logo

Genes within 1Mb (chr12:105521299:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 7.09e-01 0.0517 0.138 0.115 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0751 0.0713 0.115 B L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 3.70e-01 0.0943 0.105 0.115 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.11e-01 0.0441 0.0669 0.115 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 6.14e-01 0.0539 0.107 0.115 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 8.66e-01 0.0219 0.129 0.115 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.91e-01 -0.112 0.0855 0.115 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 5.36e-01 0.057 0.0918 0.115 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 4.31e-01 0.0784 0.0994 0.115 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.18e-01 0.085 0.0849 0.115 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.61e-01 0.0299 0.098 0.115 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.46e-01 -0.091 0.0964 0.115 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 8.40e-01 -0.027 0.134 0.115 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 7.77e-01 0.0245 0.0865 0.115 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0774 0.0746 0.115 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.12 0.115 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.35e-01 0.0166 0.0793 0.115 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.56e-01 0.0354 0.114 0.115 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 2.35e-02 -0.286 0.125 0.115 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 2.73e-01 -0.126 0.114 0.115 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.46e-01 0.0323 0.0703 0.115 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0517 0.0503 0.115 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 5.63e-01 0.0787 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 5.45e-01 0.0566 0.0934 0.119 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.69e-01 -0.101 0.139 0.119 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 7.91e-01 0.0299 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 8.39e-01 0.0194 0.0955 0.119 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0335 0.0854 0.119 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 5.42e-01 0.0857 0.14 0.119 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 8.19e-01 0.0131 0.0572 0.119 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 2.25e-01 0.145 0.119 0.115 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.83e-01 0.0126 0.0856 0.115 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00741 0.135 0.115 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0384 0.0665 0.115 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0121 0.117 0.115 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.74e-01 0.00319 0.0994 0.115 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0464 0.13 0.115 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00799 0.129 0.116 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 5.86e-01 0.069 0.126 0.116 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 4.98e-01 0.0779 0.115 0.116 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.33e-01 0.0708 0.113 0.116 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.86e-01 -0.103 0.118 0.116 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.89e-01 0.00207 0.145 0.116 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.105 0.116 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.89e-01 -0.113 0.0854 0.116 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 1.86e-01 -0.195 0.147 0.115 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 1.15e-01 -0.146 0.092 0.115 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0977 0.12 0.115 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.26e-01 0.101 0.158 0.115 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 5.87e-01 0.0606 0.111 0.115 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.04e-01 0.0589 0.113 0.115 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.19e-01 0.144 0.0922 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 8.10e-01 0.0367 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0494 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 8.72e-01 0.0264 0.164 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.36e-01 -0.15 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 3.72e-01 0.104 0.116 0.112 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.36e-01 -0.013 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 3.78e-01 0.143 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.77e-01 -0.111 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 3.82e-01 0.134 0.152 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 1.79e-01 -0.152 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 9.64e-01 0.0061 0.134 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0429 0.116 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 1.60e-01 -0.179 0.127 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 2.31e-01 0.177 0.147 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0549 0.131 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 3.15e-01 0.138 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 2.61e-01 0.173 0.153 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000498 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 2.85e-01 0.15 0.14 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 6.70e-01 0.0493 0.116 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0329 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 2.76e-01 -0.171 0.156 0.116 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.11e-01 -0.205 0.128 0.116 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 5.94e-01 0.0634 0.119 0.116 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 5.33e-01 0.0885 0.142 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.70e-01 0.0175 0.107 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.68e-01 0.0684 0.12 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0155 0.108 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 9.02e-01 0.0154 0.124 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 6.13e-01 0.0782 0.154 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.17e-01 -0.164 0.104 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 9.94e-01 0.00108 0.138 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00159 0.151 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 1.53e-01 -0.188 0.131 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.38e-01 0.0774 0.125 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.37e-01 0.109 0.113 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 2.41e-01 -0.14 0.119 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 1.68e-01 -0.222 0.161 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.15e-01 0.0563 0.112 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.26e-01 -0.111 0.139 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 7.54e-02 0.254 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.70e-01 0.106 0.118 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 1.45e-01 -0.214 0.146 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0448 0.141 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0966 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0365 0.149 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 9.94e-01 0.000695 0.0856 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.111 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.51e-01 0.089 0.0952 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0328 0.102 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 2.50e-01 -0.115 0.0999 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 6.72e-01 -0.062 0.146 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 8.10e-01 -0.023 0.0955 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0742 0.13 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 4.19e-02 0.254 0.124 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0721 0.0919 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 1.49e-01 0.172 0.119 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 1.64e-01 -0.172 0.123 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 7.30e-01 0.0527 0.152 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 4.57e-01 0.0754 0.101 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0437 0.1 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 4.45e-01 -0.12 0.157 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 4.12e-01 -0.101 0.123 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.12e-01 0.0498 0.135 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.54e-01 0.0281 0.152 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 5.25e-01 0.0939 0.147 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 5.91e-02 -0.232 0.122 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 8.06e-01 0.0242 0.0987 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 2.73e-01 0.156 0.142 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.62e-01 0.0221 0.127 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 2.33e-01 -0.143 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 4.75e-02 -0.263 0.132 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 4.19e-01 -0.127 0.157 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 5.08e-01 0.0903 0.136 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 8.74e-01 0.0159 0.101 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 8.02e-01 0.0332 0.132 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.59e-01 0.00606 0.118 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.56e-01 0.0376 0.121 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.81e-01 -0.115 0.131 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 8.82e-01 0.0209 0.141 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 7.76e-01 -0.03 0.105 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0826 0.112 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 4.33e-01 0.123 0.156 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.43e-01 -0.129 0.136 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0846 0.153 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.86e-01 -0.134 0.154 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.42e-01 0.012 0.165 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00867 0.132 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.82e-01 -0.103 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 8.35e-02 -0.266 0.153 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.141 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 1.47e-01 0.226 0.155 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.01e-01 -0.109 0.161 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 4.32e-01 -0.124 0.157 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0707 0.147 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0902 0.12 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 2.74e-02 -0.314 0.141 0.117 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.117 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.48e-01 -0.104 0.137 0.117 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.82e-01 -0.024 0.161 0.117 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0115 0.145 0.117 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 7.17e-01 0.0473 0.131 0.117 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0093 0.109 0.117 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.41e-01 0.0108 0.145 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 1.74e-01 0.173 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.118 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 1.16e-01 0.223 0.141 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.67e-01 -0.132 0.146 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 6.19e-01 -0.079 0.158 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.36e-01 -0.226 0.151 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 3.42e-01 0.13 0.137 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 8.79e-01 0.0199 0.131 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 8.40e-01 0.0258 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.52e-01 0.0245 0.131 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.85e-01 0.0642 0.118 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 2.33e-01 0.184 0.154 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 4.04e-01 -0.096 0.115 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.97e-01 -0.12 0.0927 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 6.54e-01 0.0663 0.148 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 8.68e-02 0.246 0.143 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.06e-01 -0.136 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.20e-01 0.0943 0.146 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0272 0.151 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0454 0.152 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 4.79e-01 0.106 0.149 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 6.29e-02 -0.203 0.109 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0935 0.146 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 8.95e-01 0.0178 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00482 0.134 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 9.38e-01 -0.011 0.142 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 9.76e-01 0.0042 0.137 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 4.44e-01 -0.116 0.151 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0801 0.12 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 4.21e-01 -0.081 0.1 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0209 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00927 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 8.21e-01 0.0426 0.187 0.111 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 1.50e-01 -0.229 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 3.71e-01 0.152 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 3.13e-01 0.169 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 7.71e-01 0.0505 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 7.63e-01 0.0354 0.117 0.111 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 1.37e-01 -0.226 0.152 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0147 0.0797 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 6.77e-02 -0.263 0.143 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.53e-01 0.0954 0.161 0.111 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0438 0.123 0.111 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 5.85e-02 0.232 0.122 0.111 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 9.78e-02 0.17 0.102 0.111 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 1.46e-01 0.215 0.148 0.115 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 2.17e-01 -0.135 0.109 0.115 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.75e-01 0.0933 0.13 0.115 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.45e-01 0.088 0.145 0.115 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.52e-01 0.00879 0.146 0.115 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 2.18e-01 0.145 0.118 0.115 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 3.63e-01 -0.086 0.0943 0.115 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.15e-01 0.0147 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 7.07e-02 0.184 0.101 0.127 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0659 0.145 0.127 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0236 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.113 0.127 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 4.72e-01 0.0722 0.1 0.127 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 2.00e-01 0.195 0.152 0.127 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.127 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 3.36e-01 0.138 0.143 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 5.33e-01 0.061 0.0978 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.19e-01 0.119 0.147 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0205 0.076 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0659 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.89e-01 0.00156 0.117 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.03e-01 -0.223 0.136 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 7.60e-01 0.045 0.147 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.84e-01 0.00214 0.108 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0569 0.159 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0283 0.111 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 7.35e-01 -0.045 0.133 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.58e-01 0.0559 0.126 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0451 0.136 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 9.70e-01 0.00609 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00374 0.154 0.127 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 2.22e-01 0.187 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00976 0.18 0.127 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 1.62e-01 0.251 0.178 0.127 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 6.59e-02 -0.307 0.166 0.127 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.16e-01 0.223 0.141 0.127 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0858 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.88e-01 0.123 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 8.67e-01 -0.025 0.149 0.116 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 8.71e-01 0.0205 0.126 0.116 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 5.79e-01 0.0845 0.152 0.116 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.20e-01 0.0161 0.159 0.116 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.31e-01 0.198 0.131 0.116 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 6.19e-01 0.0662 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 5.37e-01 -0.085 0.137 0.113 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.31e-01 -0.111 0.14 0.113 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0426 0.0947 0.113 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0318 0.152 0.113 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.20e-01 -0.21 0.134 0.113 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 8.39e-01 0.0299 0.147 0.113 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0673 0.159 0.127 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00315 0.102 0.127 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.44e-01 -0.12 0.157 0.127 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.07e-01 0.0991 0.149 0.127 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 8.39e-01 0.0237 0.116 0.127 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0481 0.101 0.127 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.90e-01 0.00193 0.154 0.127 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 6.23e-01 -0.048 0.0974 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 3.13e-01 0.154 0.152 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 3.71e-02 -0.213 0.102 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.97e-01 0.0881 0.13 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00275 0.0926 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 7.21e-01 -0.048 0.134 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 8.23e-01 0.0315 0.141 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 7.12e-02 -0.224 0.124 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 2.60e-01 0.143 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 7.62e-01 0.0436 0.144 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00581 0.107 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 5.38e-01 0.0678 0.11 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.21e-01 0.0602 0.0936 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 562555 sc-eQTL 8.97e-01 0.0148 0.115 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 3.32e-01 -0.151 0.156 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 2.09e-01 -0.118 0.0932 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0849 0.132 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 4.97e-01 0.0914 0.134 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 7.34e-01 0.0319 0.0935 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 6.52e-01 0.0653 0.145 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00229 0.0708 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0694 0.116 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 9.62e-01 0.00472 0.0995 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.50e-01 -0.189 0.131 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 8.12e-01 0.0304 0.127 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 2.59e-01 0.142 0.125 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 4.24e-01 -0.113 0.141 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 5.82e-01 0.0462 0.0837 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.28e-01 0.0138 0.152 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 1.06e-01 -0.21 0.129 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 8.09e-01 0.0361 0.149 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -836449 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0617 0.132 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -618734 sc-eQTL 7.43e-01 0.0417 0.127 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -782980 sc-eQTL 7.45e-01 0.0394 0.121 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 285096 sc-eQTL 6.38e-01 0.0533 0.113 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413975 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0916 0.123 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534983 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00957 0.149 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -780630 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0947 0.103 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 286009 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.086 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -836449 eQTL 2.40e-02 -0.0969 0.0429 0.0 0.0 0.105
ENSG00000136044 APPL2 285096 pQTL 0.012 0.0421 0.0168 0.0 0.0 0.0965

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000235162 \N 286009 1.28e-06 1.29e-06 2.84e-07 1.26e-06 1.78e-07 5.95e-07 1.46e-06 3.33e-07 1.35e-06 3.78e-07 1.85e-06 6.16e-07 2.56e-06 2.81e-07 5.08e-07 6.35e-07 9.07e-07 5.76e-07 8.41e-07 6.97e-07 2.83e-07 1.45e-06 8.9e-07 5.86e-07 2.44e-06 3.59e-07 7.33e-07 7.22e-07 1.44e-06 1.31e-06 6.04e-07 5.88e-08 2.17e-07 6.95e-07 5.42e-07 2.94e-07 4.68e-07 1.37e-07 3.89e-07 1.3e-07 1.95e-07 1.73e-06 6.75e-08 2.07e-07 1.61e-07 9.85e-08 1.85e-07 2.41e-08 6.17e-08