logo

Genes within 1Mb (chr12:105501794:C:CA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0429 0.0908 0.239 B L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 2.55e-01 0.0535 0.0468 0.239 B L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.68e-01 0.0204 0.0691 0.239 B L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00825 0.044 0.239 B L1
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0227 0.0701 0.239 B L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 8.97e-01 0.011 0.0848 0.239 B L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0499 0.0563 0.239 B L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0471 0.0603 0.239 B L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0451 0.0669 0.239 CD4T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0284 0.0572 0.239 CD4T L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 1.17e-01 0.103 0.0655 0.239 CD4T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0072 0.065 0.239 CD4T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0416 0.0898 0.239 CD4T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0238 0.0582 0.239 CD4T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0667 0.0501 0.239 CD4T L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 8.38e-01 0.016 0.0785 0.239 CD8T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 5.05e-01 0.0346 0.0518 0.239 CD8T L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.93e-01 0.0195 0.0742 0.239 CD8T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0607 0.0828 0.239 CD8T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.99e-01 0.0191 0.075 0.239 CD8T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0585 0.0458 0.239 CD8T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 5.46e-01 0.0199 0.0329 0.239 CD8T L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 1.90e-02 -0.226 0.0956 0.241 DC L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 8.53e-01 0.0123 0.0667 0.241 DC L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 3.77e-01 0.088 0.0994 0.241 DC L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 3.70e-01 0.072 0.0802 0.241 DC L1
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0479 0.0681 0.241 DC L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.09e-01 0.0228 0.0609 0.241 DC L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.05e-01 -0.038 0.1 0.241 DC L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 7.23e-01 0.0145 0.0408 0.241 DC L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 1.35e-01 -0.119 0.0792 0.239 Mono L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.35e-01 0.00464 0.0571 0.239 Mono L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.50e-01 0.054 0.0902 0.239 Mono L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.90e-01 0.0469 0.0443 0.239 Mono L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0258 0.078 0.239 Mono L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0147 0.0663 0.239 Mono L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0847 0.0863 0.239 Mono L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0268 0.0868 0.238 NK L1
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 3.91e-01 0.0734 0.0853 0.238 NK L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.74e-03 -0.199 0.0764 0.238 NK L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.58e-01 0.0449 0.0765 0.238 NK L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.60e-01 0.09 0.0797 0.238 NK L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 8.05e-01 0.0242 0.0982 0.238 NK L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.41e-01 -0.033 0.0707 0.238 NK L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.39e-01 0.0555 0.0578 0.238 NK L1
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.27e-01 0.0955 0.0972 0.239 Other_T L1
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.88e-01 0.000935 0.0611 0.239 Other_T L1
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.33e-01 0.095 0.0794 0.239 Other_T L1
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.35e-01 0.065 0.104 0.239 Other_T L1
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0358 0.0735 0.239 Other_T L1
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 1.81e-01 -0.1 0.0746 0.239 Other_T L1
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0612 0.061 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.81e-01 0.0872 0.0994 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 2.88e-01 0.101 0.0944 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0214 0.107 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.76e-01 0.111 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 2.23e-01 0.0924 0.0755 0.24 B_Activated L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 2.97e-01 -0.11 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.90e-01 0.0146 0.105 0.24 B_Activated L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.37e-02 -0.23 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.01e-01 -0.106 0.102 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 3.09e-01 0.0771 0.0757 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 4.88e-01 0.0627 0.0901 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00286 0.078 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0118 0.0857 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0576 0.099 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.10e-02 -0.165 0.0874 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.05e-01 -0.117 0.0918 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0651 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.18e-01 0.00901 0.0869 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0442 0.0938 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0146 0.0775 0.241 B_Memory L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0174 0.091 0.241 B_Memory L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.27e-01 -0.16 0.104 0.241 B_Memory L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.07e-02 -0.156 0.0859 0.241 B_Memory L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 7.84e-01 0.0219 0.0796 0.241 B_Memory L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0674 0.0957 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0128 0.0722 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00853 0.0808 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0557 0.0726 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000438 0.0841 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.63e-01 0.146 0.104 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0288 0.0708 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.76e-02 -0.159 0.0924 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.53e-01 0.0939 0.101 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.24e-01 -0.043 0.0876 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 8.54e-01 0.0154 0.0839 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0614 0.0757 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 1.08e-01 0.128 0.0791 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 6.07e-01 0.0554 0.108 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.48e-02 -0.133 0.0742 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.34e-01 0.0194 0.0929 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0931 0.0952 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.90e-03 -0.202 0.0775 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.47e-01 0.0592 0.098 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 1.86e-01 0.124 0.0936 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0892 0.0945 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0674 0.0994 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 9.16e-01 0.00601 0.0571 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0722 0.0755 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00191 0.065 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.60e-01 0.0781 0.0691 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.41e-01 0.0417 0.0682 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0383 0.0997 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 9.31e-01 0.00564 0.0651 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0968 0.0886 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 1.68e-01 -0.116 0.0837 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 9.65e-01 0.0027 0.0618 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 1.80e-01 0.108 0.0801 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0575 0.0827 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00329 0.102 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 2.57e-02 -0.151 0.0672 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0953 0.067 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 4.01e-01 0.0876 0.104 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0667 0.0817 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.75e-01 0.0977 0.0893 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0397 0.101 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0727 0.098 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0732 0.0817 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.00e-02 -0.115 0.0652 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.18e-01 0.034 0.094 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0432 0.0836 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 6.86e-01 0.032 0.0791 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0562 0.0876 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0347 0.103 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 1.73e-02 -0.213 0.0886 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 9.25e-01 0.00621 0.0663 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.55e-01 0.0531 0.0897 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.94e-01 0.0316 0.0801 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0212 0.0823 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0787 0.0891 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 9.31e-01 0.00834 0.0959 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 4.01e-01 -0.06 0.0714 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 6.74e-02 -0.14 0.0759 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0354 0.102 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 4.23e-01 -0.071 0.0885 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0569 0.0996 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0833 0.1 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.18e-01 0.167 0.106 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 2.05e-01 -0.108 0.0851 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0228 0.0945 0.238 CD8_TCM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0321 0.1 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0896 0.0923 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 6.62e-02 -0.187 0.101 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.17e-01 -0.011 0.105 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 4.09e-01 0.0848 0.103 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 4.56e-01 0.0719 0.0962 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.06e-01 0.0803 0.0783 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0455 0.0968 0.238 MAIT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.04e-01 0.033 0.0868 0.238 MAIT L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.26e-02 0.211 0.0917 0.238 MAIT L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.00e-01 0.0737 0.109 0.238 MAIT L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 2.68e-01 -0.109 0.0978 0.238 MAIT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 2.78e-01 -0.096 0.0882 0.238 MAIT L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 9.53e-01 0.00437 0.0736 0.238 MAIT L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0514 0.0946 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 4.08e-02 -0.168 0.0818 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 1.06e-02 -0.197 0.0763 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0927 0.0921 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.59e-02 0.211 0.0942 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 6.41e-01 0.0481 0.103 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0561 0.0988 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 1.59e-01 0.126 0.0889 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.65e-01 0.0266 0.0889 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 3.07e-01 0.0888 0.0866 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 2.12e-01 -0.111 0.0889 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 3.85e-01 0.0696 0.08 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.61e-01 0.0984 0.0873 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0398 0.105 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0731 0.0781 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0633 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 4.51e-01 0.0741 0.0982 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 5.17e-01 0.0622 0.0958 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 5.30e-02 -0.171 0.0877 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 8.69e-01 0.0161 0.0975 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 3.11e-02 -0.216 0.0997 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00566 0.102 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.71e-01 0.0162 0.0996 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 4.89e-01 0.0505 0.0729 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0234 0.1 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0516 0.0925 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 1.89e-02 -0.214 0.0905 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.60e-01 0.0296 0.097 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.99e-01 0.000109 0.0938 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.18e-02 0.186 0.103 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0112 0.082 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 4.73e-01 0.0494 0.0688 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 2.17e-01 -0.147 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0261 0.0671 0.248 PB L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 4.95e-01 0.0828 0.121 0.248 PB L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 6.19e-01 0.0514 0.103 0.248 PB L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 4.35e-02 -0.221 0.108 0.248 PB L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.64e-01 0.151 0.108 0.248 PB L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0337 0.112 0.248 PB L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0435 0.0759 0.248 PB L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 2.49e-01 0.119 0.103 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.72e-01 0.0157 0.0541 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 4.26e-01 0.0782 0.098 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.19e-01 0.134 0.109 0.241 Pro_T L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0294 0.0834 0.241 Pro_T L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.07e-01 0.043 0.0834 0.241 Pro_T L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 1.15e-01 -0.11 0.0693 0.241 Pro_T L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0191 0.0995 0.239 Treg L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0187 0.0735 0.239 Treg L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.03e-01 0.0588 0.0876 0.239 Treg L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 3.09e-02 -0.209 0.0964 0.239 Treg L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.44e-01 -0.032 0.0981 0.239 Treg L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0492 0.0792 0.239 Treg L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0828 0.0631 0.239 Treg L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 6.52e-02 -0.183 0.0987 0.237 cDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0356 0.074 0.237 cDC L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 5.32e-01 0.0657 0.105 0.237 cDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 2.05e-01 0.119 0.0934 0.237 cDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 1.84e-01 -0.108 0.0814 0.237 cDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.26e-01 0.0255 0.0727 0.237 cDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.77e-01 0.0171 0.11 0.237 cDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.72e-01 0.0127 0.0787 0.237 cDC L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0603 0.0974 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0104 0.0668 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 3.82e-01 0.0879 0.1 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 7.69e-01 0.0153 0.0519 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 5.77e-01 0.0471 0.0844 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0307 0.0797 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0202 0.0936 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0629 0.0995 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.63e-01 -0.022 0.0728 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.107 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0157 0.0751 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.52e-01 -0.128 0.0893 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.95e-01 0.0335 0.0853 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0528 0.0921 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 4.35e-01 0.0881 0.113 0.236 gdT L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.73e-02 0.189 0.106 0.236 gdT L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 3.25e-01 -0.105 0.106 0.236 gdT L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.27e-02 -0.21 0.124 0.236 gdT L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.43e-01 0.0411 0.125 0.236 gdT L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0361 0.117 0.236 gdT L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 7.67e-01 0.0294 0.099 0.236 gdT L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 9.73e-01 0.00323 0.0963 0.236 intMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 8.20e-01 0.0224 0.0982 0.236 intMono L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0498 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 3.80e-01 0.0762 0.0867 0.236 intMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 9.65e-01 0.00465 0.105 0.236 intMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0254 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.19e-01 -0.112 0.0906 0.236 intMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0319 0.0884 0.238 ncMono L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0912 0.238 ncMono L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.73e-01 -0.027 0.0935 0.238 ncMono L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 9.60e-01 0.00315 0.063 0.238 ncMono L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.07e-01 -0.163 0.1 0.238 ncMono L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0451 0.0899 0.238 ncMono L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0509 0.0978 0.238 ncMono L2
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.26e-01 0.0412 0.118 0.234 pDC L2
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 1.78e-02 0.177 0.074 0.234 pDC L2
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 8.33e-01 0.0244 0.116 0.234 pDC L2
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0442 0.11 0.234 pDC L2
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 2.47e-01 0.099 0.0852 0.234 pDC L2
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.44e-01 0.0244 0.0746 0.234 pDC L2
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.43e-01 0.0526 0.113 0.234 pDC L2
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.23e-01 0.0711 0.0716 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0462 0.101 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 6.10e-01 0.0349 0.0683 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.50e-01 0.0276 0.0862 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 7.07e-01 0.0232 0.0616 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0441 0.0895 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 1.69e-02 -0.222 0.0923 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 1.88e-01 -0.109 0.0825 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0816 0.0846 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 9.22e-01 0.00942 0.0964 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 8.50e-01 0.0136 0.0718 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.89e-01 0.0197 0.0735 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0382 0.0627 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00573 0.0768 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 4.04e-01 0.0873 0.104 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0258 0.0626 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.04e-01 -0.112 0.0879 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 1.75e-01 -0.124 0.0909 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0204 0.0635 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 2.14e-01 0.122 0.098 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 5.24e-01 0.0306 0.048 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0216 0.0785 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0166 0.0675 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0675 0.0891 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0237 0.0844 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 3.77e-01 0.0737 0.0832 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0321 0.0939 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 6.29e-01 0.0268 0.0555 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 9.86e-01 0.00182 0.101 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 5.46e-01 0.0521 0.0862 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 2.37e-01 -0.116 0.0983 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000013503 POLR3B -855954 sc-eQTL 9.39e-01 0.00683 0.0898 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000074590 NUAK1 -638239 sc-eQTL 3.54e-01 0.0801 0.0862 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136026 CKAP4 -802485 sc-eQTL 5.45e-02 -0.157 0.0814 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136044 APPL2 265591 sc-eQTL 4.15e-01 0.0626 0.0766 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136051 WASHC4 394470 sc-eQTL 4.73e-01 0.0603 0.0839 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000151131 C12orf45 515478 sc-eQTL 8.15e-01 0.0237 0.101 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000166046 TCP11L2 -800135 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0535 0.0701 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000235162 C12orf75 266504 sc-eQTL 3.67e-01 0.0531 0.0586 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136052 SLC41A2 543050 eQTL 0.03 0.0911 0.0419 0.0 0.0 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000013503 \N -855954 2.66e-07 1.11e-07 3.31e-08 1.68e-07 1.03e-07 9.32e-08 1.42e-07 5.29e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.63e-07 8.03e-08 1.27e-07 6.21e-08 4.77e-08 7.87e-08 5.12e-08 1.06e-07 5.12e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.3e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.27e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.02e-08 9.14e-08 4.14e-08 4.7e-08 8.48e-08 8.3e-08 3.8e-08 2.6e-08 1.36e-07 4.23e-08 0.0 1.15e-07 1.83e-08 1.46e-07 4.96e-09 4.72e-08