logo

Genes within 1Mb (chr12:105539474:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 4.84e-01 0.0641 0.0914 0.263 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 9.99e-02 -0.0777 0.047 0.263 B L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0295 0.0695 0.263 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0305 0.0443 0.263 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 4.41e-01 0.0545 0.0705 0.263 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0249 0.0853 0.263 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 6.23e-01 0.0279 0.0568 0.263 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.51e-02 0.108 0.0604 0.263 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 1.55e-01 0.0952 0.0666 0.263 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 3.51e-01 0.0534 0.0571 0.263 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00049 0.0659 0.263 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 5.98e-01 0.0343 0.0649 0.263 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 3.68e-01 -0.081 0.0897 0.263 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.20e-01 0.0209 0.0582 0.263 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.10e-01 0.0332 0.0502 0.263 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.61e-01 0.0465 0.0798 0.263 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0218 0.0528 0.263 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0614 0.0755 0.263 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0784 0.0842 0.263 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.15e-02 -0.155 0.0756 0.263 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 5.22e-01 0.03 0.0468 0.263 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00224 0.0336 0.263 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 3.54e-01 0.0863 0.0929 0.27 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00898 0.064 0.27 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 1.51e-01 -0.137 0.0951 0.27 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0234 0.0771 0.27 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 8.45e-01 0.0128 0.0654 0.27 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 9.76e-01 0.00176 0.0585 0.27 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 1.41e-01 0.141 0.0957 0.27 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0469 0.0391 0.27 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 3.60e-01 0.0724 0.0788 0.263 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 9.02e-01 0.00701 0.0566 0.263 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0659 0.0894 0.263 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 6.62e-02 -0.0807 0.0437 0.263 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.10e-01 0.0186 0.0773 0.263 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.30e-01 0.0141 0.0657 0.263 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0591 0.0857 0.263 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 4.42e-02 0.175 0.0864 0.264 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 1.15e-01 0.135 0.0854 0.264 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0095 0.078 0.264 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0735 0.0768 0.264 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00576 0.0803 0.264 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 6.79e-02 -0.18 0.0979 0.264 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.36e-01 0.0239 0.0711 0.264 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.05e-01 -0.022 0.0582 0.264 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.51e-02 -0.188 0.0974 0.263 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.36e-01 -0.048 0.0615 0.263 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 2.72e-02 -0.177 0.0794 0.263 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00298 0.105 0.263 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 6.05e-01 0.0384 0.0741 0.263 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 2.38e-01 0.0891 0.0753 0.263 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 1.16e-01 0.0968 0.0613 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0589 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.13e-01 -0.078 0.0952 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.94e-01 0.0737 0.107 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 3.39e-01 -0.073 0.0762 0.253 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.70e-01 0.0174 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.67e-01 0.0305 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0497 0.103 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 2.87e-02 -0.166 0.0756 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0164 0.0909 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0503 0.0785 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 1.71e-01 0.118 0.0859 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.24e-02 0.202 0.0989 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.17e-03 0.237 0.0873 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 3.60e-02 0.194 0.0919 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 8.77e-01 -0.016 0.103 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0358 0.0866 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 7.60e-01 0.0287 0.0935 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.32e-01 0.00662 0.0773 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 8.47e-01 0.0175 0.0907 0.265 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0215 0.105 0.265 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0132 0.0863 0.265 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0324 0.0794 0.265 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.39e-01 0.112 0.0947 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.25e-01 0.0571 0.0715 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.79e-01 0.0445 0.0801 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0518 0.0719 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 9.51e-01 0.00516 0.0833 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 1.95e-01 -0.134 0.103 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0318 0.0702 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.15e-02 0.211 0.091 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.09e-01 0.038 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 5.97e-01 0.0467 0.0882 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0528 0.0844 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00451 0.0763 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 1.92e-01 -0.104 0.0798 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 2.09e-01 -0.136 0.108 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 4.15e-01 0.0614 0.0752 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.12e-01 0.0614 0.0935 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 1.74e-01 0.131 0.0961 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 2.96e-01 0.0834 0.0795 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 2.49e-01 -0.114 0.0989 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 3.47e-01 0.0894 0.095 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0678 0.0957 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 6.54e-01 0.0452 0.101 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.28e-01 0.00524 0.0578 0.266 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.94e-01 0.0788 0.075 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.99e-01 0.025 0.0645 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0395 0.0688 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0267 0.0678 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 3.17e-01 -0.099 0.0988 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0488 0.0646 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.41e-01 0.103 0.088 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.35e-01 0.101 0.0847 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0211 0.0624 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 9.70e-01 0.0031 0.0812 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 6.69e-01 0.0358 0.0837 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0791 0.103 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 1.98e-01 0.0885 0.0685 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.69e-01 0.0753 0.0678 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 9.34e-01 0.00877 0.106 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0135 0.083 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 8.86e-01 0.013 0.0909 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0329 0.103 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 2.25e-01 0.121 0.0993 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0537 0.083 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00379 0.0667 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 4.72e-01 0.0688 0.0955 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0427 0.0851 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 1.14e-01 -0.127 0.08 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.15e-02 -0.181 0.0883 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 2.15e-02 -0.241 0.104 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 4.48e-01 0.0695 0.0913 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.92e-01 0.0178 0.0675 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0527 0.0887 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.95e-01 -0.054 0.0791 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 6.19e-01 0.0405 0.0813 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0116 0.0882 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 2.90e-01 -0.1 0.0945 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.50e-01 0.0134 0.0707 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0493 0.0756 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 6.80e-01 0.0437 0.106 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0317 0.0921 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0248 0.104 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0662 0.104 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 7.76e-01 0.0316 0.111 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 5.71e-01 0.0504 0.0887 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.01e-01 -0.126 0.0978 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0307 0.103 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.38e-01 0.0194 0.0946 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 7.77e-01 0.0295 0.104 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 3.28e-01 0.105 0.108 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 1.02e-03 -0.341 0.102 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.05e-01 0.0243 0.0986 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.64e-01 0.00361 0.0803 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.32e-02 -0.174 0.0966 0.264 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0215 0.0873 0.264 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 6.25e-03 -0.253 0.0917 0.264 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 2.35e-01 -0.131 0.11 0.264 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0157 0.0987 0.264 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.81e-01 0.0134 0.089 0.264 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0448 0.0739 0.264 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 3.29e-01 0.0944 0.0965 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 5.74e-02 0.16 0.0837 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 5.10e-01 0.0521 0.0791 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 3.91e-02 0.194 0.0933 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.10e-01 0.011 0.0974 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0148 0.105 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0689 0.101 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 8.37e-01 0.0188 0.0912 0.264 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 3.26e-01 0.0879 0.0893 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 6.76e-02 0.159 0.0867 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.32e-01 -0.043 0.0897 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.27e-02 -0.156 0.0799 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 7.79e-01 0.0247 0.0881 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 1.01e-01 -0.173 0.105 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 4.06e-01 0.0654 0.0786 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 3.43e-01 0.0605 0.0637 0.265 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.97e-01 0.106 0.101 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 9.23e-01 0.0096 0.0988 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 1.21e-01 -0.141 0.0906 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.77e-01 0.0715 0.1 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 3.57e-01 0.0957 0.104 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 5.36e-01 0.0647 0.104 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 6.53e-01 0.0461 0.103 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.20e-01 0.0076 0.0752 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 4.94e-01 0.0681 0.0995 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 6.80e-01 0.038 0.092 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0684 0.091 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0796 0.0962 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0418 0.0932 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0626 0.103 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 5.99e-01 0.0429 0.0814 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 2.42e-01 -0.08 0.0682 0.265 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0442 0.127 0.256 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.12e-01 -0.017 0.0716 0.256 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.52e-01 0.0769 0.129 0.256 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0749 0.11 0.256 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 5.75e-01 0.0659 0.117 0.256 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 1.17e-01 -0.181 0.114 0.256 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0727 0.119 0.256 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 4.83e-01 0.0569 0.0809 0.256 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 9.94e-01 0.000731 0.1 0.257 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 7.46e-01 0.017 0.0525 0.257 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00914 0.0952 0.257 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.82e-01 0.0744 0.106 0.257 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0224 0.0809 0.257 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 9.10e-01 0.00918 0.0809 0.257 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 4.52e-01 0.0509 0.0675 0.257 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 4.35e-01 0.0782 0.1 0.263 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 8.15e-01 0.0173 0.074 0.263 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0159 0.0882 0.263 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 5.70e-01 0.0558 0.098 0.263 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0654 0.0986 0.263 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0793 0.263 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 4.01e-01 0.0535 0.0637 0.263 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 6.39e-01 0.0447 0.0952 0.28 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 1.10e-01 0.113 0.0703 0.28 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.33e-02 -0.202 0.0994 0.28 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 2.04e-01 -0.114 0.0893 0.28 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 8.70e-01 0.0128 0.0782 0.28 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0154 0.0695 0.28 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.07e-01 0.0396 0.105 0.28 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.99e-01 0.0192 0.0753 0.28 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.36e-01 0.112 0.0943 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 7.48e-01 0.0209 0.0648 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0808 0.0975 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 7.45e-02 -0.0896 0.05 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0642 0.0819 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.26e-01 0.017 0.0774 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0432 0.0909 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.15e-01 0.0355 0.097 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0385 0.0709 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.66e-01 0.0766 0.105 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0543 0.0731 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.22e-01 0.0197 0.0875 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0782 0.083 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0251 0.0898 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.114 0.273 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 4.51e-02 -0.219 0.108 0.273 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0604 0.108 0.273 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 3.15e-01 0.129 0.128 0.273 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.18e-01 0.103 0.127 0.273 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 2.48e-01 0.138 0.119 0.273 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 3.43e-02 0.212 0.0994 0.273 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0345 0.0948 0.264 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 6.38e-01 0.0455 0.0966 0.264 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0692 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0165 0.0855 0.264 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 6.64e-01 -0.045 0.104 0.264 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.56e-02 0.192 0.107 0.264 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 1.26e-01 0.137 0.0889 0.264 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0306 0.0866 0.265 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0972 0.0894 0.265 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0422 0.0915 0.265 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 6.52e-02 -0.114 0.0612 0.265 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 6.71e-01 0.0421 0.099 0.265 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 6.41e-01 0.0411 0.088 0.265 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0644 0.0958 0.265 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0589 0.111 0.274 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 1.30e-01 -0.107 0.0704 0.274 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 6.77e-01 0.0455 0.109 0.274 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 9.25e-01 0.00977 0.103 0.274 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0465 0.0805 0.274 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 7.32e-01 0.0241 0.0702 0.274 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.95e-01 0.0277 0.107 0.274 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 8.02e-01 -0.017 0.0676 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.40e-01 -0.12 0.102 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 2.06e-02 -0.159 0.0682 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0012 0.0871 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0498 0.0622 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 1.26e-01 0.138 0.0899 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 9.61e-02 0.157 0.0939 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 2.24e-01 0.102 0.0834 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.12e-02 0.144 0.085 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 2.85e-01 0.103 0.0962 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 5.23e-01 0.046 0.0718 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0181 0.0736 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0373 0.0627 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 580730 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000833 0.0769 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 1.77e-01 -0.141 0.104 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 8.67e-01 0.0105 0.0627 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 8.80e-02 0.15 0.0878 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 3.09e-01 0.0904 0.0886 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00583 0.0618 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 9.85e-01 0.00185 0.0957 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0621 0.0466 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0295 0.0764 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 7.73e-01 -0.019 0.0657 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0515 0.0867 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0453 0.0848 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00533 0.0838 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 1.89e-01 -0.124 0.094 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0774 0.0556 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0233 0.102 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 2.93e-01 0.0913 0.0865 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00681 0.0991 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818274 sc-eQTL 1.74e-01 0.122 0.0898 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -600559 sc-eQTL 9.12e-02 0.146 0.0862 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -764805 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0768 0.0823 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 303271 sc-eQTL 1.77e-01 -0.104 0.0768 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 432150 sc-eQTL 8.73e-01 0.0135 0.0844 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 553158 sc-eQTL 4.79e-02 -0.2 0.101 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762455 sc-eQTL 3.42e-01 0.067 0.0704 0.265 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 304184 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0122 0.059 0.265 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 303271 eQTL 0.000667 -0.0719 0.0211 0.0 0.0 0.282

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000151131 \N 553158 7.23e-07 3.55e-07 9.71e-08 3.05e-07 9.26e-08 1.71e-07 4.53e-07 1.09e-07 3.62e-07 2.14e-07 4.74e-07 3.48e-07 6e-07 1.1e-07 1.78e-07 2.08e-07 1.85e-07 3.44e-07 1.69e-07 1.31e-07 1.91e-07 3.1e-07 2.81e-07 1.27e-07 6.02e-07 2.36e-07 2.43e-07 2.19e-07 2.76e-07 4.1e-07 2.11e-07 7.59e-08 5.58e-08 1.25e-07 2.84e-07 7.92e-08 9.11e-08 7.62e-08 4.11e-08 5.12e-08 4.82e-08 3.55e-07 1.7e-08 2.06e-08 9.79e-08 1.84e-08 8.01e-08 7.25e-09 5.05e-08