logo

Genes within 1Mb (chr12:105598317:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.12e-02 0.238 0.0932 0.222 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0184 0.0489 0.222 B L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0593 0.0718 0.222 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0193 0.0458 0.222 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 1.31e-01 0.11 0.0726 0.222 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0484 0.0882 0.222 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0659 0.0585 0.222 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.17e-01 -0.063 0.0628 0.222 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 8.96e-01 0.00919 0.0705 0.222 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 3.50e-02 -0.126 0.0596 0.222 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 4.71e-01 0.05 0.0693 0.222 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0749 0.0682 0.222 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.19e-01 0.0341 0.0945 0.222 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0213 0.0612 0.222 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.50e-01 0.0608 0.0528 0.222 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.27e-03 -0.25 0.081 0.222 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 5.08e-02 -0.107 0.0543 0.222 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 3.90e-01 0.0674 0.0783 0.222 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.40e-02 0.168 0.0868 0.222 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 3.77e-01 0.07 0.0791 0.222 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0324 0.0485 0.222 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 7.84e-01 -0.00954 0.0348 0.222 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0276 0.0995 0.209 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0621 0.0683 0.209 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.209 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 7.11e-01 0.0306 0.0824 0.209 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00653 0.0699 0.209 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.72e-02 -0.119 0.062 0.209 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0319 0.103 0.209 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 8.92e-02 0.0711 0.0416 0.209 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.29e-01 0.124 0.0811 0.222 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 4.29e-01 0.0463 0.0584 0.222 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 5.75e-01 0.0518 0.0923 0.222 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.55e-01 0.0269 0.0454 0.222 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 6.90e-01 0.0319 0.0798 0.222 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0265 0.0678 0.222 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 5.87e-01 0.0481 0.0885 0.222 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.33e-01 -0.137 0.0907 0.221 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 9.46e-01 0.00614 0.0898 0.221 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 8.28e-01 0.0178 0.0816 0.221 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 4.99e-01 0.0544 0.0804 0.221 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0716 0.0839 0.221 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00866 0.103 0.221 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0043 0.0743 0.221 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 8.14e-01 0.0144 0.0609 0.221 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 9.52e-01 0.0061 0.101 0.222 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0298 0.0635 0.222 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 9.31e-01 0.00718 0.0829 0.222 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 2.34e-01 -0.129 0.108 0.222 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.00e-02 -0.15 0.0759 0.222 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 3.57e-01 0.0718 0.0778 0.222 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.00e-01 0.0814 0.0634 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 8.71e-01 -0.017 0.105 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0979 0.0995 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.23e-01 -0.137 0.112 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 7.35e-01 0.0363 0.107 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 6.44e-01 -0.037 0.0798 0.227 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0275 0.111 0.227 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 1.13e-02 -0.279 0.109 0.227 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.37e-01 0.127 0.107 0.227 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.89e-01 0.141 0.107 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.74e-01 0.0333 0.0792 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0892 0.094 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.25e-01 0.0399 0.0814 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 8.68e-01 0.0149 0.0895 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 4.16e-02 -0.21 0.102 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 1.19e-01 -0.143 0.0915 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0983 0.096 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00545 0.107 0.222 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0239 0.0903 0.222 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.93e-01 0.127 0.0971 0.222 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0782 0.0804 0.222 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 1.06e-01 -0.152 0.0939 0.222 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.47e-02 0.209 0.108 0.222 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.77e-01 0.0375 0.0899 0.222 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0649 0.0826 0.222 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.57e-02 0.198 0.0986 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 2.75e-02 -0.165 0.0742 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.48e-01 -0.121 0.0836 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 3.92e-01 0.0647 0.0754 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 6.02e-01 0.0456 0.0873 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.25e-01 -0.069 0.108 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00884 0.0736 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0568 0.0966 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0829 0.106 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0349 0.0917 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00494 0.0877 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.94e-01 0.0313 0.0793 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0353 0.0832 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 6.02e-01 0.0589 0.113 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0342 0.0782 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 5.78e-01 0.0541 0.0971 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00483 0.101 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.16e-01 -0.042 0.0835 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.07e-01 0.167 0.103 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 4.10e-01 0.0823 0.0995 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 2.17e-01 0.124 0.1 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 3.69e-01 0.0948 0.105 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0414 0.0604 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 6.20e-01 0.0395 0.0795 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0775 0.0681 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.56e-01 0.103 0.0725 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 3.37e-01 -0.069 0.0717 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.28e-01 0.0662 0.105 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.79e-01 0.0192 0.0684 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 8.09e-01 0.0227 0.0934 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.51e-01 0.0669 0.0885 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0662 0.0649 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 6.93e-01 0.0335 0.0847 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0533 0.0872 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 6.68e-02 -0.197 0.107 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 4.58e-01 0.0532 0.0715 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 4.46e-01 0.0541 0.0708 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0497 0.11 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 1.77e-01 -0.116 0.0857 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 5.35e-01 0.0584 0.0941 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00599 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 6.59e-01 0.0456 0.103 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.21e-02 0.16 0.0854 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 7.67e-01 0.0204 0.0691 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 8.38e-02 -0.17 0.098 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.70e-01 0.0257 0.0879 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 7.56e-01 0.0258 0.0831 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.84e-02 0.174 0.0913 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 1.26e-01 0.166 0.108 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.38e-01 0.0444 0.0943 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00214 0.0697 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 5.75e-02 -0.177 0.0924 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 1.42e-01 -0.122 0.0827 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 4.81e-01 0.0602 0.0853 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 2.16e-01 0.114 0.0923 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00294 0.0995 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0739 0.0741 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.57e-01 0.09 0.0792 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0803 0.107 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.57e-01 0.00501 0.0935 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.17e-01 0.164 0.104 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 9.06e-01 0.0125 0.106 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 1.67e-01 -0.156 0.112 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 9.63e-01 0.00424 0.0902 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 9.58e-01 0.00523 0.0997 0.208 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 3.03e-01 -0.112 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0104 0.0996 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 5.46e-01 0.0663 0.11 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.82e-01 0.0466 0.113 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0887 0.11 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 4.99e-01 0.0701 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 6.91e-01 0.0336 0.0845 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.19e-01 0.155 0.099 0.223 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0412 0.0893 0.223 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.0951 0.223 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 2.41e-01 -0.132 0.112 0.223 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.34e-01 0.0343 0.101 0.223 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 2.08e-01 0.114 0.0907 0.223 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 1.48e-01 0.109 0.0753 0.223 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.31e-01 -0.151 0.0994 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 8.91e-01 0.012 0.0873 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 5.55e-02 0.156 0.0811 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0235 0.0975 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 1.13e-01 -0.159 0.1 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0633 0.109 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 2.29e-01 0.125 0.104 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0344 0.0943 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 3.78e-01 -0.082 0.0929 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00185 0.0909 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.76e-01 0.0265 0.0933 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 8.12e-01 -0.02 0.0838 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 8.47e-01 0.0177 0.0916 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00718 0.11 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0482 0.0818 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 7.16e-01 0.0242 0.0663 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 8.90e-02 -0.172 0.101 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.06e-01 0.0354 0.0937 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0428 0.103 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 1.12e-02 0.269 0.105 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0252 0.107 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 3.93e-01 0.0902 0.105 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 1.25e-01 0.118 0.0768 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0651 0.103 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 9.46e-02 0.159 0.0946 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.96e-01 0.0243 0.0942 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 6.07e-02 0.186 0.0989 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0692 0.0963 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0895 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 8.65e-01 0.0144 0.0843 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 4.39e-01 0.0549 0.0707 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 6.94e-02 0.235 0.128 0.241 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.48e-01 0.0334 0.073 0.241 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0347 0.132 0.241 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 4.40e-01 0.0868 0.112 0.241 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 4.12e-02 0.243 0.118 0.241 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.46e-01 0.0384 0.118 0.241 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 2.92e-01 0.128 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0986 0.0822 0.241 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.27e-01 0.0816 0.103 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 4.10e-01 0.0442 0.0536 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0126 0.0974 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0542 0.108 0.226 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.11e-01 0.0198 0.0828 0.226 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.78e-01 0.0234 0.0827 0.226 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.25e-01 0.0681 0.069 0.226 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0574 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.15e-01 0.00832 0.0776 0.222 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.64e-01 -0.103 0.0922 0.222 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 9.78e-01 0.0028 0.103 0.222 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.79e-01 0.0158 0.103 0.222 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0625 0.0835 0.222 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 4.99e-01 0.0452 0.0668 0.222 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 8.25e-01 0.0222 0.1 0.215 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0955 0.0742 0.215 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 1.17e-01 0.166 0.105 0.215 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 8.79e-01 0.0144 0.0945 0.215 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0626 0.0823 0.215 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0664 0.0731 0.215 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0227 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.12e-01 0.0802 0.0791 0.215 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 6.05e-01 0.0513 0.0991 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00833 0.068 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 9.36e-01 0.00827 0.102 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.05e-01 0.0352 0.0527 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0296 0.0859 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0225 0.0811 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.10e-01 0.0968 0.095 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.67e-02 0.223 0.1 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 5.25e-01 0.047 0.0739 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 4.41e-01 0.0845 0.109 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00452 0.0763 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.16e-01 0.0332 0.0912 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 5.23e-01 0.0554 0.0866 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 6.54e-01 0.042 0.0936 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.95e-01 -0.122 0.116 0.209 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 8.39e-01 0.0225 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 8.75e-01 0.0172 0.11 0.209 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0423 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 3.22e-01 -0.128 0.128 0.209 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.90e-01 0.048 0.12 0.209 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 8.70e-01 0.0168 0.102 0.209 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0558 0.0984 0.216 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 5.34e-01 0.0624 0.1 0.216 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.47e-01 0.122 0.105 0.216 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0366 0.0888 0.216 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.41e-01 0.0216 0.108 0.216 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 3.69e-01 -0.101 0.112 0.216 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0382 0.0929 0.216 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 4.11e-01 0.076 0.0922 0.217 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0416 0.0955 0.217 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 7.56e-01 0.0304 0.0976 0.217 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0177 0.0658 0.217 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 6.67e-01 0.0454 0.106 0.217 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0402 0.0938 0.217 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 9.76e-01 0.00307 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0251 0.117 0.206 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0217 0.0747 0.206 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0392 0.115 0.206 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 1.31e-01 0.164 0.108 0.206 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 3.00e-01 -0.088 0.0846 0.206 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0612 0.0738 0.206 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.43e-01 0.0521 0.112 0.206 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 1.04e-01 0.115 0.0706 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.22e-01 0.163 0.105 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 5.26e-01 0.0452 0.0713 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0364 0.0899 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0458 0.0642 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 2.42e-01 -0.109 0.093 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 9.45e-01 0.00676 0.0976 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.73e-02 -0.152 0.0857 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.13e-01 -0.11 0.0881 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 1.48e-01 0.145 0.0999 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 6.74e-02 -0.136 0.0742 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0816 0.0764 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 5.30e-01 0.0411 0.0653 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 639573 sc-eQTL 4.87e-01 0.0557 0.0799 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0264 0.109 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0258 0.0652 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00242 0.092 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 3.72e-02 0.194 0.0924 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.15e-01 0.00695 0.0649 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 8.95e-01 0.0133 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 9.05e-01 0.00585 0.0491 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0205 0.0803 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 7.66e-01 0.0206 0.069 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 3.38e-01 0.0874 0.091 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.46e-01 0.102 0.0875 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000153 0.0866 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 2.22e-01 0.119 0.0973 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00951 0.0577 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 8.68e-01 0.0175 0.105 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0936 0.0895 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 2.34e-01 0.122 0.102 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -759431 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0993 0.094 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -541716 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00211 0.0906 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -705962 sc-eQTL 9.19e-01 0.00878 0.0862 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 362114 sc-eQTL 5.12e-01 0.0529 0.0805 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 490993 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0609 0.0881 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 612001 sc-eQTL 9.83e-01 0.00223 0.106 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -703612 sc-eQTL 9.90e-01 0.000937 0.0737 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 363027 sc-eQTL 7.70e-01 0.0181 0.0617 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 362114 eQTL 0.0116 0.0584 0.0231 0.0 0.0 0.211

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 612001 2.8e-07 1.35e-07 3.88e-08 1.89e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.73e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.08e-08 1.67e-07 1.08e-07 1.87e-07 7.37e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.82e-08 4.16e-08 1.19e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.65e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.2e-07 1.05e-07 1.09e-07 3.87e-08 3.66e-08 8.56e-08 4.84e-08 3.62e-08 4.95e-08 9.25e-08 6.59e-08 3.8e-08 4.94e-08 1.46e-07 4.89e-08 1.07e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.21e-07 3.83e-09 4.94e-08