logo

Genes within 1Mb (chr12:105527531:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0279 0.161 0.062 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 5.63e-01 0.0481 0.0829 0.062 B L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.11e-01 0.0803 0.122 0.062 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.80e-01 0.104 0.0775 0.062 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 8.40e-01 -0.025 0.124 0.062 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 6.10e-01 0.0766 0.15 0.062 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.87e-02 -0.233 0.0984 0.062 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.78e-01 -0.116 0.106 0.062 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.17e-01 0.0124 0.119 0.062 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 6.40e-01 0.0476 0.102 0.062 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 6.72e-02 0.214 0.116 0.062 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 3.36e-01 0.111 0.115 0.062 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0264 0.16 0.062 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.38e-01 0.153 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.43e-01 -0.104 0.0891 0.062 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 3.54e-01 0.133 0.143 0.062 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 4.56e-01 0.0705 0.0945 0.062 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 2.13e-01 0.169 0.135 0.062 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.13e-01 -0.24 0.15 0.062 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.83e-01 0.0753 0.137 0.062 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.61e-01 0.0767 0.0838 0.062 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 8.36e-01 0.0125 0.0601 0.062 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0219 0.165 0.063 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 6.61e-02 0.208 0.113 0.063 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 2.85e-01 -0.181 0.169 0.063 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 2.93e-01 0.144 0.137 0.063 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 1.34e-02 0.285 0.114 0.063 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.74e-01 0.00344 0.104 0.063 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 4.55e-01 0.128 0.171 0.063 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0508 0.0696 0.063 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0501 0.141 0.062 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 3.63e-01 0.092 0.101 0.062 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.30e-01 -0.1 0.16 0.062 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 2.78e-01 0.0852 0.0784 0.062 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 3.43e-01 -0.131 0.138 0.062 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0599 0.117 0.062 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.97e-02 -0.355 0.151 0.062 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 3.65e-01 -0.142 0.156 0.06 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 2.67e-01 -0.171 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 7.00e-02 -0.253 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.25e-01 0.088 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 5.19e-01 0.0932 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.74e-01 -0.127 0.177 0.06 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 7.93e-01 0.0336 0.128 0.06 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.90e-01 -0.111 0.104 0.06 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.21e-01 -0.039 0.172 0.062 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0299 0.108 0.062 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 2.29e-01 0.169 0.14 0.062 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0753 0.184 0.062 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 8.99e-01 0.0164 0.13 0.062 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.88e-01 -0.114 0.132 0.062 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 3.36e-01 -0.104 0.108 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 5.51e-01 0.11 0.185 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 7.17e-01 0.0638 0.176 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.55e-01 0.148 0.198 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.40e-01 0.0883 0.188 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 9.72e-01 0.0049 0.141 0.054 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.41e-01 -0.12 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 7.24e-01 0.0692 0.196 0.054 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 3.77e-01 -0.168 0.19 0.054 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.60e-01 0.00932 0.185 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 4.86e-01 0.0956 0.137 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.70e-01 0.0927 0.163 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0273 0.141 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 5.56e-01 0.0912 0.155 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.61e-01 0.00872 0.179 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.42e-03 -0.462 0.156 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0424 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 5.02e-01 0.119 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 9.65e-02 -0.248 0.149 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0484 0.162 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0644 0.133 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 2.34e-01 -0.186 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.15e-01 -0.148 0.181 0.062 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 8.78e-02 -0.254 0.148 0.062 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.45e-01 0.159 0.137 0.062 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.66e-01 -0.072 0.166 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.86e-01 -0.018 0.125 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.62e-01 0.0245 0.14 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.94e-01 0.0329 0.126 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 4.67e-01 -0.106 0.146 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 6.11e-01 0.0923 0.181 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 2.46e-01 -0.143 0.123 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 9.31e-02 -0.271 0.16 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.43e-01 0.0831 0.179 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 5.61e-04 -0.529 0.151 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.52e-01 0.112 0.149 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.14e-01 0.212 0.134 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 5.12e-01 0.0925 0.141 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.59e-01 0.142 0.191 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 2.14e-04 -0.483 0.128 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 7.46e-02 -0.293 0.163 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0226 0.169 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.43e-01 -0.204 0.139 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0295 0.174 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 5.83e-01 0.0916 0.166 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 1.72e-01 -0.229 0.167 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.82e-01 0.154 0.176 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.29e-01 -0.153 0.1 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0444 0.134 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00151 0.115 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 1.29e-01 0.186 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.23e-01 0.0428 0.121 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.77e-01 0.0051 0.176 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.19e-01 0.179 0.114 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0584 0.157 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 5.00e-01 0.101 0.15 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 4.00e-02 0.225 0.109 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 1.24e-01 0.22 0.142 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 3.84e-01 0.128 0.147 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.16e-01 -0.148 0.182 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0578 0.121 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00784 0.12 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.58e-01 0.0818 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.95e-01 0.019 0.145 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 6.80e-01 0.0653 0.158 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0729 0.179 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 2.93e-01 0.183 0.173 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.145 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.72e-02 -0.23 0.115 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.52e-02 0.305 0.165 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.90e-01 0.0205 0.148 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 9.69e-01 0.00543 0.14 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.32e-01 -0.053 0.155 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 8.87e-01 0.026 0.183 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00273 0.159 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0756 0.117 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.90e-01 0.063 0.158 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.44e-01 0.0278 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.03e-01 0.149 0.144 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.07e-01 -0.253 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.22e-01 0.135 0.168 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 5.02e-01 0.0844 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.99e-01 -0.14 0.134 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0122 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 6.42e-01 0.0725 0.156 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.42e-01 -0.166 0.175 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 4.73e-01 -0.127 0.176 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 7.73e-02 0.331 0.186 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 5.95e-01 0.0798 0.15 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 5.37e-01 -0.103 0.166 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.22e-01 0.0182 0.185 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.75e-01 -0.231 0.17 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0385 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.45e-01 0.0897 0.194 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 2.96e-01 -0.198 0.189 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 5.66e-02 0.338 0.176 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 9.73e-01 0.00491 0.145 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 2.27e-01 -0.204 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 5.75e-01 0.0853 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.05e-01 0.135 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 2.85e-01 -0.204 0.191 0.061 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.63e-02 -0.327 0.17 0.061 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.71e-01 -0.139 0.155 0.061 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0949 0.129 0.061 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 1.33e-01 -0.257 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 1.06e-01 -0.241 0.149 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.41e-01 -0.206 0.14 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.40e-01 0.129 0.167 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 2.61e-01 0.194 0.172 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0196 0.187 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.72e-01 -0.244 0.178 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0198 0.162 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 7.48e-01 0.0514 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 3.45e-01 -0.147 0.156 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0877 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.10e-01 0.0949 0.144 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.61e-01 0.0479 0.157 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0568 0.189 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 4.64e-01 -0.103 0.14 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.45e-02 -0.228 0.113 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0276 0.18 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 1.29e-01 -0.266 0.174 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 2.58e-01 -0.183 0.161 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0649 0.178 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 8.26e-01 0.0406 0.184 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.33e-01 -0.116 0.185 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 2.80e-01 0.197 0.182 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 3.50e-01 -0.125 0.133 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.97e-02 -0.295 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 2.12e-01 -0.207 0.165 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.71e-02 -0.28 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.77e-01 -0.124 0.174 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.10e-02 -0.303 0.167 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.35e-01 0.145 0.186 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.25e-01 0.225 0.146 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.28e-01 -0.149 0.123 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 5.63e-01 -0.121 0.208 0.063 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0939 0.117 0.063 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.95e-01 0.18 0.211 0.063 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 9.39e-01 0.0138 0.18 0.063 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 6.20e-01 0.0953 0.192 0.063 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 2.07e-01 0.239 0.188 0.063 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.57e-01 0.0871 0.195 0.063 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.42e-01 -0.102 0.132 0.063 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.24e-02 0.345 0.184 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 3.08e-01 0.099 0.0969 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.11e-01 0.116 0.176 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 3.45e-01 0.185 0.196 0.061 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 6.22e-01 0.074 0.15 0.061 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.20e-01 0.0742 0.15 0.061 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0298 0.125 0.061 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 2.19e-01 -0.217 0.176 0.062 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 7.26e-01 0.0457 0.13 0.062 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.93e-01 0.107 0.155 0.062 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.08e-01 0.0887 0.173 0.062 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.45e-01 0.0121 0.174 0.062 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00459 0.14 0.062 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.19e-01 -0.175 0.112 0.062 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.99e-01 0.000277 0.167 0.061 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 5.05e-01 0.0827 0.124 0.061 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.52e-01 -0.164 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 6.16e-01 0.0791 0.157 0.061 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 1.92e-01 0.179 0.137 0.061 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0139 0.122 0.061 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.22e-01 0.183 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.61e-01 0.185 0.131 0.061 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 1.86e-01 0.219 0.165 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.01e-01 0.186 0.113 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.61e-01 -0.126 0.171 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 5.91e-01 0.0475 0.0881 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0211 0.144 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0759 0.135 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 5.06e-02 -0.31 0.158 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 3.43e-01 -0.161 0.169 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 4.77e-01 0.0881 0.124 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.15e-01 0.0429 0.183 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0274 0.128 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 4.95e-01 0.104 0.152 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0109 0.145 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.46e-02 -0.381 0.155 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 2.58e-01 -0.187 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 6.54e-01 0.0757 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 4.74e-01 0.127 0.177 0.062 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.89e-02 0.349 0.147 0.062 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 7.96e-01 0.047 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0453 0.189 0.062 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.60e-01 -0.176 0.156 0.062 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 3.48e-01 0.153 0.163 0.057 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 2.37e-01 0.199 0.168 0.057 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.74e-01 -0.153 0.172 0.057 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 9.85e-01 0.00217 0.116 0.057 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.52e-01 -0.111 0.186 0.057 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.05e-01 -0.17 0.165 0.057 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 3.61e-01 -0.165 0.18 0.057 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 8.87e-01 0.0269 0.19 0.065 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 3.87e-01 0.105 0.121 0.065 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.01e-01 -0.194 0.186 0.065 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 9.98e-01 0.000369 0.177 0.065 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 3.11e-01 0.14 0.138 0.065 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 7.48e-01 0.0388 0.12 0.065 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 4.00e-01 0.154 0.182 0.065 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 4.53e-01 0.087 0.116 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 7.76e-01 0.0509 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0275 0.121 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.72e-01 0.0245 0.152 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0286 0.109 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 5.11e-01 -0.104 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 2.90e-01 -0.175 0.165 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 2.48e-02 -0.327 0.145 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 8.76e-01 0.0233 0.15 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0836 0.169 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 2.78e-01 -0.136 0.125 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.128 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 2.79e-01 0.119 0.11 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 568787 sc-eQTL 3.86e-01 -0.116 0.134 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 6.48e-01 0.0836 0.183 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 1.85e-02 -0.257 0.108 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 2.29e-02 -0.35 0.153 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 6.98e-01 0.0607 0.156 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.92e-01 0.142 0.108 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0966 0.168 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 8.37e-01 0.017 0.0822 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0028 0.134 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0504 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.57e-03 -0.477 0.149 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 9.22e-01 -0.015 0.152 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 3.78e-01 0.132 0.15 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0372 0.169 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 1.79e-01 0.134 0.0996 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 7.96e-01 0.0471 0.182 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 3.56e-01 -0.144 0.155 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 7.27e-02 -0.318 0.176 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -830217 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0942 0.163 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -612502 sc-eQTL 4.27e-01 -0.125 0.156 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -776748 sc-eQTL 1.05e-01 -0.241 0.148 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 291328 sc-eQTL 5.51e-01 0.0831 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 420207 sc-eQTL 9.52e-01 0.00914 0.152 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 541215 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0972 0.184 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -774398 sc-eQTL 6.23e-01 0.0627 0.127 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 292241 sc-eQTL 1.69e-01 -0.146 0.106 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136044 APPL2 291328 pQTL 0.0219 0.0533 0.0232 0.0 0.0 0.0484

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina