Genes within 1Mb (chr12:105544741:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 8.53e-01 0.0215 0.116 0.13 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 1.05e-02 -0.152 0.0589 0.13 B L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0645 0.0879 0.13 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.52e-02 -0.112 0.0556 0.13 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 6.83e-01 0.0366 0.0893 0.13 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 1.65e-01 -0.15 0.108 0.13 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 2.94e-01 0.0753 0.0717 0.13 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 6.70e-02 0.141 0.0764 0.13 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 3.05e-01 0.0875 0.085 0.13 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 6.10e-01 0.0372 0.0728 0.13 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 9.15e-01 0.00893 0.0839 0.13 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.64e-01 0.0606 0.0826 0.13 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.47e-01 -0.107 0.114 0.13 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 3.62e-01 0.0675 0.0739 0.13 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 1.77e-01 0.0864 0.0637 0.13 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.75e-01 0.056 0.0997 0.13 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0305 0.0659 0.13 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 1.85e-01 -0.125 0.094 0.13 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.105 0.13 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 5.21e-02 -0.185 0.0946 0.13 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00753 0.0585 0.13 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.42e-01 0.0256 0.0419 0.13 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.81e-01 0.0639 0.116 0.133 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0178 0.0796 0.133 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.34e-01 -0.141 0.118 0.133 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 2.64e-01 -0.107 0.0955 0.133 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 7.51e-01 0.0259 0.0813 0.133 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0681 0.0725 0.133 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 2.09e-01 0.15 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0404 0.0486 0.133 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0217 0.1 0.13 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.70e-01 0.0117 0.0717 0.13 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0405 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0565 0.0556 0.13 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00507 0.0979 0.13 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.87e-01 0.0014 0.0832 0.13 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0318 0.109 0.13 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 6.37e-03 0.299 0.108 0.131 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 1.56e-01 0.154 0.108 0.131 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0053 0.0988 0.131 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.00e-01 -0.125 0.0971 0.131 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.66e-01 0.0742 0.102 0.131 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0888 0.125 0.131 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 1.34e-01 0.135 0.0895 0.131 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0544 0.0736 0.131 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 3.86e-01 -0.107 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.84e-01 0.0113 0.0774 0.13 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.25e-02 -0.187 0.1 0.13 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0818 0.132 0.13 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0478 0.0931 0.13 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.36e-01 0.0739 0.0947 0.13 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0239 0.0775 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0849 0.132 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0527 0.126 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 8.20e-01 0.0324 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.51e-01 -0.126 0.135 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 3.77e-02 -0.209 0.0997 0.128 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.58e-01 -0.104 0.14 0.128 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0481 0.14 0.128 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.50e-01 0.0815 0.136 0.128 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 8.70e-02 -0.224 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 5.09e-03 -0.27 0.0954 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 8.98e-01 0.0149 0.116 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 9.99e-02 -0.164 0.0993 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 1.61e-02 0.263 0.108 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.65e-01 0.115 0.127 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.27e-03 0.292 0.111 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 1.88e-01 0.155 0.118 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 4.12e-01 -0.106 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 1.97e-01 -0.141 0.109 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 7.29e-01 0.0409 0.118 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 7.37e-01 0.0328 0.0974 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 9.06e-01 0.0135 0.114 0.131 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0519 0.132 0.131 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.131 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00777 0.1 0.131 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 8.50e-02 0.206 0.119 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 7.94e-01 0.0236 0.0905 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.65e-01 0.0439 0.101 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0651 0.091 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00717 0.105 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 1.98e-01 -0.168 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 5.11e-01 0.0584 0.0887 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.54e-02 0.232 0.115 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0429 0.129 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.77e-01 0.099 0.112 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0479 0.107 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.82e-02 -0.165 0.0963 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 3.56e-01 -0.094 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.81e-02 -0.285 0.136 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.95e-01 0.0375 0.0956 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 1.09e-01 0.19 0.118 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 2.27e-01 0.148 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.41e-01 0.096 0.101 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 3.59e-01 -0.115 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.85e-01 0.159 0.12 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.09e-01 -0.1 0.121 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.15e-01 0.104 0.127 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.97e-01 0.0387 0.0729 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.47e-01 0.0576 0.0955 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.31e-01 0.0176 0.0821 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 8.63e-01 0.0151 0.0876 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.51e-01 0.0163 0.0863 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 1.70e-01 -0.173 0.125 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.95e-01 0.0323 0.0822 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 1.95e-01 0.145 0.112 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.54e-01 0.0638 0.107 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0222 0.079 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0653 0.103 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.35e-01 0.102 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0493 0.131 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.27e-01 0.0423 0.0869 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 2.17e-01 0.106 0.0858 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 4.77e-01 0.0938 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 5.86e-01 0.0565 0.103 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0584 0.113 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0544 0.128 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.47e-01 0.117 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 8.21e-01 0.0235 0.104 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0115 0.0831 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 1.19e-01 -0.166 0.106 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 1.15e-01 -0.159 0.1 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0841 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 5.17e-02 -0.256 0.131 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 7.85e-01 0.0314 0.115 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0113 0.0847 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0594 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.98e-01 -0.084 0.0991 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 9.02e-01 0.0126 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0407 0.111 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 1.07e-01 -0.192 0.118 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.37e-01 0.00703 0.0887 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0486 0.0948 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0292 0.131 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 5.18e-01 0.0738 0.114 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 6.87e-01 0.0521 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0457 0.138 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.37e-01 0.00864 0.11 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 2.80e-01 -0.131 0.121 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 1.95e-01 0.173 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 7.64e-01 -0.037 0.123 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0684 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.02e-01 0.229 0.139 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 6.09e-02 -0.256 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.16e-01 0.0644 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 3.33e-01 0.101 0.104 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 3.80e-01 -0.109 0.123 0.13 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0427 0.111 0.13 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 1.28e-02 -0.293 0.117 0.13 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.36e-01 -0.208 0.139 0.13 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.19e-01 -0.101 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0425 0.113 0.13 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0175 0.094 0.13 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 7.75e-01 0.0352 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 4.68e-03 0.302 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00863 0.101 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.31e-01 0.0947 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 6.23e-01 0.0611 0.124 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0179 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.35e-01 0.0612 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0949 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 2.60e-02 0.249 0.111 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 4.02e-02 0.224 0.109 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0271 0.113 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.48e-02 -0.202 0.1 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.48e-01 0.084 0.11 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 2.36e-01 -0.157 0.133 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 1.90e-02 0.23 0.0975 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 6.14e-01 0.0404 0.08 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.56e-01 0.0073 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 2.33e-01 -0.153 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0694 0.118 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.12e-01 0.107 0.13 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.32e-02 0.286 0.133 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 9.02e-01 0.0168 0.136 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0801 0.133 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 3.24e-01 0.0962 0.0973 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 3.76e-01 0.112 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 6.99e-01 0.0451 0.116 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0871 0.115 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0753 0.122 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 9.03e-01 0.0144 0.118 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.98e-01 0.0884 0.13 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 2.66e-01 0.115 0.103 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0679 0.0865 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0057 0.156 0.126 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0759 0.0871 0.126 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.34e-01 0.124 0.157 0.126 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 9.34e-01 0.0112 0.135 0.126 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 6.55e-01 0.0641 0.143 0.126 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 2.78e-02 -0.308 0.138 0.126 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0714 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 3.38e-01 0.0949 0.0986 0.126 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.37e-01 0.0776 0.126 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 1.89e-01 0.0861 0.0654 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.35e-01 0.141 0.119 0.13 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 2.12e-01 0.165 0.132 0.13 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 7.85e-01 0.0276 0.101 0.13 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 2.17e-01 -0.125 0.101 0.13 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 8.86e-02 -0.144 0.084 0.13 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0438 0.127 0.13 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.90e-01 0.0805 0.0934 0.13 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0841 0.111 0.13 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0199 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0971 0.125 0.13 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 3.71e-01 0.0903 0.101 0.13 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 1.80e-01 0.108 0.0803 0.13 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0898 0.12 0.134 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.42e-01 0.0178 0.0891 0.134 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.56e-02 -0.281 0.125 0.134 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0737 0.113 0.134 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 1.95e-01 0.128 0.098 0.134 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.64e-02 -0.174 0.0866 0.134 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0688 0.133 0.134 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0269 0.0948 0.134 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.04e-01 0.0145 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 7.02e-01 0.0317 0.0827 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 3.17e-01 -0.125 0.124 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0986 0.0639 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0936 0.104 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.13e-01 0.0109 0.0987 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.16e-01 0.0753 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 5.08e-01 0.0815 0.123 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0831 0.0899 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.09e-01 0.167 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0137 0.093 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.53e-01 0.0834 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 6.03e-02 -0.198 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.90e-01 0.0615 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.54e-01 0.00853 0.146 0.127 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 2.92e-02 -0.302 0.137 0.127 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 1.88e-01 -0.182 0.137 0.127 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 4.30e-01 0.128 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0695 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 3.62e-02 0.316 0.149 0.127 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 3.83e-01 0.112 0.128 0.127 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0457 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 3.90e-01 0.107 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0826 0.13 0.131 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.70e-01 -0.151 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 3.20e-01 -0.133 0.133 0.131 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.82e-02 0.274 0.138 0.131 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 3.84e-01 0.1 0.115 0.131 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0866 0.111 0.133 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0567 0.115 0.133 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 7.54e-01 0.0369 0.118 0.133 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0688 0.0792 0.133 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 8.26e-01 0.0281 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.22e-02 0.229 0.112 0.133 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 2.26e-01 -0.149 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 6.94e-01 0.0547 0.139 0.133 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 5.00e-01 -0.06 0.0888 0.133 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 2.08e-01 0.172 0.136 0.133 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0603 0.13 0.133 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 7.74e-01 -0.029 0.101 0.133 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00547 0.088 0.133 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 9.80e-01 0.00339 0.134 0.133 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 7.20e-01 0.0304 0.0847 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 1.35e-02 -0.318 0.128 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 8.16e-03 -0.23 0.086 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00549 0.11 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 1.33e-01 -0.118 0.0784 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 1.20e-01 0.177 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 7.69e-01 0.0351 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 3.64e-02 0.221 0.105 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 2.16e-01 0.134 0.108 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 3.08e-01 0.125 0.122 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 9.33e-01 0.00764 0.0911 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00874 0.0934 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 9.71e-02 -0.132 0.0791 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 585997 sc-eQTL 8.62e-01 -0.017 0.0975 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 1.18e-01 -0.207 0.132 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.38e-01 0.0618 0.0794 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.39e-02 0.225 0.111 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 6.22e-01 0.0557 0.113 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00789 0.0787 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 8.16e-01 0.0283 0.122 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0554 0.0594 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0124 0.0972 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 4.10e-01 -0.069 0.0835 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 5.53e-01 0.0656 0.11 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 1.94e-01 -0.141 0.109 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 9.93e-01 0.000994 0.108 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0562 0.121 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 8.86e-02 -0.122 0.0712 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 4.10e-01 -0.107 0.13 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 5.77e-03 0.305 0.109 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0917 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -813007 sc-eQTL 9.28e-03 0.293 0.112 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -595292 sc-eQTL 1.32e-01 0.164 0.109 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0869 0.104 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 308538 sc-eQTL 1.23e-01 -0.15 0.0965 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 437417 sc-eQTL 3.42e-01 0.101 0.106 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 558425 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0633 0.128 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -757188 sc-eQTL 3.28e-02 0.189 0.0878 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 309451 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0257 0.0743 0.131 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -759538 eQTL 0.00949 0.0368 0.0142 0.00288 0.0 0.153
ENSG00000136044 APPL2 308538 eQTL 4.08e-05 -0.107 0.026 0.0 0.0 0.153


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 308538 1.3e-06 9.48e-07 2.81e-07 6.94e-07 2.98e-07 4.82e-07 1.33e-06 3.37e-07 1.35e-06 4.19e-07 1.48e-06 6.16e-07 2.02e-06 2.83e-07 5.79e-07 8.25e-07 8.43e-07 5.99e-07 5.88e-07 6.8e-07 4.43e-07 1.22e-06 8.95e-07 6.51e-07 2.01e-06 4.11e-07 7.33e-07 7.59e-07 1.25e-06 1.21e-06 6.02e-07 1.29e-07 2.16e-07 6.35e-07 4.66e-07 4.6e-07 4.61e-07 1.69e-07 3.2e-07 2.42e-07 2.92e-07 1.62e-06 5.29e-08 4.12e-08 1.65e-07 1.14e-07 2.38e-07 7.69e-08 1.04e-07
ENSG00000151131 \N 558425 5.74e-07 2.56e-07 7.16e-08 2.61e-07 1.07e-07 1.26e-07 3.57e-07 8.11e-08 2.6e-07 1.6e-07 3.25e-07 2.22e-07 4.34e-07 8.55e-08 1.07e-07 1.39e-07 8.64e-08 2.9e-07 9.19e-08 7.4e-08 1.35e-07 2.3e-07 2.2e-07 6.65e-08 3.98e-07 2.07e-07 1.72e-07 1.67e-07 1.98e-07 2.1e-07 1.86e-07 5.3e-08 4.96e-08 1.23e-07 1.33e-07 5.05e-08 6.48e-08 5.53e-08 4.72e-08 7.53e-08 5.19e-08 2.65e-07 3.65e-08 1.53e-08 8.01e-08 8.76e-09 9.38e-08 0.0 4.59e-08