logo

Genes within 1Mb (chr12:105520481:T:TA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0425 0.116 0.169 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0619 0.0599 0.169 B L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.93e-01 0.0927 0.088 0.169 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 3.97e-02 0.115 0.0557 0.169 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0257 0.0896 0.169 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 3.79e-01 0.0954 0.108 0.169 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000933 0.0721 0.169 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.64e-01 0.0702 0.0771 0.169 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 8.58e-01 0.0151 0.0843 0.169 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 7.45e-01 0.0234 0.072 0.169 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0118 0.083 0.169 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0497 0.0818 0.169 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0251 0.113 0.169 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.24e-01 0.0164 0.0733 0.169 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0832 0.0631 0.169 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.84e-01 0.088 0.101 0.169 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0514 0.0666 0.169 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 5.96e-01 0.0507 0.0955 0.169 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.15e-01 -0.087 0.106 0.169 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0456 0.0965 0.169 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.41e-01 0.0362 0.0591 0.169 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0451 0.0423 0.169 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.173 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 5.92e-01 0.0425 0.0791 0.173 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0893 0.118 0.173 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.94e-01 0.0653 0.0953 0.173 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 1.33e-01 0.121 0.0804 0.173 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 5.38e-01 0.0446 0.0723 0.173 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 7.01e-01 0.0457 0.119 0.173 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.01e-01 0.0254 0.0485 0.173 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.23e-01 0.05 0.102 0.169 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0525 0.0728 0.169 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 9.58e-01 0.00605 0.115 0.169 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0241 0.0567 0.169 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 9.15e-01 0.0106 0.0996 0.169 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.31e-01 0.00729 0.0846 0.169 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 5.46e-01 0.0667 0.11 0.169 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 2.71e-01 0.121 0.11 0.17 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0506 0.108 0.17 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 9.31e-01 0.00848 0.0983 0.17 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 5.06e-01 0.0645 0.0969 0.17 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0711 0.101 0.17 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0566 0.124 0.17 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0179 0.0896 0.17 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 7.69e-01 0.0216 0.0733 0.17 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 8.38e-01 0.025 0.122 0.169 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0544 0.0766 0.169 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.66e-01 0.111 0.0997 0.169 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 7.03e-01 0.0501 0.131 0.169 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 4.59e-01 0.0685 0.0923 0.169 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 2.80e-01 0.102 0.0938 0.169 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.59e-01 0.108 0.0765 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.33e-01 0.0425 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0986 0.118 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 7.17e-01 0.0484 0.133 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0408 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 1.35e-01 0.141 0.0942 0.166 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.06e-01 0.068 0.132 0.166 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 7.90e-01 0.0351 0.132 0.166 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.77e-01 0.0534 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.33e-02 0.239 0.128 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.92e-02 -0.162 0.0947 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.89e-01 0.0158 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00909 0.098 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0823 0.108 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.124 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00153 0.111 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.15e-01 0.0583 0.116 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 1.28e-01 0.196 0.128 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0489 0.109 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.40e-01 0.138 0.117 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 7.66e-01 0.0289 0.097 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0183 0.114 0.17 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.39e-01 0.0267 0.131 0.17 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.26e-01 0.0687 0.108 0.17 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.99e-01 0.0386 0.0996 0.17 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0515 0.119 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.34e-01 0.0189 0.0897 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0127 0.1 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.94e-01 0.0948 0.09 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 2.43e-01 -0.122 0.104 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 5.82e-01 0.0715 0.13 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0923 0.0878 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 7.95e-01 0.0301 0.115 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.10e-01 -0.106 0.128 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0663 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.86e-01 0.114 0.106 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 1.06e-01 0.155 0.0958 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 5.60e-01 -0.059 0.101 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0951 0.137 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 3.80e-01 0.0836 0.0949 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0823 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 2.83e-01 0.133 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 3.87e-01 0.0883 0.102 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.41e-01 -0.149 0.127 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.82e-01 0.0857 0.122 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 1.70e-01 -0.168 0.122 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.94e-01 0.0171 0.129 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0584 0.0738 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0362 0.0941 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.81e-01 0.0121 0.0808 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0722 0.086 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0849 0.0847 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 7.97e-01 0.032 0.124 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0525 0.0808 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0402 0.11 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.31e-01 0.103 0.106 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0873 0.0778 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 1.23e-01 0.156 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0427 0.129 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 3.04e-01 0.0883 0.0857 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 4.95e-01 -0.058 0.0849 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.94e-01 0.0344 0.132 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0105 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.47e-01 -0.022 0.113 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.90e-01 0.135 0.128 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.64e-01 0.0213 0.124 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 1.29e-01 -0.157 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 5.43e-01 0.0506 0.083 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0257 0.119 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0372 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 4.21e-02 -0.203 0.0993 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.23e-01 -0.135 0.111 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.79e-01 0.02 0.131 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.08e-01 0.0132 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.46e-01 0.0387 0.0841 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.67e-01 0.1 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 3.01e-01 -0.103 0.0989 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 1.35e-01 0.152 0.101 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0227 0.11 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 7.19e-01 0.0428 0.119 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.80e-01 0.049 0.0885 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 8.68e-01 0.0158 0.0948 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 5.75e-01 0.0731 0.13 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0435 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0167 0.128 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0608 0.128 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.69e-01 0.0587 0.137 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.97e-01 0.0579 0.109 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.97e-01 -0.156 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.65e-01 -0.118 0.13 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.99e-01 0.0812 0.12 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.71e-01 0.0562 0.132 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0793 0.137 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 2.92e-01 -0.141 0.133 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0632 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0875 0.102 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0745 0.12 0.171 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0724 0.108 0.171 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.70e-01 0.0492 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0204 0.136 0.171 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.80e-01 0.0504 0.122 0.171 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.16e-01 0.0715 0.11 0.171 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 9.69e-01 0.00359 0.0916 0.171 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 8.99e-01 0.0155 0.123 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 3.97e-01 0.0907 0.107 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 2.78e-01 0.109 0.1 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 7.11e-01 0.0444 0.12 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.12e-01 -0.101 0.123 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 4.29e-01 -0.106 0.134 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 7.83e-01 0.0354 0.128 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 2.52e-01 0.132 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.11e-01 0.0563 0.11 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0675 0.108 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.01e-01 -0.028 0.111 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 3.29e-01 0.0971 0.0992 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.96e-01 -0.114 0.108 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 1.69e-01 0.179 0.13 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0338 0.0971 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 8.59e-01 0.014 0.0787 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 2.30e-01 0.149 0.124 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 3.59e-01 0.111 0.121 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.31e-01 -0.024 0.112 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 3.14e-01 0.124 0.123 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 3.40e-01 0.122 0.127 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 3.51e-01 -0.12 0.128 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.78e-01 0.0702 0.126 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.08e-01 -0.148 0.0918 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.77e-01 0.0348 0.123 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0102 0.113 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0458 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.73e-01 -0.019 0.119 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000346 0.115 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 1.69e-01 -0.174 0.126 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0212 0.1 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 4.01e-01 0.0708 0.0841 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0463 0.156 0.163 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0877 0.163 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0802 0.158 0.163 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.48e-01 -0.156 0.134 0.163 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 4.58e-01 0.107 0.143 0.163 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 3.69e-01 0.127 0.141 0.163 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0962 0.146 0.163 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.35e-01 0.148 0.0983 0.163 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 2.98e-01 -0.13 0.125 0.165 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0142 0.0654 0.165 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 7.65e-01 0.0356 0.119 0.165 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 4.35e-01 0.103 0.132 0.165 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.82e-01 -0.015 0.101 0.165 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 1.85e-01 0.134 0.1 0.165 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.64e-01 0.0766 0.0842 0.165 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.83e-01 0.0879 0.125 0.169 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 2.75e-02 -0.203 0.0915 0.169 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 5.94e-01 0.059 0.11 0.169 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.71e-01 0.135 0.122 0.169 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0174 0.124 0.169 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.09e-02 0.174 0.0991 0.169 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 9.65e-02 -0.132 0.0793 0.169 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.86e-01 0.0475 0.117 0.18 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 1.15e-01 0.137 0.0866 0.18 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0554 0.124 0.18 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 7.98e-01 0.0283 0.11 0.18 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 7.62e-02 0.17 0.0955 0.18 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 1.23e-01 0.132 0.0851 0.18 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.72e-01 0.021 0.13 0.18 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.88e-01 0.08 0.0926 0.18 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.39e-01 0.0572 0.122 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 5.10e-01 -0.055 0.0834 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0495 0.126 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 8.18e-01 0.0149 0.0648 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0923 0.105 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.04e-01 0.012 0.0996 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0657 0.117 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 5.47e-01 0.076 0.126 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0858 0.0919 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 6.58e-01 0.0605 0.136 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 9.48e-01 0.00618 0.0951 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 4.45e-01 0.0869 0.113 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.42e-01 0.0216 0.108 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.00e-01 0.0612 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 3.56e-01 0.131 0.142 0.176 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.63e-01 0.0995 0.135 0.176 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 2.37e-02 0.301 0.132 0.176 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 2.94e-01 0.166 0.158 0.176 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 5.72e-01 0.089 0.157 0.176 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 2.00e-01 -0.188 0.146 0.176 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.38e-01 0.12 0.124 0.176 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0554 0.119 0.169 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 5.87e-01 -0.066 0.121 0.169 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 9.34e-01 0.0106 0.127 0.169 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 9.22e-01 0.0106 0.107 0.169 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 9.49e-01 0.00836 0.13 0.169 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 3.70e-01 -0.122 0.136 0.169 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 5.31e-03 0.311 0.11 0.169 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.37e-01 -0.087 0.112 0.165 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 9.16e-01 0.0122 0.116 0.165 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.32e-01 -0.025 0.118 0.165 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0462 0.0796 0.165 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 3.11e-01 0.129 0.127 0.165 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0507 0.114 0.165 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 3.26e-01 0.122 0.123 0.165 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0202 0.132 0.186 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0213 0.0847 0.186 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0724 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 5.95e-01 0.0658 0.123 0.186 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 6.73e-01 0.0406 0.0962 0.186 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0328 0.0839 0.186 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0298 0.127 0.186 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000849 0.0808 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 6.77e-02 0.235 0.128 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 1.19e-02 -0.218 0.0858 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 5.52e-01 0.0654 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00138 0.0785 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 9.19e-01 0.0116 0.114 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 8.46e-02 0.205 0.118 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.16e-01 0.0111 0.105 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 4.96e-01 0.0735 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0995 0.121 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 9.59e-01 0.00467 0.0902 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.04e-01 0.023 0.0924 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 3.89e-02 0.162 0.0781 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 561737 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0683 0.0964 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0407 0.131 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0542 0.0787 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.92e-01 -0.044 0.111 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 7.11e-01 0.0427 0.115 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0561 0.0799 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 9.06e-01 0.0146 0.124 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 8.00e-01 0.0153 0.0605 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0511 0.0988 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00642 0.0851 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0513 0.112 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0766 0.108 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 8.93e-01 0.0144 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0171 0.12 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 8.72e-01 0.0114 0.0711 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 4.52e-01 0.0972 0.129 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 2.75e-01 -0.121 0.11 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 1.47e-01 0.183 0.126 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -837267 sc-eQTL 4.88e-01 0.078 0.112 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -619552 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0881 0.108 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -783798 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00535 0.103 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 284278 sc-eQTL 3.79e-01 0.0847 0.096 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 413157 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0575 0.105 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 534165 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0539 0.127 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -781448 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0408 0.0879 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 285191 sc-eQTL 8.85e-01 0.0107 0.0737 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -837267 eQTL 1.90e-02 -0.0839 0.0357 0.0 0.0 0.16
ENSG00000136044 APPL2 284278 pQTL 0.0103 0.0354 0.0138 0.0 0.0 0.152

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000074590 \N -619552 1.27e-06 3.65e-06 3.17e-07 1.56e-06 1.05e-07 4.06e-07 1.13e-06 7.98e-08 1.42e-06 1.7e-07 1.96e-06 5.62e-07 2.84e-06 8.94e-07 3.98e-07 4.47e-07 9.15e-07 7.89e-07 1.93e-07 8.39e-08 1.86e-07 1.17e-06 7.96e-07 1.78e-07 2.45e-06 2.39e-07 2.56e-07 2.7e-07 8.56e-07 1.36e-06 6.73e-07 3.8e-08 3.21e-08 6.78e-07 9.89e-07 6.18e-08 6.39e-08 9.23e-08 6.41e-08 4.24e-08 4.76e-08 3.43e-06 4.17e-08 1.74e-07 4.7e-08 1.17e-07 1.21e-07 3.79e-09 4.85e-08