logo

Genes within 1Mb (chr12:105560351:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 8.46e-01 0.0228 0.117 0.132 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 4.91e-03 -0.169 0.0596 0.132 B L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0457 0.0892 0.132 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.72e-02 -0.112 0.0564 0.132 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 7.86e-01 0.0247 0.0906 0.132 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.48e-01 -0.127 0.109 0.132 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 2.60e-01 0.0821 0.0727 0.132 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.16e-02 0.146 0.0774 0.132 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.0859 0.132 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.19e-01 0.0476 0.0737 0.132 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00123 0.085 0.132 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.35e-01 0.0654 0.0836 0.132 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.116 0.132 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 4.21e-01 0.0604 0.0749 0.132 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 1.53e-01 0.0925 0.0645 0.132 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.80e-01 0.0892 0.101 0.132 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00736 0.0671 0.132 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.42e-01 -0.112 0.0958 0.132 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 5.72e-01 0.0607 0.107 0.132 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.19e-02 -0.221 0.0959 0.132 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0231 0.0595 0.132 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.67e-01 0.0311 0.0426 0.132 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 8.15e-01 0.0276 0.118 0.135 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0095 0.0811 0.135 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.54e-01 -0.138 0.121 0.135 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0975 0.135 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 5.21e-01 0.0533 0.0828 0.135 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0805 0.0739 0.135 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 4.69e-01 0.0884 0.122 0.135 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0306 0.0496 0.135 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0357 0.102 0.132 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.31e-01 0.00631 0.073 0.132 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0465 0.115 0.132 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0594 0.0566 0.132 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00626 0.0997 0.132 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00719 0.0847 0.132 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0492 0.111 0.132 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.30e-03 0.328 0.11 0.133 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 9.96e-02 0.182 0.11 0.133 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.30e-01 0.00881 0.101 0.133 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 1.05e-01 -0.161 0.0988 0.133 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 2.63e-01 0.116 0.103 0.133 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.09e-01 -0.13 0.127 0.133 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 1.54e-01 0.131 0.0913 0.133 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0496 0.0751 0.133 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 4.11e-01 -0.103 0.125 0.132 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.67e-01 0.0132 0.0786 0.132 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 1.31e-01 -0.154 0.102 0.132 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.52e-01 -0.101 0.134 0.132 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0878 0.0945 0.132 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 3.94e-01 0.0823 0.0963 0.132 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0116 0.0788 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 4.54e-01 -0.102 0.136 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0809 0.129 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0212 0.146 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 2.78e-01 -0.151 0.138 0.13 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 3.53e-02 -0.217 0.102 0.13 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.76e-01 -0.128 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 9.39e-01 0.011 0.144 0.13 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.65e-01 0.102 0.14 0.13 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 1.04e-01 -0.217 0.133 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 2.67e-03 -0.295 0.0969 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 7.89e-01 0.0315 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.60e-01 -0.143 0.101 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 1.75e-02 0.264 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 7.15e-01 0.0473 0.129 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 1.17e-02 0.288 0.113 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 1.41e-01 0.177 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.35e-01 -0.127 0.131 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 1.88e-01 -0.146 0.111 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.67e-01 0.0517 0.12 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 7.97e-01 0.0256 0.0991 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 8.81e-01 0.0174 0.116 0.134 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 8.88e-01 -0.019 0.134 0.134 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 3.81e-01 0.0968 0.11 0.134 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0107 0.102 0.134 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.52e-02 0.203 0.121 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.81e-01 0.0138 0.092 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 5.16e-01 0.067 0.103 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0689 0.0925 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0197 0.107 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.41e-01 -0.127 0.133 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 5.36e-01 0.0559 0.0902 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 5.26e-02 0.229 0.117 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 8.73e-01 -0.021 0.132 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 4.82e-01 0.0805 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.09e-01 -0.056 0.109 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.64e-02 -0.169 0.0981 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0885 0.104 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 6.98e-02 -0.254 0.139 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.87e-01 0.0393 0.0974 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.27e-02 0.225 0.12 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 7.48e-01 0.0399 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 4.21e-01 0.0824 0.102 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.44e-01 -0.148 0.127 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.09e-01 0.195 0.121 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.39e-01 -0.118 0.123 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.04e-01 0.067 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.00e-01 0.0623 0.0739 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 2.81e-01 0.105 0.0966 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 6.57e-01 0.037 0.0832 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 8.03e-01 0.0222 0.0887 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.43e-01 0.0173 0.0875 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 1.79e-01 -0.171 0.127 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 7.60e-01 0.0255 0.0833 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 1.18e-01 0.177 0.113 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 5.25e-01 0.0694 0.109 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0172 0.0802 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0977 0.104 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.107 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0995 0.133 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 5.06e-01 0.0587 0.0882 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.14e-01 0.109 0.0871 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 5.47e-01 0.0809 0.134 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.19e-01 0.0681 0.105 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0785 0.115 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0659 0.13 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.48e-01 0.119 0.126 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 9.50e-01 0.00659 0.105 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0244 0.0846 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 8.43e-01 0.0242 0.122 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 2.50e-01 -0.125 0.108 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 7.04e-02 -0.185 0.102 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 5.68e-01 -0.065 0.114 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.00e-02 -0.311 0.133 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 8.98e-01 -0.015 0.117 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0273 0.0861 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0355 0.113 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0548 0.101 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 7.75e-01 0.0297 0.104 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00702 0.112 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 8.99e-02 -0.205 0.12 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 9.64e-01 0.0041 0.0901 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0329 0.0964 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.41e-01 0.00989 0.133 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 3.66e-01 0.105 0.116 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 7.31e-01 -0.045 0.131 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 6.44e-01 0.0608 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0498 0.14 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0177 0.112 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 3.41e-01 -0.118 0.124 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.07e-01 0.14 0.137 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0664 0.126 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0336 0.139 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.34e-02 0.248 0.143 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.17e-02 -0.32 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 3.50e-01 0.123 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.57e-01 0.121 0.107 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.69e-01 -0.113 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0196 0.113 0.132 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.81e-02 -0.264 0.119 0.132 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.53e-01 -0.203 0.141 0.132 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.25e-01 -0.155 0.127 0.132 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0329 0.115 0.132 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00635 0.0957 0.132 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 7.41e-01 0.0417 0.126 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 1.39e-02 0.269 0.108 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.73e-01 0.00356 0.103 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.70e-01 0.0525 0.123 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.24e-01 0.102 0.127 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0906 0.137 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 7.68e-01 0.0388 0.132 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 3.14e-01 -0.12 0.119 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 1.12e-02 0.288 0.113 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 2.30e-02 0.253 0.11 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000178 0.115 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 3.53e-02 -0.216 0.102 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 2.89e-01 0.119 0.112 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 9.88e-02 -0.223 0.135 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 2.03e-02 0.232 0.0993 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.45e-01 0.0622 0.0814 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 8.82e-01 0.0201 0.134 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 2.59e-01 -0.148 0.131 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0768 0.121 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.70e-01 0.0568 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.24e-02 0.239 0.137 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 7.74e-01 0.04 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.39e-01 -0.064 0.136 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 3.20e-01 0.0993 0.0995 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 4.17e-01 0.104 0.128 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 5.57e-01 0.0699 0.119 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 3.89e-01 -0.101 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0801 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 7.31e-01 0.0414 0.12 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.82e-01 0.116 0.133 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 2.63e-01 0.118 0.105 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0718 0.0882 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00621 0.161 0.13 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 1.93e-01 -0.118 0.0897 0.13 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 4.97e-01 0.111 0.163 0.13 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.139 0.13 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 5.45e-01 0.0898 0.148 0.13 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 8.73e-02 -0.249 0.144 0.13 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0424 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.85e-01 0.0416 0.102 0.13 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 5.81e-01 0.0705 0.128 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 1.48e-01 0.0965 0.0665 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.58e-01 0.19 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 6.71e-01 0.0439 0.103 0.133 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 2.10e-01 -0.129 0.103 0.133 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.0856 0.133 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.92e-01 0.00137 0.129 0.132 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 4.00e-01 0.0803 0.0952 0.132 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.132 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0662 0.126 0.132 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0987 0.127 0.132 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.04e-01 0.0534 0.103 0.132 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.27e-01 0.0994 0.082 0.132 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 2.93e-01 -0.129 0.122 0.137 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.76e-01 0.00275 0.0908 0.137 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.01e-02 -0.298 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0861 0.115 0.137 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 2.02e-01 0.128 0.0999 0.137 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 1.19e-01 -0.139 0.0886 0.137 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 2.09e-01 -0.17 0.135 0.137 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 7.88e-01 -0.026 0.0966 0.137 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 7.54e-01 0.0386 0.123 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 7.14e-01 0.0309 0.0842 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 3.31e-01 -0.123 0.127 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0975 0.065 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 3.28e-01 -0.104 0.106 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0193 0.1 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.81e-01 0.0833 0.118 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 5.03e-01 0.084 0.125 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0896 0.0914 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 3.26e-01 0.133 0.135 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0207 0.0945 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 5.80e-01 0.0626 0.113 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 1.22e-01 -0.166 0.107 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.67e-01 0.05 0.116 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 6.64e-01 0.0651 0.149 0.13 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 1.28e-02 -0.352 0.139 0.13 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 2.32e-01 -0.169 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 5.39e-01 0.103 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0195 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 6.52e-02 0.285 0.153 0.13 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.84e-01 0.141 0.131 0.13 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.63e-01 -0.113 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 2.86e-01 0.135 0.126 0.133 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0968 0.133 0.133 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.68e-01 -0.154 0.112 0.133 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 4.18e-01 -0.11 0.136 0.133 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 8.46e-02 0.245 0.141 0.133 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.36e-01 0.0914 0.117 0.133 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.113 0.136 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0539 0.117 0.136 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.68e-01 0.0516 0.12 0.136 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0679 0.0808 0.136 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 7.17e-01 0.047 0.13 0.136 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 7.53e-02 0.205 0.115 0.136 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.30e-01 0.012 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0463 0.0881 0.138 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 1.41e-01 0.199 0.135 0.138 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0427 0.129 0.138 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 9.71e-01 0.00366 0.1 0.138 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0362 0.0873 0.138 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0212 0.133 0.138 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.87e-01 0.034 0.084 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 1.00e-02 -0.337 0.13 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 4.23e-03 -0.253 0.0873 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 9.15e-01 0.012 0.112 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.83e-01 -0.107 0.0799 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 1.26e-01 0.178 0.116 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 9.28e-01 0.011 0.122 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 4.29e-02 0.217 0.107 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 2.07e-01 0.139 0.11 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 2.83e-01 0.133 0.124 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 9.73e-01 0.00317 0.0926 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 9.22e-01 0.00931 0.0949 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.02e-01 -0.132 0.0804 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 601607 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0275 0.0991 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 2.08e-01 -0.17 0.134 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 4.06e-01 0.0672 0.0807 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.86e-02 0.224 0.113 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 5.66e-01 0.0661 0.115 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0177 0.0801 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 9.18e-01 0.0128 0.124 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0575 0.0605 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0284 0.099 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0704 0.0851 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 6.06e-01 0.0581 0.112 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 9.58e-02 -0.185 0.11 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 8.83e-01 0.0161 0.11 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0447 0.123 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 8.14e-02 -0.127 0.0725 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0737 0.133 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 1.59e-02 0.272 0.112 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0899 0.13 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -797397 sc-eQTL 4.75e-03 0.324 0.113 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -579682 sc-eQTL 8.14e-02 0.193 0.11 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0681 0.106 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 324148 sc-eQTL 6.96e-02 -0.179 0.0981 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 453027 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 574035 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0863 0.13 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -741578 sc-eQTL 3.58e-02 0.189 0.0895 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 325061 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0165 0.0757 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -743928 eQTL 0.0102 0.0362 0.014 0.00272 0.0 0.157
ENSG00000136044 APPL2 324148 eQTL 9.3e-05 -0.101 0.0258 0.0 0.0 0.157

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 324148 5.14e-06 7.73e-06 6.54e-07 3.4e-06 1.32e-06 1.57e-06 6.45e-06 6.19e-07 4.8e-06 1.37e-06 4.22e-06 1.31e-06 7.67e-06 1.2e-06 1.3e-06 1.66e-06 2.06e-06 2.08e-06 1.35e-06 1.05e-06 1.39e-06 3.5e-06 4.73e-06 9.91e-07 5.59e-06 1.24e-06 1.31e-06 1.81e-06 6.27e-06 4.43e-06 2.7e-06 3e-07 3.58e-07 1.59e-06 2.6e-06 8.93e-07 7.82e-07 4.65e-07 1.05e-06 3.64e-07 2.79e-07 8.39e-06 5.95e-07 1.56e-07 3.4e-07 1.68e-06 4.27e-07 2.62e-07 3.41e-07
ENSG00000151131 \N 574035 2.75e-06 4.3e-06 3.33e-07 1.72e-06 4.9e-07 7.6e-07 2.26e-06 3.49e-07 1.67e-06 5.93e-07 1.93e-06 5.53e-07 3.75e-06 2.77e-07 4.95e-07 9.45e-07 1.01e-06 9.52e-07 8.15e-07 6.19e-07 7.79e-07 1.91e-06 2.47e-06 6.23e-07 3.45e-06 5.53e-07 9.28e-07 9.31e-07 3.18e-06 2.46e-06 1.81e-06 4.4e-08 4.92e-08 6.83e-07 1.27e-06 3.98e-07 1.12e-07 1.18e-07 8.35e-08 2.99e-08 4.47e-08 3.43e-06 6.87e-08 1.32e-07 1.16e-07 3.62e-07 1.11e-07 1.18e-08 6.03e-08