logo

Genes within 1Mb (chr12:105512749:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 7.09e-01 0.0517 0.138 0.115 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0751 0.0713 0.115 B L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 3.70e-01 0.0943 0.105 0.115 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.11e-01 0.0441 0.0669 0.115 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 6.14e-01 0.0539 0.107 0.115 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 8.66e-01 0.0219 0.129 0.115 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.91e-01 -0.112 0.0855 0.115 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 5.36e-01 0.057 0.0918 0.115 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 4.31e-01 0.0784 0.0994 0.115 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.18e-01 0.085 0.0849 0.115 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.61e-01 0.0299 0.098 0.115 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.46e-01 -0.091 0.0964 0.115 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 8.40e-01 -0.027 0.134 0.115 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 7.77e-01 0.0245 0.0865 0.115 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0774 0.0746 0.115 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.12 0.115 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.35e-01 0.0166 0.0793 0.115 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.56e-01 0.0354 0.114 0.115 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 2.35e-02 -0.286 0.125 0.115 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 2.73e-01 -0.126 0.114 0.115 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.46e-01 0.0323 0.0703 0.115 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0517 0.0503 0.115 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 5.63e-01 0.0787 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 5.45e-01 0.0566 0.0934 0.119 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.69e-01 -0.101 0.139 0.119 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 7.91e-01 0.0299 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 8.39e-01 0.0194 0.0955 0.119 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0335 0.0854 0.119 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 5.42e-01 0.0857 0.14 0.119 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 8.19e-01 0.0131 0.0572 0.119 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 2.25e-01 0.145 0.119 0.115 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.83e-01 0.0126 0.0856 0.115 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00741 0.135 0.115 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0384 0.0665 0.115 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0121 0.117 0.115 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.74e-01 0.00319 0.0994 0.115 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0464 0.13 0.115 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00799 0.129 0.116 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 5.86e-01 0.069 0.126 0.116 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 4.98e-01 0.0779 0.115 0.116 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.33e-01 0.0708 0.113 0.116 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.86e-01 -0.103 0.118 0.116 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.89e-01 0.00207 0.145 0.116 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 3.29e-01 -0.102 0.105 0.116 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.89e-01 -0.113 0.0854 0.116 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 1.86e-01 -0.195 0.147 0.115 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 1.15e-01 -0.146 0.092 0.115 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0977 0.12 0.115 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.26e-01 0.101 0.158 0.115 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 5.87e-01 0.0606 0.111 0.115 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.04e-01 0.0589 0.113 0.115 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.19e-01 0.144 0.0922 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 8.10e-01 0.0367 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0494 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 8.72e-01 0.0264 0.164 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.36e-01 -0.15 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 3.72e-01 0.104 0.116 0.112 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.36e-01 -0.013 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 3.78e-01 0.143 0.161 0.112 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.77e-01 -0.111 0.156 0.112 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 3.82e-01 0.134 0.152 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 1.79e-01 -0.152 0.113 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 9.64e-01 0.0061 0.134 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0429 0.116 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 1.60e-01 -0.179 0.127 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 2.31e-01 0.177 0.147 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0549 0.131 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 3.15e-01 0.138 0.137 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 2.61e-01 0.173 0.153 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000498 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 2.85e-01 0.15 0.14 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 6.70e-01 0.0493 0.116 0.116 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0329 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 2.76e-01 -0.171 0.156 0.116 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.11e-01 -0.205 0.128 0.116 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 5.94e-01 0.0634 0.119 0.116 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 5.33e-01 0.0885 0.142 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.70e-01 0.0175 0.107 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.68e-01 0.0684 0.12 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0155 0.108 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 9.02e-01 0.0154 0.124 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 6.13e-01 0.0782 0.154 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.17e-01 -0.164 0.104 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 9.94e-01 0.00108 0.138 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00159 0.151 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 1.53e-01 -0.188 0.131 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.38e-01 0.0774 0.125 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.37e-01 0.109 0.113 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 2.41e-01 -0.14 0.119 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 1.68e-01 -0.222 0.161 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.15e-01 0.0563 0.112 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.26e-01 -0.111 0.139 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 7.54e-02 0.254 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.70e-01 0.106 0.118 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 1.45e-01 -0.214 0.146 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0448 0.141 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0966 0.142 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0365 0.149 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 9.94e-01 0.000695 0.0856 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.111 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.51e-01 0.089 0.0952 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0328 0.102 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 2.50e-01 -0.115 0.0999 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 6.72e-01 -0.062 0.146 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 8.10e-01 -0.023 0.0955 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0742 0.13 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 4.19e-02 0.254 0.124 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0721 0.0919 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 1.49e-01 0.172 0.119 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 1.64e-01 -0.172 0.123 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 7.30e-01 0.0527 0.152 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 4.57e-01 0.0754 0.101 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0437 0.1 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 4.45e-01 -0.12 0.157 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 4.12e-01 -0.101 0.123 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.12e-01 0.0498 0.135 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.54e-01 0.0281 0.152 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 5.25e-01 0.0939 0.147 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 5.91e-02 -0.232 0.122 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 8.06e-01 0.0242 0.0987 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 2.73e-01 0.156 0.142 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.62e-01 0.0221 0.127 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 2.33e-01 -0.143 0.12 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 4.75e-02 -0.263 0.132 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 4.19e-01 -0.127 0.157 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 5.08e-01 0.0903 0.136 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 8.74e-01 0.0159 0.101 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 8.02e-01 0.0332 0.132 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.59e-01 0.00606 0.118 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.56e-01 0.0376 0.121 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.81e-01 -0.115 0.131 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 8.82e-01 0.0209 0.141 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 7.76e-01 -0.03 0.105 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0826 0.112 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 4.33e-01 0.123 0.156 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.43e-01 -0.129 0.136 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0846 0.153 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.86e-01 -0.134 0.154 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.42e-01 0.012 0.165 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00867 0.132 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.82e-01 -0.103 0.145 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 8.35e-02 -0.266 0.153 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.141 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 1.47e-01 0.226 0.155 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.01e-01 -0.109 0.161 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 4.32e-01 -0.124 0.157 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0707 0.147 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0902 0.12 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 2.74e-02 -0.314 0.141 0.117 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.117 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.48e-01 -0.104 0.137 0.117 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.82e-01 -0.024 0.161 0.117 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0115 0.145 0.117 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 7.17e-01 0.0473 0.131 0.117 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0093 0.109 0.117 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.41e-01 0.0108 0.145 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 1.74e-01 0.173 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.118 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 1.16e-01 0.223 0.141 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.67e-01 -0.132 0.146 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 6.19e-01 -0.079 0.158 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.36e-01 -0.226 0.151 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 3.42e-01 0.13 0.137 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 8.79e-01 0.0199 0.131 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 8.40e-01 0.0258 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.52e-01 0.0245 0.131 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.85e-01 0.0642 0.118 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 2.33e-01 0.184 0.154 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 4.04e-01 -0.096 0.115 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.97e-01 -0.12 0.0927 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 6.54e-01 0.0663 0.148 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 8.68e-02 0.246 0.143 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.06e-01 -0.136 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.20e-01 0.0943 0.146 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0272 0.151 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0454 0.152 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 4.79e-01 0.106 0.149 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 6.29e-02 -0.203 0.109 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0935 0.146 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 8.95e-01 0.0178 0.135 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00482 0.134 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 9.38e-01 -0.011 0.142 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 9.76e-01 0.0042 0.137 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 4.44e-01 -0.116 0.151 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0801 0.12 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 4.21e-01 -0.081 0.1 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0209 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00927 0.104 0.111 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 8.21e-01 0.0426 0.187 0.111 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 1.50e-01 -0.229 0.158 0.111 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 3.71e-01 0.152 0.169 0.111 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 3.13e-01 0.169 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 7.71e-01 0.0505 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 7.63e-01 0.0354 0.117 0.111 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 1.37e-01 -0.226 0.152 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0147 0.0797 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 6.77e-02 -0.263 0.143 0.111 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.53e-01 0.0954 0.161 0.111 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0438 0.123 0.111 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 5.85e-02 0.232 0.122 0.111 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 9.78e-02 0.17 0.102 0.111 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 1.46e-01 0.215 0.148 0.115 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 2.17e-01 -0.135 0.109 0.115 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.75e-01 0.0933 0.13 0.115 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.45e-01 0.088 0.145 0.115 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.52e-01 0.00879 0.146 0.115 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 2.18e-01 0.145 0.118 0.115 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 3.63e-01 -0.086 0.0943 0.115 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.15e-01 0.0147 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 7.07e-02 0.184 0.101 0.127 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0659 0.145 0.127 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0236 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 9.80e-01 0.00279 0.113 0.127 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 4.72e-01 0.0722 0.1 0.127 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 2.00e-01 0.195 0.152 0.127 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.127 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 3.36e-01 0.138 0.143 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 5.33e-01 0.061 0.0978 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.19e-01 0.119 0.147 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0205 0.076 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0659 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.89e-01 0.00156 0.117 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.03e-01 -0.223 0.136 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 7.60e-01 0.045 0.147 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.84e-01 0.00214 0.108 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0569 0.159 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0283 0.111 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 7.35e-01 -0.045 0.133 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.58e-01 0.0559 0.126 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0451 0.136 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 9.70e-01 0.00609 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00374 0.154 0.127 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 2.22e-01 0.187 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00976 0.18 0.127 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 1.62e-01 0.251 0.178 0.127 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 6.59e-02 -0.307 0.166 0.127 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.16e-01 0.223 0.141 0.127 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0858 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.88e-01 0.123 0.142 0.116 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 8.67e-01 -0.025 0.149 0.116 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 8.71e-01 0.0205 0.126 0.116 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 5.79e-01 0.0845 0.152 0.116 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.20e-01 0.0161 0.159 0.116 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.31e-01 0.198 0.131 0.116 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 6.19e-01 0.0662 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 5.37e-01 -0.085 0.137 0.113 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.31e-01 -0.111 0.14 0.113 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0426 0.0947 0.113 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0318 0.152 0.113 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.20e-01 -0.21 0.134 0.113 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 8.39e-01 0.0299 0.147 0.113 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0673 0.159 0.127 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00315 0.102 0.127 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.44e-01 -0.12 0.157 0.127 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.07e-01 0.0991 0.149 0.127 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 8.39e-01 0.0237 0.116 0.127 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0481 0.101 0.127 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.90e-01 0.00193 0.154 0.127 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 6.23e-01 -0.048 0.0974 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 3.13e-01 0.154 0.152 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 3.71e-02 -0.213 0.102 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.97e-01 0.0881 0.13 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00275 0.0926 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 7.21e-01 -0.048 0.134 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 8.23e-01 0.0315 0.141 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 7.12e-02 -0.224 0.124 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 2.60e-01 0.143 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 7.62e-01 0.0436 0.144 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00581 0.107 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 5.38e-01 0.0678 0.11 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.21e-01 0.0602 0.0936 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 554005 sc-eQTL 8.97e-01 0.0148 0.115 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 3.32e-01 -0.151 0.156 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 2.09e-01 -0.118 0.0932 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0849 0.132 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 4.97e-01 0.0914 0.134 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 7.34e-01 0.0319 0.0935 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 6.52e-01 0.0653 0.145 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00229 0.0708 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0694 0.116 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 9.62e-01 0.00472 0.0995 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.50e-01 -0.189 0.131 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 8.12e-01 0.0304 0.127 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 2.59e-01 0.142 0.125 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 4.24e-01 -0.113 0.141 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 5.82e-01 0.0462 0.0837 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.28e-01 0.0138 0.152 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 1.06e-01 -0.21 0.129 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 8.09e-01 0.0361 0.149 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -844999 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0617 0.132 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -627284 sc-eQTL 7.43e-01 0.0417 0.127 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -791530 sc-eQTL 7.45e-01 0.0394 0.121 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 276546 sc-eQTL 6.38e-01 0.0533 0.113 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 405425 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0916 0.123 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 526433 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00957 0.149 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -789180 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0947 0.103 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 277459 sc-eQTL 1.32e-01 -0.13 0.086 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000013503 POLR3B -844999 eQTL 3.21e-02 -0.0921 0.0429 0.0 0.0 0.104
ENSG00000136044 APPL2 276546 pQTL 0.00918 0.0437 0.0168 0.0 0.0 0.0961

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000235162 \N 277459 4.89e-06 9.04e-06 1.39e-06 4.51e-06 1.46e-06 2.51e-06 8.39e-06 1.69e-06 6.19e-06 4.19e-06 8.97e-06 3.19e-06 1.03e-05 2.37e-06 2.02e-06 5.68e-06 3.61e-06 3.78e-06 2.26e-06 2.68e-06 3.71e-06 7.65e-06 4.81e-06 2.82e-06 9.22e-06 2.37e-06 4.55e-06 3.43e-06 6.26e-06 6.66e-06 3.68e-06 1.04e-06 1.14e-06 2.75e-06 3.41e-06 2.43e-06 1.41e-06 1.74e-06 1.26e-06 9.53e-07 6.91e-07 7.45e-06 8.59e-07 3.05e-07 6.85e-07 1.51e-06 9.03e-07 7.8e-07 5.01e-07