logo

Genes within 1Mb (chr12:105514935:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0626 0.119 0.111 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.65e-02 -0.122 0.0611 0.111 B L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0389 0.0906 0.111 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.94e-02 -0.105 0.0574 0.111 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 8.31e-02 0.159 0.0914 0.111 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.68e-01 -0.123 0.111 0.111 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 2.61e-01 0.0833 0.0738 0.111 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 9.36e-02 0.133 0.0788 0.111 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.69e-01 0.0506 0.0887 0.111 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.02e-01 0.051 0.0757 0.111 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0961 0.0871 0.111 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 7.20e-01 0.0308 0.0861 0.111 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 1.53e-01 -0.17 0.119 0.111 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 7.86e-01 0.021 0.0771 0.111 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.40e-01 0.0983 0.0663 0.111 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.49e-01 0.0198 0.103 0.111 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0237 0.0683 0.111 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.58e-02 -0.179 0.097 0.111 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.109 0.111 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 3.45e-02 -0.208 0.0978 0.111 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.05e-01 -0.015 0.0606 0.111 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 3.32e-01 0.0421 0.0433 0.111 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 4.24e-01 0.0956 0.119 0.115 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0524 0.0821 0.115 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 5.18e-02 -0.238 0.122 0.115 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0873 0.0988 0.115 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 3.42e-01 0.0799 0.0838 0.115 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0247 0.0751 0.115 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 1.69e-01 0.17 0.123 0.115 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0483 0.0502 0.115 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0739 0.104 0.111 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 6.61e-01 0.0327 0.0745 0.111 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0757 0.118 0.111 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 3.27e-02 -0.123 0.0573 0.111 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0679 0.102 0.111 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.57e-01 0.0384 0.0864 0.111 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.54e-01 0.0208 0.113 0.111 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.05e-02 0.223 0.113 0.112 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 7.44e-01 0.0368 0.113 0.112 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.56e-01 0.0318 0.102 0.112 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 8.70e-02 -0.172 0.1 0.112 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 4.08e-01 0.0872 0.105 0.112 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.76e-02 -0.284 0.128 0.112 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 3.82e-01 0.0815 0.093 0.112 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.59e-01 0.0136 0.0763 0.112 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 3.55e-01 -0.118 0.128 0.111 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.85e-01 0.0219 0.0802 0.111 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 7.35e-02 -0.187 0.104 0.111 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0555 0.137 0.111 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0294 0.0966 0.111 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 9.08e-01 0.0114 0.0984 0.111 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0212 0.0804 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00706 0.14 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0723 0.133 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.89e-01 0.159 0.149 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.32e-01 -0.214 0.141 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 9.52e-02 -0.177 0.106 0.105 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0862 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 5.32e-01 0.0925 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.96e-01 0.185 0.143 0.105 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 1.09e-01 -0.218 0.135 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 1.89e-02 -0.236 0.0996 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 7.68e-01 0.0354 0.12 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.36e-01 -0.154 0.103 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 2.65e-03 0.339 0.112 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 1.46e-01 0.191 0.131 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 1.89e-02 0.274 0.116 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.73e-01 0.167 0.122 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 4.09e-01 -0.111 0.134 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 2.94e-01 -0.119 0.113 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 7.58e-01 0.0377 0.122 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0203 0.101 0.112 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 8.09e-01 0.0287 0.118 0.112 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0115 0.137 0.112 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.92e-01 0.0153 0.113 0.112 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0491 0.104 0.112 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.02e-01 0.0836 0.124 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.17e-01 0.0609 0.0937 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 5.19e-01 0.0677 0.105 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0784 0.0942 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 3.54e-01 0.101 0.109 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.84e-01 -0.145 0.135 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 3.28e-01 0.0899 0.0918 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.83e-02 0.205 0.12 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.98e-01 0.0174 0.135 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0691 0.112 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0992 0.101 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0849 0.106 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 4.23e-02 -0.291 0.143 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 5.55e-01 0.0591 0.0999 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.78e-01 0.167 0.124 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 2.18e-01 0.158 0.128 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 1.31e-01 0.16 0.105 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0656 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.62e-01 0.0552 0.126 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0373 0.127 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 2.34e-01 0.159 0.133 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 2.75e-01 0.0837 0.0765 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.06e-01 0.0118 0.0993 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 9.77e-01 0.00248 0.0853 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.62e-01 -0.102 0.0907 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 9.00e-01 0.0112 0.0896 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.32e-01 -0.156 0.13 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0314 0.0854 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.87e-01 0.0159 0.112 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.74e-01 0.0589 0.0821 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.05e-01 -0.135 0.107 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.95e-01 0.115 0.11 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0849 0.136 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.81e-01 0.0373 0.0904 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.83e-01 0.119 0.0892 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.26e-01 0.0874 0.138 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.72e-01 0.0313 0.108 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.78e-01 -0.128 0.118 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.86e-01 -0.143 0.133 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.20e-01 0.013 0.13 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.60e-01 0.0191 0.108 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 7.75e-01 0.0249 0.0867 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0515 0.124 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0929 0.111 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 4.32e-02 -0.211 0.104 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0757 0.116 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.48e-02 -0.262 0.136 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 4.93e-01 0.0817 0.119 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 3.60e-01 0.0805 0.0877 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0562 0.116 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0163 0.103 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0105 0.106 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0243 0.115 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0213 0.0923 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0458 0.0987 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0177 0.135 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.13e-01 0.0768 0.117 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0742 0.132 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.01e-01 0.0696 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0436 0.142 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0499 0.113 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 6.04e-01 -0.065 0.125 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 2.20e-01 0.17 0.138 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 6.50e-01 -0.058 0.128 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.25e-01 -0.17 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.40e-01 0.214 0.145 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 1.04e-01 -0.23 0.141 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 7.76e-01 0.0378 0.133 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.16e-01 0.17 0.108 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0793 0.128 0.11 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.66e-01 0.0194 0.115 0.11 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.10e-03 -0.374 0.12 0.11 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.49e-01 -0.209 0.144 0.11 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 3.39e-01 -0.124 0.13 0.11 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0539 0.117 0.11 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0212 0.0974 0.11 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 7.96e-01 0.0331 0.128 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 3.43e-02 0.236 0.111 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.48e-01 0.0201 0.105 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 3.75e-01 0.111 0.125 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.17e-01 0.0646 0.129 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0384 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 5.36e-01 0.0828 0.134 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 2.39e-01 -0.142 0.12 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 1.49e-01 0.167 0.116 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 3.78e-01 0.1 0.113 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0651 0.116 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.06e-03 -0.285 0.103 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.81e-01 0.0471 0.114 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 4.97e-02 -0.269 0.136 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.04e-02 0.191 0.101 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 2.77e-01 0.09 0.0826 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.08e-01 0.0321 0.132 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 3.17e-02 -0.275 0.127 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0192 0.119 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 4.70e-01 0.0944 0.131 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 4.01e-02 0.277 0.134 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.52e-01 0.00824 0.136 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0956 0.133 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.58e-01 0.138 0.0974 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.30e-01 0.0626 0.13 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 8.09e-01 -0.029 0.12 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.01e-01 0.0299 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0644 0.125 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 8.13e-01 0.0288 0.121 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0647 0.134 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0113 0.106 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 7.45e-01 -0.029 0.0891 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0973 0.162 0.107 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0231 0.0908 0.107 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 4.50e-01 0.124 0.164 0.107 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 8.49e-01 0.0266 0.14 0.107 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 6.18e-01 0.0744 0.149 0.107 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 4.73e-02 -0.29 0.144 0.107 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 4.06e-01 -0.126 0.151 0.107 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 5.83e-01 0.0567 0.103 0.107 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 3.03e-01 0.135 0.131 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.14e-01 0.0252 0.0686 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 1.89e-01 0.164 0.124 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.78e-01 0.15 0.138 0.111 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 8.59e-01 0.0189 0.106 0.111 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 9.85e-02 -0.175 0.105 0.111 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 6.95e-02 -0.16 0.0878 0.111 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0616 0.132 0.111 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 3.53e-01 0.0909 0.0976 0.111 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 3.23e-01 -0.115 0.116 0.111 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0213 0.13 0.111 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.09e-01 -0.164 0.13 0.111 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.82e-01 0.0156 0.105 0.111 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 7.99e-02 0.147 0.0837 0.111 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0599 0.126 0.117 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0262 0.0934 0.117 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 3.23e-02 -0.283 0.131 0.117 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0466 0.118 0.117 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 1.54e-01 0.147 0.103 0.117 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 2.03e-01 -0.117 0.0913 0.117 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0253 0.139 0.117 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.69e-01 0.0164 0.0994 0.117 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0431 0.124 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.83e-01 0.0596 0.0848 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 1.47e-01 -0.185 0.127 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.54e-02 -0.147 0.0651 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 3.50e-01 -0.1 0.107 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.49e-01 0.0462 0.101 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.19e-01 0.185 0.118 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0151 0.127 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0665 0.0929 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 4.06e-01 0.114 0.138 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0304 0.096 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 7.27e-01 0.0402 0.115 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00393 0.118 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0108 0.148 0.115 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 2.51e-02 -0.314 0.139 0.115 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 2.09e-01 -0.176 0.139 0.115 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.50e-01 0.19 0.164 0.115 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0134 0.164 0.115 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 8.51e-02 0.263 0.152 0.115 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 1.41e-01 0.191 0.129 0.115 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.99e-01 0.000188 0.123 0.113 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 3.25e-01 0.123 0.125 0.113 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 1.83e-01 -0.175 0.131 0.113 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0946 0.111 0.113 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.134 0.113 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 3.60e-02 0.294 0.139 0.113 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 8.49e-01 0.0222 0.116 0.113 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 1.01e-01 -0.187 0.114 0.115 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 9.60e-01 0.00597 0.118 0.115 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 3.81e-01 0.106 0.121 0.115 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.04e-01 -0.132 0.081 0.115 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00694 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 1.30e-02 0.287 0.114 0.115 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 4.63e-01 -0.093 0.126 0.115 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 6.14e-01 0.0749 0.148 0.11 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 3.66e-01 -0.086 0.0948 0.11 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.91e-01 0.0581 0.146 0.11 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 4.69e-01 -0.1 0.138 0.11 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 8.24e-01 0.024 0.108 0.11 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 9.57e-01 0.00508 0.0941 0.11 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 9.91e-01 0.00154 0.143 0.11 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 9.03e-01 0.0111 0.0906 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 2.64e-02 -0.296 0.133 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 4.40e-02 -0.182 0.0898 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 9.29e-01 0.0102 0.114 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 6.53e-02 -0.15 0.081 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 1.81e-02 0.279 0.117 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 3.55e-01 0.115 0.124 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 7.95e-02 0.192 0.109 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 2.67e-01 0.125 0.112 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 7.96e-01 0.0329 0.127 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 6.45e-01 0.0435 0.0943 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00104 0.0966 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.84e-01 -0.11 0.0821 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 556191 sc-eQTL 3.90e-01 0.0868 0.101 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 1.86e-01 -0.182 0.137 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 2.44e-01 0.0959 0.0821 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 7.70e-02 0.205 0.115 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 9.99e-01 -9.59e-05 0.117 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 8.31e-01 0.0174 0.0816 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0347 0.126 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0954 0.0614 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.99e-01 -0.053 0.101 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0359 0.0867 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 2.21e-01 0.14 0.114 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 8.93e-02 -0.188 0.11 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.60e-01 0.0335 0.109 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 6.15e-01 -0.062 0.123 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 2.84e-02 -0.159 0.0721 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 3.49e-01 -0.124 0.132 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 7.17e-03 0.303 0.111 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 3.89e-01 -0.112 0.129 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -842813 sc-eQTL 7.43e-02 0.209 0.117 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -625098 sc-eQTL 7.21e-01 0.0405 0.113 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0325 0.107 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 278732 sc-eQTL 4.41e-02 -0.202 0.0995 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 407611 sc-eQTL 3.71e-01 0.0984 0.11 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 528619 sc-eQTL 5.65e-02 -0.252 0.131 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -786994 sc-eQTL 1.72e-01 0.125 0.0915 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 279645 sc-eQTL 6.35e-01 0.0366 0.0769 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -789344 eQTL 0.0118 0.0394 0.0156 0.00263 0.0 0.125
ENSG00000136044 APPL2 278732 eQTL 0.000119 -0.111 0.0287 0.0 0.0 0.125

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 278732 1.27e-06 1e-06 3.28e-07 1.16e-06 3.51e-07 5.32e-07 1.54e-06 3.62e-07 1.52e-06 5.06e-07 1.88e-06 7.32e-07 2.46e-06 2.81e-07 5.28e-07 9.42e-07 8.9e-07 7.78e-07 8.26e-07 6.43e-07 6.36e-07 1.6e-06 8.94e-07 5.59e-07 2.25e-06 5.38e-07 9.05e-07 7.19e-07 1.48e-06 1.16e-06 7.32e-07 1.88e-07 1.97e-07 6.9e-07 5.85e-07 4.36e-07 5.93e-07 1.54e-07 4.94e-07 2.93e-07 2.87e-07 1.62e-06 5.07e-08 9.61e-08 2.83e-07 1.27e-07 2.21e-07 7.69e-08 1.23e-07