364 0.0 0.0 0.212
ENSG00000136026 CKAP4 -676901 pQTL 0.0102 -0.0413 0.0161 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina