logo

Genes within 1Mb (chr12:105591023:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 7.97e-02 -0.324 0.184 0.051 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 2.36e-01 -0.114 0.0955 0.051 B L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0397 0.141 0.051 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 4.18e-01 0.0728 0.0897 0.051 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 8.27e-01 0.0314 0.143 0.051 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.25e-01 -0.11 0.173 0.051 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.02e-01 -0.188 0.114 0.051 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.99e-01 0.0834 0.123 0.051 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 1.41e-01 -0.196 0.133 0.051 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0622 0.114 0.051 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.00e-01 -0.168 0.131 0.051 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 9.78e-01 0.00364 0.129 0.051 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0474 0.179 0.051 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.54e-01 -0.108 0.116 0.051 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0212 0.1 0.051 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 7.15e-01 0.0576 0.158 0.051 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.88e-01 0.0724 0.104 0.051 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 4.79e-01 -0.106 0.149 0.051 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 6.56e-01 0.0744 0.167 0.051 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 2.83e-01 0.162 0.15 0.051 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0925 0.0922 0.051 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0649 0.0661 0.051 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.77e-01 0.131 0.184 0.054 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0882 0.127 0.054 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.20e-01 -0.122 0.19 0.054 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.84e-01 -0.133 0.153 0.054 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 9.60e-01 0.00652 0.13 0.054 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 4.33e-01 0.0911 0.116 0.054 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0761 0.191 0.054 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 5.20e-01 0.0501 0.0777 0.054 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 2.90e-01 0.168 0.158 0.051 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 8.45e-01 0.0222 0.114 0.051 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 9.80e-02 -0.296 0.178 0.051 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 5.86e-01 0.0481 0.0882 0.051 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.70e-01 -0.088 0.155 0.051 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.07e-01 0.166 0.131 0.051 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 7.71e-01 0.05 0.172 0.051 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.68e-01 -0.126 0.173 0.052 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 6.05e-01 0.0885 0.171 0.052 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 6.29e-01 -0.075 0.155 0.052 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.83e-01 -0.164 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.23e-01 0.158 0.159 0.052 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.32e-01 -0.123 0.196 0.052 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 4.85e-02 -0.278 0.14 0.052 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0357 0.116 0.052 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 8.68e-01 -0.033 0.199 0.051 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.64e-01 0.0914 0.125 0.051 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 9.09e-01 0.0186 0.163 0.051 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 5.31e-01 -0.134 0.213 0.051 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.39e-01 0.0306 0.15 0.051 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.91e-01 -0.2 0.152 0.051 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 9.74e-01 0.00404 0.125 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.78e-01 -0.149 0.209 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0702 0.155 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0921 0.184 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 1.77e-02 0.376 0.157 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0816 0.175 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 4.94e-01 -0.139 0.202 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.79e-01 -0.242 0.179 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.74e-01 0.0299 0.188 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 8.87e-01 0.0298 0.209 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.24e-01 -0.271 0.176 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 4.92e-01 -0.131 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 8.25e-01 0.0348 0.158 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 3.66e-01 0.167 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.63e-01 0.123 0.213 0.052 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.61e-01 -0.246 0.175 0.052 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.45e-01 0.124 0.162 0.052 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 1.13e-01 -0.303 0.19 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 9.23e-01 0.014 0.144 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.64e-01 0.0932 0.161 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 4.40e-01 -0.112 0.145 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 8.44e-01 0.0332 0.168 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0348 0.209 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0718 0.141 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 6.96e-01 0.0726 0.186 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.09e-02 -0.403 0.205 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.53e-01 0.257 0.179 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00303 0.172 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.09e-01 0.058 0.155 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0111 0.163 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 2.51e-01 0.254 0.22 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0568 0.153 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 1.20e-01 -0.296 0.19 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 1.12e-01 -0.309 0.194 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.47e-01 0.122 0.161 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.24e-01 -0.244 0.199 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 2.10e-01 -0.24 0.191 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 1.65e-01 0.268 0.192 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0487 0.203 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 5.16e-01 0.0757 0.116 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 9.37e-02 -0.249 0.148 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0213 0.128 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0753 0.136 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.32e-01 -0.131 0.134 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.83e-01 -0.108 0.196 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.97e-01 -0.108 0.128 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0304 0.175 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0801 0.169 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 9.30e-02 -0.208 0.123 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.13e-01 -0.201 0.161 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00884 0.166 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.41e-01 0.125 0.205 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.22e-01 -0.135 0.136 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.90e-02 0.265 0.134 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.38e-02 -0.425 0.21 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.57e-01 0.124 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.63e-01 0.0548 0.182 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 4.51e-02 0.41 0.204 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0358 0.199 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.28e-01 -0.2 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0324 0.133 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 7.39e-01 0.0635 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.07e-02 0.346 0.168 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 9.35e-01 0.0131 0.16 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 5.37e-01 -0.11 0.177 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 7.88e-01 0.0563 0.209 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.02e-01 -0.297 0.181 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.39e-01 -0.104 0.134 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.97e-01 0.0931 0.176 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 5.38e-01 0.0967 0.157 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.28e-02 -0.311 0.16 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 1.38e-02 0.428 0.172 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 2.40e-01 0.221 0.187 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0519 0.14 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0279 0.15 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 2.82e-01 0.219 0.202 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 5.74e-01 0.0997 0.177 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.75e-01 -0.217 0.199 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0682 0.2 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 1.32e-01 0.321 0.213 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.75e-01 -0.231 0.17 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 3.67e-01 0.17 0.188 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.25e-01 0.136 0.213 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00579 0.196 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.35e-01 0.0732 0.216 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0686 0.223 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 9.81e-01 0.00519 0.218 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.78e-02 -0.447 0.202 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0179 0.166 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 8.02e-01 0.0497 0.198 0.052 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 7.97e-01 0.0456 0.178 0.052 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.07e-01 0.126 0.19 0.052 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 1.84e-01 -0.297 0.223 0.052 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 9.79e-01 0.00529 0.201 0.052 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 6.24e-01 0.0889 0.181 0.052 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0737 0.15 0.052 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 3.21e-01 -0.189 0.19 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0951 0.166 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0312 0.156 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0476 0.186 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.71e-01 -0.056 0.192 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 2.69e-01 -0.23 0.207 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000726 0.199 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.49e-01 0.0342 0.18 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.07e-01 -0.117 0.176 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 1.92e-01 0.224 0.171 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0683 0.177 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.59e-01 0.0487 0.159 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0101 0.174 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.33e-01 0.13 0.208 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 6.84e-02 -0.282 0.154 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.46e-01 0.0244 0.126 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 7.59e-01 0.0602 0.196 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 3.40e-01 0.183 0.191 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 6.90e-01 0.0706 0.177 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 3.18e-01 -0.194 0.194 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 1.11e-01 -0.32 0.2 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.40e-01 0.041 0.203 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.73e-01 -0.218 0.198 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 2.28e-01 -0.176 0.145 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0208 0.196 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 9.57e-01 0.00984 0.181 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0192 0.18 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 1.08e-01 -0.305 0.189 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.03e-02 0.396 0.182 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 1.74e-01 -0.276 0.202 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.94e-01 -0.137 0.16 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.135 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 2.83e-01 -0.222 0.206 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.107 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.52e-01 -0.225 0.195 0.05 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 6.31e-01 0.105 0.218 0.05 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 9.46e-01 0.0114 0.167 0.05 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.87e-01 -0.22 0.166 0.05 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 6.79e-01 0.0578 0.139 0.05 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.28e-02 0.385 0.198 0.051 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 7.67e-01 0.0438 0.147 0.051 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.35e-01 -0.109 0.175 0.051 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.22e-02 0.417 0.193 0.051 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 9.47e-01 0.0132 0.197 0.051 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 4.60e-01 -0.117 0.159 0.051 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.14e-01 -0.104 0.127 0.051 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 1.04e-01 0.304 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 2.44e-01 -0.162 0.139 0.054 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 6.65e-01 -0.086 0.198 0.054 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0199 0.177 0.054 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 5.67e-01 0.0882 0.154 0.054 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 7.71e-01 0.0399 0.137 0.054 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.53e-01 -0.237 0.207 0.054 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 9.13e-01 0.0162 0.148 0.054 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 3.87e-01 0.163 0.188 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.41e-01 0.0995 0.129 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 1.22e-02 -0.484 0.192 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.77e-01 0.0283 0.1 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 3.41e-01 -0.155 0.163 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 6.13e-01 0.0779 0.154 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 8.61e-01 0.0318 0.181 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 5.03e-01 0.13 0.193 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 2.02e-01 0.181 0.141 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.96e-01 0.111 0.21 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 4.64e-01 0.107 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.06e-01 -0.043 0.175 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.16e-01 0.167 0.166 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 1.46e-01 -0.261 0.178 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 9.26e-01 0.0206 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 6.14e-01 -0.107 0.213 0.055 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.98e-01 0.0542 0.211 0.055 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 6.09e-02 0.464 0.245 0.055 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 2.93e-01 -0.26 0.246 0.055 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.59e-01 -0.261 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 9.24e-01 0.0188 0.196 0.055 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 3.10e-01 0.19 0.187 0.053 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 2.17e-02 -0.437 0.189 0.053 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 2.83e-01 -0.215 0.2 0.053 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 1.88e-01 -0.223 0.169 0.053 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 7.90e-01 0.0547 0.205 0.053 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 4.66e-01 0.156 0.214 0.053 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.39e-01 -0.137 0.177 0.053 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.67e-01 0.129 0.177 0.052 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.37e-01 -0.273 0.183 0.052 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 3.14e-02 0.402 0.185 0.052 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 2.37e-01 0.15 0.126 0.052 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.41e-01 0.0407 0.203 0.052 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.37e-01 -0.173 0.18 0.052 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 9.91e-02 0.323 0.195 0.052 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 2.28e-01 -0.238 0.197 0.062 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0449 0.127 0.062 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.40e-01 -0.119 0.195 0.062 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 4.17e-01 -0.15 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0573 0.144 0.062 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 9.39e-01 0.00965 0.125 0.062 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 2.73e-01 0.208 0.19 0.062 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0898 0.121 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.39e-01 -0.162 0.209 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.25e-01 -0.216 0.14 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.49e-01 -0.107 0.178 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.27e-02 0.271 0.126 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 5.70e-01 0.105 0.185 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 3.10e-01 -0.196 0.193 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.70e-01 -0.234 0.17 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 2.84e-01 0.188 0.175 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 6.71e-02 -0.354 0.192 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 4.43e-01 0.111 0.144 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.40e-01 0.0908 0.148 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0162 0.126 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 632279 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0179 0.154 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 5.20e-01 0.135 0.21 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 3.89e-01 -0.109 0.126 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 7.57e-01 -0.055 0.178 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 3.97e-01 0.151 0.178 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 7.80e-02 -0.337 0.19 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 6.46e-01 0.043 0.0936 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 4.09e-01 -0.126 0.153 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 1.56e-01 0.187 0.131 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 5.06e-01 -0.116 0.174 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 4.09e-01 0.14 0.169 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 1.14e-01 -0.265 0.166 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 5.18e-01 0.122 0.188 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 7.12e-01 0.0413 0.112 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0334 0.203 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 8.68e-01 0.029 0.173 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 3.52e-01 0.184 0.198 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -766725 sc-eQTL 6.55e-01 -0.08 0.179 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -549010 sc-eQTL 5.09e-01 0.114 0.172 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -713256 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0418 0.163 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 354820 sc-eQTL 4.04e-01 -0.127 0.153 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 483699 sc-eQTL 3.97e-01 0.142 0.167 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 604707 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0289 0.202 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -710906 sc-eQTL 7.13e-02 -0.251 0.139 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 355733 sc-eQTL 7.52e-01 -0.037 0.117 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 354820 pQTL 0.016 -0.0474 0.0197 0.0 0.0 0.0658
ENSG00000136044 APPL2 354820 eQTL 0.0274 -0.0818 0.037 0.0 0.0 0.0667

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136052 \N 632279 3.02e-07 1.42e-07 5.72e-08 2.05e-07 9.87e-08 8.45e-08 2.16e-07 5.53e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.59e-07 1.2e-07 2.13e-07 7.64e-08 5.69e-08 7.97e-08 4.31e-08 1.56e-07 6.92e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.39e-07 1.62e-07 2.68e-08 1.85e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.06e-07 3.93e-08 3.21e-08 8.72e-08 3.12e-08 3.28e-08 5.61e-08 8.89e-08 6.41e-08 3.67e-08 4.47e-08 1.5e-07 5.24e-08 1.43e-08 3.07e-08 1.92e-08 9.96e-08 1.95e-09 4.8e-08
ENSG00000258355 \N -655933 2.95e-07 1.33e-07 5.49e-08 2.05e-07 9.79e-08 8.33e-08 1.99e-07 5.48e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.67e-07 1.15e-07 1.95e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.74e-08 4.24e-08 1.51e-07 6.75e-08 4.8e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.87e-08 1.68e-07 1.22e-07 1.18e-07 1.01e-07 1.26e-07 1.05e-07 1.07e-07 3.54e-08 3.68e-08 8.23e-08 2.97e-08 3.2e-08 5.59e-08 9.03e-08 6.76e-08 4.55e-08 4.92e-08 1.46e-07 5.21e-08 1.43e-08 3.2e-08 1.87e-08 1.15e-07 1.92e-09 4.99e-08