logo

Genes within 1Mb (chr12:105537988:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.09e-01 -0.043 0.115 0.182 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0301 0.0595 0.182 B L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 4.67e-01 0.0637 0.0874 0.182 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 6.13e-02 0.104 0.0553 0.182 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0268 0.0888 0.182 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.40e-01 0.0502 0.107 0.182 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0102 0.0714 0.182 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.46e-01 0.0463 0.0765 0.182 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00944 0.0836 0.182 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.81e-01 0.00168 0.0714 0.182 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.73e-01 0.0238 0.0822 0.182 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0376 0.081 0.182 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0159 0.112 0.182 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0246 0.0726 0.182 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0805 0.0625 0.182 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.71e-01 0.0569 0.1 0.182 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0311 0.0662 0.182 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 6.09e-01 0.0486 0.0949 0.182 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0663 0.106 0.182 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0113 0.0959 0.182 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.48e-01 0.0269 0.0588 0.182 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0496 0.042 0.182 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.20e-01 0.14 0.114 0.187 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 2.93e-01 0.0828 0.0785 0.187 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 2.80e-01 -0.127 0.117 0.187 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 6.03e-01 0.0493 0.0947 0.187 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 3.33e-01 0.0779 0.0802 0.187 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 9.74e-01 0.00236 0.0719 0.187 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 3.74e-01 0.105 0.118 0.187 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.80e-01 0.0199 0.0482 0.187 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 6.26e-01 0.0491 0.101 0.182 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0321 0.0721 0.182 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.22e-01 0.0112 0.114 0.182 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00674 0.0561 0.182 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 9.79e-01 0.00265 0.0985 0.182 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.99e-01 0.000107 0.0837 0.182 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.71e-01 0.062 0.109 0.182 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 1.94e-01 0.141 0.108 0.182 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0246 0.107 0.182 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00732 0.0973 0.182 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.06e-01 0.0362 0.0959 0.182 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0912 0.0999 0.182 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0563 0.123 0.182 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.17e-01 0.0206 0.0886 0.182 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.96e-01 0.0188 0.0726 0.182 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0274 0.122 0.182 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.18e-01 -0.038 0.0763 0.182 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0992 0.182 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.18e-01 0.0134 0.131 0.182 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.34e-01 0.0889 0.0917 0.182 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 3.89e-01 0.0806 0.0934 0.182 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.19e-01 0.094 0.0762 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00665 0.124 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0677 0.118 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 5.85e-01 0.0726 0.133 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 6.81e-01 -0.052 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 2.21e-01 0.115 0.0939 0.176 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 8.14e-01 0.0308 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 4.71e-01 0.0947 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.67e-01 0.0728 0.127 0.176 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 6.62e-02 0.234 0.126 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0926 0.0942 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0264 0.112 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.01e-01 0.0121 0.097 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0272 0.107 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.80e-01 0.108 0.123 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.97e-01 0.0142 0.11 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.78e-01 0.0324 0.115 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 1.10e-01 0.203 0.127 0.183 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0472 0.108 0.183 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 3.75e-01 0.103 0.116 0.183 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0343 0.0959 0.183 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 7.30e-01 0.0389 0.113 0.183 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.79e-01 0.0538 0.13 0.183 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 7.50e-01 0.0341 0.107 0.183 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00643 0.0985 0.183 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.35e-01 -0.073 0.118 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.86e-01 0.0016 0.0886 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0154 0.0992 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 3.14e-01 0.0898 0.089 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 9.50e-02 -0.172 0.103 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 7.03e-01 0.0489 0.128 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 1.16e-01 -0.137 0.0865 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 9.62e-01 0.00542 0.114 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0804 0.127 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0794 0.11 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 2.65e-01 0.117 0.105 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 1.61e-01 0.133 0.0946 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 6.31e-01 -0.048 0.0997 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.87e-01 -0.117 0.135 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 1.84e-01 0.124 0.0933 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0344 0.116 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 3.90e-01 0.105 0.122 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.08e-01 0.0519 0.101 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 1.94e-01 -0.163 0.125 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 5.98e-01 0.0636 0.12 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 2.20e-01 -0.149 0.121 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0322 0.127 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0636 0.073 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0726 0.0931 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00565 0.08 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0286 0.0853 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0838 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 7.39e-01 0.0409 0.123 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0759 0.08 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0535 0.109 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.23e-01 0.128 0.105 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 1.91e-01 -0.101 0.077 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.10e-02 0.181 0.0998 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0864 0.103 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0406 0.128 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 7.15e-01 0.0311 0.0851 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0665 0.0841 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0407 0.131 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00329 0.103 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0125 0.112 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.39e-01 0.15 0.127 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 8.80e-01 0.0186 0.123 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.95e-02 -0.186 0.102 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.74e-01 0.0464 0.0823 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0431 0.118 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 8.45e-01 0.0207 0.106 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 4.70e-02 -0.197 0.0988 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.32e-01 -0.132 0.11 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 7.66e-01 0.0388 0.13 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.49e-01 0.0216 0.113 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.97e-01 0.0215 0.0836 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.82e-01 0.119 0.11 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0775 0.0982 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 1.12e-01 0.16 0.1 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00688 0.11 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.64e-01 0.0512 0.118 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.92e-01 0.0348 0.0878 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 9.68e-01 0.00374 0.094 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0351 0.129 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0407 0.112 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.85e-01 0.00231 0.126 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0959 0.127 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 5.43e-01 0.0824 0.135 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 7.73e-01 0.0313 0.108 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.79e-01 -0.13 0.119 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.06e-01 -0.164 0.129 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 8.41e-01 0.024 0.12 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 6.46e-01 0.0606 0.132 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.47e-01 -0.104 0.136 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 2.91e-01 -0.14 0.132 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0576 0.124 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 3.07e-01 -0.104 0.101 0.185 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.98e-01 -0.124 0.119 0.184 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0499 0.107 0.184 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.114 0.184 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0264 0.135 0.184 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.06e-01 0.0624 0.121 0.184 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.36e-01 0.0226 0.109 0.184 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 9.95e-01 0.000579 0.0907 0.184 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 6.99e-01 0.0468 0.121 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 3.84e-01 0.0862 0.0987 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.03e-01 0.0144 0.118 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.74e-01 -0.133 0.121 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.132 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.21e-01 0.0625 0.126 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.56e-01 0.129 0.114 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.109 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 5.75e-01 -0.06 0.107 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.81e-01 0.00256 0.11 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 5.27e-01 0.0624 0.0983 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.107 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 2.86e-01 0.138 0.129 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00137 0.0961 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.25e-01 0.0274 0.0778 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 1.65e-01 0.171 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 2.51e-01 0.138 0.12 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0542 0.111 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 2.66e-01 0.136 0.122 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.73e-01 0.138 0.126 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0962 0.127 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 4.88e-01 0.0865 0.124 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.89e-02 -0.172 0.0905 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.97e-01 0.0642 0.121 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00215 0.112 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0737 0.111 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0338 0.117 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00744 0.113 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 1.31e-01 -0.189 0.125 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 7.37e-01 0.0334 0.0992 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.22e-01 0.0296 0.0833 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0463 0.156 0.163 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0877 0.163 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0802 0.158 0.163 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 2.48e-01 -0.156 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 4.58e-01 0.107 0.143 0.163 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.69e-01 0.127 0.141 0.163 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0962 0.146 0.163 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.0983 0.163 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0844 0.124 0.178 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.01e-01 -0.034 0.0648 0.178 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 5.59e-01 0.0688 0.118 0.178 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 7.01e-01 0.0504 0.131 0.178 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0237 0.1 0.178 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.06e-02 0.169 0.0994 0.178 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.17e-01 0.0418 0.0836 0.178 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 3.69e-01 0.112 0.124 0.182 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 1.04e-02 -0.234 0.0904 0.182 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 5.35e-01 0.068 0.109 0.182 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 1.38e-01 0.18 0.121 0.182 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0131 0.123 0.182 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 1.02e-01 0.162 0.0984 0.182 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0982 0.0789 0.182 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 6.53e-01 0.0524 0.116 0.195 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 3.09e-02 0.186 0.0854 0.195 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 3.65e-01 -0.111 0.123 0.195 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0301 0.11 0.195 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 2.94e-01 0.1 0.0953 0.195 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.51e-01 0.0793 0.0848 0.195 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 5.35e-01 0.0802 0.129 0.195 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 5.32e-01 0.0576 0.092 0.195 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.22e-01 0.0775 0.121 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0339 0.0828 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 7.61e-01 -0.038 0.125 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 6.09e-01 0.033 0.0642 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0979 0.104 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00997 0.0988 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0469 0.116 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.39e-01 0.0767 0.125 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0737 0.091 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 6.95e-01 0.053 0.135 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 5.01e-01 0.0634 0.094 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 4.83e-01 0.0789 0.112 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 5.76e-01 0.0597 0.107 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 8.04e-01 0.0286 0.115 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.85e-01 0.0766 0.14 0.194 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 4.85e-01 0.0934 0.133 0.194 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 1.89e-02 0.308 0.13 0.194 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 3.82e-01 0.136 0.156 0.194 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 4.16e-01 0.127 0.155 0.194 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 1.17e-01 -0.227 0.144 0.194 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 4.57e-01 0.0915 0.123 0.194 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0161 0.117 0.182 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0221 0.12 0.182 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00779 0.125 0.182 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0254 0.106 0.182 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.38e-01 0.0604 0.128 0.182 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 3.75e-01 -0.119 0.134 0.182 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.49e-03 0.299 0.109 0.182 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.179 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0429 0.114 0.179 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 9.52e-01 0.007 0.116 0.179 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0464 0.0785 0.179 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 6.11e-01 0.0641 0.126 0.179 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0456 0.112 0.179 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 3.59e-01 0.112 0.122 0.179 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 7.72e-01 0.0383 0.132 0.203 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0344 0.0844 0.203 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0615 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.32e-01 0.0967 0.123 0.203 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 8.76e-01 -0.015 0.0959 0.203 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0611 0.0834 0.203 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0166 0.127 0.203 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.53e-01 0.0253 0.0804 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 6.59e-02 0.235 0.127 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 5.14e-02 -0.168 0.0856 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.78e-01 0.0168 0.109 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0208 0.0779 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 4.15e-01 0.0922 0.113 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.76e-01 0.00309 0.105 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 8.33e-01 0.0226 0.107 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0935 0.12 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0103 0.0892 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0914 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 5.16e-02 0.151 0.0773 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 579244 sc-eQTL 2.47e-01 -0.11 0.0951 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0712 0.13 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0659 0.0777 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0401 0.11 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 5.98e-01 0.0602 0.114 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 6.51e-01 -0.036 0.0793 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.67e-01 0.0206 0.123 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.32e-01 0.0471 0.0599 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0556 0.098 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0176 0.0843 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 6.41e-01 -0.052 0.111 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 2.83e-01 -0.115 0.107 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.63e-01 0.00485 0.105 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0168 0.119 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 9.12e-01 0.0078 0.0703 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 5.20e-01 0.0822 0.128 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 2.66e-01 -0.122 0.109 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 2.00e-01 0.16 0.124 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -819760 sc-eQTL 3.63e-01 0.101 0.111 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -602045 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0619 0.107 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -766291 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0093 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 301785 sc-eQTL 5.71e-01 0.0541 0.0951 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 430664 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0825 0.104 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 551672 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0709 0.125 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -763941 sc-eQTL 9.78e-01 0.0024 0.0871 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 302698 sc-eQTL 9.55e-01 0.00409 0.0729 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -819760 eQTL 1.72e-02 -0.0851 0.0357 0.0 0.0 0.159
ENSG00000136044 APPL2 301785 pQTL 0.04 0.0281 0.0137 0.0 0.0 0.153

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -602045 5.59e-07 4.78e-07 7.45e-08 3.66e-07 1.07e-07 1.26e-07 4.42e-07 5.56e-08 2.26e-07 1.37e-07 3.21e-07 1.46e-07 5.54e-07 8.85e-08 1.07e-07 1.06e-07 6.63e-08 2.66e-07 1.36e-07 6.73e-08 1.33e-07 2.07e-07 2.67e-07 3.68e-08 5.75e-07 1.39e-07 1.31e-07 1.47e-07 2.03e-07 2.75e-07 1.86e-07 3.99e-08 3.43e-08 1.03e-07 1.56e-07 3.43e-08 4.47e-08 8.25e-08 5.25e-08 8.09e-08 5.48e-08 4.95e-07 3.37e-08 1.77e-08 3.3e-08 1.3e-08 7.83e-08 2e-09 4.67e-08