logo

Genes within 1Mb (chr12:105567605:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.92e-01 -0.15 0.175 0.06 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 7.90e-01 0.0242 0.0908 0.06 B L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.66e-01 0.00578 0.134 0.06 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 1.54e-01 0.121 0.0847 0.06 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 2.36e-01 -0.161 0.135 0.06 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 3.86e-01 0.142 0.164 0.06 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 5.28e-02 0.211 0.108 0.06 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0939 0.117 0.06 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.69e-01 -0.143 0.129 0.06 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 2.59e-01 -0.124 0.11 0.06 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0155 0.127 0.06 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.42e-01 0.0413 0.125 0.06 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0776 0.173 0.06 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 3.71e-01 -0.1 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0232 0.097 0.06 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0307 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 6.28e-01 -0.049 0.101 0.06 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0658 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 1.13e-01 0.256 0.161 0.06 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.27e-01 0.0927 0.146 0.06 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 7.37e-01 0.0302 0.0897 0.06 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0374 0.0643 0.06 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.92e-01 0.234 0.179 0.061 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 4.16e-01 0.1 0.123 0.061 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 5.76e-01 -0.103 0.184 0.061 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 3.92e-01 0.127 0.148 0.061 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 3.18e-01 0.126 0.126 0.061 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00335 0.113 0.061 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.97e-01 0.024 0.185 0.061 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 8.66e-01 0.0127 0.0756 0.061 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.56e-02 -0.283 0.153 0.06 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 1.95e-01 -0.143 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0383 0.175 0.06 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.76e-01 0.0245 0.086 0.06 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.17e-01 0.0548 0.151 0.06 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0613 0.128 0.06 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.87e-01 0.145 0.167 0.06 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.06e-01 0.277 0.171 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 2.36e-01 -0.2 0.169 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 4.82e-01 -0.108 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0178 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 4.23e-01 -0.127 0.158 0.06 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.07e-01 -0.129 0.194 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 9.79e-02 0.231 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 1.43e-01 0.168 0.114 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.77e-02 0.343 0.187 0.06 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 3.15e-01 0.119 0.118 0.06 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 2.01e-02 0.355 0.152 0.06 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0346 0.202 0.06 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 4.72e-01 0.102 0.142 0.06 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 4.41e-01 0.112 0.144 0.06 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0254 0.118 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 4.71e-01 0.142 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0811 0.187 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 6.46e-01 0.0969 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.89e-01 0.0537 0.201 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 2.92e-01 0.158 0.149 0.056 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0354 0.208 0.056 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 7.92e-01 0.0552 0.208 0.056 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.46e-01 0.234 0.201 0.056 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.58e-02 0.48 0.197 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 6.79e-01 0.0614 0.148 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00166 0.176 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 3.55e-01 0.141 0.152 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 3.46e-01 0.158 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.16e-01 0.126 0.193 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 3.22e-01 0.17 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.67e-01 -0.199 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 7.73e-01 0.057 0.198 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.29e-01 -0.105 0.167 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0419 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 4.94e-01 -0.102 0.149 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 4.13e-01 0.143 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 9.77e-02 0.334 0.2 0.06 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.19e-03 0.437 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.61e-01 -0.172 0.153 0.06 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 4.65e-02 -0.363 0.181 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 8.59e-01 0.0245 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 4.93e-01 -0.106 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 2.29e-01 0.167 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 1.86e-02 -0.376 0.158 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.92e-01 -0.027 0.199 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 4.47e-01 0.103 0.135 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.48e-01 -0.167 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.71e-01 -0.217 0.197 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.94e-01 0.0913 0.171 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 2.61e-01 0.184 0.163 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.86e-01 0.0402 0.148 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 3.48e-01 0.146 0.155 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.32e-01 0.0447 0.21 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.09e-01 0.234 0.145 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 8.13e-01 -0.043 0.182 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.04e-01 -0.205 0.199 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 7.31e-01 0.0565 0.164 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0113 0.205 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 1.15e-01 0.308 0.195 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 4.80e-01 -0.14 0.197 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 7.34e-01 0.0705 0.208 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.76e-01 -0.13 0.119 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.27e-01 -0.174 0.144 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 1.58e-01 -0.175 0.123 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0527 0.132 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 9.63e-01 0.00604 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.40e-01 0.0384 0.19 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.62e-01 -0.139 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0193 0.169 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0794 0.162 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 3.58e-01 -0.11 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.90e-01 0.203 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0452 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.72e-01 -0.112 0.197 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0561 0.131 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0713 0.13 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.69e-01 0.179 0.199 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 2.96e-01 0.163 0.156 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 2.89e-01 -0.182 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 1.27e-01 0.295 0.193 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0535 0.188 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.95e-01 -0.164 0.156 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 7.96e-01 0.0325 0.126 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.10e-01 -0.299 0.187 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0996 0.167 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 2.87e-02 -0.344 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 2.34e-01 0.208 0.174 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 3.96e-01 0.176 0.206 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0803 0.179 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0342 0.132 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.45e-01 0.16 0.17 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 3.85e-01 -0.132 0.151 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.97e-01 0.201 0.155 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.81e-01 0.0932 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 6.88e-01 0.073 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 3.84e-01 0.118 0.135 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 6.51e-01 0.0656 0.145 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0955 0.197 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.36e-01 0.106 0.172 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 7.37e-01 -0.065 0.193 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.24e-01 0.124 0.194 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.32e-01 0.071 0.207 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.36e-01 0.0343 0.166 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.61e-01 -0.167 0.183 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 5.38e-01 0.127 0.205 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0482 0.189 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 4.67e-01 -0.152 0.208 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.66e-01 -0.124 0.215 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0546 0.21 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0482 0.197 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.55e-01 -0.149 0.16 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.01e-01 0.236 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0977 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.36e-01 0.263 0.176 0.061 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 6.45e-01 0.096 0.208 0.061 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.77e-01 0.104 0.187 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0272 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0343 0.14 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 7.35e-01 0.064 0.189 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 8.39e-01 0.0336 0.165 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0258 0.154 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 7.26e-02 -0.33 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 2.89e-01 -0.201 0.19 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 1.05e-01 -0.333 0.204 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 4.00e-02 0.403 0.195 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 6.66e-01 0.0769 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.85e-01 0.0702 0.173 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 2.91e-01 -0.179 0.169 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0128 0.174 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 5.43e-01 0.0949 0.156 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 2.65e-01 -0.19 0.17 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.19e-01 0.0468 0.205 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.68e-01 0.21 0.152 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 6.97e-02 0.223 0.122 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.14e-01 0.238 0.191 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0746 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.76e-01 0.0964 0.172 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 3.11e-01 0.192 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 6.37e-02 0.363 0.195 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 4.13e-01 -0.162 0.197 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 9.04e-01 0.0235 0.194 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 4.01e-01 -0.119 0.142 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.98e-01 0.198 0.19 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 4.75e-01 -0.126 0.176 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 3.74e-01 -0.155 0.174 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 5.22e-01 -0.118 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0468 0.178 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 2.88e-01 -0.209 0.196 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 4.01e-01 0.131 0.155 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.00e-01 0.136 0.13 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.08e-01 0.312 0.193 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0236 0.102 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.37e-03 0.583 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0229 0.205 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0244 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.60e-01 0.0277 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 9.38e-02 -0.219 0.13 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 5.56e-01 -0.113 0.192 0.06 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.23e-03 -0.394 0.14 0.06 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0604 0.169 0.06 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 2.71e-01 0.208 0.188 0.06 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0982 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.61e-01 0.172 0.153 0.06 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.30e-01 -0.119 0.122 0.06 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 7.60e-01 0.0566 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 5.77e-01 0.0766 0.137 0.061 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 4.17e-01 -0.158 0.195 0.061 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.41e-01 0.106 0.174 0.061 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 2.39e-01 0.179 0.151 0.061 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 9.13e-01 0.0147 0.135 0.061 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.19e-01 -0.252 0.204 0.061 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0902 0.146 0.061 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.37e-01 -0.177 0.184 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 1.62e-01 -0.176 0.126 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.18e-01 -0.297 0.189 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.68e-01 0.0289 0.0979 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0604 0.16 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0996 0.15 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 1.60e-01 0.248 0.176 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 8.45e-01 0.0371 0.189 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 3.91e-02 -0.285 0.137 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 7.04e-01 0.078 0.205 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 9.68e-02 0.237 0.142 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 1.40e-01 0.252 0.17 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 8.90e-01 0.0226 0.162 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 5.25e-01 0.112 0.175 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.93e-01 0.277 0.212 0.064 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 7.35e-01 0.0688 0.203 0.064 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 4.97e-01 0.137 0.201 0.064 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.50e-01 0.142 0.237 0.064 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0344 0.236 0.064 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 6.56e-01 0.0986 0.221 0.064 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.05e-01 -0.237 0.186 0.064 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 9.74e-01 0.00589 0.18 0.06 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 1.40e-01 -0.27 0.183 0.06 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0184 0.192 0.06 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0734 0.162 0.06 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0554 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.67e-01 -0.284 0.205 0.06 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 4.49e-02 0.34 0.168 0.06 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 7.61e-03 -0.444 0.165 0.061 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 8.69e-01 0.0286 0.174 0.061 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 1.55e-01 0.252 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0372 0.12 0.061 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 1.75e-01 0.26 0.191 0.061 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.18e-01 0.266 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 4.65e-01 0.136 0.186 0.061 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 2.56e-01 0.233 0.205 0.068 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0407 0.132 0.068 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 9.49e-01 -0.013 0.203 0.068 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.03e-01 0.0735 0.192 0.068 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0451 0.15 0.068 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 3.71e-01 -0.117 0.13 0.068 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.76e-01 -0.216 0.197 0.068 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.32e-01 0.15 0.125 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 7.56e-02 0.354 0.198 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00367 0.135 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0941 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 9.49e-01 0.00775 0.122 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 2.27e-01 0.213 0.176 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 5.87e-02 0.348 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.21e-02 0.408 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 1.42e-01 -0.246 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 6.83e-02 -0.338 0.185 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 9.10e-01 0.0157 0.139 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0356 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 1.51e-01 0.174 0.121 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 sc-eQTL 1.06e-01 -0.239 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 8.68e-01 0.0336 0.202 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 1.61e-01 0.169 0.12 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 4.08e-01 -0.141 0.17 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 3.81e-01 -0.153 0.174 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 1.03e-01 -0.198 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 4.41e-01 -0.145 0.188 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 3.22e-01 0.091 0.0917 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 9.51e-01 0.00926 0.15 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 4.31e-01 -0.102 0.129 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 3.19e-01 0.17 0.17 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.94e-02 -0.375 0.159 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 2.03e-01 -0.202 0.158 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 5.41e-01 0.11 0.179 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0341 0.106 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 4.55e-01 0.144 0.193 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 5.03e-01 0.111 0.165 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 2.41e-01 0.221 0.188 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -790143 sc-eQTL 1.58e-01 0.248 0.175 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -572428 sc-eQTL 1.67e-01 -0.233 0.168 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -736674 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0696 0.161 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 331402 sc-eQTL 6.56e-01 0.0671 0.15 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 460281 sc-eQTL 5.97e-01 -0.087 0.164 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 581289 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0562 0.198 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -734324 sc-eQTL 2.01e-01 0.175 0.137 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 332315 sc-eQTL 1.81e-01 0.153 0.114 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136052 SLC41A2 608861 eQTL 0.0475 0.173 0.087 0.0 0.0 0.0422

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -572428 4.89e-07 2.5e-07 8.02e-08 2.53e-07 1.11e-07 1.25e-07 3.44e-07 8.86e-08 2.76e-07 1.5e-07 3.25e-07 2.09e-07 4.11e-07 8.26e-08 9.12e-08 1.49e-07 9.3e-08 2.93e-07 9.71e-08 7.26e-08 1.52e-07 2.45e-07 2.26e-07 6.65e-08 3.55e-07 2.2e-07 1.72e-07 1.61e-07 2.03e-07 2.1e-07 1.86e-07 5.24e-08 5.09e-08 1.24e-07 9.25e-08 5.23e-08 6.48e-08 6.11e-08 4.99e-08 8.3e-08 3.24e-08 2.65e-07 3.65e-08 7.3e-09 6.59e-08 1.05e-08 8.94e-08 0.0 4.59e-08
ENSG00000235162 \N 332315 1.28e-06 9.03e-07 2.79e-07 3.65e-07 2.71e-07 4.06e-07 1.02e-06 3.5e-07 1.15e-06 3.66e-07 1.35e-06 5.49e-07 1.59e-06 2.4e-07 4.16e-07 7.17e-07 7.73e-07 5.69e-07 5.29e-07 6.25e-07 3.91e-07 1.08e-06 7.95e-07 5.79e-07 1.85e-06 3.87e-07 6.16e-07 5.44e-07 1.02e-06 1.06e-06 5.2e-07 4.94e-08 1.94e-07 5.53e-07 3.67e-07 4.34e-07 4.74e-07 1.56e-07 2.21e-07 9.18e-08 3.01e-07 1.3e-06 6.53e-08 2.67e-08 1.88e-07 7.43e-08 1.9e-07 8.66e-08 8.61e-08