logo

Genes within 1Mb (chr12:105538936:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.06e-01 -0.137 0.134 0.113 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.44e-01 0.00491 0.0695 0.113 B L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 8.46e-01 0.0199 0.102 0.113 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.95e-01 0.0554 0.065 0.113 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 8.06e-01 0.0255 0.104 0.113 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 9.38e-01 0.00978 0.125 0.113 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.07e-01 -0.105 0.0831 0.113 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 1.37e-01 0.133 0.0889 0.113 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 2.03e-01 -0.123 0.0966 0.113 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.70e-01 -0.114 0.0825 0.113 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0818 0.0953 0.113 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0417 0.0941 0.113 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.47e-01 0.122 0.13 0.113 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0802 0.0841 0.113 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0248 0.0728 0.113 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.08e-01 0.0952 0.115 0.113 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 5.55e-01 0.0449 0.076 0.113 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0431 0.109 0.113 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.57e-01 0.138 0.121 0.113 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.113 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0371 0.0674 0.113 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0366 0.0483 0.113 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.68e-01 0.0226 0.136 0.117 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 7.79e-02 -0.164 0.0927 0.117 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 3.55e-01 -0.129 0.139 0.117 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.99e-01 -0.144 0.112 0.117 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0874 0.0952 0.117 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.75e-01 0.116 0.0849 0.117 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 7.92e-01 0.037 0.14 0.117 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.46e-02 -0.0954 0.0568 0.117 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 9.28e-01 0.0105 0.116 0.113 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0881 0.0829 0.113 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.13e-01 -0.208 0.131 0.113 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0582 0.0645 0.113 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 5.48e-01 0.0683 0.113 0.113 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.62e-01 0.088 0.0963 0.113 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 6.09e-01 0.0645 0.126 0.113 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.75e-01 -0.113 0.127 0.114 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 6.78e-01 0.0519 0.125 0.114 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0594 0.113 0.114 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.35e-01 0.0531 0.112 0.114 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 8.26e-01 0.0257 0.117 0.114 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.98e-02 0.294 0.142 0.114 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.89e-01 -0.11 0.103 0.114 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 3.84e-01 0.0737 0.0845 0.114 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 6.34e-02 0.27 0.144 0.113 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00522 0.0913 0.113 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 5.79e-01 0.0662 0.119 0.113 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.28e-01 -0.238 0.155 0.113 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 6.77e-01 0.0458 0.11 0.113 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.59e-01 -0.158 0.111 0.113 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 2.58e-01 -0.103 0.0912 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.24e-01 0.122 0.152 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 2.93e-01 -0.152 0.144 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.09e-01 0.0834 0.163 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.76e-01 0.0649 0.155 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 3.38e-01 -0.111 0.115 0.105 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 4.70e-01 -0.116 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 8.57e-02 -0.276 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.09e-01 -0.129 0.156 0.105 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.35e-01 -0.12 0.154 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 7.40e-01 0.0377 0.114 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 9.28e-02 0.227 0.134 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.12e-01 0.146 0.117 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0495 0.129 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 4.18e-01 -0.12 0.148 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.16e-01 -0.207 0.131 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.25e-01 0.11 0.138 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0131 0.151 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0866 0.128 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.98e-01 -0.144 0.138 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.55e-01 0.13 0.114 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 2.32e-01 0.16 0.133 0.112 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 5.12e-01 -0.101 0.154 0.112 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 4.25e-01 -0.102 0.127 0.112 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 5.53e-01 0.0697 0.117 0.112 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.23e-01 -0.138 0.139 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.16e-01 0.165 0.105 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 5.45e-01 0.0713 0.118 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.09e-01 -0.133 0.105 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 5.66e-01 0.0702 0.122 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.99e-01 0.128 0.152 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0825 0.103 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 7.21e-01 0.0483 0.135 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.04e-01 -0.126 0.151 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 5.58e-02 0.25 0.13 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0287 0.125 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.113 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0657 0.119 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.63e-01 0.224 0.16 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00413 0.112 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.53e-01 -0.104 0.139 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 1.38e-01 -0.209 0.14 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 5.37e-01 0.0719 0.116 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 7.41e-01 0.0478 0.145 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.139 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 2.63e-01 0.156 0.139 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.55e-01 0.136 0.147 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 6.66e-01 0.0365 0.0842 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0524 0.108 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0989 0.0928 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0328 0.0992 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0732 0.0976 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 6.32e-01 0.0685 0.143 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.00e-01 -0.119 0.0928 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.84e-01 0.00259 0.127 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 2.56e-01 -0.14 0.123 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.80e-01 -0.121 0.09 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0463 0.118 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 9.10e-01 0.0137 0.121 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 4.02e-01 0.125 0.149 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.08e-01 -0.159 0.0989 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 2.66e-01 0.11 0.0982 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 1.62e-01 -0.216 0.154 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 3.70e-01 -0.109 0.121 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.91e-01 -0.174 0.132 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 5.99e-01 0.0791 0.15 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 8.56e-01 0.0264 0.146 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 7.96e-01 0.0314 0.121 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 2.22e-01 0.119 0.0971 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.74e-01 0.1 0.139 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 3.78e-01 0.11 0.124 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.70e-01 0.13 0.117 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 4.40e-01 0.1 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 5.97e-01 0.0813 0.154 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0384 0.133 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0282 0.0984 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 5.17e-01 0.0839 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 6.71e-01 0.049 0.115 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.06e-01 -0.191 0.118 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.97e-03 0.367 0.126 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 6.20e-01 0.0684 0.138 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0984 0.103 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000502 0.11 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 2.89e-01 0.161 0.151 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 4.00e-01 0.111 0.132 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0415 0.149 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0098 0.15 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 9.95e-02 0.262 0.158 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00677 0.127 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 2.55e-01 0.16 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 7.02e-02 0.275 0.151 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00971 0.14 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0999 0.154 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.87e-01 -0.138 0.159 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 8.54e-01 0.0286 0.155 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.08e-01 -0.234 0.145 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 3.00e-01 -0.123 0.118 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 1.87e-01 0.188 0.142 0.115 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 8.38e-01 0.0262 0.128 0.115 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.43e-01 0.2 0.136 0.115 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.34e-01 -0.156 0.161 0.115 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 8.24e-01 0.0322 0.145 0.115 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 6.01e-01 0.0684 0.13 0.115 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.83e-01 0.00237 0.109 0.115 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00583 0.142 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0587 0.124 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.02e-01 0.0143 0.116 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 9.84e-02 0.229 0.138 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.14e-01 -0.178 0.143 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.58e-01 0.143 0.155 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.94e-01 0.127 0.148 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 8.11e-01 0.0321 0.134 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0232 0.129 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 1.27e-01 0.192 0.125 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0751 0.129 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.55e-01 0.132 0.116 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.87e-01 0.0511 0.127 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.81e-02 0.358 0.15 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0646 0.113 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.71e-01 0.0662 0.0916 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 4.75e-01 -0.106 0.148 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 9.44e-01 0.0101 0.145 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0971 0.133 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 4.36e-01 -0.115 0.147 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0678 0.152 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.13e-01 0.155 0.153 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.75e-01 -0.133 0.15 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.79e-01 0.0029 0.11 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0205 0.145 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0358 0.132 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.45e-01 -0.163 0.14 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 8.52e-01 0.028 0.15 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.80e-01 -0.104 0.118 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0619 0.0993 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 5.18e-01 -0.12 0.185 0.107 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.88e-01 -0.137 0.103 0.107 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 3.98e-02 -0.384 0.184 0.107 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0677 0.16 0.107 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0636 0.17 0.107 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.27e-01 -0.256 0.167 0.107 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 7.07e-01 0.0656 0.174 0.107 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 6.25e-01 0.0577 0.118 0.107 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 1.77e-01 -0.203 0.15 0.113 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00761 0.0786 0.113 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.66e-01 -0.197 0.142 0.113 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.38e-01 -0.235 0.158 0.113 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0152 0.121 0.113 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.84e-02 -0.284 0.12 0.113 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 7.05e-01 0.0384 0.101 0.113 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.38e-01 0.0305 0.149 0.113 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0405 0.11 0.113 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.91e-01 -0.052 0.131 0.113 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 2.12e-01 0.181 0.145 0.113 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.60e-02 0.351 0.144 0.113 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.68e-01 -0.107 0.118 0.113 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.57e-01 0.00511 0.0946 0.113 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 2.26e-01 0.164 0.135 0.122 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 3.50e-02 -0.212 0.0996 0.122 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0149 0.143 0.122 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0847 0.128 0.122 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 9.15e-01 0.0119 0.111 0.122 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 6.38e-01 0.0467 0.099 0.122 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00997 0.15 0.122 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00267 0.107 0.122 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.97e-01 0.117 0.138 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0305 0.0945 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.19e-01 -0.222 0.142 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0413 0.0733 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.59e-02 0.25 0.118 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 9.86e-01 0.00198 0.113 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 5.40e-01 0.0813 0.132 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0481 0.142 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00181 0.104 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.54e-01 0.0689 0.153 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0881 0.107 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 2.42e-01 -0.149 0.127 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.18e-01 0.149 0.121 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0743 0.131 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 5.59e-01 0.0998 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 3.22e-01 -0.161 0.162 0.112 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0136 0.161 0.112 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 8.56e-02 0.325 0.188 0.112 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 9.15e-01 0.0203 0.189 0.112 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0782 0.177 0.112 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0526 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 9.64e-01 0.00624 0.137 0.116 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.09e-02 -0.352 0.137 0.116 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.70e-01 -0.161 0.145 0.116 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.54e-01 -0.114 0.123 0.116 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 4.86e-01 0.104 0.149 0.116 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.72e-01 -0.139 0.156 0.116 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 3.92e-01 -0.11 0.129 0.116 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.08e-01 0.032 0.132 0.115 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.10e-01 -0.217 0.135 0.115 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 6.47e-01 0.0637 0.139 0.115 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 4.97e-01 0.0637 0.0937 0.115 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0756 0.15 0.115 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 8.99e-01 -0.017 0.134 0.115 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 2.64e-01 0.163 0.145 0.115 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 5.05e-01 -0.105 0.156 0.124 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 2.04e-01 -0.127 0.0999 0.124 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 1.44e-01 -0.225 0.153 0.124 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.22e-01 -0.226 0.145 0.124 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 2.66e-01 -0.127 0.114 0.124 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.18e-01 0.155 0.0987 0.124 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.80e-01 0.163 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 5.37e-02 -0.184 0.0946 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00252 0.151 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0216 0.102 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 5.01e-01 0.0867 0.129 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 1.27e-01 0.14 0.0915 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 8.99e-01 -0.017 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 2.04e-01 -0.177 0.139 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 9.73e-02 -0.205 0.123 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.02e-01 0.106 0.126 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.75e-01 -0.125 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 1.49e-01 0.152 0.105 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 5.94e-01 0.0575 0.108 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0408 0.092 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 580192 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0136 0.113 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.19e-01 0.238 0.152 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 1.68e-01 -0.127 0.0915 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.34e-01 0.0108 0.13 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 6.43e-01 0.0606 0.131 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 8.69e-01 -0.015 0.0908 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 2.77e-01 -0.153 0.14 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0682 0.0686 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 3.93e-01 0.096 0.112 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 2.59e-01 0.109 0.0963 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0243 0.128 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 8.72e-01 0.02 0.124 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 4.76e-02 -0.241 0.121 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0191 0.137 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 8.36e-01 0.0169 0.0812 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 9.16e-01 0.0155 0.148 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0514 0.126 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00889 0.144 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -818812 sc-eQTL 3.62e-01 -0.119 0.131 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 sc-eQTL 4.62e-01 0.0926 0.126 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -765343 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0734 0.12 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 302733 sc-eQTL 9.15e-01 0.012 0.112 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 431612 sc-eQTL 5.96e-01 0.0649 0.122 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 552620 sc-eQTL 1.91e-02 0.344 0.146 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -762993 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.102 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 303646 sc-eQTL 4.11e-01 0.0704 0.0855 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -601097 eQTL 0.0258 -0.0945 0.0423 0.0 0.0 0.132
ENSG00000136044 APPL2 302733 pQTL 0.000846 -0.0484 0.0145 0.0 0.0 0.128
ENSG00000136044 APPL2 302733 eQTL 0.0357 -0.057 0.0271 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136052 \N 580192 2.76e-07 1.76e-07 3.56e-08 2.01e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.9e-07 5.49e-08 1.45e-07 4.4e-08 1.76e-07 8.14e-08 3.4e-07 7.13e-08 9.2e-08 7.37e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.19e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.39e-07 1.39e-07 4.98e-08 1.85e-07 1.15e-07 1.08e-07 9.36e-08 1.23e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.71e-08 2.74e-08 8.34e-08 8.96e-08 3.87e-08 4.75e-08 9.25e-08 7.23e-08 3.37e-08 4.27e-08 2.9e-06 5.27e-08 3.06e-08 9.88e-08 1.86e-08 1.37e-07 4.6e-09 4.74e-08
ENSG00000166046 \N -762993 2.61e-07 1.3e-07 3.35e-08 1.82e-07 9.91e-08 9.36e-08 1.44e-07 5.21e-08 1.41e-07 4.24e-08 1.62e-07 8.02e-08 1.52e-07 6.21e-08 6.25e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.22e-08 3.89e-08 1.03e-07 1.23e-07 1.3e-07 5.01e-08 1.32e-07 1.09e-07 1.1e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.12e-07 9.91e-08 3.82e-08 2.74e-08 8.21e-08 9.14e-08 4.12e-08 4.99e-08 8.91e-08 8.3e-08 3.05e-08 3.61e-08 1.3e-06 3.98e-08 3.48e-08 1.09e-07 1.68e-08 1.46e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000258355 \N -708020 2.64e-07 1.35e-07 3.69e-08 1.8e-07 9.65e-08 9.36e-08 1.49e-07 5.21e-08 1.4e-07 4.24e-08 1.55e-07 8.03e-08 1.71e-07 6.38e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.63e-08 1.14e-07 5.2e-08 3.88e-08 1.03e-07 1.28e-07 1.26e-07 5.01e-08 1.4e-07 1.09e-07 1.12e-07 8.7e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.64e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.82e-08 9.13e-08 4.02e-08 4.85e-08 9.2e-08 7.92e-08 3.01e-08 3.34e-08 1.51e-06 4.1e-08 2.85e-08 1.09e-07 1.66e-08 1.45e-07 4.7e-09 4.61e-08