logo

Genes within 1Mb (chr12:105502126:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0465 0.117 0.12 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.62e-02 -0.111 0.0602 0.12 B L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0863 0.0891 0.12 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 5.11e-02 -0.111 0.0564 0.12 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 1.47e-01 0.131 0.0902 0.12 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.67e-01 -0.151 0.109 0.12 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 3.64e-01 0.0662 0.0728 0.12 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.25e-02 0.131 0.0776 0.12 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 7.28e-01 0.0303 0.0869 0.12 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.64e-01 0.0323 0.0743 0.12 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0907 0.0854 0.12 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.37e-01 0.0399 0.0843 0.12 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.81e-01 -0.156 0.116 0.12 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 6.99e-01 0.0293 0.0756 0.12 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.04e-01 0.106 0.0649 0.12 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 9.67e-01 0.0042 0.101 0.12 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.41e-01 -0.041 0.067 0.12 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 7.79e-02 -0.169 0.0953 0.12 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.61e-01 0.0471 0.107 0.12 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 3.09e-02 -0.209 0.096 0.12 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0176 0.0595 0.12 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 4.20e-01 0.0344 0.0426 0.12 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.53e-01 0.0887 0.118 0.124 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0927 0.081 0.124 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 2.92e-02 -0.263 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0679 0.0978 0.124 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 4.03e-01 0.0695 0.0829 0.124 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00597 0.0743 0.124 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 2.55e-01 0.139 0.122 0.124 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0215 0.0497 0.124 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0556 0.102 0.12 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0172 0.0734 0.12 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0533 0.116 0.12 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.16e-02 -0.13 0.0564 0.12 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0898 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 6.70e-01 0.0363 0.0851 0.12 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.111 0.12 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 7.38e-02 0.2 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 6.09e-01 0.0566 0.11 0.12 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 7.34e-01 0.0341 0.1 0.12 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 9.34e-02 -0.166 0.0983 0.12 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.48e-01 0.0784 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.31e-02 -0.287 0.125 0.12 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.60e-01 0.0676 0.0913 0.12 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.80e-01 0.00185 0.0749 0.12 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 2.32e-01 -0.15 0.125 0.12 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.32e-01 0.0378 0.0789 0.12 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.13e-02 -0.192 0.102 0.12 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00997 0.135 0.12 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.87e-01 0.0015 0.0951 0.12 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.93e-01 0.0518 0.0967 0.12 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.14e-01 0.00856 0.079 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00702 0.137 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00629 0.131 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.31e-01 0.116 0.147 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 7.01e-02 -0.253 0.139 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 7.71e-02 -0.184 0.104 0.112 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.37e-01 0.0116 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.58e-01 0.0853 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 2.37e-01 0.167 0.14 0.112 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 1.13e-01 -0.212 0.133 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.37e-03 -0.274 0.0973 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 9.37e-01 0.00933 0.118 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 1.52e-01 -0.146 0.101 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 8.51e-03 0.292 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.21e-01 0.158 0.129 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 1.00e-02 0.294 0.113 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.06e-01 0.194 0.12 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 2.23e-01 -0.16 0.131 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0665 0.111 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 7.48e-01 0.0385 0.12 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0542 0.0991 0.121 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00236 0.116 0.121 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00258 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 6.93e-01 0.0437 0.111 0.121 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0562 0.102 0.121 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 2.51e-01 0.14 0.122 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 4.53e-01 0.0691 0.092 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 8.90e-01 0.0143 0.103 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0408 0.0927 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 2.63e-01 0.12 0.107 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.79e-01 -0.179 0.133 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.67e-01 0.0518 0.0903 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 4.91e-02 0.233 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.79e-01 0.0201 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 2.96e-01 0.12 0.114 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0881 0.11 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 1.55e-01 -0.141 0.0987 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 1.56e-01 -0.148 0.104 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.27e-02 -0.349 0.139 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.14e-01 0.0358 0.0978 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.121 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 1.77e-01 0.141 0.104 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0535 0.13 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 3.89e-01 0.107 0.124 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.80e-01 0.00313 0.125 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 1.42e-01 0.193 0.131 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 3.59e-01 0.0694 0.0755 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 9.90e-01 0.00118 0.0975 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0205 0.0837 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0804 0.0891 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 9.96e-01 0.000461 0.088 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.53e-01 -0.147 0.128 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0222 0.0838 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 2.42e-01 0.134 0.114 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.88e-01 0.0154 0.109 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.60e-01 0.0355 0.0804 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 1.02e-01 -0.171 0.104 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.48e-01 0.124 0.107 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 4.24e-01 -0.107 0.133 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.09e-01 0.0732 0.0884 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0872 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 5.71e-01 0.0771 0.136 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.53e-01 0.048 0.107 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 2.37e-01 -0.138 0.116 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 3.60e-01 -0.121 0.132 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.81e-01 0.00301 0.128 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 9.44e-01 0.00753 0.107 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.83e-01 0.0018 0.0857 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 5.63e-01 -0.071 0.122 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 1.95e-01 -0.141 0.109 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.14e-02 -0.192 0.102 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0175 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 4.57e-02 -0.268 0.134 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.65e-01 0.0674 0.117 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 7.43e-01 0.0284 0.0864 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0525 0.113 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 7.59e-01 -0.031 0.101 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00484 0.104 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0308 0.113 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.09e-01 -0.194 0.12 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0215 0.0903 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0372 0.0966 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00961 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.32e-01 0.0557 0.116 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0737 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.34e-01 0.0628 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0609 0.14 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0245 0.112 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0599 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 1.48e-01 0.198 0.136 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0573 0.126 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.66e-01 -0.101 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 1.48e-01 0.207 0.143 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 3.60e-02 -0.292 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.131 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.60e-01 0.15 0.106 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.94e-01 -0.087 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.96e-01 0.0149 0.114 0.119 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.44e-03 -0.353 0.119 0.119 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.15e-01 -0.178 0.143 0.119 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0774 0.129 0.119 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.119 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00343 0.0966 0.119 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 6.61e-01 0.055 0.125 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 3.82e-02 0.226 0.108 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 9.47e-01 0.00687 0.103 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.43e-01 0.0937 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.21e-01 0.102 0.126 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0889 0.136 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.84e-01 0.0358 0.131 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.44e-01 -0.172 0.118 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 2.09e-01 0.143 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 2.48e-01 0.129 0.111 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 7.01e-01 -0.044 0.114 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 5.04e-03 -0.286 0.101 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 7.45e-01 0.0365 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 4.71e-02 -0.267 0.134 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 7.96e-02 0.175 0.0996 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 2.59e-01 0.0917 0.0811 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 9.54e-01 0.00746 0.13 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 5.18e-02 -0.245 0.125 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.98e-01 0.0453 0.117 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 5.48e-01 0.0773 0.128 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.12e-02 0.305 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0421 0.134 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 3.31e-01 -0.128 0.131 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0958 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.20e-01 0.0291 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0244 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 9.33e-01 0.00984 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.56e-01 -0.055 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.119 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0474 0.132 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 9.76e-01 0.00313 0.104 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 5.37e-01 -0.054 0.0874 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.68e-01 -0.115 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0581 0.0889 0.115 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.89e-01 0.112 0.161 0.115 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 7.04e-01 0.0523 0.137 0.115 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 5.89e-01 0.0791 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.82e-02 -0.313 0.141 0.115 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.19e-01 -0.12 0.148 0.115 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 5.30e-01 0.0635 0.101 0.115 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 3.92e-01 0.11 0.129 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 4.85e-01 0.0471 0.0674 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 2.47e-01 0.142 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.13e-01 0.169 0.136 0.12 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 8.75e-01 0.0164 0.104 0.12 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 2.00e-01 -0.133 0.104 0.12 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 5.95e-02 -0.163 0.0862 0.12 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0498 0.131 0.12 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 1.13e-01 0.153 0.0959 0.12 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.06e-01 -0.118 0.115 0.12 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0168 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.46e-01 -0.187 0.128 0.12 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 8.98e-01 0.0134 0.104 0.12 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.14e-01 0.131 0.0827 0.12 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0905 0.123 0.127 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0746 0.0915 0.127 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 1.35e-02 -0.319 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0581 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 2.33e-01 0.121 0.101 0.127 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 1.38e-01 -0.133 0.0895 0.127 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0687 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 8.72e-01 0.0157 0.0975 0.127 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0297 0.122 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.93e-01 0.0112 0.0836 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 1.56e-01 -0.178 0.125 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 1.37e-02 -0.159 0.064 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 3.07e-01 -0.108 0.105 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 8.59e-01 0.0178 0.0998 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.37e-01 0.174 0.117 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.64e-01 0.0215 0.125 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 2.09e-01 -0.115 0.0911 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.03e-01 0.14 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0617 0.0943 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.87e-01 0.00178 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 1.85e-01 -0.142 0.107 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 9.38e-01 0.00903 0.116 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0236 0.146 0.121 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 2.94e-02 -0.3 0.136 0.121 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 1.55e-01 -0.195 0.136 0.121 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.75e-01 0.177 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00894 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.35e-02 0.29 0.149 0.121 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.66e-01 0.177 0.127 0.121 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0529 0.121 0.122 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.54e-01 0.073 0.123 0.122 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 3.09e-01 -0.132 0.129 0.122 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0974 0.109 0.122 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.86e-01 -0.141 0.132 0.122 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.44e-02 0.277 0.137 0.122 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 6.24e-01 0.0561 0.114 0.122 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 2.51e-01 -0.129 0.112 0.124 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0692 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 4.61e-01 0.0877 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0938 0.08 0.124 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 8.39e-01 0.0261 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 9.69e-03 0.294 0.113 0.124 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 4.18e-01 -0.101 0.124 0.124 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 6.24e-01 0.0716 0.146 0.119 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 2.85e-01 -0.1 0.0933 0.119 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 7.28e-01 0.0502 0.144 0.119 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0727 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 7.49e-01 0.0341 0.106 0.119 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 7.12e-01 0.0342 0.0927 0.119 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 9.15e-01 0.0149 0.141 0.119 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 4.64e-01 0.0654 0.0891 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 1.07e-02 -0.335 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 3.70e-02 -0.185 0.0882 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0247 0.112 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.66e-02 -0.159 0.0796 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 5.64e-02 0.222 0.116 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.69e-01 0.135 0.122 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 5.21e-02 0.209 0.107 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 1.88e-01 0.145 0.11 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 4.16e-01 0.101 0.124 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.05e-01 0.0479 0.0926 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0474 0.0949 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 2.12e-01 -0.101 0.0807 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 543382 sc-eQTL 4.05e-01 0.0825 0.099 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 6.71e-02 -0.246 0.134 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.55e-01 0.0604 0.0808 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 7.70e-02 0.201 0.113 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 8.65e-01 0.0196 0.115 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0372 0.0803 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0198 0.124 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.94e-02 -0.119 0.0602 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0804 0.0992 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0398 0.0854 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 2.46e-01 0.131 0.112 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 1.26e-01 -0.167 0.109 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0259 0.108 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0634 0.121 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 6.90e-02 -0.13 0.0713 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 2.81e-01 -0.141 0.13 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 4.69e-03 0.313 0.11 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0893 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855622 sc-eQTL 1.26e-01 0.176 0.115 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -637907 sc-eQTL 5.88e-01 0.0601 0.111 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0254 0.105 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265923 sc-eQTL 5.26e-02 -0.19 0.0977 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394802 sc-eQTL 4.68e-01 0.0783 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515810 sc-eQTL 5.27e-02 -0.251 0.129 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -799803 sc-eQTL 1.86e-01 0.119 0.0898 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266836 sc-eQTL 7.25e-01 0.0266 0.0754 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136026 CKAP4 -802153 eQTL 0.0254 0.0339 0.0152 0.00132 0.0 0.136
ENSG00000136044 APPL2 265923 eQTL 8.58e-07 -0.137 0.0277 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136044 APPL2 265923 1.21e-06 1.25e-06 2.91e-07 1.21e-06 2.48e-07 6.09e-07 1.55e-06 3.46e-07 1.39e-06 4.31e-07 1.87e-06 6.43e-07 2.1e-06 2.87e-07 5.08e-07 8.27e-07 7.94e-07 5.99e-07 7.55e-07 6.96e-07 4.99e-07 1.63e-06 8.61e-07 6.2e-07 2.23e-06 3.63e-07 8.98e-07 7.16e-07 1.35e-06 1.29e-06 7.41e-07 1.54e-07 1.81e-07 6.35e-07 5.28e-07 3.21e-07 4.12e-07 1.24e-07 2.78e-07 1.04e-07 2.89e-07 1.57e-06 5.37e-08 1.06e-07 1.61e-07 1.29e-07 2.45e-07 8.41e-08 8.28e-08
ENSG00000151131 \N 515810 3.77e-07 3.11e-07 6.15e-08 2.62e-07 1.02e-07 1.44e-07 3.33e-07 6.12e-08 1.96e-07 1.11e-07 2.62e-07 1.62e-07 3.48e-07 8.26e-08 6.6e-08 9.48e-08 5.27e-08 2.15e-07 7.11e-08 6.29e-08 1.27e-07 2.09e-07 2.04e-07 4.37e-08 3.7e-07 1.43e-07 1.33e-07 1.46e-07 1.48e-07 1.81e-07 1.76e-07 4.51e-08 4.23e-08 9.72e-08 1.01e-07 2.68e-08 4.62e-08 7.49e-08 6.45e-08 6.67e-08 4.89e-08 2.71e-07 4.76e-08 1.71e-08 3.32e-08 9.65e-09 7.26e-08 1.96e-09 4.69e-08