Genes within 1Mb (chr12:105530385:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0283 0.116 0.171 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0524 0.0599 0.171 B L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 4.47e-01 0.0672 0.0882 0.171 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 7.02e-02 0.102 0.0558 0.171 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0336 0.0896 0.171 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 4.49e-01 0.082 0.108 0.171 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.75e-01 0.0113 0.0721 0.171 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 4.18e-01 0.0626 0.0771 0.171 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 9.14e-01 0.00914 0.0845 0.171 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 7.02e-01 0.0276 0.0722 0.171 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000167 0.0832 0.171 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0495 0.0819 0.171 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0194 0.113 0.171 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.96e-01 0.00963 0.0734 0.171 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0763 0.0632 0.171 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.08e-01 0.0837 0.101 0.171 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0469 0.0667 0.171 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 5.81e-01 0.0528 0.0956 0.171 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0899 0.107 0.171 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.64e-01 -0.042 0.0966 0.171 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.29e-01 0.0373 0.0592 0.171 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0447 0.0424 0.171 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.04e-01 0.0962 0.115 0.176 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 5.14e-01 0.0518 0.0792 0.176 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0977 0.118 0.176 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.72e-01 0.054 0.0954 0.176 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 1.52e-01 0.116 0.0806 0.176 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.62e-01 0.0317 0.0724 0.176 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.98e-01 0.0629 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.91e-01 0.0261 0.0485 0.176 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.88e-01 0.0409 0.102 0.171 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0543 0.073 0.171 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 9.51e-01 0.00717 0.116 0.171 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0185 0.0568 0.171 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 8.57e-01 0.018 0.0998 0.171 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00466 0.0848 0.171 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 6.32e-01 0.0531 0.111 0.171 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 2.35e-01 0.131 0.11 0.172 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0582 0.108 0.172 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.0985 0.172 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 5.09e-01 0.0642 0.097 0.172 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0874 0.101 0.172 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0639 0.124 0.172 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.82e-01 -0.002 0.0897 0.172 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 6.43e-01 0.0341 0.0734 0.172 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 9.41e-01 -0.009 0.122 0.171 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0773 0.0766 0.171 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.39e-01 0.0957 0.0998 0.171 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 7.59e-01 0.0404 0.131 0.171 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 3.68e-01 0.0832 0.0923 0.171 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 3.93e-01 0.0804 0.094 0.171 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 1.51e-01 0.11 0.0765 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.99e-01 0.0481 0.124 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0907 0.118 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 6.41e-01 0.0623 0.133 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0734 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 1.43e-01 0.138 0.0942 0.168 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.06e-01 0.0497 0.132 0.168 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 6.73e-01 0.0557 0.132 0.168 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.70e-01 0.0374 0.128 0.168 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.39e-02 0.259 0.128 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 1.52e-01 -0.137 0.095 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.43e-01 0.0225 0.113 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0156 0.0981 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0788 0.108 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 1.92e-01 0.163 0.124 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.14e-01 0.0119 0.111 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.48e-01 0.0373 0.116 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 1.27e-01 0.196 0.128 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0407 0.109 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.31e-01 0.114 0.117 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 9.34e-01 0.008 0.097 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 9.81e-01 0.00277 0.114 0.172 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 8.06e-01 0.0322 0.131 0.172 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 4.62e-01 0.0797 0.108 0.172 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 6.98e-01 0.0387 0.0996 0.172 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0521 0.119 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 7.72e-01 0.026 0.0898 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0381 0.1 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.50e-01 0.0845 0.0902 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 2.18e-01 -0.129 0.104 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.02e-01 0.0678 0.13 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0906 0.0879 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 8.45e-01 0.0226 0.116 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0985 0.128 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0903 0.111 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.87e-01 0.0922 0.106 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 1.40e-01 0.142 0.0959 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 4.89e-01 -0.07 0.101 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 3.88e-01 -0.118 0.137 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0948 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0718 0.118 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.23e-01 0.122 0.123 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.25e-01 0.101 0.102 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 2.90e-01 -0.134 0.127 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 4.25e-01 0.0972 0.122 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 1.69e-01 -0.169 0.122 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.32e-01 0.0111 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0551 0.0739 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0395 0.0941 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 8.75e-01 0.0127 0.0809 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0653 0.0861 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0877 0.0848 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.54e-01 0.0389 0.124 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 4.67e-01 -0.059 0.0809 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0302 0.111 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.106 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0822 0.078 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 1.02e-01 0.166 0.101 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 2.17e-01 -0.129 0.104 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.00e-01 -0.05 0.129 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 3.72e-01 0.0769 0.0859 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.89e-01 -0.046 0.0851 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00339 0.104 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0329 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.09e-01 0.131 0.128 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.71e-01 0.0362 0.124 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.67e-02 -0.172 0.103 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.75e-01 0.0467 0.0832 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0346 0.119 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0331 0.106 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 4.65e-02 -0.199 0.0995 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 1.67e-01 -0.154 0.111 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 8.93e-01 0.0177 0.131 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.88e-01 0.0161 0.114 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 6.92e-01 0.0334 0.0841 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.23e-01 0.11 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0967 0.0991 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 1.22e-01 0.158 0.102 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0155 0.111 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.86e-01 0.0482 0.119 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.76e-01 0.0496 0.0887 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 8.07e-01 0.0233 0.0949 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.85e-01 0.053 0.13 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0502 0.114 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0216 0.128 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0567 0.129 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.27e-01 0.048 0.137 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.45e-01 0.0664 0.109 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 2.40e-01 -0.142 0.121 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.16e-01 -0.131 0.13 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.26e-01 0.0957 0.12 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.00e-01 0.051 0.132 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0935 0.137 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 2.65e-01 -0.149 0.133 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0633 0.125 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0846 0.102 0.174 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.65e-01 -0.109 0.12 0.173 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0844 0.108 0.173 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.18e-01 0.0266 0.116 0.173 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0273 0.136 0.173 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.75e-01 0.0512 0.122 0.173 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 7.05e-01 0.0417 0.11 0.173 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 9.12e-01 0.0101 0.0916 0.173 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 8.37e-01 0.0252 0.123 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 3.36e-01 0.103 0.107 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.08e-01 0.102 0.1 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.55e-01 0.0374 0.12 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.36e-01 -0.119 0.123 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 4.35e-01 -0.104 0.133 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 7.60e-01 0.0391 0.128 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 2.27e-01 0.14 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.55e-01 0.0494 0.111 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0758 0.108 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 8.78e-01 -0.017 0.111 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.60e-01 0.0911 0.0994 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.109 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 2.09e-01 0.165 0.13 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0222 0.0972 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.29e-01 0.0273 0.0788 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 1.93e-01 0.162 0.124 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 3.73e-01 0.108 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0258 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 2.95e-01 0.13 0.123 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 3.16e-01 0.128 0.128 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0971 0.129 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 4.75e-01 0.0903 0.126 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 1.01e-01 -0.152 0.0919 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 6.76e-01 0.0513 0.123 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 8.19e-01 -0.026 0.113 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0472 0.112 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0146 0.119 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0167 0.115 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 1.48e-01 -0.183 0.126 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.76e-01 0.00299 0.1 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 3.53e-01 0.0782 0.0841 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0463 0.156 0.163 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0877 0.163 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0802 0.158 0.163 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 2.48e-01 -0.156 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 4.58e-01 0.107 0.143 0.163 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 3.69e-01 0.127 0.141 0.163 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0962 0.146 0.163 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.0983 0.163 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 2.92e-01 -0.132 0.125 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0254 0.0654 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.19e-01 0.0427 0.119 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 4.64e-01 0.0968 0.132 0.167 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00578 0.101 0.167 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 1.99e-01 0.129 0.1 0.167 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 3.40e-01 0.0804 0.0841 0.167 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.72e-01 0.0904 0.125 0.171 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 2.06e-02 -0.213 0.0915 0.171 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 5.35e-01 0.0687 0.11 0.171 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 2.51e-01 0.141 0.123 0.171 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0126 0.124 0.171 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 4.69e-02 0.198 0.099 0.171 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 1.44e-01 -0.117 0.0795 0.171 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 8.28e-01 0.0256 0.117 0.183 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 8.91e-02 0.148 0.0866 0.183 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0525 0.124 0.183 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 9.78e-01 0.00299 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 8.74e-02 0.164 0.0957 0.183 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 1.32e-01 0.129 0.0852 0.183 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.27e-01 0.0285 0.13 0.183 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 4.36e-01 0.0724 0.0927 0.183 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 7.23e-01 0.0435 0.122 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0523 0.0838 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0326 0.126 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 7.41e-01 0.0215 0.0651 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0909 0.106 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0164 0.1 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0637 0.117 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 7.71e-01 0.0369 0.126 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0919 0.0922 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 7.41e-01 0.0453 0.137 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 6.46e-01 0.0439 0.0953 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 4.74e-01 0.0817 0.114 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 7.41e-01 0.0358 0.108 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.40e-01 0.0389 0.117 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 3.87e-01 0.123 0.142 0.179 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 5.92e-01 0.0726 0.135 0.179 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.93e-02 0.275 0.132 0.179 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 2.89e-01 0.167 0.157 0.179 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 4.28e-01 0.125 0.157 0.179 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.146 0.179 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 3.02e-01 0.129 0.124 0.179 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0122 0.119 0.171 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0715 0.121 0.171 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.91e-01 0.0174 0.127 0.171 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000882 0.107 0.171 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 7.26e-01 0.0457 0.13 0.171 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0932 0.136 0.171 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.51e-03 0.298 0.111 0.171 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0901 0.112 0.167 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.17e-01 -0.012 0.116 0.167 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0298 0.118 0.167 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0476 0.0797 0.167 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 2.99e-01 0.133 0.128 0.167 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0446 0.114 0.167 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 3.22e-01 0.123 0.124 0.167 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0421 0.132 0.189 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00773 0.0847 0.189 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0791 0.13 0.189 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 6.07e-01 0.0636 0.123 0.189 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 7.34e-01 0.0327 0.0962 0.189 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0514 0.0838 0.189 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0147 0.127 0.189 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000149 0.0808 0.189 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 5.06e-02 0.251 0.128 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 2.50e-02 -0.194 0.0861 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 5.85e-01 0.0601 0.11 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0193 0.0785 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.119 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 8.23e-01 0.0236 0.106 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.69e-01 0.0616 0.108 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0969 0.121 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.21e-01 0.00891 0.0903 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00398 0.0925 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.71e-02 0.15 0.0783 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 571641 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0793 0.0965 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.93e-01 -0.052 0.132 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 5.60e-01 -0.046 0.0788 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0506 0.111 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 8.85e-01 0.0167 0.116 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0551 0.0803 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.58e-01 0.0224 0.124 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 5.81e-01 0.0336 0.0608 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0522 0.0993 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 7.52e-01 -0.027 0.0855 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0609 0.113 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0723 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00218 0.107 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0272 0.12 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 8.84e-01 0.0104 0.0712 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 3.83e-01 0.113 0.129 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 2.98e-01 -0.115 0.11 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 1.58e-01 0.179 0.126 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827363 sc-eQTL 4.56e-01 0.084 0.113 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -609648 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0973 0.108 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -773894 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00107 0.103 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 294182 sc-eQTL 3.70e-01 0.0863 0.0962 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 423061 sc-eQTL 4.95e-01 -0.072 0.105 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 544069 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0602 0.127 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -771544 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0233 0.0881 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 295095 sc-eQTL 7.66e-01 0.0219 0.0737 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -827363 eQTL 1.61e-02 -0.0872 0.0362 0.0 0.0 0.155
ENSG00000136044 APPL2 294182 pQTL 0.0142 0.0342 0.0139 0.0 0.0 0.148


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -609648 3.21e-07 1.67e-07 7.45e-08 2.35e-07 1.03e-07 1.03e-07 2.4e-07 7.12e-08 1.89e-07 1.11e-07 1.83e-07 1.52e-07 2.45e-07 8.44e-08 6.6e-08 1.01e-07 6.17e-08 2.21e-07 8e-08 7.05e-08 1.33e-07 1.9e-07 1.73e-07 3.41e-08 2.37e-07 1.71e-07 1.33e-07 1.42e-07 1.4e-07 1.69e-07 1.22e-07 5.32e-08 4.87e-08 1.03e-07 6.98e-08 4.95e-08 6.24e-08 5.53e-08 5.69e-08 7.78e-08 4.89e-08 1.6e-07 3.26e-08 7.21e-09 5.49e-08 1.03e-08 9.1e-08 0.0 5.49e-08