logo

Genes within 1Mb (chr12:105595325:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 3.01e-02 0.201 0.0921 0.22 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 9.27e-01 0.00443 0.0482 0.22 B L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0484 0.0707 0.22 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0269 0.0451 0.22 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 2.32e-01 0.0859 0.0717 0.22 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0451 0.0869 0.22 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0605 0.0577 0.22 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0465 0.0619 0.22 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.92e-01 0.00947 0.0694 0.22 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.77e-02 -0.101 0.0589 0.22 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 6.69e-01 0.0293 0.0683 0.22 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 1.20e-01 -0.105 0.067 0.22 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 6.07e-01 0.048 0.0931 0.22 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 6.43e-01 -0.028 0.0603 0.22 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.97e-01 0.0673 0.0519 0.22 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 2.01e-03 -0.249 0.0797 0.22 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0808 0.0535 0.22 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 4.66e-01 0.0563 0.077 0.22 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 7.56e-02 0.153 0.0854 0.22 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 3.14e-01 0.0784 0.0777 0.22 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0202 0.0477 0.22 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 9.53e-01 0.00201 0.0342 0.22 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 9.67e-01 0.00409 0.0976 0.209 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0429 0.0671 0.209 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.1 0.209 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 8.40e-01 0.0164 0.0808 0.209 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0277 0.0685 0.209 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.21e-02 -0.124 0.0607 0.209 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0468 0.101 0.209 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.41e-01 0.0603 0.0409 0.209 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 2.84e-01 0.0861 0.0802 0.22 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.48e-01 0.0346 0.0576 0.22 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.75e-01 0.0511 0.0911 0.22 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 7.63e-01 0.0135 0.0448 0.22 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.22e-01 0.00773 0.0787 0.22 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0141 0.0669 0.22 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 4.33e-01 0.0685 0.0872 0.22 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 1.19e-01 -0.139 0.0891 0.219 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 8.70e-01 0.0144 0.0882 0.219 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.31e-01 0.0503 0.0801 0.219 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.86e-01 0.0431 0.079 0.219 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0903 0.0822 0.219 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.70e-01 0.00384 0.101 0.219 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.77e-01 0.00214 0.073 0.219 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 8.28e-01 0.013 0.0598 0.219 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0998 0.22 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 9.32e-01 0.00531 0.0626 0.22 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0188 0.0815 0.22 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 2.62e-01 -0.12 0.107 0.22 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 6.84e-02 -0.137 0.0748 0.22 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 2.00e-01 0.0983 0.0764 0.22 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.33e-01 0.0941 0.0623 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0137 0.103 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0721 0.0981 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 3.12e-01 -0.112 0.11 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 8.66e-01 0.0178 0.105 0.224 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0609 0.0785 0.224 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0399 0.109 0.224 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 1.26e-02 -0.271 0.107 0.224 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.12e-01 0.168 0.105 0.224 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 1.38e-01 0.156 0.105 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 4.98e-01 0.0529 0.0778 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0341 0.0926 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.75e-01 0.0336 0.0801 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 8.48e-01 0.0169 0.088 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 2.69e-02 -0.224 0.101 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 1.04e-01 -0.147 0.0899 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0864 0.0945 0.219 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 9.47e-01 0.00705 0.105 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 9.98e-01 0.000214 0.0888 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 3.03e-01 0.0987 0.0956 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0907 0.079 0.22 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 1.32e-01 -0.14 0.0924 0.22 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 5.39e-02 0.206 0.106 0.22 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.07e-01 0.0588 0.0883 0.22 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0359 0.0813 0.22 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0976 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 3.88e-02 -0.152 0.0733 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.02e-01 -0.106 0.0825 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 4.06e-01 0.062 0.0744 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 9.01e-01 0.0108 0.0862 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.84e-01 -0.075 0.107 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00619 0.0726 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0566 0.0953 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0996 0.104 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0194 0.0902 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0238 0.0863 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.00e-01 0.0409 0.0779 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 6.61e-01 -0.036 0.0818 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 5.30e-01 0.0697 0.111 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0413 0.0768 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 6.08e-01 0.049 0.0955 0.219 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 9.82e-01 0.00226 0.0997 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 7.43e-01 -0.027 0.0823 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 1.13e-01 0.162 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.42e-01 0.0458 0.0982 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.0984 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 4.26e-01 0.0829 0.104 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00203 0.0596 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.49e-01 0.0357 0.0784 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 3.42e-01 -0.064 0.0672 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.40e-01 0.0844 0.0716 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0943 0.0705 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.00e-01 0.087 0.103 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 8.76e-01 0.0106 0.0675 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 9.66e-01 0.00392 0.0921 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 5.59e-01 0.0511 0.0874 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0415 0.0642 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00242 0.0836 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0736 0.086 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 5.52e-02 -0.203 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 4.50e-01 0.0534 0.0706 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 4.14e-01 0.0572 0.0699 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0429 0.108 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 2.28e-01 -0.103 0.0848 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 7.11e-01 0.0345 0.0931 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0386 0.105 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 6.71e-01 0.0433 0.102 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.39e-02 0.142 0.0846 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 7.27e-01 0.0239 0.0683 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.46e-02 -0.179 0.0963 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 7.71e-01 0.0252 0.0865 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 6.77e-01 0.0341 0.0817 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.25e-02 0.168 0.0898 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 1.09e-01 0.171 0.106 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.58e-01 0.0545 0.0927 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 8.34e-01 0.0144 0.0685 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.03e-02 -0.172 0.0911 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0969 0.0816 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.38e-01 0.0519 0.0841 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0909 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.63e-01 0.0169 0.098 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 3.46e-01 -0.069 0.073 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 2.90e-01 0.0827 0.078 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0319 0.106 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.05e-01 0.0479 0.0922 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 8.95e-02 0.176 0.103 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.71e-01 0.0444 0.104 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.44e-02 -0.186 0.111 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 8.83e-01 0.0131 0.089 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 8.65e-01 0.0168 0.0984 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 2.69e-01 -0.117 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 9.48e-01 0.0064 0.0974 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.44e-01 0.0651 0.107 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 8.44e-01 0.0218 0.111 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0902 0.108 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 4.20e-01 0.0819 0.101 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 7.03e-01 0.0315 0.0826 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 2.16e-01 0.121 0.0977 0.221 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.58e-01 -0.039 0.0879 0.221 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 1.59e-01 -0.132 0.0936 0.221 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 2.95e-01 -0.116 0.11 0.221 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.02e-01 0.025 0.0993 0.221 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 1.21e-01 0.139 0.0891 0.221 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.10e-01 0.119 0.0741 0.221 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 9.73e-02 -0.163 0.0976 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00403 0.0858 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 4.81e-02 0.158 0.0796 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00661 0.0958 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.76e-02 -0.18 0.0981 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0805 0.107 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 2.70e-01 0.113 0.102 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0261 0.0926 0.222 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0728 0.091 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 9.69e-01 0.00349 0.0891 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 4.82e-01 0.0644 0.0913 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0266 0.0821 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 9.86e-01 0.00153 0.0898 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.12e-01 0.012 0.108 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0489 0.0801 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 7.11e-01 0.0241 0.065 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 1.46e-01 -0.149 0.102 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 1.24e-01 -0.153 0.0991 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.48e-01 0.0421 0.092 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0844 0.101 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 9.86e-03 0.269 0.103 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0155 0.106 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 3.48e-01 0.0972 0.103 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.37e-01 0.113 0.0755 0.219 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0646 0.101 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 1.00e-01 0.153 0.0927 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.26e-01 0.045 0.0923 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 4.90e-02 0.192 0.0968 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0749 0.0944 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0948 0.104 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 7.77e-01 0.0234 0.0826 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 6.56e-01 0.0309 0.0693 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 4.74e-02 0.257 0.128 0.241 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 7.97e-01 0.0189 0.0733 0.241 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0204 0.132 0.241 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 4.19e-01 0.0912 0.113 0.241 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 1.48e-02 0.29 0.117 0.241 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 7.27e-01 0.0415 0.119 0.241 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 1.68e-01 0.168 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.98e-01 -0.107 0.0824 0.241 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 4.11e-01 0.0835 0.101 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.99e-01 0.0279 0.053 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 7.24e-01 -0.034 0.0963 0.224 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0891 0.107 0.224 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.34e-01 0.0171 0.0818 0.224 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.79e-01 0.00211 0.0818 0.224 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 2.08e-01 0.086 0.0681 0.224 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0418 0.104 0.22 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.92e-01 0.0104 0.0766 0.22 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.00e-01 -0.117 0.091 0.22 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0244 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.63e-01 0.0177 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0908 0.0824 0.22 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 3.46e-01 0.0623 0.066 0.22 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.53e-01 0.0444 0.0984 0.215 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0652 0.073 0.215 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 1.66e-01 0.144 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 5.90e-01 0.05 0.0927 0.215 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0613 0.0807 0.215 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0938 0.0715 0.215 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0234 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 3.03e-01 0.0802 0.0776 0.215 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.07e-01 0.0239 0.0976 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.66e-01 0.0113 0.0669 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00178 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 4.36e-01 0.0404 0.0519 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 7.95e-01 -0.022 0.0846 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00761 0.0798 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 2.73e-01 0.103 0.0935 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 4.01e-02 0.205 0.0991 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.09e-01 0.0177 0.0731 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.33e-01 0.0675 0.108 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00532 0.0755 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 7.31e-01 0.0311 0.0902 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.11e-01 0.0564 0.0857 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 4.89e-01 0.0642 0.0925 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 1.71e-01 -0.155 0.113 0.209 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 5.29e-01 0.0682 0.108 0.209 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 8.29e-01 0.0232 0.107 0.209 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 9.59e-01 0.00646 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0957 0.126 0.209 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 6.26e-01 0.0575 0.118 0.209 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 9.55e-01 0.00565 0.0997 0.209 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0655 0.0968 0.216 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 3.71e-01 0.0883 0.0986 0.216 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.17e-01 0.128 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0761 0.0872 0.216 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 7.56e-01 0.0329 0.106 0.216 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0743 0.111 0.216 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0578 0.0914 0.216 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.65e-01 0.0155 0.0909 0.217 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.10e-01 -0.048 0.094 0.217 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 6.90e-01 0.0383 0.0961 0.217 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0194 0.0648 0.217 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 6.32e-01 0.0499 0.104 0.217 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 5.67e-01 -0.053 0.0924 0.217 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 8.58e-01 0.0181 0.101 0.217 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00916 0.113 0.209 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0247 0.0725 0.209 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0686 0.111 0.209 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 3.44e-01 0.1 0.105 0.209 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 1.92e-01 -0.107 0.0819 0.209 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0437 0.0717 0.209 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 8.22e-01 0.0245 0.109 0.209 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 1.77e-01 0.0933 0.0687 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 8.66e-02 0.178 0.103 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 3.01e-01 0.0726 0.07 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0103 0.0886 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0563 0.0632 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 1.97e-01 -0.119 0.0915 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0085 0.0961 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 1.04e-01 -0.138 0.0845 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0726 0.0869 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 3.12e-01 0.1 0.0987 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 1.14e-01 -0.116 0.0733 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0829 0.0753 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 5.05e-01 0.043 0.0644 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 636581 sc-eQTL 6.39e-01 0.0371 0.0788 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0214 0.107 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0258 0.0643 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 9.59e-01 0.00461 0.0907 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.95e-02 0.165 0.0907 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 9.64e-01 0.0029 0.0636 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 9.68e-01 0.00401 0.0985 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 9.35e-01 0.00393 0.0481 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0195 0.0786 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 7.10e-01 0.0251 0.0676 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 2.79e-01 0.0967 0.0891 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 6.39e-01 0.0407 0.0867 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 8.70e-01 0.0141 0.0855 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 2.55e-01 0.11 0.0961 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0233 0.057 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00504 0.104 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 2.21e-01 -0.108 0.0883 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 3.85e-01 0.0879 0.101 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -762423 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0984 0.0922 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -544708 sc-eQTL 9.27e-01 0.00816 0.0889 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -708954 sc-eQTL 6.07e-01 0.0435 0.0845 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 359122 sc-eQTL 6.35e-01 0.0375 0.079 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 488001 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0789 0.0863 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 609009 sc-eQTL 8.88e-01 0.0147 0.104 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -706604 sc-eQTL 9.31e-01 0.00626 0.0723 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 360035 sc-eQTL 8.31e-01 0.0129 0.0605 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 359122 eQTL 0.00647 0.0645 0.0236 0.0 0.0 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 609009 3.27e-07 2.17e-07 6.41e-08 2.43e-07 1.05e-07 1.19e-07 2.86e-07 7.46e-08 2.04e-07 1.28e-07 2.18e-07 1.72e-07 3.18e-07 8.54e-08 7.98e-08 1.1e-07 7.3e-08 2.33e-07 8e-08 8.31e-08 1.33e-07 2.06e-07 1.86e-07 4.34e-08 2.74e-07 1.82e-07 1.31e-07 1.54e-07 1.44e-07 1.85e-07 1.35e-07 5.54e-08 4.87e-08 9.81e-08 9.25e-08 5.04e-08 6.48e-08 6.2e-08 4.99e-08 8.2e-08 4.73e-08 1.79e-07 3.4e-08 2.06e-08 4.91e-08 8.24e-09 8.94e-08 2.75e-09 4.59e-08