logo

Genes within 1Mb (chr12:105581366:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 6.22e-01 0.0569 0.115 0.16 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.76e-01 0.0425 0.0595 0.16 B L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 1.56e-01 0.124 0.0872 0.16 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.71e-01 0.05 0.0557 0.16 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 7.39e-01 0.0297 0.0889 0.16 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 7.33e-02 0.192 0.107 0.16 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0257 0.0715 0.16 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.76e-01 0.0321 0.0766 0.16 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 3.29e-01 0.0824 0.0842 0.16 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 3.77e-01 0.0637 0.072 0.16 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 6.91e-01 0.0331 0.0831 0.16 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.02e-01 0.0313 0.0819 0.16 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.24e-01 0.112 0.113 0.16 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 9.09e-01 0.00837 0.0734 0.16 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0412 0.0633 0.16 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.37e-01 0.0344 0.102 0.16 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00188 0.0677 0.16 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 6.22e-01 0.0479 0.0969 0.16 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.49e-01 -0.101 0.108 0.16 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0416 0.0979 0.16 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 1.61e-01 0.0841 0.0598 0.16 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0174 0.043 0.16 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 5.20e-01 -0.073 0.113 0.164 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0445 0.0779 0.164 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 2.71e-01 -0.128 0.116 0.164 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00852 0.0938 0.164 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0311 0.0796 0.164 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 7.71e-02 0.126 0.0706 0.164 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.49e-01 0.11 0.117 0.164 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 2.40e-01 -0.056 0.0475 0.164 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 3.42e-01 0.0941 0.0988 0.16 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0515 0.0709 0.16 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0385 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0274 0.0552 0.16 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.25e-01 0.117 0.0966 0.16 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0275 0.0823 0.16 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0902 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.27e-01 -0.01 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 4.08e-01 0.0887 0.107 0.161 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0973 0.161 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 5.15e-01 0.0626 0.0959 0.161 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.13e-01 -0.101 0.0999 0.161 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.53e-01 0.114 0.123 0.161 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0153 0.0886 0.161 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.91e-01 0.0289 0.0726 0.161 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 2.22e-01 -0.152 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 1.62e-01 -0.109 0.0776 0.16 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 1.73e-01 -0.138 0.101 0.16 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.133 0.16 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.54e-01 0.107 0.0936 0.16 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 4.38e-01 0.0741 0.0954 0.16 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 5.71e-01 0.0442 0.078 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.48e-01 0.00817 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0709 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 4.84e-01 0.0934 0.133 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0583 0.127 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 8.01e-01 0.0239 0.0947 0.158 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0636 0.131 0.158 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.62e-01 0.12 0.131 0.158 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0858 0.128 0.158 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0399 0.129 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 8.59e-01 0.017 0.0953 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 5.37e-01 0.0699 0.113 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 8.36e-01 0.0204 0.0979 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0915 0.107 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 1.35e-01 0.186 0.124 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.14e-01 0.111 0.11 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.46e-02 0.199 0.115 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0168 0.127 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 5.76e-01 0.0601 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0351 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.32e-01 0.0928 0.0954 0.162 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 3.75e-01 0.0996 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.79e-01 -0.14 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0282 0.0982 0.162 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 8.75e-01 0.0186 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 2.61e-02 0.197 0.088 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 2.47e-01 0.115 0.0993 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0702 0.0895 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 8.45e-01 0.0203 0.104 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 8.40e-01 0.0261 0.129 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0893 0.0871 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.39e-01 0.0538 0.115 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.17e-01 0.198 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.82e-01 0.0451 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 8.55e-01 0.0192 0.105 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 2.87e-02 0.207 0.0939 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0893 0.0995 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 6.43e-01 0.0626 0.135 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.24e-01 0.0924 0.0934 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0189 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.62e-01 0.0363 0.12 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.00e-01 0.0833 0.0988 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 5.92e-01 0.066 0.123 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 2.60e-01 -0.133 0.118 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.20e-01 -0.118 0.119 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0442 0.125 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.67e-01 -0.012 0.0717 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0941 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 8.68e-01 0.0136 0.0813 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0447 0.0866 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00641 0.0854 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.88e-01 0.108 0.124 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0905 0.0812 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0192 0.111 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.27e-01 0.00975 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.75e-01 0.0225 0.0784 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 2.34e-01 0.121 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00907 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.32e-01 0.126 0.13 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.33e-01 0.103 0.0861 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00571 0.0855 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 2.96e-01 -0.14 0.134 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0887 0.105 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00196 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00542 0.126 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0537 0.105 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 2.11e-01 0.106 0.0841 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 4.82e-01 0.085 0.121 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.16e-01 -0.054 0.107 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 3.49e-01 0.0952 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.77e-01 -0.032 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.23e-01 -0.131 0.133 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.47e-01 0.134 0.115 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.70e-01 0.0364 0.0852 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0393 0.113 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00819 0.101 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00434 0.104 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.45e-01 0.0366 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 8.88e-01 0.017 0.121 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 6.77e-01 0.0375 0.09 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 4.62e-01 0.0709 0.0962 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 4.34e-01 0.101 0.129 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 1.21e-01 -0.175 0.112 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 5.06e-01 0.0845 0.127 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0784 0.128 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 8.80e-01 0.0206 0.136 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.30e-01 0.106 0.109 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0285 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.81e-01 -0.171 0.128 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0585 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0162 0.13 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.96e-01 -0.114 0.134 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 1.14e-01 -0.207 0.13 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0171 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0997 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 8.44e-02 -0.209 0.121 0.162 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.73e-01 0.0315 0.109 0.162 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 1.93e-01 -0.151 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 5.59e-01 0.0802 0.137 0.162 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 5.92e-01 0.066 0.123 0.162 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 6.94e-01 0.0437 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0339 0.0923 0.162 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 4.90e-01 0.0845 0.122 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 4.83e-01 0.075 0.107 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 2.65e-01 0.112 0.1 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.28e-03 0.309 0.118 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.75e-01 0.00391 0.123 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.07e-01 0.168 0.133 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.51e-01 -0.024 0.128 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 3.46e-01 0.109 0.115 0.164 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.48e-01 0.00719 0.111 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 5.12e-01 0.0709 0.108 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0331 0.111 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 8.07e-01 0.0244 0.0997 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0344 0.109 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.54e-01 0.149 0.131 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0111 0.0973 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 7.38e-01 0.0264 0.0789 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.40e-01 0.041 0.123 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 2.51e-01 0.138 0.12 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.15e-02 -0.226 0.11 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00635 0.122 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 2.52e-01 -0.145 0.126 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 6.53e-01 0.0573 0.127 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.60e-01 0.141 0.125 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.11e-01 -0.022 0.0916 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0287 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 8.70e-01 0.0185 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 9.46e-01 0.00757 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 3.88e-01 -0.102 0.118 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 2.00e-01 -0.147 0.114 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 8.53e-01 0.0234 0.127 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0225 0.1 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0573 0.0839 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.60e-01 0.0501 0.164 0.148 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.77e-01 0.0261 0.0918 0.148 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 6.20e-01 0.0824 0.166 0.148 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.148 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 3.55e-01 0.139 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 4.89e-01 0.103 0.148 0.148 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 4.75e-01 0.11 0.153 0.148 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0199 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.73e-01 -0.17 0.124 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0637 0.065 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 4.11e-02 -0.24 0.117 0.154 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 2.32e-01 -0.157 0.131 0.154 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0761 0.1 0.154 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 1.84e-01 0.133 0.1 0.154 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 2.80e-01 0.0907 0.0837 0.154 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 5.27e-01 0.0797 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0738 0.093 0.16 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 3.19e-01 0.111 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 5.04e-01 0.0826 0.123 0.16 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.44e-01 0.145 0.124 0.16 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 3.40e-01 0.0958 0.1 0.16 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0158 0.0803 0.16 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 5.18e-01 0.0742 0.114 0.173 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.04e-01 0.0442 0.0851 0.173 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0961 0.121 0.173 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.50e-02 -0.18 0.107 0.173 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 2.19e-01 -0.116 0.0937 0.173 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 7.29e-02 0.15 0.0829 0.173 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.31e-01 0.152 0.126 0.173 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 3.97e-01 0.0769 0.0904 0.173 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.58e-01 0.166 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0549 0.0807 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 4.79e-01 0.0862 0.122 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0297 0.0627 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.102 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0159 0.0964 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.81e-02 -0.206 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 2.35e-01 -0.143 0.12 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0373 0.0882 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 6.41e-01 -0.061 0.131 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0877 0.0909 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 4.85e-01 -0.076 0.109 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 5.99e-01 0.0545 0.103 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0183 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.64e-02 -0.223 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 8.91e-01 0.0176 0.128 0.176 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.01e-01 0.0159 0.127 0.176 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 8.37e-01 0.0308 0.15 0.176 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.33e-02 0.336 0.146 0.176 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00323 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.176 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0269 0.116 0.16 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0427 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.97e-01 0.000534 0.124 0.16 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.06e-01 0.107 0.104 0.16 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 1.27e-01 0.193 0.126 0.16 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0454 0.132 0.16 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 3.54e-01 0.102 0.109 0.16 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 7.37e-01 0.0372 0.11 0.156 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 1.54e-01 -0.163 0.114 0.156 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 8.00e-02 -0.204 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0273 0.0788 0.156 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 9.87e-01 0.00198 0.126 0.156 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 2.11e-01 -0.141 0.112 0.156 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 6.12e-01 0.0621 0.122 0.156 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 1.97e-01 -0.171 0.132 0.169 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0909 0.0846 0.169 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 2.53e-01 -0.149 0.13 0.169 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00848 0.124 0.169 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 6.19e-01 -0.048 0.0963 0.169 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 1.64e-01 0.117 0.0835 0.169 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.06e-01 0.0482 0.127 0.169 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 7.56e-02 -0.143 0.0801 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 9.94e-01 0.00101 0.128 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0418 0.0867 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 5.46e-01 0.0662 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 5.09e-01 0.0517 0.0781 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 8.27e-01 0.0248 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 4.21e-01 0.0956 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 3.01e-01 0.111 0.107 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 3.96e-01 0.102 0.12 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.78e-02 0.157 0.0886 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 4.31e-01 0.072 0.0913 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 6.54e-01 0.035 0.078 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 622622 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00253 0.0955 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 6.99e-01 0.0502 0.13 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0568 0.0778 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 9.98e-01 0.000307 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 5.46e-01 0.0671 0.111 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0453 0.0772 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 7.52e-01 0.0377 0.12 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0168 0.0584 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 5.56e-01 0.0562 0.0954 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00276 0.0821 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 1.41e-01 -0.159 0.108 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 6.09e-01 0.0548 0.107 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0358 0.105 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 3.76e-01 -0.105 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.92e-01 0.0602 0.0702 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 2.38e-01 0.151 0.127 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 1.03e-01 -0.178 0.109 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 5.35e-01 0.0775 0.125 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -776382 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0755 0.112 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -558667 sc-eQTL 4.14e-01 0.0879 0.107 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0194 0.102 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 345163 sc-eQTL 9.79e-01 0.00249 0.0955 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 474042 sc-eQTL 3.09e-01 -0.106 0.104 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 595050 sc-eQTL 7.24e-01 0.0445 0.126 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0291 0.0873 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 346076 sc-eQTL 8.62e-01 0.0127 0.0731 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 pQTL 0.0204 -0.0401 0.0173 0.0 0.0 0.169
ENSG00000166046 TCP11L2 -720563 eQTL 0.0106 0.0477 0.0186 0.0 0.0 0.182

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136026 CKAP4 -722913 3.1e-07 1.76e-07 6.26e-08 2.31e-07 1.08e-07 8.33e-08 2.24e-07 5.82e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.84e-07 1.72e-07 2.94e-07 8.26e-08 6.27e-08 9.35e-08 4.35e-08 2.15e-07 7.39e-08 5.2e-08 1.22e-07 1.76e-07 1.64e-07 3.58e-08 2.59e-07 1.31e-07 1.23e-07 1.28e-07 1.31e-07 1.59e-07 1.71e-07 3.55e-08 3.59e-08 9.8e-08 3.57e-08 3.18e-08 5.8e-08 8.76e-08 6.76e-08 3.99e-08 5.13e-08 2.43e-07 4.87e-08 1.08e-08 3.32e-08 1.68e-08 1.19e-07 1.92e-09 4.94e-08
ENSG00000277715 \N -669393 3.62e-07 2.3e-07 6.42e-08 2.45e-07 1.07e-07 7.75e-08 2.74e-07 6.2e-08 2.35e-07 1.37e-07 3.92e-07 2.09e-07 3.95e-07 9.18e-08 7.79e-08 1.14e-07 5.57e-08 2.56e-07 7.11e-08 5.75e-08 1.24e-07 2.06e-07 1.73e-07 4.17e-08 3.41e-07 1.56e-07 1.29e-07 1.46e-07 1.39e-07 2.02e-07 1.93e-07 4.32e-08 3.38e-08 9.5e-08 5.65e-08 4.6e-08 4.41e-08 8.37e-08 6.62e-08 5.56e-08 5.37e-08 2.91e-07 3.55e-08 1.13e-08 3.34e-08 8.31e-09 1.2e-07 2e-09 4.83e-08