logo

Genes within 1Mb (chr12:105529867:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 1.76e-01 -0.172 0.127 0.126 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.14e-01 0.043 0.0658 0.126 B L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 5.99e-01 0.0509 0.0968 0.126 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 3.61e-01 0.0564 0.0616 0.126 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00124 0.0984 0.126 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.64e-01 0.0204 0.119 0.126 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0348 0.0791 0.126 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.05e-02 0.215 0.0834 0.126 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 1.89e-01 -0.123 0.0933 0.126 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.47e-01 -0.116 0.0796 0.126 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.35e-01 -0.137 0.0917 0.126 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0523 0.0908 0.126 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 7.88e-02 0.22 0.125 0.126 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.34e-01 0.0277 0.0814 0.126 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0597 0.0702 0.126 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 3.15e-01 0.11 0.109 0.126 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.94e-01 0.094 0.0722 0.126 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0997 0.104 0.126 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 1.79e-01 0.156 0.115 0.126 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 4.20e-01 0.0847 0.105 0.126 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00767 0.0643 0.126 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00546 0.0461 0.126 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.03e-01 0.0875 0.13 0.126 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0787 0.0896 0.126 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 4.05e-01 -0.112 0.134 0.126 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 7.05e-03 -0.289 0.106 0.126 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0692 0.0916 0.126 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0234 0.082 0.126 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0694 0.135 0.126 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0803 0.0547 0.126 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.126 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0666 0.079 0.126 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.80e-01 -0.11 0.125 0.126 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 7.00e-01 0.0237 0.0615 0.126 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.14e-01 0.0706 0.108 0.126 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.33e-01 0.0313 0.0918 0.126 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.53e-01 0.09 0.12 0.126 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 3.58e-01 -0.112 0.121 0.127 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 5.33e-01 0.0746 0.12 0.127 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 8.80e-01 0.0165 0.109 0.127 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 8.12e-01 0.0256 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0298 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 1.20e-01 0.213 0.137 0.127 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0601 0.099 0.127 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0191 0.0812 0.127 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.05e-01 0.115 0.138 0.126 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 4.17e-01 0.0703 0.0864 0.126 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0966 0.113 0.126 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00966 0.148 0.126 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00467 0.104 0.126 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0554 0.106 0.126 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0995 0.0864 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.45e-01 0.0867 0.143 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.25e-01 -0.208 0.135 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 9.40e-01 0.0116 0.153 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 7.78e-01 0.0412 0.146 0.115 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 2.52e-01 -0.125 0.108 0.115 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 3.66e-01 -0.137 0.151 0.115 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 3.07e-02 -0.325 0.149 0.115 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 7.38e-01 0.0491 0.147 0.115 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0938 0.147 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 3.23e-01 0.108 0.109 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.35e-01 0.193 0.129 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.112 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0485 0.123 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0596 0.142 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0784 0.126 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 2.59e-01 0.149 0.132 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 7.74e-01 0.0419 0.146 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0815 0.123 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0486 0.133 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.78e-02 0.2 0.109 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 3.23e-01 0.127 0.128 0.125 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.47e-01 0.0895 0.149 0.125 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.122 0.125 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 5.00e-01 0.0761 0.113 0.125 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.80e-02 -0.251 0.132 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 4.78e-02 0.198 0.0993 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 6.21e-01 0.0556 0.112 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 2.43e-01 -0.118 0.101 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00398 0.145 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.08e-01 0.0239 0.0983 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 5.75e-02 0.244 0.128 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 2.47e-01 -0.165 0.142 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.36e-02 0.238 0.123 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 6.52e-01 0.0535 0.118 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.66e-02 0.196 0.106 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 6.82e-01 -0.046 0.112 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 7.21e-02 0.273 0.151 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.44e-01 0.0642 0.106 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0129 0.131 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.40e-01 -0.104 0.134 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.25e-01 0.135 0.111 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 7.85e-01 0.0378 0.138 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 2.34e-01 -0.158 0.132 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 1.29e-01 0.202 0.133 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0403 0.14 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 7.23e-01 0.0285 0.0804 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.44e-01 -0.063 0.104 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0888 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 2.65e-01 -0.106 0.0948 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0651 0.0936 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 3.38e-01 0.131 0.137 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 6.01e-01 0.0467 0.0892 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 3.50e-01 -0.114 0.122 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.15e-02 -0.205 0.117 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.07e-01 -0.139 0.0863 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.71e-01 -0.101 0.113 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0596 0.116 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 3.18e-01 0.144 0.143 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0102 0.0955 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00935 0.0946 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 1.18e-01 -0.234 0.149 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00513 0.118 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.27e-01 -0.126 0.128 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.86e-01 0.0589 0.145 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 6.65e-01 0.0611 0.141 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 6.43e-01 0.0546 0.118 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.05e-01 0.153 0.0938 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 9.94e-01 0.000923 0.132 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.44e-01 0.172 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 2.70e-01 0.123 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 1.57e-01 0.174 0.123 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.30e-01 0.0313 0.146 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.31e-01 0.0435 0.127 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0249 0.0935 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.123 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.11 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 4.65e-02 -0.224 0.112 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 4.56e-03 0.345 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 3.85e-01 0.115 0.131 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 9.83e-01 0.00214 0.0982 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0355 0.105 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.16e-01 0.116 0.143 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.98e-01 0.13 0.124 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 8.19e-01 0.0321 0.14 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.59e-01 0.0623 0.141 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 7.42e-01 0.0496 0.15 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.80e-01 0.0337 0.12 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.97e-01 0.0903 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.08e-02 0.253 0.144 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00461 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0253 0.147 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0951 0.152 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.34e-01 0.0311 0.148 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.06e-02 -0.271 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 2.27e-01 -0.137 0.113 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 2.26e-01 0.164 0.135 0.128 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.36e-01 0.00983 0.122 0.128 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 9.08e-01 0.015 0.13 0.128 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0906 0.153 0.128 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 9.77e-01 0.00403 0.138 0.128 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 1.08e-01 0.199 0.123 0.128 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0244 0.103 0.128 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.81e-01 0.02 0.133 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 3.33e-01 -0.113 0.116 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 6.65e-01 0.0474 0.109 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 2.28e-01 0.157 0.13 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.08e-02 -0.227 0.133 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.40e-01 0.0293 0.146 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 3.01e-01 0.144 0.139 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 3.61e-01 -0.115 0.126 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.00e-01 -0.104 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 3.86e-02 0.248 0.119 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0466 0.124 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.26e-01 0.109 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 8.39e-01 0.0247 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 4.71e-02 0.289 0.145 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0643 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.74e-01 0.00291 0.0879 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0228 0.141 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 8.51e-01 0.0257 0.137 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 3.86e-01 -0.11 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.57e-01 -0.129 0.139 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.69e-01 0.00568 0.144 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 1.43e-01 0.212 0.144 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.36e-01 -0.048 0.142 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0129 0.104 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0739 0.137 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 9.38e-01 0.00992 0.127 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00547 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 3.37e-01 -0.127 0.132 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 8.70e-01 0.021 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0919 0.142 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0829 0.112 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.30e-01 -0.142 0.0936 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.31e-01 0.0368 0.172 0.119 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0403 0.0963 0.119 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.57e-01 -0.246 0.172 0.119 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.48e-01 0.00977 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 8.81e-01 0.0237 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 1.90e-01 -0.204 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.87e-01 -0.023 0.161 0.119 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 5.12e-01 0.0717 0.109 0.119 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 1.17e-02 -0.364 0.143 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.87e-01 0.0808 0.0757 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.43e-02 -0.336 0.136 0.126 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0911 0.153 0.126 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.78e-01 0.0181 0.117 0.126 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 5.72e-02 -0.222 0.116 0.126 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.08e-01 0.0809 0.0977 0.126 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 3.46e-01 0.133 0.141 0.126 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0158 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 9.04e-01 -0.015 0.124 0.126 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 7.96e-02 0.242 0.137 0.126 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 4.27e-02 0.281 0.138 0.126 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0328 0.112 0.126 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0652 0.0898 0.126 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 2.85e-02 0.294 0.133 0.124 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 1.17e-01 -0.157 0.0996 0.124 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 5.62e-01 0.0827 0.142 0.124 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 1.51e-01 -0.182 0.126 0.124 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 7.92e-01 0.0293 0.111 0.124 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.64e-01 0.0168 0.0985 0.124 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0197 0.149 0.124 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0926 0.106 0.124 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 1.99e-01 0.17 0.132 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0575 0.0907 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.02e-01 -0.223 0.136 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0621 0.0703 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 2.73e-01 0.126 0.114 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.46e-01 0.0211 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 7.32e-01 0.0437 0.127 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 6.43e-01 0.0631 0.136 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 8.70e-01 0.0163 0.0994 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 4.79e-01 0.104 0.147 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 4.57e-01 0.0765 0.102 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0776 0.122 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.116 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 9.20e-01 0.0126 0.126 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0387 0.16 0.13 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.62e-01 -0.171 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0401 0.151 0.13 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 6.04e-02 0.334 0.176 0.13 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.15e-01 -0.116 0.178 0.13 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0154 0.166 0.13 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0773 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 9.37e-01 0.0103 0.13 0.129 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.46e-03 -0.366 0.13 0.129 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0567 0.139 0.129 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 1.04e-01 -0.19 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 4.35e-01 0.111 0.142 0.129 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 2.97e-01 -0.155 0.148 0.129 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0869 0.123 0.129 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0846 0.125 0.127 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 5.29e-02 -0.249 0.128 0.127 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 8.34e-01 0.0278 0.132 0.127 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 1.83e-02 0.209 0.0878 0.127 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 4.79e-01 0.101 0.143 0.127 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 2.46e-01 -0.147 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 2.31e-01 0.166 0.138 0.127 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 2.36e-01 -0.179 0.15 0.133 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 2.13e-01 -0.12 0.0963 0.133 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.18e-01 -0.232 0.148 0.133 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 5.01e-03 -0.392 0.138 0.133 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 1.82e-01 -0.146 0.109 0.133 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0239 0.0958 0.133 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.21e-01 0.033 0.145 0.133 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.56e-02 -0.184 0.0911 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 6.85e-01 0.0589 0.145 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.53e-01 0.0058 0.098 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 1.69e-01 0.17 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.04e-02 0.149 0.0878 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0234 0.128 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 7.77e-01 -0.038 0.134 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 2.96e-01 -0.124 0.118 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.61e-01 0.17 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 4.19e-02 -0.273 0.134 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 4.48e-02 0.201 0.0995 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 6.10e-01 0.0525 0.103 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00234 0.0878 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 571123 sc-eQTL 8.63e-01 0.0186 0.107 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 2.54e-01 0.167 0.146 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0113 0.0877 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 1.20e-01 0.192 0.123 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 7.27e-02 0.223 0.124 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0358 0.0866 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 4.20e-01 -0.108 0.134 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00802 0.0656 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 6.99e-01 0.0415 0.107 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 3.57e-01 0.0848 0.092 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 6.35e-01 0.0578 0.122 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0692 0.118 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 4.94e-02 -0.228 0.115 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 8.16e-01 0.0305 0.131 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 3.10e-01 0.0788 0.0774 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 5.68e-01 0.0807 0.141 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 2.08e-01 -0.152 0.12 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 4.75e-01 0.0984 0.138 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -827881 sc-eQTL 3.74e-01 -0.111 0.125 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 sc-eQTL 4.14e-01 0.0983 0.12 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -774412 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00431 0.114 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 293664 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00722 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 422543 sc-eQTL 8.80e-01 0.0177 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 543551 sc-eQTL 6.48e-02 0.26 0.14 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -772062 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0667 0.0977 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 294577 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0142 0.0819 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000074590 NUAK1 -610166 eQTL 0.0141 -0.0971 0.0395 0.0 0.0 0.159
ENSG00000136044 APPL2 293664 pQTL 2.93e-07 -0.0695 0.0135 0.00711 0.0 0.155

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000258355 \N -717089 3.07e-07 1.53e-07 5.82e-08 2.09e-07 1.03e-07 8.33e-08 2.1e-07 5.68e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.2e-07 2.24e-07 8.13e-08 5.94e-08 7.98e-08 4.45e-08 1.72e-07 7.12e-08 5.2e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.49e-08 2.02e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.09e-07 3.55e-08 3.68e-08 9.76e-08 3.07e-08 2.74e-08 4.41e-08 8.2e-08 6.39e-08 3.67e-08 5.33e-08 1.59e-07 5.27e-08 7.51e-09 3.2e-08 1.71e-08 8.74e-08 1.92e-09 4.81e-08