logo

Genes within 1Mb (chr12:105542316:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.45e-01 0.0709 0.0926 0.259 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.98e-02 -0.0899 0.0475 0.259 B L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0346 0.0704 0.259 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0411 0.0448 0.259 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 5.74e-01 0.0402 0.0715 0.259 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0371 0.0865 0.259 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 6.29e-01 0.0278 0.0575 0.259 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.02e-01 0.101 0.0613 0.259 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.15e-01 0.107 0.0674 0.259 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 3.96e-01 0.0492 0.0578 0.259 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.83e-01 0.0184 0.0667 0.259 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 6.08e-01 0.0337 0.0657 0.259 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0804 0.0908 0.259 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 6.21e-01 0.0291 0.0589 0.259 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.11e-01 0.0419 0.0508 0.259 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.64e-01 0.0593 0.0809 0.259 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0118 0.0535 0.259 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0605 0.0765 0.259 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0933 0.0853 0.259 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 4.69e-02 -0.153 0.0767 0.259 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.59e-01 0.0352 0.0474 0.259 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00276 0.034 0.259 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.41e-01 0.0726 0.094 0.266 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0185 0.0647 0.266 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 1.84e-01 -0.128 0.0962 0.266 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0218 0.0779 0.266 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 8.36e-01 0.0137 0.0661 0.266 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00928 0.0591 0.266 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 1.11e-01 0.155 0.0967 0.266 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0428 0.0395 0.266 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 3.01e-01 0.0828 0.0799 0.259 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00356 0.0574 0.259 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 5.09e-01 -0.06 0.0907 0.259 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.06e-02 -0.0806 0.0443 0.259 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.05e-01 0.0297 0.0784 0.259 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 8.44e-01 0.0132 0.0667 0.259 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0622 0.0869 0.259 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.97e-02 0.191 0.0875 0.26 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 9.85e-02 0.144 0.0865 0.26 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00679 0.0791 0.26 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0682 0.0779 0.26 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 9.89e-01 0.00118 0.0814 0.26 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 9.66e-02 -0.166 0.0994 0.26 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 6.74e-01 0.0303 0.072 0.26 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.54e-01 -0.035 0.059 0.26 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 5.88e-02 -0.187 0.0986 0.259 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0435 0.0623 0.259 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 3.18e-02 -0.174 0.0804 0.259 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0111 0.107 0.259 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 6.58e-01 0.0333 0.0751 0.259 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 1.73e-01 0.104 0.0761 0.259 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.24e-01 0.0958 0.0621 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0589 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 4.13e-01 -0.078 0.0952 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.94e-01 0.0737 0.107 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 3.39e-01 -0.073 0.0762 0.253 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 8.70e-01 0.0174 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 7.67e-01 0.0305 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0796 0.104 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 2.08e-02 -0.178 0.0764 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0347 0.092 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0658 0.0794 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 2.34e-01 0.104 0.0871 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.36e-02 0.18 0.1 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 6.10e-03 0.245 0.0883 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 6.06e-02 0.176 0.0932 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0101 0.104 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0532 0.0877 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 5.77e-01 0.0529 0.0947 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00219 0.0783 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 6.44e-01 0.0425 0.0918 0.261 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0415 0.106 0.261 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 9.58e-01 0.00462 0.0874 0.261 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.72e-01 -0.013 0.0804 0.261 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.51e-01 0.138 0.096 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 3.03e-01 0.0749 0.0725 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.06e-01 0.042 0.0813 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0555 0.0731 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0167 0.0846 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.22e-01 -0.128 0.105 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0246 0.0713 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 2.62e-02 0.207 0.0926 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 7.53e-01 0.0325 0.103 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.18e-01 0.0579 0.0894 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0608 0.0855 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000699 0.0773 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 1.70e-01 -0.111 0.0808 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 1.51e-01 -0.158 0.109 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.27e-01 0.0607 0.0762 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.67e-01 0.0543 0.0947 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.56e-01 0.139 0.0972 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 2.17e-01 0.0995 0.0804 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 1.76e-01 -0.136 0.1 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 4.23e-01 0.0771 0.0961 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0765 0.0968 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.41e-01 0.0337 0.102 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.79e-01 0.00891 0.0584 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.95e-01 0.0794 0.0756 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 6.91e-01 0.0259 0.0651 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00915 0.0694 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 6.83e-01 -0.028 0.0684 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.61e-01 -0.112 0.0996 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0371 0.0652 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 2.02e-01 0.113 0.0887 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.87e-01 0.113 0.0857 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0245 0.0632 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 8.44e-01 0.0162 0.0823 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.85e-01 0.0232 0.0848 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0673 0.105 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 1.88e-01 0.0916 0.0693 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.94e-01 0.0894 0.0686 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 7.51e-01 0.034 0.107 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0115 0.0841 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 9.84e-01 0.00186 0.0921 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.44e-01 -0.034 0.104 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.101 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0579 0.084 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.81e-01 0.0101 0.0675 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 3.77e-01 0.0855 0.0966 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0408 0.0862 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 1.01e-01 -0.133 0.081 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 2.57e-02 -0.2 0.0892 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.48e-02 -0.238 0.105 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.26e-01 0.0587 0.0925 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.07e-01 0.0167 0.0683 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0467 0.0898 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0447 0.0801 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.52e-01 0.0372 0.0824 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0191 0.0893 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0957 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.48e-01 0.023 0.0716 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0474 0.0765 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 8.60e-01 0.0189 0.107 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.89e-01 -0.025 0.0934 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0359 0.105 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0672 0.106 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 8.35e-01 0.0236 0.113 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.29e-01 0.0568 0.09 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.95e-01 -0.129 0.0992 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000515 0.104 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.95e-01 0.025 0.096 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 8.82e-01 0.0157 0.106 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.35e-01 0.105 0.109 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 2.78e-03 -0.316 0.104 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.61e-01 0.0305 0.1 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00985 0.0815 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 5.69e-02 -0.187 0.0976 0.26 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0108 0.0884 0.26 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.80e-03 -0.254 0.0928 0.26 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 1.98e-01 -0.143 0.111 0.26 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0271 0.0998 0.26 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.50e-01 0.0288 0.09 0.26 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0499 0.0748 0.26 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.84e-01 0.105 0.0975 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 4.24e-02 0.173 0.0845 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 4.68e-01 0.0582 0.08 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.97e-02 0.187 0.0945 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 9.93e-01 0.000829 0.0985 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00742 0.107 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0571 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 7.45e-01 0.0301 0.0923 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 3.45e-01 0.0858 0.0906 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 5.77e-02 0.168 0.0879 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0461 0.091 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.68e-02 -0.144 0.0812 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.52e-01 0.0283 0.0894 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 1.58e-01 -0.152 0.107 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.72e-01 0.0574 0.0797 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.35e-01 0.0506 0.0646 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.46e-01 0.119 0.102 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 8.64e-01 0.0171 0.1 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.83e-02 -0.175 0.0917 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.67e-01 0.0439 0.102 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.30e-01 0.103 0.105 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 3.70e-01 0.0951 0.106 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.57e-01 0.0612 0.104 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 9.94e-01 0.000548 0.0763 0.26 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.15e-01 0.0824 0.101 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 6.69e-01 0.04 0.0933 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0588 0.0923 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0855 0.0976 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0305 0.0945 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0701 0.104 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.46e-01 0.063 0.0825 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0912 0.0691 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0282 0.131 0.252 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 6.35e-01 -0.035 0.0735 0.252 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 5.91e-01 0.0716 0.133 0.252 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0733 0.113 0.252 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 6.00e-01 0.0634 0.12 0.252 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 1.21e-01 -0.184 0.118 0.252 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0663 0.123 0.252 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.81e-01 0.0589 0.0832 0.252 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00626 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.50e-01 0.017 0.0532 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0102 0.0965 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 4.71e-01 0.0774 0.107 0.252 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0161 0.0821 0.252 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 8.73e-01 0.0131 0.082 0.252 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.51e-01 0.0517 0.0685 0.252 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 4.27e-01 0.0801 0.101 0.259 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.17e-01 0.0173 0.0745 0.259 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0155 0.0888 0.259 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 4.41e-01 0.0762 0.0986 0.259 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0515 0.0993 0.259 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.05e-02 0.145 0.0797 0.259 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.00e-01 0.0434 0.0642 0.259 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 6.27e-01 0.0465 0.0957 0.276 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 1.15e-01 0.112 0.0707 0.276 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 3.81e-02 -0.209 0.0999 0.276 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0991 0.0899 0.276 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 5.56e-01 0.0464 0.0786 0.276 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 9.49e-01 0.00452 0.0699 0.276 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.64e-01 0.0319 0.106 0.276 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 7.18e-01 0.0274 0.0757 0.276 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0958 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.51e-01 0.0124 0.0658 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0769 0.099 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 8.22e-02 -0.0886 0.0507 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0576 0.0831 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 9.31e-01 0.00681 0.0785 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.61e-01 -0.068 0.0921 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 5.77e-01 0.055 0.0986 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0428 0.0721 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 4.56e-01 0.0796 0.107 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0702 0.0743 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.43e-01 0.0292 0.0889 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0598 0.0845 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0234 0.0913 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.73e-01 -0.127 0.115 0.267 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.05e-02 -0.199 0.109 0.267 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 8.20e-01 -0.025 0.109 0.267 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.129 0.267 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.03e-01 0.049 0.128 0.267 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 5.28e-01 0.0758 0.12 0.267 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 3.73e-02 0.211 0.1 0.267 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0449 0.0957 0.26 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.91e-01 0.0134 0.0976 0.26 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0598 0.102 0.26 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0137 0.0864 0.26 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0364 0.105 0.26 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 9.35e-02 0.183 0.109 0.26 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 7.42e-02 0.161 0.0897 0.26 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 8.73e-01 -0.014 0.0879 0.26 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 2.14e-01 -0.113 0.0906 0.26 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.14e-01 -0.034 0.0929 0.26 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0974 0.0623 0.26 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 5.99e-01 0.0529 0.1 0.26 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 6.36e-01 0.0423 0.0893 0.26 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0525 0.0972 0.26 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 6.71e-01 -0.047 0.11 0.271 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 9.62e-02 -0.117 0.0702 0.271 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 6.09e-01 0.0558 0.109 0.271 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0139 0.103 0.271 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0483 0.0804 0.271 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 8.82e-01 0.0104 0.0701 0.271 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.43e-01 0.0349 0.106 0.271 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0104 0.0675 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.69e-01 -0.142 0.103 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 1.02e-02 -0.178 0.0688 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 9.86e-01 0.00159 0.0881 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0613 0.0628 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 1.27e-01 0.139 0.0909 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 1.50e-01 0.137 0.0951 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 1.78e-01 0.114 0.0842 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.52e-02 0.149 0.086 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.37e-01 0.116 0.0977 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 4.23e-01 0.0584 0.0729 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0237 0.0747 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0397 0.0637 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 583572 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0216 0.078 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 1.33e-01 -0.16 0.106 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 8.18e-01 0.0147 0.0637 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 1.07e-01 0.144 0.0892 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 2.73e-01 0.0988 0.09 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0138 0.0628 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 9.32e-01 0.00831 0.0972 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0687 0.0473 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 8.06e-01 -0.019 0.0776 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0241 0.0668 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0686 0.088 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0468 0.0859 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 7.15e-01 -0.031 0.0848 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 2.46e-01 -0.111 0.0953 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 2.36e-01 -0.067 0.0564 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 2.81e-01 0.0947 0.0877 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 8.52e-01 0.0188 0.1 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -815432 sc-eQTL 1.35e-01 0.136 0.0909 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -597717 sc-eQTL 8.28e-02 0.152 0.0873 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -761963 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0786 0.0834 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 306113 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0982 0.0779 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 434992 sc-eQTL 7.96e-01 0.0221 0.0855 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 556000 sc-eQTL 6.29e-02 -0.191 0.102 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -759613 sc-eQTL 3.26e-01 0.0702 0.0713 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 307026 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0262 0.0598 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 306113 eQTL 0.000917 -0.0698 0.021 0.0 0.0 0.283

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 556000 4.68e-07 2.5e-07 7.45e-08 2.53e-07 1.07e-07 1.28e-07 3.33e-07 7.46e-08 2.26e-07 1.37e-07 2.68e-07 1.82e-07 3.77e-07 8.42e-08 8.45e-08 1.17e-07 8.53e-08 2.83e-07 9.19e-08 8.87e-08 1.35e-07 2.15e-07 2.11e-07 5.11e-08 3.41e-07 1.94e-07 1.39e-07 1.54e-07 1.6e-07 2.19e-07 1.59e-07 5.24e-08 4.76e-08 1.03e-07 1.01e-07 4.86e-08 6.57e-08 5.71e-08 4.74e-08 8.61e-08 4.79e-08 2.71e-07 3.4e-08 2.06e-08 6.59e-08 1.05e-08 8.94e-08 0.0 4.68e-08