logo

Genes within 1Mb (chr12:105552623:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 6.26e-01 0.0562 0.115 0.154 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 3.36e-01 0.0574 0.0594 0.154 B L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 1.25e-01 0.134 0.0871 0.154 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.82e-01 0.0229 0.0558 0.154 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 9.88e-01 0.0013 0.0889 0.154 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.48e-01 0.155 0.107 0.154 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0123 0.0715 0.154 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 7.15e-01 0.028 0.0766 0.154 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 3.21e-01 0.0835 0.0839 0.154 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 3.70e-01 0.0644 0.0717 0.154 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.10e-01 0.0199 0.0828 0.154 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 9.42e-01 0.00589 0.0816 0.154 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.154 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 7.94e-01 0.0192 0.0731 0.154 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0324 0.0631 0.154 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.63e-01 0.0753 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 6.59e-01 0.03 0.0678 0.154 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 6.36e-01 0.046 0.097 0.154 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.44e-01 -0.126 0.108 0.154 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0328 0.0981 0.154 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 1.01e-01 0.0985 0.0598 0.154 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0137 0.0431 0.154 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0351 0.114 0.16 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0612 0.0784 0.16 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 2.69e-01 -0.13 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 9.43e-01 0.00678 0.0945 0.16 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0296 0.0801 0.16 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.09e-01 0.115 0.0712 0.16 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 3.57e-01 0.109 0.118 0.16 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0548 0.0479 0.16 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 6.62e-01 0.0432 0.0987 0.154 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0729 0.0706 0.154 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0418 0.112 0.154 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0485 0.0549 0.154 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 3.61e-01 0.0883 0.0965 0.154 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0208 0.0821 0.154 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0789 0.107 0.154 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0161 0.109 0.155 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 3.48e-01 0.101 0.107 0.155 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 7.69e-01 0.0287 0.0973 0.155 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 7.24e-01 0.034 0.096 0.155 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.59e-01 -0.113 0.0999 0.155 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 3.39e-01 0.118 0.123 0.155 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00711 0.0887 0.155 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.70e-01 0.0119 0.0726 0.155 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 1.85e-01 -0.165 0.124 0.154 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0749 0.078 0.154 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 1.75e-01 -0.138 0.101 0.154 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 5.57e-01 0.0786 0.134 0.154 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.99e-01 0.0978 0.0939 0.154 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.72e-01 0.105 0.0955 0.154 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 5.40e-01 0.048 0.0782 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00313 0.125 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0797 0.119 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 3.54e-01 0.124 0.134 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.127 0.153 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 8.27e-01 0.0208 0.0951 0.153 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0652 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.83e-01 0.142 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0397 0.128 0.153 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.04e-01 -0.032 0.129 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 8.24e-01 0.0212 0.0953 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.01e-01 0.0952 0.113 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 9.47e-01 0.0065 0.098 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 3.03e-01 -0.111 0.107 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.97e-01 0.16 0.124 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 3.89e-01 0.0953 0.111 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.48e-02 0.193 0.115 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.46e-01 0.0247 0.127 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 5.37e-01 0.0665 0.108 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0209 0.116 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.47e-01 0.044 0.096 0.155 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 2.84e-01 0.121 0.112 0.155 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.35e-01 -0.154 0.13 0.155 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.81e-01 -0.116 0.107 0.155 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0222 0.0986 0.155 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 7.11e-01 0.0439 0.118 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.23e-03 0.23 0.0877 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 1.35e-01 0.149 0.0992 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0809 0.0895 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0216 0.104 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 7.99e-01 0.0328 0.129 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0603 0.0874 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.98e-01 0.0446 0.115 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 1.73e-01 0.173 0.127 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 8.94e-01 0.0147 0.11 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0214 0.105 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.49e-02 0.213 0.0942 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 3.17e-01 -0.1 0.0998 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.20e-01 0.0136 0.135 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 3.59e-01 0.0862 0.0938 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0528 0.117 0.155 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 7.22e-01 0.0429 0.12 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 2.26e-01 0.12 0.0989 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 9.03e-01 0.015 0.124 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 1.19e-01 -0.184 0.118 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 3.97e-01 -0.101 0.119 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0545 0.125 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 7.28e-01 0.025 0.0719 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 1.73e-01 0.128 0.0939 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.35e-01 0.0066 0.081 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0441 0.0864 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0289 0.0851 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0727 0.081 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0512 0.111 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.02e-01 0.0131 0.107 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 6.71e-01 0.0333 0.0783 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 2.48e-01 0.118 0.102 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0213 0.105 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.97e-01 0.135 0.129 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 1.87e-01 0.113 0.0858 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.54e-01 0.00489 0.0853 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 3.84e-01 -0.116 0.133 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 3.30e-01 -0.102 0.104 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0285 0.115 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0745 0.129 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0101 0.126 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 5.29e-01 -0.066 0.105 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 2.28e-01 0.101 0.0838 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.08e-01 0.1 0.121 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0384 0.108 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.35e-01 0.0795 0.102 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0461 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.10e-01 -0.11 0.133 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.55e-01 0.132 0.115 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.44e-01 0.0395 0.0854 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0114 0.113 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 6.85e-01 0.041 0.101 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 9.18e-01 0.0107 0.104 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 8.37e-01 0.0233 0.113 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 8.11e-01 0.029 0.121 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 4.55e-01 0.0674 0.0901 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 7.08e-01 0.0362 0.0965 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.13 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.113 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 5.83e-01 0.0701 0.127 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0481 0.128 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0119 0.137 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 4.36e-01 0.0853 0.109 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.66e-01 0.00521 0.121 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 2.53e-01 -0.147 0.128 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0392 0.118 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0175 0.131 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 3.80e-01 -0.119 0.135 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.52e-01 -0.151 0.131 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0219 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 1.48e-01 -0.145 0.1 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.88e-02 -0.238 0.12 0.156 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 8.44e-01 0.0215 0.109 0.156 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 2.50e-01 -0.134 0.116 0.156 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.49e-01 0.0622 0.137 0.156 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 8.59e-01 0.0218 0.123 0.156 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.04e-01 0.0575 0.111 0.156 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0364 0.0921 0.156 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 5.78e-01 0.0683 0.123 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 3.97e-01 0.0909 0.107 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 1.55e-01 0.143 0.1 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 1.00e-02 0.306 0.118 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 7.47e-01 -0.04 0.124 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 3.36e-01 0.129 0.134 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.52e-01 -0.058 0.128 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.116 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0295 0.111 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 4.02e-01 0.0907 0.108 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0282 0.111 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 9.29e-01 0.00887 0.0998 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0438 0.109 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.57e-01 0.185 0.131 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 1.00e+00 2.41e-05 0.0974 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.05e-01 0.0195 0.0789 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.04e-01 0.0309 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 1.89e-01 0.159 0.12 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 4.01e-02 -0.228 0.11 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0506 0.123 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 4.46e-01 -0.097 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.96e-01 0.0872 0.128 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.25e-01 0.152 0.125 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0613 0.092 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00405 0.123 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 9.46e-01 0.00762 0.113 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.16e-01 0.0119 0.112 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.119 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 1.77e-01 -0.155 0.114 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0087 0.127 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0168 0.1 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0867 0.0842 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 6.39e-01 0.0772 0.164 0.144 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.19e-01 0.00933 0.0921 0.144 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.03e-01 0.139 0.166 0.144 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.67e-01 -0.157 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 2.26e-01 0.182 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 5.18e-01 0.0966 0.149 0.144 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.48e-01 0.178 0.153 0.144 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0231 0.104 0.144 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 1.89e-01 -0.163 0.124 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0721 0.0649 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.27e-02 -0.239 0.117 0.148 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 1.13e-01 -0.208 0.131 0.148 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0837 0.1 0.148 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.01e-01 0.128 0.1 0.148 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 2.41e-01 0.0983 0.0836 0.148 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.79e-01 0.0885 0.125 0.154 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0751 0.092 0.154 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 5.82e-01 0.0606 0.11 0.154 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 5.85e-01 0.0668 0.122 0.154 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.90e-01 0.161 0.122 0.154 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.95e-01 0.104 0.0991 0.154 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0188 0.0795 0.154 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.115 0.168 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 6.99e-01 0.0332 0.0856 0.168 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 3.31e-01 -0.118 0.121 0.168 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.58e-01 -0.123 0.108 0.168 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0872 0.0945 0.168 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.99e-02 0.164 0.0833 0.168 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 2.32e-01 0.153 0.127 0.168 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 3.72e-01 0.0813 0.091 0.168 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 3.35e-01 0.114 0.118 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0458 0.0808 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 5.02e-01 0.0817 0.122 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0392 0.0627 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.21e-01 0.125 0.102 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0166 0.0965 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 4.60e-02 -0.225 0.112 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 1.55e-01 -0.171 0.12 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0563 0.0881 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0891 0.13 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0783 0.0908 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0681 0.109 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.46e-01 0.0476 0.103 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0105 0.112 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.87e-02 -0.22 0.132 0.17 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.41e-01 0.0095 0.127 0.17 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 7.24e-01 0.0446 0.126 0.17 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.32e-01 0.0711 0.148 0.17 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.11e-02 0.3 0.146 0.17 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0438 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.117 0.17 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0612 0.116 0.156 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0242 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0068 0.124 0.156 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 3.98e-01 0.0887 0.105 0.156 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 1.46e-01 0.185 0.126 0.156 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.80e-01 -0.055 0.133 0.156 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 2.80e-01 0.119 0.109 0.156 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.79e-01 0.0168 0.111 0.152 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 1.17e-01 -0.179 0.114 0.152 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 8.46e-02 -0.201 0.116 0.152 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 8.29e-01 -0.017 0.0788 0.152 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.76e-01 0.00385 0.126 0.152 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.152 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 5.43e-01 0.0745 0.122 0.152 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 2.44e-01 -0.155 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 2.09e-01 -0.107 0.0847 0.167 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 3.03e-01 -0.135 0.13 0.167 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0427 0.124 0.167 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 5.98e-01 -0.051 0.0966 0.167 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 2.46e-01 0.0978 0.0839 0.167 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.45e-01 0.059 0.128 0.167 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.64e-02 -0.134 0.0804 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.89e-01 0.0179 0.128 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0253 0.0866 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.18e-01 0.0884 0.109 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 7.58e-01 0.0241 0.078 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 8.50e-01 0.0215 0.113 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 5.55e-01 0.07 0.118 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0215 0.105 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 2.34e-01 0.128 0.107 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.06e-01 0.0997 0.12 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 5.53e-02 0.171 0.0886 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 4.31e-01 0.0721 0.0915 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 6.92e-01 0.031 0.0781 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 593879 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0375 0.0956 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 9.51e-01 0.00802 0.13 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0384 0.078 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0203 0.11 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 8.27e-01 0.0243 0.111 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0531 0.0772 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 7.91e-01 0.0318 0.12 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0315 0.0585 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.72e-01 0.0687 0.0955 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0136 0.0822 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 1.14e-01 -0.171 0.108 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 9.33e-01 0.00892 0.106 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0281 0.104 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 2.80e-01 -0.127 0.117 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 4.63e-01 0.0512 0.0696 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 4.14e-01 0.104 0.126 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.27e-02 -0.187 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 6.93e-01 0.0488 0.124 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -805125 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0787 0.112 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -587410 sc-eQTL 3.81e-01 0.0943 0.107 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -751656 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0118 0.102 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 316420 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0293 0.0955 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 445299 sc-eQTL 2.74e-01 -0.114 0.104 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 566307 sc-eQTL 7.00e-01 0.0485 0.126 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 sc-eQTL 8.37e-01 -0.018 0.0874 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 317333 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0056 0.0731 0.155 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000166046 TCP11L2 -749306 eQTL 0.0203 0.0442 0.019 0.0 0.0 0.171

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000277715 \N -698136 2.74e-07 1.53e-07 5.35e-08 2.05e-07 9.24e-08 9.91e-08 2.1e-07 5.2e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.52e-07 8.59e-08 1.69e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.3e-08 4.18e-08 1.4e-07 6.32e-08 4.3e-08 1.26e-07 1.24e-07 1.58e-07 2.64e-08 1.65e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.31e-07 1e-07 1.02e-07 3.08e-08 3.59e-08 8e-08 6.34e-08 3.53e-08 4.47e-08 9.17e-08 6.57e-08 3.8e-08 3.89e-08 1.46e-07 5.24e-08 1.92e-08 5.43e-08 1.83e-08 1.2e-07 3.79e-09 5.02e-08