logo

Genes within 1Mb (chr12:105593031:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.39e-02 0.202 0.0945 0.212 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.72e-01 0.0144 0.0494 0.212 B L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0615 0.0725 0.212 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0374 0.0462 0.212 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 3.67e-01 0.0666 0.0736 0.212 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0523 0.0891 0.212 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0606 0.0592 0.212 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0732 0.0633 0.212 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 8.95e-01 0.00941 0.0711 0.212 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.65e-02 -0.107 0.0603 0.212 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 7.35e-01 0.0237 0.07 0.212 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0939 0.0687 0.212 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.50e-01 0.0434 0.0954 0.212 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0461 0.0617 0.212 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 3.09e-01 0.0543 0.0533 0.212 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 2.80e-03 -0.248 0.0819 0.212 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0593 0.0551 0.212 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.50e-01 0.0598 0.079 0.212 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 8.29e-02 0.153 0.0877 0.212 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 2.35e-01 0.0948 0.0797 0.212 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0136 0.049 0.212 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.71e-01 0.00129 0.0351 0.212 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 9.90e-01 0.0012 0.0993 0.2 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0302 0.0683 0.2 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 1.97e-01 0.132 0.102 0.2 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 9.38e-01 0.00645 0.0823 0.2 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0143 0.0698 0.2 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 3.26e-02 -0.133 0.0617 0.2 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0418 0.103 0.2 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.04e-01 0.0679 0.0416 0.2 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.26e-01 0.081 0.0822 0.212 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.61e-01 0.0436 0.059 0.212 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 5.11e-01 0.0614 0.0933 0.212 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.52e-01 0.0146 0.0459 0.212 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.61e-01 0.0246 0.0807 0.212 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0254 0.0686 0.212 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.92e-01 0.0615 0.0894 0.212 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 1.43e-01 -0.134 0.0911 0.21 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0237 0.0902 0.21 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.63e-01 0.0602 0.0818 0.21 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 5.35e-01 0.0501 0.0807 0.21 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 2.00e-01 -0.108 0.084 0.21 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.92e-01 -0.001 0.104 0.21 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00847 0.0746 0.21 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.95e-01 0.000406 0.0611 0.21 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0177 0.102 0.212 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 9.39e-01 0.00491 0.0639 0.212 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0229 0.0832 0.212 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.212 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.63e-02 -0.141 0.0763 0.212 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 3.37e-01 0.0751 0.0781 0.212 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.61e-01 0.0718 0.0638 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0602 0.105 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0833 0.0999 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 1.96e-01 -0.146 0.112 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 8.04e-01 0.0266 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0537 0.0801 0.214 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0289 0.111 0.214 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.56e-03 -0.295 0.109 0.214 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.81e-01 0.144 0.108 0.214 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.45e-02 0.192 0.107 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.82e-01 0.0562 0.0797 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0725 0.0948 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 6.04e-01 0.0426 0.082 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 9.61e-01 0.00445 0.0902 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 3.56e-02 -0.218 0.103 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.17e-02 -0.173 0.092 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.26e-01 -0.117 0.0967 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 8.48e-01 0.0207 0.108 0.211 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 8.76e-01 0.0142 0.0909 0.211 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 5.27e-01 0.0622 0.098 0.211 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 1.36e-01 -0.121 0.0807 0.211 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 9.43e-02 -0.159 0.0945 0.211 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.30e-02 0.204 0.109 0.211 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 4.73e-01 0.065 0.0904 0.211 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0605 0.0832 0.211 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 2.09e-01 0.126 0.1 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 2.62e-02 -0.168 0.0749 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 2.06e-01 -0.107 0.0845 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 4.61e-01 0.0562 0.0761 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0024 0.0882 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0883 0.109 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.99e-01 -0.019 0.0743 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0721 0.0974 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0926 0.106 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0204 0.0925 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0269 0.0885 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 6.00e-01 0.042 0.0799 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0512 0.0839 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 4.83e-01 0.0798 0.113 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0343 0.0788 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 7.25e-01 0.0345 0.098 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.43e-01 0.0333 0.102 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0553 0.0838 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 2.23e-01 0.127 0.104 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.53e-01 0.0316 0.1 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 1.75e-01 0.136 0.1 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.08e-01 0.0397 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00451 0.0608 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.77e-01 0.0229 0.0805 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0755 0.0689 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 2.64e-01 0.0823 0.0735 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0678 0.0725 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 4.02e-01 0.0889 0.106 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000474 0.0692 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0231 0.0945 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 5.48e-01 0.0541 0.0899 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0609 0.066 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00821 0.086 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0765 0.0885 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 5.60e-02 -0.209 0.109 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.40e-01 0.0341 0.0728 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 6.18e-01 0.036 0.072 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 9.58e-01 0.00587 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0856 0.0871 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 9.02e-01 0.0118 0.0955 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0372 0.108 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.17e-01 0.0524 0.105 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 1.19e-01 0.136 0.0868 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 5.76e-01 0.0392 0.07 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 1.21e-01 -0.154 0.0988 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.81e-01 0.0246 0.0884 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 7.41e-01 0.0276 0.0836 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 5.84e-02 0.175 0.0918 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 1.10e-01 0.174 0.109 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 5.98e-01 0.0502 0.0949 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.85e-01 0.00129 0.0701 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.69e-02 -0.196 0.0931 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 3.59e-01 -0.077 0.0837 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.58e-01 0.0641 0.0861 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 1.93e-01 0.122 0.0931 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.83e-01 0.0411 0.1 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0619 0.0748 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.14e-01 0.0995 0.0799 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0372 0.108 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.64e-01 0.0284 0.0946 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 6.43e-02 0.196 0.105 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 6.47e-01 0.0491 0.107 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.31e-01 0.0195 0.0912 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 8.78e-01 0.0155 0.101 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.09e-01 -0.111 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.86e-01 0.0271 0.0999 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.15e-01 0.0898 0.11 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 6.98e-01 0.0442 0.114 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0582 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.24e-01 0.0511 0.104 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.25e-01 0.00798 0.0848 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 2.33e-01 0.119 0.0998 0.212 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0748 0.0897 0.212 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0943 0.0958 0.212 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0933 0.113 0.212 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.68e-01 0.00411 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 1.74e-01 0.124 0.0911 0.212 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.62e-01 0.0854 0.0759 0.212 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 1.15e-01 -0.158 0.0996 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00669 0.0875 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 5.08e-02 0.16 0.0813 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0289 0.0978 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.84e-02 -0.208 0.0999 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.15e-01 -0.04 0.109 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 5.63e-01 0.0606 0.105 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0557 0.0945 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0636 0.0932 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0235 0.0911 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 3.39e-01 0.0894 0.0934 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00923 0.084 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0282 0.0919 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.36e-01 0.00892 0.11 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0472 0.082 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 8.73e-01 0.0107 0.0665 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 2.19e-01 -0.127 0.103 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 2.74e-01 -0.11 0.1 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.25e-01 0.0327 0.093 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0872 0.102 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 2.24e-02 0.241 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000873 0.107 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 3.99e-01 0.0884 0.105 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.48e-01 0.111 0.0763 0.212 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0703 0.103 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 2.70e-01 0.105 0.0951 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 5.32e-01 0.0591 0.0944 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.47e-02 0.21 0.0989 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0426 0.0966 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 3.12e-01 -0.108 0.107 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.86e-01 0.0122 0.0845 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 7.94e-01 0.0185 0.0709 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.86e-02 0.262 0.131 0.233 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 6.67e-01 0.0323 0.0751 0.233 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 1.00e+00 2.09e-05 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 5.03e-01 0.0775 0.115 0.233 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 2.83e-02 0.268 0.121 0.233 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.93e-01 0.00109 0.122 0.233 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 2.02e-01 0.16 0.125 0.233 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.25e-01 -0.103 0.0845 0.233 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 5.32e-01 0.0652 0.104 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 6.27e-01 0.0264 0.0544 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0731 0.0986 0.215 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.109 0.215 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00919 0.0839 0.215 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0118 0.0839 0.215 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.04e-01 0.114 0.0697 0.215 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0405 0.106 0.212 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 9.20e-01 0.00788 0.0786 0.212 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0779 0.0936 0.212 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0225 0.104 0.212 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.68e-01 0.031 0.105 0.212 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 1.66e-01 -0.117 0.0844 0.212 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.78e-01 0.0482 0.0677 0.212 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.09e-01 0.0374 0.1 0.205 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0277 0.0745 0.205 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 1.24e-01 0.162 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.83e-01 0.0261 0.0945 0.205 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0439 0.0824 0.205 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 2.09e-01 -0.092 0.0729 0.205 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.92e-01 0.0152 0.111 0.205 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 2.76e-01 0.0865 0.0791 0.205 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.37e-01 0.0336 0.1 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 8.02e-01 0.0172 0.0685 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 8.69e-01 0.017 0.103 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.70e-01 0.0477 0.0531 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0128 0.0866 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.36e-01 -0.017 0.0818 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 3.46e-01 0.0906 0.0958 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 5.39e-02 0.197 0.101 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 6.12e-01 0.038 0.0748 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 4.69e-01 0.0803 0.111 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00783 0.0773 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 6.43e-01 0.0428 0.0923 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 5.80e-01 0.0486 0.0877 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 5.10e-01 0.0626 0.0947 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 1.29e-01 -0.178 0.116 0.2 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.84e-01 0.0783 0.112 0.2 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 9.82e-01 0.00247 0.111 0.2 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0022 0.131 0.2 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 3.71e-01 -0.116 0.13 0.2 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00183 0.122 0.2 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0426 0.103 0.2 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.51e-01 -0.075 0.0994 0.207 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 3.44e-01 0.096 0.101 0.207 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.08e-01 0.108 0.106 0.207 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0696 0.0896 0.207 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 5.58e-01 0.0638 0.109 0.207 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0869 0.114 0.207 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0665 0.0938 0.207 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 9.19e-01 0.00942 0.0928 0.208 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0313 0.0961 0.208 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 6.59e-01 0.0433 0.0981 0.208 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0149 0.0662 0.208 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.27e-01 0.0371 0.106 0.208 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0572 0.0943 0.208 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000343 0.103 0.208 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 9.55e-01 0.00649 0.115 0.198 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0201 0.0737 0.198 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0257 0.113 0.198 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 2.67e-01 0.119 0.107 0.198 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0904 0.0835 0.198 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0739 0.0728 0.198 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0047 0.111 0.198 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.33e-01 0.105 0.0698 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.45e-02 0.214 0.106 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 2.70e-01 0.0794 0.0718 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0561 0.0908 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0641 0.0648 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 1.23e-01 -0.145 0.0938 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00312 0.0986 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 7.96e-02 -0.153 0.0866 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 1.94e-01 -0.116 0.0889 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 4.68e-01 0.0736 0.101 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 9.74e-02 -0.125 0.075 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0873 0.0771 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 5.48e-01 0.0397 0.066 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 634287 sc-eQTL 8.07e-01 0.0198 0.0808 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0306 0.11 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0328 0.0659 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00667 0.0929 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 7.86e-02 0.164 0.093 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 8.35e-01 0.0136 0.0651 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 8.49e-01 0.0193 0.101 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 9.19e-01 0.00503 0.0493 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00618 0.0805 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 8.22e-01 0.0156 0.0693 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 3.51e-01 0.0854 0.0913 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 6.70e-01 0.0379 0.0886 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 7.66e-01 0.026 0.0874 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 3.28e-01 0.0964 0.0983 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0211 0.0583 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.30e-01 0.00926 0.106 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 1.82e-01 -0.121 0.0902 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 4.41e-01 0.0798 0.103 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -764717 sc-eQTL 3.25e-01 -0.093 0.0943 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -547002 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0313 0.0909 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -711248 sc-eQTL 4.71e-01 0.0623 0.0864 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 356828 sc-eQTL 5.24e-01 0.0516 0.0808 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 485707 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0911 0.0883 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 606715 sc-eQTL 9.83e-01 0.00232 0.107 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -708898 sc-eQTL 9.90e-01 0.000965 0.0739 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 357741 sc-eQTL 9.83e-01 0.00133 0.0619 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 356828 eQTL 0.00439 0.0696 0.0244 0.0 0.0 0.187

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 606715 3.92e-07 1.92e-07 7.92e-08 2.41e-07 1.07e-07 1.13e-07 2.95e-07 7.65e-08 2.26e-07 1.28e-07 2.18e-07 1.86e-07 3.18e-07 8.66e-08 7.79e-08 1.14e-07 7.3e-08 2.66e-07 8.68e-08 8.69e-08 1.33e-07 2.07e-07 2e-07 4.81e-08 2.74e-07 1.9e-07 1.48e-07 1.46e-07 1.54e-07 1.85e-07 1.39e-07 4.71e-08 4.97e-08 1.01e-07 7.55e-08 5.14e-08 5.67e-08 5.71e-08 4.75e-08 8.06e-08 4.9e-08 1.79e-07 3.46e-08 1.43e-08 5.49e-08 1.03e-08 9.26e-08 0.0 4.52e-08